Index of /data/main/v/vmatch/2.3.1+dfsg-6/src/include

• Parent Directory
• FUNname.sh
• Makefile
• absdef.h
• accvirt.pr
• alignment.h
• alphabet.pr
• alphadef.h
• applall.pr
• args.h
• arraydef.h
• assertion.h
• bestmatch.pr
• binsearch.pr
• binsplitvn.pr
• bitvdist.pr
• bmhfun.pr
• boundedgaps.h
• bwtcode.pr
• bytehandler.pr
• ceillog2.pr
• chain2count.pr
• chain2dim.pr
• chaindef.h
• chardef.h
• checkgzip.pr
• checkonoff.pr
• cleanMUMcand.pr
• clock.pr
• cluster.pr
• clusterdef.h
• cmp-gentab.c
• cmp-tabdef.h
• cmpalpha.pr
• cmpmaxd.pr
• codon.pr
• codondef.h
• comparetabs.pr
• compfilenm.pr
• compl.h
• cpridx-data.h
• debug.pr
• debugdef.h
• detnumofcodes.pr
• detpfxlen.pr
• dictmaxsize.pr
• distri.pr
• divmodmul.h
• dlopen.h
• dpacp.pr
• dpbitvec.h
• dpbitvec48.h
• dpvecdbg.pr
• drand48.h
• drand48.pr
• dstrdup.pr
• emimergeesa.h
• encodedseq.pr
• encseq-def.h
• encseq2offset.pr
• endianess.pr
• errordef.h
• esafileend.h
• esastream.h
• evaluedef.h
• evalues.pr
• experim.h
• extcmp.c
• extendED.pr
• extendHD.pr
• extractcc.h
• extraproto.h
• failures.h
• fastastream.pr
• fdrewr.h
• fhandledef.h
• file.h
• file2lines.pr
• filehandle.pr
• fopen.h
• frontSEP.pr
• frontdef.h
• functrace.h
• galign.pr
• galigndef.h
• genericqueue.pr
• genericstream.pr
• genfile.h
• genfile.pr
• genredblack.c
• genstream.h
• getEqs.pr
• getbasename.pr
• getdirname.pr
• getfasta.pr
• gextenddef.h
• gqueue-if.h
• gqueueproc.h
• gstack.c
• guessprot.pr
• handleesastream.pr
• huffman.pr
• inputsymbol.h
• intbits.h
• iter.h
• iubdef.h
• karlin.pr
• kmer2string.pr
• logbase.h
• mapfile.pr
• match.h
• matchsub.pr
• matsort.pr
• maxfiles.h
• maxpref.pr
• mcontain.pr
• megabytes.h
• mergeesa.pr
• minmax.h
• mkcld.pr
• mkidxfilecpy.pr
• mkskip.pr
• multidef.h
• multimatdef.h
• multireverse.pr
• multiseq-adv.pr
• multiseq.pr
• mumcand.h
• nextesamerged.c
• nextesastream.c
• onflychain.pr
• onflychaindef.h
• optdesc.h
• outindextab.pr
• parsemultiform.pr
• pathmax.h
• procopt.pr
• produceqhits.pr
• programversion.h
• programversion.pr
• prsqualint.pr
• qgram2code.c
• qsort.gen
• qsort.pr
• qsortdef.h
• qualint.h
• queryext.h
• queue.c
• readgzip.pr
• readmulti.pr
• readnextline.pr
• readvirt.pr
• recvirt.pr
• redblack.pr
• redblackdef.h
• regionsmerger.pr
• remdups.pr
• reverse.pr
• safeadd.h
• safecast.h
• safecast.pr
• safemult.h
• safescpy.pr
• scanpaths.pr
• scoredef.h
• scorematrix.pr
• searchdef.h
• searchpat.pr
• select.h
• seterror.pr
• showalign.pr
• showibit.pr
• showmemsize.pr
• sixframe.pr
• skiplist.h
• skiplist.pr
• smcontain.pr
• smwa.pr
• sortstrings.pr
• space.pr
• spacedef.h
• splitargs.pr
• superbck.pr
• trieins-def.h
• trieins.pr
• types.h
• uedist.pr
• vbfstrav.pr
• vdfstrav.c
• verbosealpha.pr
• virtualdef.h
• visible.h
• vmatfind-def.h
• vmotif-data.h
• vnodedef.h
• vnodes.pr
• vplugin-interface.h
• wheels.pr
• xdrop.pr
• xdropal1.pr
• xdropal2.pr
• xdropdef.h
• xmlindent.h