Package: cdk / 1:1.2.10-7

jama-1.0.3.patch Patch series | download
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
Description: update cdk to build against Jama 1.0.3
Author: tony mancill <tmancill@debian.org>
Bug-Debian: http://bugs.debian.org/724120

---
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/builder3d.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/builder3d.libdepends
@@ -1,3 +1,3 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 vecmath*.jar
 
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/extra.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/extra.libdepends
@@ -1,3 +1,3 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 vecmath*.jar
 xom*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/forcefield.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/forcefield.libdepends
@@ -1,3 +1,3 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 vecmath*.jar
 
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/qsar.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/qsar.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 JRI.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 sjava-0.68.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/qsaratomic.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/qsaratomic.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 JRI.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 sjava-0.68.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/qsarbond.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/qsarbond.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 JRI.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 sjava-0.68.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/qsarmolecular.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/qsarmolecular.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 JRI.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 sjava-0.68.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/qsarprotein.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/qsarprotein.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 JRI.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 sjava-0.68.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-builder3d.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-builder3d.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-extra.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-extra.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 cmlxom-2.5-b1.jar
 log4j*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-forcefield.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-forcefield.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 log4j*.jar
 vecmath*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-formula.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-formula.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 log4j*.jar
 vecmath*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-ionpot.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-ionpot.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 log4j*.jar
 vecmath*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsar.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsar.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsaratomic.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsaratomic.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsarbond.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsarbond.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsarionpot.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsarionpot.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsarmolecular.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsarmolecular.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-qsarprotein.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-qsarprotein.libdepends
@@ -1,6 +1,6 @@
 vecmath*.jar
 log4j*.jar
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 xom*.jar
 JRI.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/META-INF/test-reaction.libdepends
+++ cdk-1.2.10/src/META-INF/test-reaction.libdepends
@@ -1,4 +1,4 @@
-jama-1.0.2.jar
+jama-1.0.3.jar
 jgrapht-0.6.0.jar
 log4j*.jar
 vecmath*.jar
--- cdk-1.2.10.orig/src/main/org/openscience/cdk/qsar/descriptors/molecular/MomentOfInertiaDescriptor.java
+++ cdk-1.2.10/src/main/org/openscience/cdk/qsar/descriptors/molecular/MomentOfInertiaDescriptor.java
@@ -77,8 +77,8 @@ import javax.vecmath.Point3d;
  *
  * @author           Rajarshi Guha
  * @cdk.created      2005-02-07
- * @cdk.builddepends Jama-1.0.2.jar
- * @cdk.depends      Jama-1.0.2.jar
+ * @cdk.builddepends Jama-1.0.3.jar
+ * @cdk.depends      Jama-1.0.3.jar
  * @cdk.module       qsarmolecular
  * @cdk.githash
  * @cdk.set          qsar-descriptors