File: augustus.hints.gff

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augustus 3.3.2%2Bdfsg-2
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file content (18343 lines) | stat: -rw-r--r-- 1,336,497 bytes
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# This output was generated with AUGUSTUS (version 2.5).
# AUGUSTUS is a gene prediction tool for eukaryotes written by Mario Stanke (mario.stanke@uni-greifswald.de)
# and Oliver Keller (keller@cs.uni-goettingen.de).
# Please cite: Mario Stanke, Mark Diekhans, Robert Baertsch, David Haussler (2008),
# Using native and syntenically mapped cDNA alignments to improve de novo gene finding
# Bioinformatics 24: 637-644, doi 10.1093/bioinformatics/btn013
# reading in the file hints.gff ...
# Setting CDSpart local malus: 0.985
# Setting UTRpart local malus: 0.96
# Sources of extrinsic information: M E W 
# Have extrinsic information about 1 sequences (in the specified range). 
# Initialising the parameters ...
# fly version. Use default transition matrix.
# Looks like chr2R.fa is in fasta format.
# We have hints for 1 sequence and for 1 of the sequences in the input set.
#
# ----- prediction on sequence number 1 (length = 500000, name = chr2R) -----
#
# Delete group HintGroup SRR023608.8894141/1, 7655-11243, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.17457170/2, 7726-11334, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.2379695/2, 8527-12135, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.15352763/1, 8598-12148, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.19696268/1, 8782-12292, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.7812602/2, 8965-12514, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 9006-12631, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.1146214/2, 9030-12655, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.7778235/1, 35806-35892, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 42560-42639, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 61573-62002, mult= 5, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 105193-105255, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|103722760, 107031-108522, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|49221124, 107031-108526, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|49202649, 107031-108529, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|59873838, 107031-108530, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|14707186, 107055-108737, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|49197310, 107065-108698, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|49197512, 107065-108758, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|15461853, 107069-108567, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|14711618, 107069-108736, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|14711678, 107069-108766, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|48951714, 107074-108469, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|2792964, 107093-108643, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup gi|14697781, 107450-108431, mult= 1, priority= 4 4 features
# Delete group HintGroup gi|13765449, 107496-108602, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|4419748, 107975-108864, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|148896068, 107977-108632, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup , 108126-108431, mult= 85, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.9705135/1, 108126-108433, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.5044714/2, 108709-108793, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.1746264/1, 115047-115165, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 117379-117441, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|222772829, 119784-120420, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup , 129370-129519, mult= 90, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 147204-147330, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.11086944/2, 147206-147332, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.2031185/2, 147207-147333, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.2967384/2, 147217-147331, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 161647-162084, mult= 5, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 162337-162394, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 162566-162721, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|222703359, 165680-165935, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|222722764, 165680-165935, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup SRR026433.4480954/2, 167012-167065, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 169394-169462, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|49219970, 171832-172496, mult= 1, priority= 4 2 features
# Delete group HintGroup , 173876-173936, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 174133-174301, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 174390-174453, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.13701402/2, 174598-174653, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.12076352/1, 176997-177431, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.4424713/2, 178330-178392, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 179497-179552, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|103678618, 180045-180571, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|49192983, 180045-180577, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|49392719, 180045-180591, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|107212302, 180047-180287, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup gi|103733561, 180123-180627, mult= 1, priority= 4 3 features
# Delete group HintGroup , 183176-243334, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|10607347, 193401-194235, mult= 1, priority= 4 5 features
# Delete group HintGroup , 194294-194366, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 194296-194369, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 194297-194370, mult= 9, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 194298-194369, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 198423-198480, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup gi|133841263, 201989-205070, mult= 1, priority= 4 9 features
# Delete group HintGroup , 228239-231922, mult= 6, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.17715544/1, 230031-243435, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231897-238980, mult= 8, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231906-232860, mult= 5, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231920-238935, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.6365281/2, 231932-239036, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231949-232904, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231957-232911, mult= 17, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 231968-238982, mult= 14, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.4258664/1, 232004-234574, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232010-238861, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.8295452/1, 232070-238757, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232090-302356, mult= 6, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232092-238765, mult= 9, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232118-236786, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232121-236802, mult= 8, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.14943295/2, 232240-234167, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232247-234125, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232249-234127, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232330-238551, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232341-238536, mult= 18, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232375-233329, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232420-233978, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.7234441/2, 232428-234007, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.4073344/1, 232428-234108, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.1092162/2, 232435-233963, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232437-233965, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.17585146/2, 232439-234119, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.5549780/1, 232462-234020, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.4165637/2, 232516-233958, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.7041851/1, 232584-233005, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 232921-236728, mult= 6, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.5033479/1, 233051-241222, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.4476818/1, 233070-233281, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.705719/1, 233344-234009, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.2335027/2, 233354-234004, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.4079457/1, 233356-234004, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.4889882/2, 233565-233899, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 233993-238417, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.1505023/1, 233998-238721, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.6173485/2, 234010-238399, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234028-238396, mult= 11, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234084-238568, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.3475171/2, 234085-238906, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.2087707/1, 234092-238552, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.943704/2, 234109-238746, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234181-238665, mult= 51, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.2516152/2, 234248-234299, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234252-238676, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234252-238700, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234261-238649, mult= 8, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234269-238663, mult= 11, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.6207367/2, 234271-238665, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234318-238742, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234344-238766, mult= 22, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.10048726/2, 234506-236930, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234524-238885, mult= 85, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234530-238891, mult= 6, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.5330867/1, 234547-239031, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 234586-239004, mult= 14, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.17920707/1, 236610-243446, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236620-243457, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236696-243438, mult= 8, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.6820615/2, 236705-243573, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.2861891/1, 236740-241142, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236782-238800, mult= 10, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236833-237156, mult= 7, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236862-241261, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236878-241318, mult= 166, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.3790738/2, 236881-241290, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236887-237105, mult= 28, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236892-241314, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236914-241326, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236920-237063, mult= 12, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236939-241153, mult= 35, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236941-237023, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236941-241393, mult= 205, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236944-241372, mult= 8, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR027108.3019899/2, 236947-241368, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236947-241384, mult= 18, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236971-241393, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236995-243214, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 236996-241436, mult= 14, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.7832386/2, 236997-238738, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 237036-241389, mult= 5, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 237180-241506, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.7317584/2, 237181-241504, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238495-242905, mult= 31, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.4820715/2, 238584-241447, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.1197878/2, 238613-238807, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238622-243058, mult= 29, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023608.2948540/1, 238710-239108, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238805-243154, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238806-243247, mult= 11, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238811-238891, mult= 145, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238844-243151, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238847-243172, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238848-243156, mult= 6, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238858-243222, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238861-243311, mult= 9, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238876-243299, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238876-243318, mult= 62, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238882-241297, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238898-243321, mult= 3, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238901-243367, mult= 4, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 238913-238965, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.2610031/2, 239044-243416, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.2488339/2, 239101-243435, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.3980482/2, 239108-243470, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.21200567/2, 241327-243299, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 241373-243293, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 241375-241470, mult= 25, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023546.7832386/1, 241501-243244, mult= 1, priority= 4 1 features
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# Delete group HintGroup SRR023608.9756995/2, 344426-344492, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 412734-413866, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup , 414691-415104, mult= 2, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR026433.15529407/2, 467673-467736, mult= 1, priority= 4 1 features
# Delete group HintGroup SRR023505.6684293/2, 479279-479366, mult= 1, priority= 4 1 features
# Forced unstranded hint group to the only possible strand for 1690 groups.
# Deleted 225 groups because some hint was not satisfiable.

# Constraints/Hints:
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chr2R	b2h	intron	7477446	7477507	0	-	.	grp=gi|133841336;pri=4;src=E "7.14026e+10;0.3;42:0"
chr2R	b2h	intron	7477446	7477507	0	-	.	grp=gi|133841444;pri=4;src=E "7.14026e+10;0.3;42:0"
chr2R	b2h	intron	7477446	7477507	0	-	.	mult=39;pri=4;src=E "5.36871e+13;0.3;42:0"
chr2R	b2h	intron	7478131	7478191	0	-	.	grp=gi|253993416;pri=4;src=E "3.21008e+09;0.3;14:0"
chr2R	b2h	intron	7478131	7478191	0	-	.	mult=14;pri=4;src=E "2.09516e+11;0.3;14:0"
chr2R	b2h	intron	7478680	7479189	0	-	.	grp=gi|195958167;pri=4;src=E "2.78711e+09;0.3;13:0"
chr2R	b2h	intron	7478680	7479189	0	-	.	grp=gi|195958269;pri=4;src=E "2.78711e+09;0.3;13:0"
chr2R	b2h	intron	7478680	7479189	0	-	.	mult=12;pri=4;src=E "1.36241e+11;0.3;13:0"
chr2R	b2h	intron	7479436	7479497	0	-	.	grp=gi|195958269;pri=4;src=E "2.43004e+10;0.3;27:0"
chr2R	b2h	intron	7479436	7479497	0	-	.	grp=gi|253993368;pri=4;src=E "2.43004e+10;0.3;27:0"
chr2R	b2h	intron	7479436	7479497	0	-	.	mult=26;pri=4;src=E "6.8098e+12;0.3;27:0"
chr2R	b2h	intron	7479681	7480463	0	-	.	mult=4;pri=4;src=E "8782.79;0.3;3:14"
chr2R	b2h	intron	7487146	7492273	0	-	.	mult=3;pri=4;src=E "5274.64;0.3;2:13.663"
chr2R	b2h	intron	7479681	7503083	0	.	.	mult=12;pri=4;src=E "3.65341e+09;0.3;12:8.783"
chr2R	b2h	intron	7479681	7503083	0	-	.	grp=gi|253993368;pri=4;src=E "2.34821e+08;0.3;12:8.783"
# Predicted genes for sequence number 1 on both strands
# start gene g1
chr2R	AUGUSTUS	gene	7007533	7009385	0.2	-	.	g1
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7007533	7009385	0.2	-	.	g1.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7007533	7007533	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7007533	7008630	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7007610	7007612	.	-	0	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7008631	7008694	1	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7008812	7008865	1	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7009192	7009251	1	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7007610	7008630	1	-	1	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7008695	7008811	1	-	1	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7008695	7008811	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7008866	7009191	1	-	0	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7008866	7009191	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7009252	7009353	0.94	-	0	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7009252	7009385	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7009351	7009353	.	-	0	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7009385	7009385	.	-	.	transcript_id "g1.t1"; gene_id "g1";
# protein sequence = [MNTLSSARSVAIYVGPVRSSRSASVLAHEQAKSSITEEHKTYDEIPRPNKFKFMRAFMPGGEFQNASITEYTSAMRKR
# YGDIYVMPGMFGRKDWVTTFNTKDIEMVFRNEGIWPRRDGLDSIVYFREHVRPDVYGEVQGLVASQNEAWGKLRSAINPIFMQPRGLRMYYEPLSNIN
# NEFIERIKEIRDPKTLEVPEDFTDEISRLVFESLGLVAFDRQMGLIRKNRDNSDALTLFQTSRDIFRLTFKLDIQPSMWKIISTPTYRKMKRTLNDSL
# NVAQKMLKENQDALEKRRQAGEKINSNSMLERLMEIDPKVAVIMSLDILFAGVDATATLLSAVLLCLSKHPDKQAKLREELLSIMPTKDSLLNEENMK
# DMPYLRAVIKETLRYYPNGLGTMRTCQNDVILSGYRVPKGTTVLLGSNVLMKEATYYPRPDEFLPERWLRDPETGKKMQVSPFTFLPFGFGPRMCIGK
# RVVDLEMETTVAKLIRNFHVEFNRDASRPFKTMFVMEPAITFPFKFTDIEQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 4/4
#      E:   4 
#      W:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 137
#      E:   4 (gi|15542574,SRR023546.8642467/1)
#      W: 133 
# incompatible hint groups: 18
#      E:  18 (gi|13769068,gi|4203815,gi|15543927,gi|38623822,gi|15539951,gi|14693753,gi|14699170,...)
# end gene g1
###
# start gene g2
chr2R	AUGUSTUS	gene	7011169	7013175	0.2	-	.	g2
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7011169	7013175	0.2	-	.	g2.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7011169	7011169	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7011169	7012396	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7011376	7011378	.	-	0	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7012397	7012460	1	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7012578	7012631	1	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7012958	7013017	1	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7011376	7012396	1	-	1	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7012461	7012577	1	-	1	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7012461	7012577	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7012632	7012957	1	-	0	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7012632	7012957	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7013018	7013119	0.97	-	0	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7013018	7013175	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7013117	7013119	.	-	0	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7013175	7013175	.	-	.	transcript_id "g2.t1"; gene_id "g2";
# protein sequence = [MNTLSSARSVAIYVGPVRSSRSASVLAHEQAKSSITEEHKTYDEIPRPNKFKFMRAFMPGGEFQNASITEYTSAMRKR
# YGDIYVMPGMFGRKDWVTTFNTKDIEMVFRNEGIWPRRDGLDSIVYFREHVRPDVYGEVQGLVASQNEAWGKLRSAINPIFMQPRGLRMYYEPLSNIN
# NEFIERIKEIRDPKTLEVPEDFTDEISRLVFESLGLVAFDRQMGLIRKNRDNSDALTLFQTSRDIFRLTFKLDIQPSMWKIISTPTYRKMKRTLNDSL
# NVSQKMLKENQDALEKRRQAGEKINSNSMLERLMEIDPKVAVIMSLDILFAGVDATATLLSAVLLCLSKHPDKQAKLREELLSIMPTKDSLLNEENMK
# DMPYLRAVIKETLRYYPNGFGTMRTCQNDVILSGYRVPKGTTVLLGSNVLMKEATYYPRPDEFLPERWLRDPETGKKMQVSPFTFLPFGFGPRMCIGK
# RVVDLEMETTVAKLIRNFHVEFNRDASRPFKTMFLMEPAITFPFKFTDIEQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 4/4
#      E:   4 
#      W:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 138
#      E:   4 (gi|8120954)
#      W: 134 
# incompatible hint groups: 18
#      E:  18 (gi|13769068,gi|4203815,gi|15543927,gi|38623822,gi|15539951,gi|14693753,gi|14699170,...)
# end gene g2
###
# start gene g3
chr2R	AUGUSTUS	gene	7022936	7026812	0.3	+	.	g3
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7022936	7026812	0.3	+	.	g3.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7022936	7022936	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7022936	7023434	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7023585	7023724	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7023593	7023595	.	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7023725	7023808	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7023922	7024326	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7024618	7024681	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7024839	7024919	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7025043	7025105	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7025191	7025916	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7026004	7026214	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7026427	7026592	1	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7023593	7023724	1	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7023809	7023921	1	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7023809	7023921	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7024327	7024617	1	+	1	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7024327	7024617	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7024682	7024838	1	+	1	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7024682	7024838	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7024920	7025042	1	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7024920	7025042	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7025106	7025190	1	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7025106	7025190	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7025917	7026003	1	+	2	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7025917	7026003	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7026215	7026426	1	+	2	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7026215	7026426	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7026593	7026766	1	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7026593	7026812	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7026764	7026766	.	+	0	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7026812	7026812	.	+	.	transcript_id "g3.t1"; gene_id "g3";
# protein sequence = [MPSDANIDWLLHIYFTRREFTRCRRLIERELNRHLNPEYLYFVQGLIDREEGNHIEALRHLQKSAELNPRNIETYKEI
# GRTLYIMGRFSQALGVFREAEQRSSRQDHEIYHYLGELLYRAATTQSQKDVASQQQDEARTYFELAVQSGRKLESYVRLAELYRKDKQYQKAIEILEN
# CLHLTPENSEVLIEISVLYLKINETQKAHDRLAEVVSIERKCSPKGLLAFGAILQSRNDIDGALSKYSQIANAEPEIAELWNNIGLCFFKKQKFIVAI
# SSLRKSVWLSPLNYNALYNLSLIYIASEQYASAFHTLAAAINLRKDNAECYMLLGLCLRKLDDMENAFVALERASSMATGQQGAGRNPLVVLNFALFC
# YETGRLALSTEQYNRFMSQAQDLLLPTEYKFQATKLKSLLRISNQGNGILLDSADMGESDLGHNRATELLPDELPLEVNAVVSQN]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 9/9
#      E:   9 
#      W:   1 
# CDS introns: 8/8
#      E:   8 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 14
#      E:  12 (gi|107254585,gi|49196830,gi|49403152,gi|49197122,gi|103716833,gi|107314522,gi|49197214,...)
#      W:   2 
# incompatible hint groups: 9
#      E:   5 (gi|133848359,gi|133845984,gi|133848707,gi|133848580,gi|133848358)
#      W:   4 
# end gene g3
###
# start gene g4
chr2R	AUGUSTUS	gene	7027393	7030485	0.04	-	.	g4
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7027393	7030485	0.04	-	.	g4.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7027393	7027393	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7027393	7027856	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7027535	7027537	.	-	0	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7027857	7028035	1	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7028219	7028304	1	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7028500	7028714	1	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7028842	7029183	1	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7029356	7030188	1	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7027535	7027856	1	-	1	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7028036	7028218	1	-	1	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7028036	7028218	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7028305	7028499	1	-	1	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7028305	7028499	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7028715	7028841	1	-	2	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7028715	7028841	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7029184	7029355	1	-	0	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7029184	7029355	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7030189	7030434	0.94	-	0	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7030189	7030485	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7030432	7030434	.	-	0	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7030485	7030485	.	-	.	transcript_id "g4.t1"; gene_id "g4";
# protein sequence = [MMQETGNQMGQTHMHQRVPFNDTVLKDYHLTSTDIEKFVKLWQEYQMKNMTPQVDECQGYCQGEIYNWLRAYNSIHGY
# VSLMICIFGTIANILNIMVLTRKEMAKTPINNILKWLAVADMFVMLEYIPYTSYQYIYMGPGEKDLSYTWAVCLLVHMHFTQILHTISIGLTVTLAVW
# RYVAIRHPNGGCANFLLAHSREAILLPFILSPILCLPTYFVFQVRETYDVDKVNSEAMYHVYFDKDSVLYRFNFWIHSVLIKLLPCGILIVISAVLMH
# VLCEASRRRLKLRDYNNPAKYAIQLNLNETKSKKPPRCDRRNDRTTLLLVAVLVLFLITEFPQGLLGLLSGVMEKCFFAHCYPPFGELMDLLALINAA
# VGFVLYGLMSKQFRTTFRSLFMKRHFGSTEMTRLTRVTTTCV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 6/6
#      E:   4 
#      W:   6 
# CDS introns: 5/5
#      E:   5 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 134
#      E:   9 (gi|103654816,gi|103656234,gi|103662388,gi|103650250)
#      W: 125 
# incompatible hint groups: 4
#      E:   3 (gi|107211435,gi|49403011,gi|107307894)
#      W:   1 
# end gene g4
###
# start gene g5
chr2R	AUGUSTUS	gene	7033796	7034444	0.89	+	.	g5
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7033796	7034444	0.89	+	.	g5.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7033796	7033796	.	+	.	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7033796	7033884	.	+	.	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7033873	7033875	.	+	0	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7033885	7034017	1	+	.	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7033873	7033884	1	+	0	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7034018	7034308	1	+	0	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7034018	7034444	.	+	.	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7034306	7034308	.	+	0	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7034444	7034444	.	+	.	transcript_id "g5.t1"; gene_id "g5";
# protein sequence = [MKFTLLLLIASLACILAAPAPAAEEQQEESSVKAKRGISLGLGYHAPLVTHSHYIAAPTLVHHAPIISHAPLIAHAPL
# IAHHPVSSVSYHLPTYHSIHHF]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 20
# CDS exons: 0/2
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 1
#      E:   1 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g5
###
# start gene g6
chr2R	AUGUSTUS	gene	7035140	7037565	0.1	-	.	g6
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7035140	7037565	0.1	-	.	g6.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7035140	7035140	.	-	.	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7035140	7037016	.	-	.	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7035430	7035432	.	-	0	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7037017	7037105	1	-	.	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7035430	7037016	1	-	0	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7037106	7037282	1	-	0	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7037106	7037565	.	-	.	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7037280	7037282	.	-	0	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7037565	7037565	.	-	.	transcript_id "g6.t1"; gene_id "g6";
# protein sequence = [MEADITPLAETNGEQRQNPQESAQNQEQPQPRQDLAGKSVGSADDGVSGTVGQIMDYLEDDAGATADQDAEMGEAEYL
# DGEMPQEDESETPQTEKANEGCQESSNKKDLQESAAKDDFSKEKSGEDGEKDTDKEKKATHLHEDNNDDAEKDGDEADAEDEDDVEKPEDEDGTEEGD
# EAIEEDEDALDEDEDPNEEVEEIEPDFETGTDAEGELITGDEPGDLADVPIRERKKEEPVDEDQCRVCTSKEELVCLFKKQIDATPADMLLVICPNVS
# ILPKDFMPQFICTKCMGSLTIAIQLRKQLETTDQELRKRLSRSKNKVRRPRGYVVIDAPVTDSSEDEDELDDEFKVSDVAGTTSADSDSADSDDSEKE
# KKKPGPRGRPRKKPLKRGTDSDGEPSSAQKKKYQPSSTASVGPFECPNCDLTFSRKQSYVLHRKTHERIEHACPICGKKFKVEWAYKTHMQRHEQERA
# HFRCELCPKIFRLRAELKHHMAQRHDEHGFIYECKRCQRTFLTQQRLQRHQAVGCQRHKEDSVRIKEEQSRFKQESRSKDDRHHGNNSSKRRPGEGRD
# LFKAVAPPTTTYWSDSFSD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 241
#      E:  43 (gi|103772367,gi|107266352,gi|107318594,gi|103743817,gi|107246543,gi|103680451,gi|49195630,...)
#      W: 198 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g6
###
# start gene g7
chr2R	AUGUSTUS	gene	7042386	7042819	0.74	+	.	g7
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7042386	7042819	0.74	+	.	g7.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7042386	7042386	.	+	.	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7042386	7042559	.	+	.	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7042433	7042435	.	+	0	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7042560	7042639	1	+	.	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7042433	7042559	1	+	0	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7042640	7042731	1	+	2	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7042640	7042819	.	+	.	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7042729	7042731	.	+	0	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7042819	7042819	.	+	.	transcript_id "g7.t1"; gene_id "g7";
# protein sequence = [MSRILVAAIAFVTICLVLVSAAPAPAPPTQILDARTAIQKIIDAYNRIPGPSVVHPWEVATLIDPNTFVAQF]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 33
#      E:   1 
#      W:  32 
# incompatible hint groups: 1
#      W:   1 
# end gene g7
###
# start gene g8
chr2R	AUGUSTUS	gene	7061326	7104923	0.76	+	.	g8
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7061326	7104923	0.72	+	.	g8.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7061326	7061326	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7061326	7062310	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7062280	7062282	.	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7062311	7077844	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7077902	7095749	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7097363	7097423	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7098135	7098202	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7098311	7098377	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7101413	7101477	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7101705	7101767	1	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7062280	7062310	1	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7077845	7077901	1	+	2	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7077845	7077901	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7095750	7097362	1	+	2	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7095750	7097362	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7097424	7098134	1	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7097424	7098134	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7098203	7098310	1	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7098203	7098310	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7098378	7101412	1	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7098378	7101412	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7101478	7101704	1	+	1	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7101478	7101704	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7101768	7103719	1	+	2	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7101768	7104923	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7103717	7103719	.	+	0	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7104923	7104923	.	+	.	transcript_id "g8.t1"; gene_id "g8";
# protein sequence = [MARRKGSGRGKSTVNSRKSALETAREKTKDEPTANTSQDNKFDNNMENATTTTAKHYKTAGKQYKTNKVNNTRRATAA
# AAAAAAAAATTTVTTAATPTKKRTYRETATATIVTQRSTNKANIAAAIALAAATEATASASASATATATDATLTASKAAATAAATTDAASGNSNSSSK
# PSTSTRDKLGEVPLPTVDSNHIISNNNNNNNNNNTSNNNNNNHHSDNSISENNYEFKSRDKASLSDSKMTLQQMAAVSSNQEPVAPNVANTMSNSSII
# NSQQTTVNATPATDEAPLGDRSNISRYLHKKFKRLASTTEVDSWSATNGGGALQASGDAVRTTSLSSNSSLSPPPTTPLANGHHLMTQQQSHQQVQQQ
# QQQQQTPPPSVAIHEFSANFVNSNHVNAIGHEESIISNSGYKAAGRTRTPLANSNSNTNSTSNSNSNHAANATLSPASFAQHQQLTQPTTVSPGIPGG
# AAAPNPACEKSGRYVCQYCNLICAKPSVLEKHIRAHTNERPYPCDTCGIAFKTKSNLYKHCRSRSHAARARGLEVPADADDGLSDQDAELSNSSSELP
# SRAGSPYEEPINSPTPSPSTLSAAKSAYIQQPPLPTYMQQLPLGSPAAGTLPPTTADNHHSATAQHRQSIDYKPYKPKFHNASLYSCSSKELQQQQQQ
# LQIQQQQQQHQLAQQKLSIQLPLVQQPSLAHPTLSPSTQMKMKHHINSHQIQLQLQQQQSLLAQQSLLAAMPPGGVYYLGQPSYYNQDTAAAIHQHAL
# AIQQFQIHLAQQQQQQQQQHPPLVKATPPMQQPPSLPPQQLVRANSQISSVATAPATPTPAANLSTFASSSGGKQVNVAKVQEHISKLISQNEAIVEN
# KEILLQKKYPKQLSRSRSFNNANSNNASQHGSNASALHANNSQNNTNAQMPERETKVNLAQAIFQKQQHQLQQQQQQQITQQQQQQLEQQNYYTYIQQ
# QQECQQQQLEPPNGVVKRNAYKPGVVMTTPVKQQQQLPPPPSPLPMQTMQYRQDPATPVTKIEQPTTAVPVMPLNLSAKPKPTLVTVPVSSLSTSSLA
# PTPTTSTNPTSSSKTAPPPAQVNNSIIKNLLLNARGLAVPIGEGDDAVYSCPICASEFRSADDLKLHNSTYCQDASSSAPMSPASSPFRSNSISLSLP
# ELKSHMANSKNPLSLAKLAWSQLKTKRSSLVLSRLSAAQTPARTSTVTAPTVTASAPAPAVATVTAPSSAPAPQIEALRFVDAPLPSPGPLLGKTPLV
# DYAQQSTPRKAQDSVVITKMHEDRQFVIEAQPAKRIKTSDLVVASSSQQPTSFNFSFNNQNSSNSVPELQSSKEERLRRFTSSGGSMIPISECPDLDN
# SPKMIRTPLLSGGSFQDVSVKVNNETGSSSKERKLMALVSGSGLLGVSSGPQHFQFPPINSITAFNPLTLPPMSGGDKTTPVTPIPHVPGMPGPGSLT
# PQMPLLPPPPQQLQLPIPSSRGRSPNRKQPSPLLLGGGSGELKALSPFGGVQNVPSEFSRQPPTPAQRQALQWNSKEAPKKAPFNFLRMADNVKTTEP
# EVRHFNLENVISGKQQELPLTPLHVDTPNGNAPEETSPVASASASAKSKFLRPTSLPLKPGTFTPKRHHGITPTANTLPLISPETPRPSKSCVQLYLN
# GHAYTYLGLKCSTKMFYCTVNCPQPSYVAGMHKLSMYSVWQVCEENQPHPLGFKLKQVMALYDSRQRMLGNGSSTAMAGSGKLSYNLVASQQIVSSPS
# TSSTSSAFYQGPLKTPPTVTIAALSEANVAAKANEEAQAKKLETSPSGQPLVGGYESHEDYTYIRGRGRGRYVCSECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVR
# PFTCSHCNFSFKTKGNLTKHMQSKTHFKKCIELGINPGPMPPDSEFLDVDMDFDQQSSTSAGGRTSSMAGESDSDDYSDNESESSDTDESKSRQKEHE
# AARGLLSLSMTPPIPQSVSPYPQLQDTPLPAASPANSIGSSGSQPKRLVCSFTSPKPPFDYQKQEQYYSNPEESKPKRSVANEESAPMDLTKPRGSIL
# LISPSPVSVPAHDLPKSQAQQMHDVIFGTSGNESGFMKTLISVSDKVRISAEMEEQAKHEAEGEDVQLQTYIKEHALHQAKIKQSQFSRSYLINTLYT
# AASPVMSSSSTLFTANSRPVMSVNEVPSIEVHEVKTPEAIESPRSAPEQAPVILAQIAQEENEEPNIAEPHNANLPAAVQQPDVNEFTGVLGNPTAPP
# TSSVTATSVSTTTAAPVAPSSTANSTQPAQRTVIVGEDGFKSSTPTSKSGDLQHVSYGRGVPPAPIAGDARPTCTMCSKTFQRQHQLTLHMNIHYMER
# KFKCEPCSISFRTQGHLQKHERSEAHKNKVMMTSTFGVPTTSNPRPFECTDCKIAFRIHGHLAKHLRSKTHVQKLECLQKLPFGTYAEIERAGISLTE
# IDTSDCENSLISLKLLAQKLQEKDPGKLSSYTTPSGMMQLAQDAAGPVSQDSASEDGFSAAIASAIASLDNDSAGNTPKRASSMSEDETVANGLNHSL
# KRRLPGSFSSTGEESDNPPESSGEKRARSGQELPVPVAVPVAASAAASN]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 8/8
#      E:   6 
#      W:   8 
# CDS introns: 7/7
#      E:   7 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 878
#      E:  49 (gi|13771388,gi|13771241,gi|148889335,gi|15534554,gi|107233443,gi|49198382,gi|103663498,...)
#      W: 829 
# incompatible hint groups: 28
#      E:  10 (gi|107319252,gi|48908663,gi|49398832,gi|107329900,gi|49397661,gi|107320832,SRR023505.4436232/2,...)
#      W:  18 
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7085666	7104923	0.04	+	.	g8.t2
chr2R	AUGUSTUS	tss	7085666	7085666	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7085666	7086506	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7095750	7097362	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7096394	7096396	.	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7097363	7097423	1	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7098135	7098202	1	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7098311	7098377	1	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7101413	7101477	1	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7101705	7101767	1	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7096394	7097362	0.82	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7097424	7098134	1	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7097424	7098134	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7098203	7098310	1	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7098203	7098310	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7098378	7101412	1	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7098378	7101412	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7101478	7101704	1	+	1	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7101478	7101704	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7101768	7103719	1	+	2	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7101768	7104923	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7103717	7103719	.	+	0	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7104923	7104923	.	+	.	transcript_id "g8.t2"; gene_id "g8";
# protein sequence = [MTLQQMAAVSSNQEPVAPNVANTMSNSSIINSQQTTVNATPATDEAPLGDRSNISRYLHKKFKRLASTTEVDSWSATN
# GGGALQASGDAVRTTSLSSNSSLSPPPTTPLANGHHLMTQQQSHQQVQQQQQQQQTPPPSVAIHEFSANFVNSNHVNAIGHEESIISNSGYKAAGRTR
# TPLANSNSNTNSTSNSNSNHAANATLSPASFAQHQQLTQPTTVSPGIPGGAAAPNPACEKSGRYVCQYCNLICAKPSVLEKHIRAHTNERPYPCDTCG
# IAFKTKSNLYKHCRSRSHAARARGLEVPADADDGLSDQDAELSNSSSELPSRAGSPYEEPINSPTPSPSTLSAAKSAYIQQPPLPTYMQQLPLGSPAA
# GTLPPTTADNHHSATAQHRQSIDYKPYKPKFHNASLYSCSSKELQQQQQQLQIQQQQQQHQLAQQKLSIQLPLVQQPSLAHPTLSPSTQMKMKHHINS
# HQIQLQLQQQQSLLAQQSLLAAMPPGGVYYLGQPSYYNQDTAAAIHQHALAIQQFQIHLAQQQQQQQQQHPPLVKATPPMQQPPSLPPQQLVRANSQI
# SSVATAPATPTPAANLSTFASSSGGKQVNVAKVQEHISKLISQNEAIVENKEILLQKKYPKQLSRSRSFNNANSNNASQHGSNASALHANNSQNNTNA
# QMPERETKVNLAQAIFQKQQHQLQQQQQQQITQQQQQQLEQQNYYTYIQQQQECQQQQLEPPNGVVKRNAYKPGVVMTTPVKQQQQLPPPPSPLPMQT
# MQYRQDPATPVTKIEQPTTAVPVMPLNLSAKPKPTLVTVPVSSLSTSSLAPTPTTSTNPTSSSKTAPPPAQVNNSIIKNLLLNARGLAVPIGEGDDAV
# YSCPICASEFRSADDLKLHNSTYCQDASSSAPMSPASSPFRSNSISLSLPELKSHMANSKNPLSLAKLAWSQLKTKRSSLVLSRLSAAQTPARTSTVT
# APTVTASAPAPAVATVTAPSSAPAPQIEALRFVDAPLPSPGPLLGKTPLVDYAQQSTPRKAQDSVVITKMHEDRQFVIEAQPAKRIKTSDLVVASSSQ
# QPTSFNFSFNNQNSSNSVPELQSSKEERLRRFTSSGGSMIPISECPDLDNSPKMIRTPLLSGGSFQDVSVKVNNETGSSSKERKLMALVSGSGLLGVS
# SGPQHFQFPPINSITAFNPLTLPPMSGGDKTTPVTPIPHVPGMPGPGSLTPQMPLLPPPPQQLQLPIPSSRGRSPNRKQPSPLLLGGGSGELKALSPF
# GGVQNVPSEFSRQPPTPAQRQALQWNSKEAPKKAPFNFLRMADNVKTTEPEVRHFNLENVISGKQQELPLTPLHVDTPNGNAPEETSPVASASASAKS
# KFLRPTSLPLKPGTFTPKRHHGITPTANTLPLISPETPRPSKSCVQLYLNGHAYTYLGLKCSTKMFYCTVNCPQPSYVAGMHKLSMYSVWQVCEENQP
# HPLGFKLKQVMALYDSRQRMLGNGSSTAMAGSGKLSYNLVASQQIVSSPSTSSTSSAFYQGPLKTPPTVTIAALSEANVAAKANEEAQAKKLETSPSG
# QPLVGGYESHEDYTYIRGRGRGRYVCSECGIRCKKPSMLKKHIRTHTDVRPFTCSHCNFSFKTKGNLTKHMQSKTHFKKCIELGINPGPMPPDSEFLD
# VDMDFDQQSSTSAGGRTSSMAGESDSDDYSDNESESSDTDESKSRQKEHEAARGLLSLSMTPPIPQSVSPYPQLQDTPLPAASPANSIGSSGSQPKRL
# VCSFTSPKPPFDYQKQEQYYSNPEESKPKRSVANEESAPMDLTKPRGSILLISPSPVSVPAHDLPKSQAQQMHDVIFGTSGNESGFMKTLISVSDKVR
# ISAEMEEQAKHEAEGEDVQLQTYIKEHALHQAKIKQSQFSRSYLINTLYTAASPVMSSSSTLFTANSRPVMSVNEVPSIEVHEVKTPEAIESPRSAPE
# QAPVILAQIAQEENEEPNIAEPHNANLPAAVQQPDVNEFTGVLGNPTAPPTSSVTATSVSTTTAAPVAPSSTANSTQPAQRTVIVGEDGFKSSTPTSK
# SGDLQHVSYGRGVPPAPIAGDARPTCTMCSKTFQRQHQLTLHMNIHYMERKFKCEPCSISFRTQGHLQKHERSEAHKNKVMMTSTFGVPTTSNPRPFE
# CTDCKIAFRIHGHLAKHLRSKTHVQKLECLQKLPFGTYAEIERAGISLTEIDTSDCENSLISLKLLAQKLQEKDPGKLSSYTTPSGMMQLAQDAAGPV
# SQDSASEDGFSAAIASAIASLDNDSAGNTPKRASSMSEDETVANGLNHSLKRRLPGSFSSTGEESDNPPESSGEKRARSGQELPVPVAVPVAASAAAS
# N]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 6/6
#      E:   6 
#      W:   6 
# CDS introns: 5/5
#      E:   5 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   2 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 818
#      E:  45 (SRR023505.4436232/2,gi|15534554,gi|107233443,gi|49198382,gi|103663498,gi|103651435,...)
#      W: 773 
# incompatible hint groups: 4
#      E:   4 (gi|48908063,gi|107322456,gi|4445465)
# end gene g8
###
# start gene g9
chr2R	AUGUSTUS	gene	7104925	7106825	0.86	-	.	g9
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7104925	7106825	0.86	-	.	g9.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7104925	7104925	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7104925	7104985	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7104956	7104958	.	-	0	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7104986	7105051	1	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7105196	7105258	1	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7105651	7105710	1	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7105888	7106587	1	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7104956	7104985	1	-	0	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7105052	7105195	1	-	0	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7105052	7105195	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7105259	7105650	1	-	2	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7105259	7105650	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7105711	7105887	1	-	2	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7105711	7105887	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7106588	7106672	1	-	0	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7106588	7106825	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7106670	7106672	.	-	0	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7106825	7106825	.	-	.	transcript_id "g9.t1"; gene_id "g9";
# protein sequence = [MLQNNAVRTLQYDSEIRVAQQPSLSEPRVYDSHISITSQPRPEAPRIPLPVPIATVTGSRTLIPLSGYDCLADLPSVH
# IEQTFELNDALTGVSSENRYVVRSPLGDAIFAANESSTEKNRLLWGAGRPFQMHLLDKTHQEALVFRKKLAMGSMCCQAKSLEIWIPPGNLLGKVVQS
# PTFMQPEFFIEDESTGQLTFCVEGPVGLGFCCFSLPKDCYFKIHSGGNMRASIDHKWLASKSQYTTNIYFSDAKLTAKERALILGSAFLLEYLFFQTR
# F]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 120
#      E:  38 (gi|38624963,gi|49374926,gi|103771086,gi|41403897,gi|48953302,gi|49389561,gi|103772680,...)
#      W:  82 
# incompatible hint groups: 2
#      W:   2 
# end gene g9
###
# start gene g10
chr2R	AUGUSTUS	gene	7106976	7109983	0.26	+	.	g10
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7106976	7109983	0.26	+	.	g10.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7106976	7106976	.	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7106976	7107217	.	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7107969	7109134	.	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7108531	7108533	.	+	0	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7109135	7109288	1	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7108531	7109134	0.95	+	0	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7109289	7109365	1	+	2	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7109289	7109983	.	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7109363	7109365	.	+	0	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7109983	7109983	.	+	.	transcript_id "g10.t1"; gene_id "g10";
# protein sequence = [MKDKMSLNRSRDRDITAHQPLLDNDRHSPNHNHSIAIPNSNSNSNEYHQHPHNDRTYLVECPNGNSLINSGSQVANTI
# AGTMSAAAAAASRHSGTKYSKLENALDSPSHYGQTHHGGMDSPSHRYVGETVSIQQRMIQGQDEQLDMISDSIGTLKTVSRQIGVELDEQAVMLDDFG
# NEFDTTESKLDTTMKKVAKVLHMNNDKRQWAAILILSGLLLFVIILFIIL]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 174
#      E:  28 (gi|49216410,gi|107298974,gi|222515188,gi|103745874,gi|49002168,gi|107256212,gi|49151948,...)
#      W: 146 
# incompatible hint groups: 41
#      W:  41 
# end gene g10
###
# start gene g11
chr2R	AUGUSTUS	gene	7110316	7113890	0.4	+	.	g11
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7110316	7113890	0.4	+	.	g11.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7110316	7110316	.	+	.	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7110316	7110515	.	+	.	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7112075	7113890	.	+	.	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7112092	7112094	.	+	0	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7112092	7113621	1	+	0	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7113619	7113621	.	+	0	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7113890	7113890	.	+	.	transcript_id "g11.t1"; gene_id "g11";
# protein sequence = [MSGAQRNQDRKIVVIGAGASGVACATKLLELGFQNVLVVEAEDRLGGRIHTIPFADNVIDLGAQWCHGERDNIVYELT
# RKQDEELLESTGPVYENYECVRSNGDVVPEEVSSRLKAIVGDSLVTRQLELRHCSGSLGSYLTNKFYDTLRRPENSDIDAEVASEFFVNYQKFENSVE
# ASDTLEQVSGRGYLDYWECEGDILLNWKDKGYVELLRLLMRSRELNVEHGVLEQRLLLGTRVVKINWNRNDGRVELQMSNGETCIADHVVVTVSLGVL
# KDQHLRLFEPQLPVEKQRAIDGLAFGTVNKIFVEFPEAFWPEDWTGFTMLWRDEDLDDIRGTSRAWLEDVFGFYRVSYQPRILAGWITNESGRHMETL
# PVDEVQAGVMYLFRRFLRWKIPDPANFRTSAWYTNDNFRGSYSYRSMDTEQLGTGARELSHPLTVVATTPEKDKDSEDEAWQQSRCDRPIVQFAGEAS
# SEHYYSTVHGAVEAGWREARRLAQFYGISVSRSGTKSQL]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 212
#      E:  29 (gi|222511373,gi|222507175,gi|222510611,gi|166159994,gi|15480759,gi|15467406,gi|15478840,...)
#      W: 183 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g11
###
# start gene g12
chr2R	AUGUSTUS	gene	7113972	7120055	0.37	-	.	g12
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7113972	7120055	0.14	-	.	g12.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7113972	7113972	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7113972	7115048	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7114528	7114530	.	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115049	7115167	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115462	7115620	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115943	7116013	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7116182	7116915	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7117048	7117103	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7117382	7117444	1	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7114528	7115048	1	-	2	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7115168	7115461	1	-	2	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7115168	7115461	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7115621	7115942	1	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7115621	7115942	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7116014	7116181	1	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7116014	7116181	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7116916	7117047	1	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7116916	7117047	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7117104	7117381	1	-	2	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7117104	7117381	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7117445	7117472	0.58	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7117445	7117553	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7117470	7117472	.	-	0	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7119659	7120055	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7120055	7120055	.	-	.	transcript_id "g12.t1"; gene_id "g12";
# protein sequence = [MASDINWDPALSKLISTLKESENLSNDQEIDFLKALLESKELNALVNVHTKVAKVGRDDRLAPVLSTSAQVLYEVLEQ
# LSQHCHLNDDCKEAFHLLQDSHLQHLLFAHDAIAQKDFYPHLPEAPVEMDEDEETIKIVQLVKSNEPLGATIKTDEESGKIIIARIMHGGAADRSGLI
# HVGDEVIEVNNINVEGKTPGDVLTILQNSEGTITFKLVPADNKGAQRESKVRVRAHFDYNPDVDPYIPCKEAGLAFQRGDVLHIVAQDDAYWWQARKE
# HERSARAGLIPSRALQERRILHDRTQKNGTDLDSKPGSCASLCTTPPGSPRLPASSSTSSCRQPKTKKIMYDLTENDDFDREQIATYEEVAKLYPRPG
# VFRPIVLIGAPGVGRNELRRRLIARDPEKFRSPVPYTTRPMRTGEVAGREYIFVAREKMDADIEAGKFVEHGEYKGHLYGTSAESVKSIVNAGCVCVL
# SPHYQAIKTLRTAQLKPFLIHVKPPELDILKATRTEARAKSTFDEANARSFTDEEFEDMIKSAERIDFLYGHFFDVELVNGELVNAFEQLVQNVQRLE
# NEPVWAPSMWVQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 7/7
#      E:   6 
#      W:   7 
# CDS introns: 6/6
#      E:   6 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 274
#      E:  36 (gi|8115895,gi|92010560,gi|49149914,gi|107212739,gi|49391075,gi|103754523,gi|107296563,...)
#      W: 238 
# incompatible hint groups: 3
#      E:   1 
#      W:   2 
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7113972	7120055	0.23	-	.	g12.t2
chr2R	AUGUSTUS	tts	7113972	7113972	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7113972	7115048	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7114528	7114530	.	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115049	7115167	1	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115345	7115620	0.99	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7115943	7116013	1	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7116182	7116915	1	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7117048	7117103	1	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7117382	7117444	1	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7114528	7115048	1	-	2	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7115168	7115344	0.99	-	2	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7115168	7115344	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7115621	7115942	1	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7115621	7115942	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7116014	7116181	1	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7116014	7116181	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7116916	7117047	1	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7116916	7117047	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7117104	7117381	1	-	2	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7117104	7117381	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7117445	7117472	0.48	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7117445	7117553	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7117470	7117472	.	-	0	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7119659	7120055	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7120055	7120055	.	-	.	transcript_id "g12.t2"; gene_id "g12";
# protein sequence = [MASDINWDPALSKLISTLKESENLSNDQEIDFLKALLESKELNALVNVHTKVAKVGRDDRLAPVLSTSAQVLYEVLEQ
# LSQHCHLNDDCKEAFHLLQDSHLQHLLFAHDAIAQKDFYPHLPEAPVEMDEDEETIKIVQLVKSNEPLGATIKTDEESGKIIIARIMHGGAADRSGLI
# HVGDEVIEVNNINVEGKTPGDVLTILQNSEGTITFKLVPADNKGAQRESKVRVRAHFDYNPDVDPYIPCKEAGLAFQRGDVLHIVAQDDAYWWQARKE
# HERSARAGLIPSRALQERRILHDRTQKNGTDLDSKQNDDFDREQIATYEEVAKLYPRPGVFRPIVLIGAPGVGRNELRRRLIARDPEKFRSPVPYTTR
# PMRTGEVAGREYIFVAREKMDADIEAGKFVEHGEYKGHLYGTSAESVKSIVNAGCVCVLSPHYQAIKTLRTAQLKPFLIHVKPPELDILKATRTEARA
# KSTFDEANARSFTDEEFEDMIKSAERIDFLYGHFFDVELVNGELVNAFEQLVQNVQRLENEPVWAPSMWVQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 7/7
#      E:   6 
#      W:   7 
# CDS introns: 6/6
#      E:   6 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 263
#      E:  36 (gi|8115895,gi|92010560,gi|49149914,gi|107212739,gi|49391075,gi|103754523,gi|107296563,...)
#      W: 227 
# incompatible hint groups: 14
#      E:   1 
#      W:  13 
# end gene g12
###
# start gene g13
chr2R	AUGUSTUS	gene	7120714	7121285	0.34	-	.	g13
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7120714	7121285	0.34	-	.	g13.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7120714	7120714	.	-	.	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7120714	7121285	.	-	.	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7120769	7120771	.	-	0	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7120769	7121209	1	-	0	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7121207	7121209	.	-	0	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7121285	7121285	.	-	.	transcript_id "g13.t1"; gene_id "g13";
# protein sequence = [MRCDLQVHFLLLLAIGAWRTEAHSLGGGGIGAVGGVAAIGGVGGIGGVQQVPVVQQVPVVQQVPVVQQVPLIQQQPQA
# LGLAGGGGFIGGGIGGGAGFGRYKESYRVRARGFGGGYRARYDKKFGGGFAGLGAAGGAGLAGGGLLG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 36
#      E:   2 (gi|114073115,gi|114058741)
#      W:  34 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g13
###
# start gene g14
chr2R	AUGUSTUS	gene	7121416	7121944	0.33	+	.	g14
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7121416	7121944	0.33	+	.	g14.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7121416	7121416	.	+	.	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7121416	7121944	.	+	.	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7121508	7121510	.	+	0	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7121508	7121915	1	+	0	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7121913	7121915	.	+	0	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7121944	7121944	.	+	.	transcript_id "g14.t1"; gene_id "g14";
# protein sequence = [MLWQTVYLLVLACAVVSTTPILSSVDEENIRRPRHIGGFGGGGVVGGGIVGGGIIGGGGVAAPIVAAPAIQTVPVVST
# VPIITTVPVIQTIPSYGYGYGGGYPVGGGLGGLGGIGGGGFVGGAVGFAKFKGGFFG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 0
# CDS exons: 0/1
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 0
# incompatible hint groups: 0
# end gene g14
###
# start gene g15
chr2R	AUGUSTUS	gene	7122756	7123248	0.95	+	.	g15
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7122756	7123248	0.95	+	.	g15.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7122756	7122756	.	+	.	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7122756	7123248	.	+	.	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7122795	7122797	.	+	0	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7122795	7123157	1	+	0	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7123155	7123157	.	+	0	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7123248	7123248	.	+	.	transcript_id "g15.t1"; gene_id "g15";
# protein sequence = [MDHKWIIFFFSIAALLLCNFVRADETETEVVQEKPSSIQLLDAGETAQSDSTDENVRKVRQYFGPPPFGPPPPPFFGP
# PPPPYYGGGFGGGFGGGFQRTRVVTRTRYRGRGGYYGGGFYG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 41
#      W:  41 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   2 (gi|15515915,gi|15511419)
# end gene g15
###
# start gene g16
chr2R	AUGUSTUS	gene	7123712	7124185	0.93	-	.	g16
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7123712	7124185	0.93	-	.	g16.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7123712	7123712	.	-	.	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7123712	7124185	.	-	.	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7123772	7123774	.	-	0	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7123772	7124113	1	-	0	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7124111	7124113	.	-	0	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7124185	7124185	.	-	.	transcript_id "g16.t1"; gene_id "g16";
# protein sequence = [MKFLALSLALIAVISCSLAIPVDFENGEPLTLLELEAEQEPQVDELEGERVVRGLGGLGGLGGKFGGFGGLGGLKGGF
# GGLGHGFGGGFGGHGFGGGFGGLGSFKSLFGKKFR]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 27
#      E:  18 (gi|14704810,gi|114068214,gi|14708023,gi|103734451,gi|103653387,gi|107215049,gi|49380171,...)
#      W:   9 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   2 (gi|15511419,gi|222485100)
# end gene g16
###
# start gene g17
chr2R	AUGUSTUS	gene	7124680	7125185	0.29	-	.	g17
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7124680	7125185	0.29	-	.	g17.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7124680	7124680	.	-	.	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7124680	7125185	.	-	.	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7124765	7124767	.	-	0	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7124765	7125121	1	-	0	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7125119	7125121	.	-	0	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7125185	7125185	.	-	.	transcript_id "g17.t1"; gene_id "g17";
# protein sequence = [MNYCALNCILIAIPILLLLMDICEAKPWWPTNEAGYDASLDPIAWSRSFVPDQVRKTRYNVIPEPRSKHRHRQSSKLW
# YQKAITTYPKQFNVNAKYYKRYLRRRQKLAARERFANWRQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 3
#      E:   3 (gi|107219867,gi|133853042,gi|49370472)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g17
###
# start gene g18
chr2R	AUGUSTUS	gene	7125617	7126505	0.43	-	.	g18
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7125617	7126505	0.43	-	.	g18.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7125617	7125617	.	-	.	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7125617	7126505	.	-	.	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7125692	7125694	.	-	0	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7125692	7126468	1	-	0	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7126466	7126468	.	-	0	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7126505	7126505	.	-	.	transcript_id "g18.t1"; gene_id "g18";
# protein sequence = [MTKFVAKKAILLLSLLLLGTAESKPLDAEQQHIDDQHVRKERQLKMAGSADPDVKMVANVTPATGSQPMSMTMGVPMN
# QMALSSVGGQLVRYPNYPGLIYPGLAPAPGLNGVPGLQTNIANNYPSYPDPNLTGSVPGFNPFGSFGYPGVAPMYGNSLMYPNPQLPNGFVPNPAVDN
# FQSLNNIVNMANVQGLAGGSSGIYPAPQGFGGVSPGLYPAPQGFGGANPGLYPAPQVNMQGLYPPSGGFLERMNMQGYAPGF]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 9
#      E:   9 (gi|38626609,gi|38627459,gi|15317310,gi|15469049,gi|222512102,gi|222486318,gi|222486484,...)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g18
###
# start gene g19
chr2R	AUGUSTUS	gene	7127002	7127635	0.52	-	.	g19
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7127002	7127635	0.52	-	.	g19.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7127002	7127002	.	-	.	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7127002	7127635	.	-	.	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7127173	7127175	.	-	0	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7127173	7127523	1	-	0	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7127521	7127523	.	-	0	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7127635	7127635	.	-	.	transcript_id "g19.t1"; gene_id "g19";
# protein sequence = [MKCIISIVVISMIFGLSLIQAAPIAKDAQNPGFVSATDITGEPVRQKRSSADYYQGDYFICYPKSAVYGKHGYGATNR
# RSYDSEDYAPHYLADDPLVVRQARADARRAAYTDSFGK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 55
#      E:   2 (gi|133839759,gi|133839758)
#      W:  53 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g19
###
# start gene g20
chr2R	AUGUSTUS	gene	7129243	7129755	0.09	-	.	g20
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7129243	7129755	0.09	-	.	g20.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7129243	7129243	.	-	.	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7129243	7129755	.	-	.	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7129306	7129308	.	-	0	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7129306	7129671	1	-	0	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7129669	7129671	.	-	0	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7129755	7129755	.	-	.	transcript_id "g20.t1"; gene_id "g20";
# protein sequence = [MKQYLVLALVFAAILAMISGHPLEEQKITLEDAEAQPGIDDGTGVRAARHFGGGFGRGGYCCGGGGGFRRGGFGGGGY
# GGGGYGGGGYPGGGFGGYPRGGFGGGSASASASASASSSWGRK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 27
#      E:   6 (gi|3626422,gi|15452613,gi|15454121,gi|3475200,gi|164481773,gi|15465777)
#      W:  21 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g20
###
# start gene g21
chr2R	AUGUSTUS	gene	7131756	7132706	0.99	+	.	g21
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7131756	7132706	0.99	+	.	g21.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7131756	7131756	.	+	.	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7131756	7132706	.	+	.	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7131795	7131797	.	+	0	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7131795	7132508	1	+	0	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7132506	7132508	.	+	0	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7132706	7132706	.	+	.	transcript_id "g21.t1"; gene_id "g21";
# protein sequence = [MYLRARLALLSLLFLMVSGQRSKSRSERPQGRTLGLLTPLLLGGGGPLFDVPLPAGPPIRPGGGSSSAAGGGTQSDSY
# YGGSYPSYGYRPNYGYGYPNYGYNYGYPVFGYGYGQNYYRPSYYNYGGYQRPQPYYGYRPTYSSSGTAGSGGYPSYSSSAVISSSPTNSAVGSASGAG
# AVSGGGTPQLSTAQQAQLAGLLGQALGSSLRPLLANGGGAAGATGAGANPQALSGLLSLLG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 0
# CDS exons: 0/1
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 0
# incompatible hint groups: 0
# end gene g21
###
# start gene g22
chr2R	AUGUSTUS	gene	7132846	7133327	0.7	+	.	g22
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7132846	7133327	0.7	+	.	g22.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7132846	7132846	.	+	.	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7132846	7133327	.	+	.	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7132949	7132951	.	+	0	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7132949	7133263	0.89	+	0	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7133261	7133263	.	+	0	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7133327	7133327	.	+	.	transcript_id "g22.t1"; gene_id "g22";
# protein sequence = [MVSMRFTFFLLVVWTLVGCVFSNPVNEDPAAAATLDDVADLGGQEAKEGNRPARWLSGGWGGGWNTGWGGGWSGSWNG
# GWNGGWNSGWSNSYSPWRNSYSSYWW]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 0
# CDS exons: 0/1
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 0
# incompatible hint groups: 0
# end gene g22
###
# start gene g23
chr2R	AUGUSTUS	gene	7133416	7134153	0.14	+	.	g23
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7133416	7134153	0.14	+	.	g23.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7133416	7133416	.	+	.	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7133416	7134153	.	+	.	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7133543	7133545	.	+	0	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7133543	7133830	0.99	+	0	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7133828	7133830	.	+	0	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7134153	7134153	.	+	.	transcript_id "g23.t1"; gene_id "g23";
# protein sequence = [MPVDSVFGSLDRIKDRSFGSKSYSCTKQRSKHNRRNLSTKSLTRSICKMRLILLSIVGLLCLAYALALNENAAALEDL
# VNLGAEHAESGVRDARG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 59
#      E:   4 (gi|3868103,gi|3864866,gi|3947376,gi|3865746)
#      W:  55 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g23
###
# start gene g24
chr2R	AUGUSTUS	gene	7135496	7136113	0.75	+	.	g24
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7135496	7136113	0.75	+	.	g24.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7135496	7135496	.	+	.	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7135496	7136113	.	+	.	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7135693	7135695	.	+	0	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7135693	7136007	1	+	0	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7136005	7136007	.	+	0	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7136113	7136113	.	+	.	transcript_id "g24.t1"; gene_id "g24";
# protein sequence = [MRLTLLALIGVLCLACAYALDDSENNDQVVGLLDVADQGANHANDGAREARQLGGWGGGWGGRGGWGGRGGWGGRGGW
# GGRGGWGGGWGGRGGWGGRGGGWYGR]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 98
#      E:  54 (gi|15479471,gi|15475532,gi|15479658,gi|15479838,gi|15513397,gi|15466951,gi|15480676,...)
#      W:  44 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g24
###
# start gene g25
chr2R	AUGUSTUS	gene	7137576	7139260	0.51	+	.	g25
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7137576	7139260	0.51	+	.	g25.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7137576	7137576	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7137576	7138183	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7137883	7137885	.	+	0	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7138184	7138239	1	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7138430	7138489	1	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7139106	7139176	1	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7137883	7138183	0.97	+	0	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7138240	7138429	1	+	2	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7138240	7138429	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7138490	7139105	1	+	1	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7138490	7139105	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7139177	7139227	1	+	0	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7139177	7139260	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7139225	7139227	.	+	0	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7139260	7139260	.	+	.	transcript_id "g25.t1"; gene_id "g25";
# protein sequence = [MDSFLQVQKSTIALLGFDLFSENREMWKRPYRAMNVFSIAAIFPFILAAVLHNWKNVLLLADAMVALLITILGLFKFS
# MILYLRRDFKRLIDKFRLLMSNEAEQGEEYAEILNAANKQDQRMCTLFRTCFLLAWALNSVLPLVRMGLSYWLAGHAEPELPFPCLFPWNIHIIRNYV
# LSFIWSAFASTGVVLPAVSLDTIFCSFTSNLCAFFKIAQYKVVRFKGGSLKESQATLNKVFALYQTSLDMCNDLNQCYQPIICAQFFISSLQLCMLGY
# LFSITFAQTEGVYYASFIATIIIQAYIYCYCGENLKTESASFEWAIYDSPWHESLGAGGASTSICRSLLISMMRAHRGFRITGYFFEANMEAFSSIVR
# TAMSYITMLRSFS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 77.8
# CDS exons: 4/4
#      E:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 6
#      E:   6 (gi|103665857,gi|103654837,gi|103653257,gi|103659339,gi|103660833,SRR023505.3704510/1)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g25
###
# start gene g26
chr2R	AUGUSTUS	gene	7139262	7140915	0.78	-	.	g26
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7139262	7140915	0.78	-	.	g26.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7139262	7139262	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7139262	7139787	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7139632	7139634	.	-	0	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7139788	7139873	1	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7139950	7140220	1	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7139632	7139787	1	-	0	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7139874	7139949	1	-	1	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7139874	7139949	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7140221	7140396	0.87	-	0	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7140221	7140399	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7140394	7140396	.	-	0	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7140862	7140915	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7140915	7140915	.	-	.	transcript_id "g26.t1"; gene_id "g26";
# protein sequence = [MSLTHASAAALVLALCCLSFIQAQPQRGLPPPRGNSFDANAVILKQNFDLNPDGSYQYNYETSNGIRADEAGYLKNPG
# SQIEAQVMQGSYSYTGPDGVVYTITYIADENGYRAEGAHIPTPPPVRAAAAPGRFFK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 8
#      E:   8 (gi|31297657,gi|133839695,gi|133839433,gi|133839608,gi|103773772,gi|133839434,SRR027108.5310351/2)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g26
###
# start gene g27
chr2R	AUGUSTUS	gene	7142676	7143487	1	+	.	g27
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7142676	7143487	1	+	.	g27.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7142676	7142676	.	+	.	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7142676	7143487	.	+	.	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7142750	7142752	.	+	0	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7142750	7143394	1	+	0	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7143392	7143394	.	+	0	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7143487	7143487	.	+	.	transcript_id "g27.t1"; gene_id "g27";
# protein sequence = [MFKIAICLLALVGGSLAASIGQVDSTTEKREIVPLLRFETNKNPDGSFHFSYEGGDQSVRQEQGVIENAGTEDEALEV
# SGMYSYIDADGNTVEVHYTAGKNGFVPIGTIIPKEITELAKSAALLPKVSEDEQKYRKARSQELDNKEVAVEKEAAPVEKEEPVVAKESVVVEKSEPL
# PAESQVAPVQVVLDAAPQAEVKTAIEAETEKKVETKTA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 91
#      E:  13 (gi|166160764,gi|15469090,gi|15471952,gi|15326097,gi|14706465,gi|41405541,gi|3946253,...)
#      W:  78 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g27
###
# start gene g28
chr2R	AUGUSTUS	gene	7143586	7146708	0.09	+	.	g28
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7143586	7146708	0.09	+	.	g28.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7143586	7143586	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7143586	7143971	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7144025	7144314	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7144082	7144084	.	+	0	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7144315	7144375	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7144780	7144829	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7145184	7145238	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7145358	7145567	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7145803	7145859	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7145928	7145986	1	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7144082	7144314	0.78	+	0	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7144376	7144779	1	+	1	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7144376	7144779	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7144830	7145183	1	+	2	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7144830	7145183	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7145239	7145357	1	+	2	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7145239	7145357	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7145568	7145802	1	+	0	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7145568	7145802	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7145860	7145927	1	+	2	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7145860	7145927	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7145987	7146181	1	+	0	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7145987	7146708	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7146179	7146181	.	+	0	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7146708	7146708	.	+	.	transcript_id "g28.t1"; gene_id "g28";
# protein sequence = [MRSEISCSMVHDLLESQKCKFVQTTPDCLINMNLFNYLGWHYCKVDVRNSFNSFWSVLGMFLITIYVFWMMQITIKNY
# FCPTLMVIADLLRMNESTAGVTVLAIANGSPDFFTAIASRVQTSKHSFLSCMSQAMFLHIFVAGLVILTKPFNMRANTYLRDFGFLFLNTVYMDYIHK
# RPKGISWLAALPSAFIFVGYVVVAIVDQHLLIARIQKMEQRQLNVAEALQLEELKPQKEMPLKRQEIDRPSIGHGSRNKRIFRQFWNTVAEFDKDRFH
# RGTFLVKLYLIVKQPIDMLLRILIPKVDMEAPQYGWSKLLFNIQVVLVPTYIAYIIVRGYSIAGLAVYMIALILMIPVATLIFFLTRTDTPPIFFRFT
# SGVGFMAAVFLIFCLTTEVNAMFFTMATILQVSQEFSLATAICWALSSNDLVANLSLAHQGWPRMAMTATFSAPVFASFVFLALPLVVNSFVNAPGNI
# FPTEGGFGETVCIFLEVGMGFSMLSVLTTNFKLRRACGFLLVSYYIFFVGVLILLEKGVIHAYGV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 88.2
# CDS exons: 7/7
#      E:   6 
#      W:   3 
# CDS introns: 6/6
#      E:   6 
# 5'UTR exons and introns: 1/3
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 34
#      E:  12 (SRR026433.7650824/2,gi|160422629,gi|103653683,gi|103655285,gi|169246478,SRR026433.10387157/1,...)
#      W:  22 
# incompatible hint groups: 7
#      E:   7 (gi|103663867,gi|103658167,gi|103653616,gi|103653719,gi|13771284,gi|103652107,gi|103653698)
# end gene g28
###
# start gene g29
chr2R	AUGUSTUS	gene	7146720	7147405	0.39	-	.	g29
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7146720	7147405	0.39	-	.	g29.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7146720	7146720	.	-	.	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7146720	7147205	.	-	.	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7146822	7146824	.	-	0	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7147206	7147332	0.67	-	.	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7146822	7147205	0.67	-	0	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7147333	7147344	0.67	-	0	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7147333	7147405	.	-	.	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7147342	7147344	.	-	0	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7147405	7147405	.	-	.	transcript_id "g29.t1"; gene_id "g29";
# protein sequence = [MCKILPLFVLAVMVACGQALPVDPEREPVAILKSEIIKTEEGYTSAYVGADGISRNEEAFLVDKGTDEEALEVKGSYK
# YINEDGQEVEVFYTAGKNGFVPYGSIINPEITAVAEAAKDLPKVEKVEKAGRP]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 56
#      E:   1 
#      W:  55 
# incompatible hint groups: 2
#      W:   2 
# end gene g29
###
# start gene g30
chr2R	AUGUSTUS	gene	7148876	7154360	0.01	+	.	g30
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7148876	7154360	0.01	+	.	g30.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7148876	7148876	.	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7148876	7150014	.	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7152562	7153270	.	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7152821	7152823	.	+	0	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7153271	7153615	1	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7152821	7153270	1	+	0	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7153616	7154275	1	+	0	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7153616	7154360	.	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7154273	7154275	.	+	0	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7154360	7154360	.	+	.	transcript_id "g30.t1"; gene_id "g30";
# protein sequence = [MSVARTPRFRHLRWVACLLASLWFSVSQAQLPGTGFQGQRPQVPPLQPLQQQANPFQRRQPNPVQGQGLFPGQRNPLN
# PLAPPLTGAALQNPYTRYNQYQQQNYVPITAYQNELNLDGSFSYGYSSADGTTAQAQGYVKNLGYGEGVEAQVIQGSYSYTSPEGTPITVRYIADENG
# FRAEGTGIPSSPQYFAGAQPYQQGLLNPNLNPYQTPFRQLPPPLPNAPFRPQLPGQQPLTPLQQQQQQQQQQLQQQRGFQQQQQPNSGQYQPEQPFNQ
# LHSGNLPGQYAGQFGQQSFGSNLTAQQAQQQQNLNQQQQQQQQQQQQQQQQQKEQQNEQQQQALITQQLRGRPNNLVDPYGYNQYGRRFKKSPKK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 71.4
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 2/3
#      E:   2 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 85
#      E:  17 (gi|133842805,gi|133842587,gi|133842735,gi|133842660,gi|222741584,gi|222739188,gi|15467543,...)
#      W:  68 
# incompatible hint groups: 5
#      E:   5 (gi|13771283,gi|133842736,gi|133842588,gi|133842806,gi|133842661)
# end gene g30
###
# start gene g31
chr2R	AUGUSTUS	gene	7154416	7160535	0.49	-	.	g31
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7154416	7160535	0.49	-	.	g31.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7154416	7154416	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7154416	7154806	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7154595	7154597	.	-	0	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7154807	7155172	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155218	7155302	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155369	7155491	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155525	7155583	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155641	7155700	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155734	7155789	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7155847	7155903	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156045	7156100	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156158	7156212	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156246	7156307	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156413	7156504	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156571	7156625	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156659	7156746	0.98	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156786	7156864	0.98	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7156991	7157054	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7157776	7159881	1	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7154595	7154806	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155173	7155217	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155173	7155217	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155303	7155368	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155303	7155368	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155492	7155524	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155492	7155524	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155584	7155640	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155584	7155640	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155701	7155733	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155701	7155733	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155790	7155846	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155790	7155846	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7155904	7156044	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7155904	7156044	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156101	7156157	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156101	7156157	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156213	7156245	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156213	7156245	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156308	7156412	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156308	7156412	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156505	7156570	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156505	7156570	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156626	7156658	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156626	7156658	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156747	7156785	0.98	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156747	7156785	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7156865	7156990	1	-	2	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7156865	7156990	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7157055	7157775	1	-	0	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7157055	7157775	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7159882	7159896	1	-	0	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7159882	7160535	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7159894	7159896	.	-	0	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7160535	7160535	.	-	.	transcript_id "g31.t1"; gene_id "g31";
# protein sequence = [MALKWALVITTLVVAQAAKLDNKYLPPPASAASAGGSPGAGLQGPGGGFGGGGGFGGGGAGGGYGGGGGGGPAGGFGG
# GPGGGGAGGFGGGNNGLGGFANGRPIAPGGGGGGGGAPAPRPSPSGGAPPTSGPPIPILSFVNENDGDGNYRFSYETGNGIKAQEEGTVKNKGSENEI
# PSVMGSYSYTNPEGELVEIMYTADENGFVPSGNALPTPPPIPEAIAKSLAAQGISILPGGGYSGGPGGQGAGGGGGGGSGYGGGSGFGGGGAGGGSGG
# GGGGAGGGGGYGSGGGSGRGGAPGGPGAPGGGGFGGQGGGGGYGGAGGGAGRGGSPGGPGSPGGGGFGGQGGAGGGYGGGGGGGRGGGGAPGAPGSPG
# GGGFGGQGGGGGFGGGGGRGGAPGAPGSPGGGGYGGQGGAGGGYGGGGGRGGGGAPGAPGAPGSPGGGGFGGQGGGGGFGGGGGRGGAPGAPGSPGGG
# GFGGQGGGGGYGGGAGRGGAPGAPGSPGGGGFGGQGGGGGFGAGGGRGGAGGAPGGPGSPGGPGYGGGAGGPGGAGGRPGGPGLPGNQYVPPAAGGGA
# PGSPGRPGSGGVPGTGSQYIPPAPGAPGGGRGNGEFNPQTGYSY]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 45.7
# CDS exons: 8/17
#      E:   8 
# CDS introns: 6/16
#      E:   6 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 11
#      E:  11 (gi|133849775,gi|133849890,gi|164498212,gi|164498150,gi|133849891,gi|160422482,gi|15473591,...)
# incompatible hint groups: 3
#      E:   3 (gi|15512095,gi|15483678,gi|15532940)
# end gene g31
###
# start gene g32
chr2R	AUGUSTUS	gene	7161357	7162855	0.45	-	.	g32
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7161357	7162855	0.45	-	.	g32.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7161357	7161357	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7161357	7161647	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7161619	7161621	.	-	0	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7161648	7162084	1	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7162337	7162394	1	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7162570	7162725	1	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7161619	7161647	1	-	2	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7162085	7162336	1	-	2	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7162085	7162336	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7162395	7162569	1	-	0	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7162395	7162569	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7162726	7162737	1	-	0	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7162726	7162855	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7162735	7162737	.	-	0	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7162855	7162855	.	-	.	transcript_id "g32.t1"; gene_id "g32";
# protein sequence = [MDNIDEDLTPEQIAVLQKAFNSFDHQKTGSIPTEMVADILRLMGQPFDRQILDELIDEVDEDKSGRLEFEEFVQLAAK
# FIVEEDDEAMQKELREAFRLYDKQGNGYIPTSCLKEILKELDDQLTEQELDIMIEEIDSDGSGTVDFDEFMEMMTGE]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 4/4
#      E:   4 
#      W:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 103
#      E:  29 (gi|49382977,gi|107301786,gi|48952344,gi|107253073,gi|107269236,gi|222603921,gi|222565638,...)
#      W:  74 
# incompatible hint groups: 3
#      W:   3 
# end gene g32
###
# start gene g33
chr2R	AUGUSTUS	gene	7165461	7165945	0.91	-	.	g33
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7165461	7165945	0.91	-	.	g33.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7165461	7165461	.	-	.	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7165461	7165831	.	-	.	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7165490	7165492	.	-	0	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7165832	7165899	1	-	.	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7165490	7165831	1	-	0	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7165900	7165911	1	-	0	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7165900	7165945	.	-	.	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7165909	7165911	.	-	0	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7165945	7165945	.	-	.	transcript_id "g33.t1"; gene_id "g33";
# protein sequence = [MKFFIAFACLLAVALANEDANVLRAEQQVNVDGFAYAVELDNSVNVQQKGDLNGEEWVVKGSQSWTSPENVPVSIQYI
# ADANGYQVVSANPPLPTPPPIPEAIQRSLEYIAAHPPSQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 76
#      E:  37 (gi|3944893,gi|14634309,gi|20145104,gi|107257832,gi|107294503,gi|103725196,gi|49202002,...)
#      W:  39 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g33
###
# start gene g34
chr2R	AUGUSTUS	gene	7166398	7167135	0.93	-	.	g34
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7166398	7167135	0.93	-	.	g34.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7166398	7166398	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7166398	7166486	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7166441	7166443	.	-	0	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7166487	7166550	1	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7166631	7166695	1	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7166784	7166843	1	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7167014	7167067	1	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7166441	7166486	1	-	1	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7166551	7166630	1	-	0	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7166551	7166630	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7166696	7166783	1	-	1	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7166696	7166783	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7166844	7167013	1	-	0	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7166844	7167013	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7167068	7167100	1	-	0	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7167068	7167135	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7167098	7167100	.	-	0	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7167135	7167135	.	-	.	transcript_id "g34.t1"; gene_id "g34";
# protein sequence = [MAFCIAVIGKDNAPLYLTTSDMEQELELQYHVNAALDVVEEKCLIGKGAPESKELYLGLLYSTENHKIYGFVTNTRVK
# FIVVIDSSNVALRENEVRAIFRNLHLLYTDAICNPFYIPGESLTSKKFDRAVQKLMSGTA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 46
#      E:   7 (gi|13758630,gi|107306337,gi|49205297)
#      W:  39 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   1 (gi|49400564)
#      W:   1 
# end gene g34
###
# start gene g35
chr2R	AUGUSTUS	gene	7167236	7168186	0.91	+	.	g35
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7167236	7168186	0.91	+	.	g35.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7167236	7167236	.	+	.	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7167236	7168186	.	+	.	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7167383	7167385	.	+	0	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7167383	7167919	1	+	0	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7167917	7167919	.	+	0	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7168186	7168186	.	+	.	transcript_id "g35.t1"; gene_id "g35";
# protein sequence = [MALQIAQNNRDGQQLVGADQGKVEVYVLFANTTYRTLDLYWVCERERENMYLTLKPFEEVRVNTFTTHSWLFRDYYTG
# ERMHVRSQRIFQPIRVRVPKSQQSPDQLVDVRSEVLIHFPMRSLRENCLWLVARWLIRTSNAPRRIIHGYHIPSTLKQQLLSLLTCIESYSRVAGTRR
# RR]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 112
#      E:  21 (gi|222751851,gi|222764810,gi|15534097,gi|222759915,gi|222736365,gi|222754115,gi|222739223,...)
#      W:  91 
# incompatible hint groups: 3
#      E:   2 (gi|222733996,gi|38626633)
#      W:   1 
# end gene g35
###
# start gene g36
chr2R	AUGUSTUS	gene	7168242	7171565	0.45	-	.	g36
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7168242	7171565	0.22	-	.	g36.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7168242	7168242	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7168242	7168655	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7168612	7168614	.	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7168656	7168778	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7168885	7168942	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169138	7169199	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169396	7169464	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169605	7169668	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169774	7169833	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7170829	7170890	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7171111	7171188	1	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7168612	7168655	1	-	2	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7168779	7168884	1	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7168779	7168884	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7168943	7169137	1	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7168943	7169137	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169200	7169395	1	-	1	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169200	7169395	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169465	7169604	1	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169465	7169604	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169669	7169773	1	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169669	7169773	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169834	7170828	1	-	2	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169834	7170828	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7170891	7171110	1	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7170891	7171110	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7171189	7171230	0.99	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7171189	7171565	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7171228	7171230	.	-	0	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7171565	7171565	.	-	.	transcript_id "g36.t1"; gene_id "g36";
# protein sequence = [MLTHKTCQARKKMQVSFVIRDAEEKQHRNGVNALQLDANNGKLYSAGRDAIIRVWNTRTDSSEKYIQSMEHHNDWVND
# IVLCCNGRNLISASCDTTVKVWNAQKGFCMSTLRTHRDYVQALAYAKDREQVASAGLDKAIFLWDVNTLTALTASNNTVTTSSLTGSKDSIYSLAMNP
# SGTVIVSGSTENILRIWDPRTCMRRMKLRGHTENVRCLVVSPDGNQVVSGSSDGTIKVWNLGQQRCVQTIHVHKEGVWSLLMSENFQYIISGSRDRNI
# IVTEMRNPSNKTLVCEEQAPVLSLGYNIDKTGVWATTWNSDIRCWKLPMYDRCTLNSSGGMDAQWTQGGTEVACIKGGAAIKECAVLNDKRYIITKDS
# QDQVVVYDVLRVVKKEQLGAVDFEAEVKKRNKQVYIPNWFTVDLKTGMPTIVLGQEEVDCFSAWVSIEAGLPECVDPTTEIKINYGKLLLEALLEYWT
# PPHSIPPNEMEPDMHGNGYFQVPKHTPVIFSEVGGRTVCRLLVRDAAGDSESTLLHETAPQWVTDVVIEKNIPKFLKIPFFLQPHPQMTKPERTKKDR
# LVANEFIQCRKVCEHVLEKVLNAETTPSGGNANNSLQNSQSDANSEGSQLPAEERIELWCNDVVVDPNMDLRTVRHFIWKQSTDLTFQYKTKQNFNYD
# GSIGDSLERVTRKY]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 9/9
#      E:   8 
#      W:   9 
# CDS introns: 8/8
#      E:   8 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 295
#      E:  47 (gi|103765417,gi|49361334,gi|49400130,gi|41403899,gi|103683519,gi|15062916,gi|4423431,...)
#      W: 248 
# incompatible hint groups: 18
#      E:   2 (gi|38626633,gi|9990873)
#      W:  16 
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7168242	7171565	0.23	-	.	g36.t2
chr2R	AUGUSTUS	tts	7168242	7168242	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7168242	7168884	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7168771	7168773	.	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7168885	7168942	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169138	7169199	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169396	7169464	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169605	7169668	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7169774	7169833	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7170829	7170890	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7171111	7171188	1	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7168771	7168884	1	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7168943	7169137	1	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7168943	7169137	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169200	7169395	1	-	1	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169200	7169395	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169465	7169604	1	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169465	7169604	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169669	7169773	1	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169669	7169773	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7169834	7170828	1	-	2	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7169834	7170828	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7170891	7171110	1	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7170891	7171110	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7171189	7171230	0.99	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7171189	7171565	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7171228	7171230	.	-	0	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7171565	7171565	.	-	.	transcript_id "g36.t2"; gene_id "g36";
# protein sequence = [MLTHKTCQARKKMQVSFVIRDAEEKQHRNGVNALQLDANNGKLYSAGRDAIIRVWNTRTDSSEKYIQSMEHHNDWVND
# IVLCCNGRNLISASCDTTVKVWNAQKGFCMSTLRTHRDYVQALAYAKDREQVASAGLDKAIFLWDVNTLTALTASNNTVTTSSLTGSKDSIYSLAMNP
# SGTVIVSGSTENILRIWDPRTCMRRMKLRGHTENVRCLVVSPDGNQVVSGSSDGTIKVWNLGQQRCVQTIHVHKEGVWSLLMSENFQYIISGSRDRNI
# IVTEMRNPSNKTLVCEEQAPVLSLGYNIDKTGVWATTWNSDIRCWKLPMYDRCTLNSSGGMDAQWTQGGTEVACIKGGAAIKECAVLNDKRYIITKDS
# QDQVVVYDVLRVVKKEQLGAVDFEAEVKKRNKQVYIPNWFTVDLKTGMPTIVLGQEEVDCFSAWVSIEAGLPECVDPTTEIKINYGKLLLEALLEYWT
# PPHSIPPNEMEPDMHGNGYFQVPKHTPVIFSEVGGRTVCRLLVRDAAGDSESTLLHETAPQWVTDVVIEKNIPKFLKIPFFLQPHPQMTKPERTKKDR
# LVANEFIQCRKVCEHVLEKVLNAETTPSGGNANNSLQNSQSDANSEGSQLPAEERIELWCNDVVVDPNMDLRTVRHFIWKQSTDLTFQYKTKQNFNYD
# GK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 8/8
#      E:   7 
#      W:   8 
# CDS introns: 7/7
#      E:   7 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 307
#      E:  46 (gi|103765417,gi|49361334,gi|49400130,gi|41403899,gi|103683519,gi|15062916,gi|4423431,...)
#      W: 261 
# incompatible hint groups: 6
#      E:   3 (gi|38626633,gi|9990873)
#      W:   3 
# end gene g36
###
# start gene g37
chr2R	AUGUSTUS	gene	7171736	7172601	0.31	+	.	g37
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7171736	7172601	0.31	+	.	g37.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7171736	7171736	.	+	.	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7171736	7172601	.	+	.	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7172003	7172005	.	+	0	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7172003	7172464	1	+	0	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7172462	7172464	.	+	0	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7172601	7172601	.	+	.	transcript_id "g37.t1"; gene_id "g37";
# protein sequence = [MAGTQSKDACSICDKVGLKPFTRDNVFNYYIPLHGLVSYGALAVNVMNPQIVPKILPKKDLTNVFLISAVVGSAFYIY
# GRPHLKDVKNNKRGAYALLGATLFSMGSVLAWALIKSALPQDNALLATLAGLGTGAAIVKVGTDYIQDVDKLQKN]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 135
#      E:  56 (gi|10607392,gi|222484604,gi|222508588,gi|222483786,gi|222489392,gi|14707961,gi|222482144,...)
#      W:  79 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   2 (gi|9990873,gi|13757380)
# end gene g37
###
# start gene g38
chr2R	AUGUSTUS	gene	7172657	7177285	0.92	-	.	g38
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7172657	7177285	0.92	-	.	g38.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7172657	7172657	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7172657	7173673	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7173469	7173471	.	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7173674	7173742	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7173878	7173937	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7174171	7174223	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7174392	7174455	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7174597	7174652	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7174823	7174880	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7175092	7175149	1	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7173469	7173673	1	-	1	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7173743	7173877	1	-	1	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7173743	7173877	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7173938	7174170	1	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7173938	7174170	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7174224	7174391	1	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7174224	7174391	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7174456	7174596	1	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7174456	7174596	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7174653	7174822	1	-	2	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7174653	7174822	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7174881	7175091	1	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7174881	7175091	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7175150	7176049	1	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7175150	7176065	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7176047	7176049	.	-	0	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7176898	7177285	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7177285	7177285	.	-	.	transcript_id "g38.t1"; gene_id "g38";
# protein sequence = [MSESLSSQVEETKVSDDDGVKEKAEVSTAKDSAETAMEVEADDTGGQQPEQSELLDKEKSATVDINTLTPSTPSQTPP
# QLLAVETATSGSTAVIPENILSPPKSETQTDETNTATSTSCSPASDGQRSPAADQQSSAPPPQVQAQATPAPVNGSVPKSGKPLSTALSGKKTSKAAT
# TSPRASRCRKTKALPMYESEISDNKMGIRLCIKKSDAGEGAPAGVTSPPVAVPAATKTVRKRVRKPKQQDSDEAEYEPRKKKGGGGGSGGEKKVSTSP
# DAAEAAGDPVEQSVWAQKLPEEVLFRIFEHAVDTQGCLPTLFRLGRVCSLWRQVSLRPTLWRTMDLTTWVKEKYRTELKLKWFVDNRCSACTDLNVSN
# WKISDINCFLAKLSSGCPNLAGITLSGWKGFTSDHLTYLVDNMHKLQRLDLSSINVEMNASKSAVGVNSLCNALQTMGSRLTHLYLAHNRLAGIPQIV
# GILSTHCPNLTLLDLSNVTTQATSHGVLHIEKLQRGCQKLKVLRVTNSHITPSTASMQEIMDSPGFPELEELSVAALTDESRIISDDHLQRILKSSSK
# LKLLDVRNCTRLTHESLIRLPAWDIKHLFLSGCSVTRDMGSGLELIASKWAHSLIELDLAWANMQQPIDNALRALAEKGRDSPLAHLNLCGSSVSDEA
# VKEILTNCQNMSSINLASCRGLPRGVKRLMQGPQELGELREVLGVQLKSSSGSN]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 8/8
#      E:   8 
#      W:   8 
# CDS introns: 7/7
#      E:   7 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 366
#      E:  71 (gi|114063017,gi|4245226,gi|8121893,gi|38623094,gi|38626163,gi|107284104,gi|49392028,...)
#      W: 295 
# incompatible hint groups: 31
#      E:   3 (gi|38622928,gi|38622927)
#      W:  28 
# end gene g38
###
# start gene g39
chr2R	AUGUSTUS	gene	7177337	7178535	0.88	-	.	g39
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7177337	7178535	0.88	-	.	g39.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7177337	7177337	.	-	.	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7177337	7178333	.	-	.	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7177403	7177405	.	-	0	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7178334	7178396	1	-	.	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7177403	7178333	1	-	1	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7178397	7178437	1	-	0	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7178397	7178535	.	-	.	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7178435	7178437	.	-	0	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7178535	7178535	.	-	.	transcript_id "g39.t1"; gene_id "g39";
# protein sequence = [MDHAITPEPHLVPGYTGHCAQNRDRVGRTYGRQTHKLLIDPCIYHAPELIVAPIHAKRGLKDYPTEQELKILRTREGL
# VDSVYRHPILPGYAGFVPNKVSQIGKRYVAAASAGVARHETLMELYRCENRTLRHRDLLESGNGLFDRKINERLLPQTYYRSPLILVTGVSKGIKDET
# CPPKTEKLCYSKFTSPHFLEDEDADKFIINGYSGHIPMSVTRFGESNKVLTNRALCSFSDYMYKRKRDTWCCGQDLSRPSITCPPVGHFVVYHEDSGM
# VPNYAGHVPGETYKFGRTYAKTTYDAKRWLEVHKNLTVLPEVANLDYAY]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 122
#      E:  12 (gi|13698332,gi|9989794,gi|13691758,gi|13692441,gi|13754927,gi|13690908,gi|13693329,...)
#      W: 110 
# incompatible hint groups: 6
#      E:   4 (gi|38622928,gi|38622927,gi|8120146,gi|38625085)
#      W:   2 
# end gene g39
###
# start gene g40
chr2R	AUGUSTUS	gene	7178587	7180815	0.24	-	.	g40
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7178587	7180815	0.24	-	.	g40.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7178587	7178587	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7178587	7179265	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7178622	7178624	.	-	0	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7179266	7179322	1	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7179495	7179550	1	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7179924	7180310	1	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7178622	7179265	1	-	2	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7179323	7179494	1	-	0	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7179323	7179494	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7179551	7179923	1	-	1	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7179551	7179923	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7180311	7180522	1	-	0	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7180311	7180815	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7180520	7180522	.	-	0	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7180815	7180815	.	-	.	transcript_id "g40.t1"; gene_id "g40";
# protein sequence = [MGINCLNIFRRGLHTSSARLQVIQSTTPTKRICIVGAGPAGFYAAQLILKQLDNCVVDVVEKLPVPFGLVRFGVAPDH
# PEVKNVINTFTKTAEHPRLRYFGNISLGTDVSLRELRDRYHAVLLTYGADQDRQLELENEQLDNVISARKFVAWYNGLPGAENLAPDLSGRDVTIVGQ
# GNVAVDVARMLLSPLDALKTTDTTEYALEALSCSQVERVHLVGRRGPLQAAFTIKELREMLKLPNVDTRWRTEDFSGIDMQLDKLQRPRKRLTELMLK
# SLKEQGRISGSKQFLPIFLRAPKAIAPGEMEFSVTELQQEAAVPTSSTERLPSHLILRSIGYKSSCVDTGINFDTRRGRVHNINGRILKDDATGEVDP
# GLYVAGWLGTGPTGVIVTTMNGAFAVAKTICDDINTNALDTSSVKPGYDADGKRVVTWDGWQRINDFESAAGKAKGKPREKIVSIEEMLRVAGV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 4/4
#      E:   4 
#      W:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 168
#      E:  18 (gi|15046274,gi|15470499,gi|15065853,gi|15324816,gi|15065634,gi|15070573,gi|107298432,...)
#      W: 150 
# incompatible hint groups: 47
#      E:   4 (gi|8120146,gi|38625085,gi|38626827,gi|38627675)
#      W:  43 
# end gene g40
###
# start gene g41
chr2R	AUGUSTUS	gene	7181222	7185075	0.19	-	.	g41
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7181222	7185075	0.19	-	.	g41.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7181222	7181222	.	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7181222	7181693	.	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7181425	7181427	.	-	0	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7181694	7181754	1	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7181425	7181693	1	-	2	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7181755	7181770	1	-	0	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7181755	7182290	.	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7181768	7181770	.	-	0	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7184767	7185075	.	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7185075	7185075	.	-	.	transcript_id "g41.t1"; gene_id "g41";
# protein sequence = [MSYSSRFGFDFHLPDEGWCYPKNDMHFIRSAEWVPVEKAGVGRSFANPNGVIYPRVVGMIPRYGGHVPGNKFRVGNTY
# GRSTIDAKRHLALNHD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 125
#      E:  23 (gi|10609179,gi|133844929,gi|133844928,gi|133844802,gi|133845043,gi|133844801,gi|133845042,...)
#      W: 102 
# incompatible hint groups: 39
#      E:   4 (gi|10606080,gi|10608274,gi|133844688)
#      W:  35 
# end gene g41
###
# start gene g42
chr2R	AUGUSTUS	gene	7182052	7185075	0.19	-	.	g42
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7182052	7185075	0.19	-	.	g42.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7182052	7182052	.	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7182052	7182290	.	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7182187	7182189	.	-	0	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7182291	7182998	1	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7182187	7182290	1	-	2	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7182999	7183317	1	-	0	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7182999	7183390	.	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7183315	7183317	.	-	0	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7184767	7185075	.	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7185075	7185075	.	-	.	transcript_id "g42.t1"; gene_id "g42";
# protein sequence = [MAEDPVNQQAFAEDVAAAAAAGGAGGFAGPEPGHPDFKMPSAEEIWKLVEGMEGISDDERAELRESIFNPKPPSPEDF
# MRQYGHPGHSSREYLVFFVMLALILIVFALFGYKLYKSLTEKELKKQEKLKSKQQKKAKKSN]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 85.7
# CDS exons: 2/2
#      E:   1 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 2/3
#      E:   1 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 85
#      E:   1 
#      W:  84 
# incompatible hint groups: 17
#      E:  12 (gi|107280196,gi|49215912,gi|41401781,gi|48952635,gi|9991356,gi|49192568,gi|107270570,...)
#      W:   5 
# end gene g42
###
# start gene g43
chr2R	AUGUSTUS	gene	7185187	7188715	0.09	-	.	g43
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7185187	7188715	0.09	-	.	g43.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7185187	7185187	.	-	.	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7185187	7186210	.	-	.	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7185449	7185451	.	-	0	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7186211	7186441	0.64	-	.	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7185449	7186210	0.66	-	0	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7186442	7188682	0.46	-	0	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7186442	7188715	.	-	.	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7188680	7188682	.	-	0	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7188715	7188715	.	-	.	transcript_id "g43.t1"; gene_id "g43";
# protein sequence = [MFTRTPPTNKKLNTDQIQAILENESEDESRKEKMNEEDQKLAPVGEAEAKKQNKDAIAKVEEKFEQMMNTLTQSMLAK
# SKQEGQVIIAAEKFEKVVSDCDGKSIPIKKWFEIFEKNAEAYELSEKQKYVQARSKMIGSAELFLESECVSGYTELKELLIEEFSGSYNSAVIHKKLQ
# DRKKKREETLHDYLLQMKKIAALGEVETVALITHIVNGLDIKKEYKGAMLRCKTLKELKQEFEIYESLNIVDKPNIQPKPKQITQGVKADHCFNCGSR
# EHKRKDGTLRVCVDYRKLNTMVLMDCFPVPIMEEVLEKLQSAKWFTTVDLQNGFFHVTVEEASKPYTAFVTREGLFEFNKAPFGFKNSPAAFIRFVQF
# IFQELINSNIMQLYMDDIIVYAATPEECMEKTEMVLKRAAEFGLKIKWKKCNFMQRRIHFLGHIIEGGQICPGKEKTSAVNSFGTPQNVKAVQGFLGL
# TGFFRKFIPGYAQIARPLTDLLKKDAIFNIGPVEQQSVNKLKEILVNEPVLRIYSREAETELHTDASKDGLGAVLLQKFEGSFHPVCFWSRKTTKAES
# NRHSYYLEVKAAYLALKKFRHYLLGVPFKLVTDCVAFKQTTKKADVPREVGPWILYMQDFNFQPEHRAGERMRHVDFLSRHPQACMMITSELTARIKK
# SQQNDDSIRAILEILKDRLFQPYKLKGGLLYSMVNGNELLVVPALMEREVIQSAHEVGHLSLQKTMHSIQQQFFIPHLEYKEEVVKRLTDWSNIFGFP
# KRIVSDKGTAFTSGAFEQFMSSHNVEHVCTTTGVARGNGQIERVNRLILAIISKLSSDEPSKWYKYVPEVQKAINCHVHSSLKLSPFEVMFGTKMYTR
# VEDRLLELLQEEVVCQFNEDRYEMRQLVKRNIEQAQKDYKRNYDKKRRAEYKYKAGDLVAIKRTQFVAGRKMASGYLGPYEVTGVKDNGRYDVKKAAN
# VEGPNVTSTSCDNMKLWKYIAENADLLSSGSDDDDQEGRM]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 40
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
# CDS introns: 0/1
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 6
#      E:   6 (gi|103735010,gi|49228269,gi|49379239,gi|107237332,gi|15532518,gi|103753180)
# incompatible hint groups: 3
#      E:   3 (gi|107219157,gi|107275024,gi|49193300)
# end gene g43
###
# start gene g44
chr2R	AUGUSTUS	gene	7189687	7190515	0.79	-	.	g44
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7189687	7190515	0.79	-	.	g44.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7189687	7189687	.	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7189687	7190123	.	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7189752	7189754	.	-	0	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7190124	7190186	1	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7190310	7190376	1	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7189752	7190123	1	-	0	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7190187	7190309	1	-	0	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7190187	7190309	.	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7190377	7190481	1	-	0	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7190377	7190515	.	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7190479	7190481	.	-	0	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7190515	7190515	.	-	.	transcript_id "g44.t1"; gene_id "g44";
# protein sequence = [MSPSQLLVIFASLALNTRLVFGQATIDCQRPPQLVDPALCCKDGGRDQVAEQCAQRILGTANGQKAGGPPSLDTAACL
# AECILTSSKYIDEPQKLNLANIRSDLSAKFSNDTLYVETMTMAFSKCEPQSQRRLAMIMQQQQQVQQQKTQQQQPRCSPFSAIVLGCTYMEYFKNCPD
# HRWTPNAQCTLAKAYVTQCGLGA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 25
#      E:   6 (gi|222572110,gi|222493264,gi|49200237,gi|107255917,SRR023608.9623286/1,SRR023608.10894690/2)
#      W:  19 
# incompatible hint groups: 8
#      E:   4 (gi|15470731,gi|222501322,gi|14691457)
#      W:   4 
# end gene g44
###
# start gene g45
chr2R	AUGUSTUS	gene	7190756	7193020	0.96	+	.	g45
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7190756	7193020	0.96	+	.	g45.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7190756	7190756	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7190756	7190859	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7190925	7191037	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7191018	7191020	.	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7191038	7191100	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7191268	7191324	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7191657	7191712	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7192031	7192088	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7192198	7192255	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7192585	7192642	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7192801	7192855	1	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7191018	7191037	0.96	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7191101	7191267	1	+	1	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7191101	7191267	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7191325	7191656	1	+	2	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7191325	7191656	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7191713	7192030	1	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7191713	7192030	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7192089	7192197	1	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7192089	7192197	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7192256	7192584	1	+	2	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7192256	7192584	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7192643	7192800	1	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7192643	7192800	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7192856	7192997	1	+	1	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7192856	7193020	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7192995	7192997	.	+	0	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7193020	7193020	.	+	.	transcript_id "g45.t1"; gene_id "g45";
# protein sequence = [MDAGTKILVVGDVRGRFKQLFQRVEQVNKKAGPFEILCCVGDFFGEDKQNEELIAYKNGFKHITVPTYILGPNQREHE
# KYFENLTDGEICTNLTYLGRRGVYTLSSGVKIAYLSGLEAQGTADSAGSEHEFTKADVIAVRNSCLVSKNCSTEYRGVDVLLTSQWPFGMQEKENATA
# SKLVSFLCREIKPRYHFCAINGTHYESAPFRMPKDETTQFELCTRFISLAEVGNAEKAKYIYALSLKPVDKSRLLDLAQKTTNEIPCPFIGLDLGGAI
# GKNDSSENRQYFYDMDGGRRKRQGGDNNKRDKRPRIPQIEQDKCWFCLSSPDVEKHLIITVGEHFYLALAKGPINKHHVMILSTKHVPCAAQLSPDDW
# KELNKFKAALRKFFKTLGQVVCFTERHYKSVHLQINALAFEEGYAWKIKHSFEDKAEEFNLEFETLPALDSEKMLPEMGPYFLAELPDDSTLITRQMK
# HFPIHFARDVFCSENLLNCDEKVNWKDCLLDKDEEVAYVEDFRKAFAPFDFTDD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 8/8
#      E:   8 
#      W:   8 
# CDS introns: 7/7
#      E:   7 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   1 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 183
#      E:  24 (SRR023505.2466295/1,gi|14633465,gi|14691307,gi|15070486,gi|20144986,gi|49391108,...)
#      W: 159 
# incompatible hint groups: 5
#      E:   5 (SRR023546.8046253/2,gi|15062896,gi|38626654,gi|103736479,gi|49373481)
# end gene g45
###
# start gene g46
chr2R	AUGUSTUS	gene	7193027	7195065	0.67	-	.	g46
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7193027	7195065	0.67	-	.	g46.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7193027	7193027	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7193027	7193316	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7193135	7193137	.	-	0	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7193317	7193376	1	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7193604	7193663	1	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7194026	7194084	1	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7194297	7194369	1	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7194465	7194765	1	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7193135	7193316	1	-	2	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7193377	7193603	1	-	1	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7193377	7193603	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7193664	7194025	1	-	0	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7193664	7194025	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7194085	7194296	1	-	2	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7194085	7194296	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7194370	7194464	1	-	1	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7194370	7194464	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7194766	7194947	0.83	-	0	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7194766	7195065	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7194945	7194947	.	-	0	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7195065	7195065	.	-	.	transcript_id "g46.t1"; gene_id "g46";
# protein sequence = [MFKLARMLLPQQRILASPLRLQRLISTSDEVNAEPIIKSMDTIGGLPTELVNEQKLKKTSRTLSTLQNHSVPIAARVT
# VSKDESRDFMAVFPDLVRDITTVTKAYNCSDAAKWFAQVLQYNVPRGKKNRGILTVLTYKNLVPTQDLTPENIKLAQYLGWCVEMLQSFFIISDDVMD
# NSTTRRGQPCWHKVENVGLTAINDALMIENAMYAILKKHFSHLDCYVALMELFHEITYITTCGQSLDQLNSNRCVSEFTMENYKAIVENKTAYYSFYL
# PFALALHLAGYKDAEAFRQSKTILLEMGNFFQVQDDFLDCFGNPEVTGKIGTDIQDNKCSWLAVVAMQRANVEQKQIMVDCYGKEEPAKVERVKELYK
# ELGLPSTYAIFEEESYNMIKTHIQQTSRGVPHQTFLQILNKIYQRDS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 6/6
#      E:   6 
#      W:   6 
# CDS introns: 5/5
#      E:   5 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 209
#      E:  73 (gi|164475184,gi|13758157,gi|13687332,gi|13693440,gi|2886724,gi|48907248,gi|15049624,...)
#      W: 136 
# incompatible hint groups: 9
#      E:   4 (gi|38626654,gi|103736479,gi|49373481,gi|13769777)
#      W:   5 
# end gene g46
###
# start gene g47
chr2R	AUGUSTUS	gene	7195386	7197280	0.21	+	.	g47
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7195386	7197280	0.21	+	.	g47.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7195386	7195386	.	+	.	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7195386	7195602	.	+	.	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7195452	7195454	.	+	0	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7195603	7195660	1	+	.	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7195452	7195602	0.6	+	0	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7195661	7197030	1	+	2	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7195661	7197280	.	+	.	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7197028	7197030	.	+	0	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7197280	7197280	.	+	.	transcript_id "g47.t1"; gene_id "g47";
# protein sequence = [MMDEQLIDEVAQHGVIYNRQKYYLNGGANGGKYETKDEAWQLIAMKLRTDVDTCKKRWKYLRERYVSQRKQGDPPVYE
# HLSRPYLEKMKFLDQHIQPRKSYRHVPNFLTSPQSANSSGYNEYQVDKSNGSMKNVSQFGSSGQSHLYHQPDQQHAMSALSNVAASALENVNGQVKIE
# ADQVFRDFAAAVASQQLQHISQSQMQQQAAAVAAVMADSSQGYQDQYKDGSVGMNGAQNSAGSLTSTSSSMKSPLSSPLQGIGAGSHHPQQQTQQQQQ
# QQQQQAQQQSPASEQQLPVVHSSSSATGASIGNSSTLQMQQSHVYNPKGDGLDSSSSSHFHMKKPRIQLNGNAHNQMTSNGSHFGNDSDDESDENSHD
# LMEPQAMMQQENHYSNSMPMQRGNGNGNNSSSNSGSNNPSGNNSHNNQQQQQHQNMFPSNTDFLFQLYQQFPHQASSSHPANFGKFQAPPNHPGVQRL
# SEHLLGELVTTELLKMNKERKKSAQKRILEILFFDD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 158
#      E:   7 (gi|15060652,gi|15544013,gi|13768889,gi|2890926,gi|164479978,gi|164482625)
#      W: 151 
# incompatible hint groups: 7
#      E:   1 (gi|8120862)
#      W:   6 
# end gene g47
###
# start gene g48
chr2R	AUGUSTUS	gene	7198802	7206225	0.37	-	.	g48
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7198802	7206225	0.37	-	.	g48.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7198802	7198802	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7198802	7199184	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7198917	7198919	.	-	0	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7199185	7199236	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7199407	7199463	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7200116	7200171	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7200312	7200387	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7200567	7200640	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7200823	7200909	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7201370	7201477	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7202231	7202343	0.99	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7202473	7202527	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7202789	7202859	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7202973	7203255	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7203443	7203611	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7203755	7203823	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7203957	7204013	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7204296	7204352	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7204701	7204925	1	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7198917	7199184	1	-	1	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7199237	7199406	1	-	0	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7199237	7199406	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7199464	7200115	1	-	1	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7199464	7200115	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7200172	7200311	1	-	0	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7200172	7200311	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7200388	7200566	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7200388	7200566	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7200641	7200822	1	-	1	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7200641	7200822	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7200910	7201369	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7200910	7201369	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7201478	7202230	0.99	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7201478	7202230	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7202344	7202472	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7202344	7202472	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7202528	7202788	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7202528	7202788	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7202860	7202972	1	-	1	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7202860	7202972	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7203256	7203442	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7203256	7203442	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7203612	7203754	1	-	1	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7203612	7203754	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7203824	7203956	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7203824	7203956	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7204014	7204295	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7204014	7204295	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7204353	7204700	1	-	2	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7204353	7204700	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7204926	7204998	1	-	0	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7204926	7205126	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7204996	7204998	.	-	0	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7206065	7206225	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7206225	7206225	.	-	.	transcript_id "g48.t1"; gene_id "g48";
# protein sequence = [MRPRKGIHVLLTTLVVSLSLSKINGQTTCKNGLGRVLYERLPNQQLQGYDDDVVRDTAPPFRVLEKCQDLCLRDRSGS
# NNLVRTCTSFDFQPGSRITSFGGNSEYEESLCYLTSEQAGPEGIGSLMLVPNSVHFNEICLTSSRPERECPSRRYVFERHPRKKLKLPISDIKEITAA
# NRSDCEDKCLNEFSFVCRSANFDSTMRSCTLSRFTRRTHPELMEDDPNSDYLENTCLNAERRCDGLAVFVKEENKRLGGPFEVDIFNNMTLEECQTMC
# LRAEKYFCRSVEFDDQSKQCILSEEDSISQKDDISISSSPTHHFYDLVCLDNQRANDYPDNSVTSHLFSSGRRPDTAFQRYRNSRLGGEFHSEITGRS
# LSECLDECLRQTSFQCRSAVYSDRFRTCRLSRYNQKDGMRIIYDADYDYYENLMLNVVGGGADGDGGGHGGSSDGKRPGDQSGSNWRQPNKHDDRYGS
# GGSSVGGGSHGGTGSGGSRLPPGEGVDYGRPYDRYPDIAGNEYDRNPYGGDRDRDRYPPDRYGSRYPTGGDGIGYNRPYDRFPDDYDRYPAGAGVNGD
# RDRERDRDRYPVVGDRDRYPGAVDRDRYPGVRDRDRYPEPYPPERYADRYGDRRYPERERDRDRDRLPYRPLPYPGINDNSLPSDLPHTRPYPTDDDA
# PFRPYGYGGGRYGENRYEGRYPPRFPPSRERDPVGGYTGRDAPDSIFPDRRYRPSSMDSPRYPYLPDSRGPPGRYDDIVHSARRPEPDSAKRYPPAPI
# APTGSSSKYASTPNRFPVGNDRYPIDIYKYGNRPGPNDLGRRPGLERPPPPFYDYDYEERYGDRYGPYDREYDGPPGRRPPSGGPYGRYDSPFNRPYG
# GNGLDDRPLPLPGLGLSHPPTPYGGGGAGHVGVGVGVNSGPPRPPITRCEESDNFKQIAARHKMRRHFVRRALIVPSLIQCERECIESRDFVCRSFNY
# RDSAASGYEDRDRDRDRDSPNCELSDRDSRELDIHDPGTFDASNYDFYERSIGRSDGECMDVTQTCNEEGMEFTIRTPEGFLGRIYTYGFYDRCFFRG
# NGGTVNVLRLSGPQGYPDCGTQRYGDTLTNIVVVQFSDNVQTSRDKRYNLTCIFRGPGEAVVSSGYIGAGSGSPIPIEYLPAENTLSSKVRLSILYQG
# RPTTTIAVGDPLTFRLEAQDGYNHVTDIFATNVVARDPYSGRSIQLIDRFGCPVDPFVFPELDKLRDGDTLEARFNAFKIPESNFLVFEATVRSCREG
# CQPAYCPGPAGRQEPSFGRRRRSLNTTEIPEPEALALEGSSQLEASTLDEVTVVNSTTVSATLGQVPLNETQLGEKTKETEEPEQVREMIEVFETREE
# IEKESYPRKLVAPVETVCMTPAEYHGLITAIILLMILLFSITLVAGLGYRRYWKSISKNRLVDRHSPIHSLGHSHSSIRTHERFTEIGHMPNLNGGGG
# GAAAGTGGGANQSASNRASNAFRTNMSMFGGSLHKTFATG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 62.2
# CDS exons: 8/17
#      E:   7 
#      W:   2 
# CDS introns: 12/16
#      E:  12 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 46
#      E:  26 (SRR027108.4521771/2,SRR026433.5893233/2,SRR026433.17836960/1,SRR026433.18677588/1,...)
#      W:  20 
# incompatible hint groups: 4
#      E:   4 (SRR023546.4320802/1,gi|133841138,gi|133841384,gi|133841262)
# end gene g48
###
# start gene g49
chr2R	AUGUSTUS	gene	7207171	7208835	0.17	-	.	g49
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7207171	7208835	0.17	-	.	g49.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7207171	7207171	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7207171	7207265	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7207215	7207217	.	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7207266	7207323	1	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7207483	7207611	1	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7207820	7207868	1	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7208387	7208448	1	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7207215	7207265	1	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7207324	7207482	1	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7207324	7207482	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7207612	7207819	1	-	1	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7207612	7207819	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7207869	7208386	1	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7207869	7208386	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7208449	7208547	0.78	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7208449	7208835	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7208545	7208547	.	-	0	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7208835	7208835	.	-	.	transcript_id "g49.t1"; gene_id "g49";
# protein sequence = [MCNVMTIFWTMFVALPESKNVIEMGDDLVWISGMALVFTKIFYMHLRCDEIDELISDFEYYNRELRPHNIDEEVLGWQ
# RLCYVIESGLYINCFCLVNFFSAAIFLQPLLGEGKLPFHSVYPFQWHRLDLHPYTFWFLYIWQSLTSQHNLMSILMVDMVGISTFLQTALNLKLLCIE
# IRKLGDMEVSDKRFHEEFCRVVRFHQHIIKLVGKANRAFNGAFNAQLMASFSLISISTFETMAAAAVDPKMAAKFVLLMLVAFIQLSLWCVSGTLVYT
# QSVEVAQAAFDINDWHTKSPGIQRDISFVILRAQKPLMYVAEPFLPFTLGTYMLVLKNCYRLLALMQESM]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 90.9
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 4
#      E:   4 (gi|103650190,gi|103665881,gi|103659254,gi|103651668)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g49
###
# start gene g50
chr2R	AUGUSTUS	gene	7216286	7224075	0.03	+	.	g50
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7216286	7224075	0.03	+	.	g50.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7216286	7216286	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7216286	7217007	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7216911	7216913	.	+	0	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7217008	7217597	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7217697	7217763	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7217959	7218617	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7218729	7219021	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7219349	7219413	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7219890	7219943	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7220187	7220293	1	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7216911	7217007	0.96	+	0	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7217598	7217696	1	+	2	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7217598	7217696	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7217764	7217958	1	+	2	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7217764	7217958	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7218618	7218728	1	+	2	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7218618	7218728	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7219022	7219348	1	+	2	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7219022	7219348	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7219414	7219889	0.91	+	2	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7219414	7219889	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7219944	7220186	1	+	0	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7219944	7220186	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7220294	7223482	0.65	+	0	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7220294	7224075	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7223480	7223482	.	+	0	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7224075	7224075	.	+	.	transcript_id "g50.t1"; gene_id "g50";
# protein sequence = [MPASLLLEELQQTNGQLVNLTRQHDGDTFHTSGLSSACNADTCIGLSSGTASLVRSTGDGSGQGNDGLNPATSSLGGG
# QMELLTRRLKLQKGRGQVANIDASGETGCTCRCLPYQRAYREDLGICVDDIHECSLSPFVSGSSSEKIPFVFLPLKGQIIYPSREISFASIHTPVCAV
# TGAQYLGSNGWSDLRNPIDTDYPFRMFRDEGRSFLLWLGEADLRQKMQGRLIVVHLVCRDMTVALNASNHVKGEPLMPPRNVHSPCVAFRVNGSPVKY
# AHNVPEVFFQPANSTTLASTSDGMTMREYVVIGICSLLLGLIYVASVFLYLYMKKRKRHSSRHSLDNLTNDINYPKNDQVTYGAPFSRVGSIYSSNSM
# GLGNGNESNTRTSIGSLKEDMGIVKNNPLLQHFPQLSEREHNSGFASDISNSNSECEMEEKIKTSVLVHPQLSKSPKPSGGTDNAAMDVDDFLQDNEC
# LPAENVAVIDELMSEEKLENLRAMVSGNVRKKLYFNPAYFEPHLLAEPPQAAIEFLQKIREVIAIAKYKMASKRYQPSLNIIPEEQHPESSSSSPMFN
# IPLQQSLAGKGMGDKRNSIEQWLQSVPNSDATPAPKTLDRPAPPTAKKPSSGSPNKGSLRKEISAPKERPPPPPMQKSKADEGNAKSSSPAPSGPHSS
# RSTGKSSPEQSPKPKTNVGSTYEGFSAFSVAANVYGFAETGGEIYNNPKFMLADSPAASLRSASSRSKSMKKRSEVLDQFAAANSTPTSLTSFDRQHY
# NMLRNMKAPEVIYDSLKREFAAHIPTPDYDSTIEKRIKDIYSSTQSSIPSVPTPDYSSLSRKSLKQFQPDSPIYRRKSPQYLIVDYETDSLERLEPSK
# RKSSHSSSSPSSDVSSQLSPSLSTALPLEEEMEISHTVYDRMNGFRKEGEMKKRLAAKHQHPHPGQQQRQKEAAARIKYDTPFRGSMTIEVEHEPPSD
# LERTDSDQFEPDTLDRKPKKQSFCDISAWDGHKPIDSDFSQISSLPDLSRQISPAPNQGIKPRTASFILRSSNSFRNLREIYESPLIAQDNIKYEKKV
# AQTPEEEGRILTLEAKHSRRQRLMETSPTHSVMDITKVNKTTITISSPKPADKAPPTRPKVNQHYCPPLVQSKRPLPPPPPNSSEHQAPDEDAYSLHS
# EITGTSEFENSCNNTMSSAISATTEERTHAKGSRSPKINAKIPEEDYEGMYNKKINSLRNDYSLTKYLNRRKSQREEVSKAGPDSPKDVAPEPEFGGS
# NKSVKEVDVAQFDALSISSRSNRSSSHLSERTKEMYRNAGVPVGIAYPQRAASSSGNASAGGNVQTVYRCEIEQAQLTAGMQIAIGLKDRAKKAKDLK
# NAWRKFVTMAANKFSPSQSPAPTYGSKTAAGFLEDDGIASIIEDAAQSAGMGQPGSQTYYEQRFGQLDSGYMSTDSTELYKRNVYDRYNFKMPCGRGQ
# IIRVDTIEDNEEESGPNDNRFEDLEHMVSPSHSRRSPENNAVVACDLSDAESDKTLTRSHSQTNSQERNVRGSTTTMSSYSSDENGRGRSTCCGSSET
# DEETNAEDMWESGAESIETHSVLYKMIRKS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 94.1
# CDS exons: 8/8
#      E:   8 
# CDS introns: 7/7
#      E:   7 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 19
#      E:  19 (gi|160422599,SRR027108.2079761/2,gi|160422411,gi|103731513,gi|49364723,gi|49373125,...)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g50
###
# start gene g51
chr2R	AUGUSTUS	gene	7224316	7225296	0.59	+	.	g51
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7224316	7225296	0.59	+	.	g51.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7224316	7224316	.	+	.	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7224316	7225296	.	+	.	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7224365	7224367	.	+	0	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7224365	7225183	1	+	0	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7225181	7225183	.	+	0	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7225296	7225296	.	+	.	transcript_id "g51.t1"; gene_id "g51";
# protein sequence = [MSRILVVFLVLGVGCSLADPIYRNEEVHIPKLDGRIVGGQDTNITQYPHQISMRYRGNHRCGGTIYRSNQIISAAHCV
# NTLSGPENLTIVAGSSNIWFPTGPQQELEVREIIIHPKYRTLNNDYDAAILILDGDFEFNDAVQPIELAKERPDHDTPVTVTGWGTTSEGGTISDVLQ
# EVSVNVVDNSNCKNAYSIMLTSRMLCAGVNGGGKDACQGDSGGPLVYNNTLLGIVSWGTGCAREKYPGVYCSVPDVLDWLVETVADKESVGKIDFL]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 104
#      E:  15 (gi|222507133,gi|222482142,gi|222508870,gi|222484425,gi|222513048,gi|222509927,gi|222481854,...)
#      W:  89 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g51
###
# start gene g52
chr2R	AUGUSTUS	gene	7225305	7226315	0.26	-	.	g52
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7225305	7226315	0.26	-	.	g52.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7225305	7225305	.	-	.	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7225305	7226315	.	-	.	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7225398	7225400	.	-	0	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7225398	7226282	0.59	-	0	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7226280	7226282	.	-	0	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7226315	7226315	.	-	.	transcript_id "g52.t1"; gene_id "g52";
# protein sequence = [MFIERNLAKSKLKSVISSIGTSHPCESMEGAMCIPLLLLAIGFSSVISISGQPEGRIINGTTVDIARHPYLVSLRYRR
# DNESSYMHECAGVIISEQALITSAQCLYGLPEETKLVAVAGANTRNGTDGFIYPVANWTHHPNYDPVTVDNDIGVLLLDTTLDLTLLGISSIGIRPER
# PAVGRLATVAGWGYREEWGPSSYKLEQTEVPVVSSEQCTQIYGAGEVTERMICAGFVVQGGSDACQGDTGGPLVIDGQLVGLVSWGRGCARPNYPTVY
# CYVASFVDWIEETIAAAGVQ]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 97
#      E:   7 (gi|133836056,gi|133836055,gi|148890979,gi|164479141,gi|103658691,gi|103652575,gi|103666292)
#      W:  90 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g52
###
# start gene g53
chr2R	AUGUSTUS	gene	7226642	7227725	0.44	-	.	g53
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7226642	7227725	0.44	-	.	g53.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7226642	7226642	.	-	.	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7226642	7227725	.	-	.	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7226762	7226764	.	-	0	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7226762	7227604	1	-	0	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7227602	7227604	.	-	0	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7227725	7227725	.	-	.	transcript_id "g53.t1"; gene_id "g53";
# protein sequence = [MSSSWIVGLLAFLVSLVALTQGLPLLEDLDEKSVPDGRIVGGYATDIAQVPYQISLRYKGITTPENPFRHRCGGSIFN
# ETTIVTAAHCVIGTVASQYKVVAGTNFQTGSDGVITNVKEIVMHEGYYSGAAYNNDIAILFVDPPLPLNNFTIKAIKLALEQPIEGTVSKVSGWGTTS
# PGGYSSNQLLAVDVPIVSNELCDQDYEDFGDETYRITSAMLCAGKRGVGGADACQGDSGGPLAVRDELYGVVSWGNSCALPNYPGVYANVAYLRPWID
# AVLAGL]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 105
#      E:  14 (gi|133839325,gi|103651177,gi|103660278,gi|15069150,gi|133839326,gi|15058723,gi|14633110,...)
#      W:  91 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g53
###
# start gene g54
chr2R	AUGUSTUS	gene	7228083	7228955	0.89	-	.	g54
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7228083	7228955	0.89	-	.	g54.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7228083	7228083	.	-	.	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7228083	7228955	.	-	.	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7228140	7228142	.	-	0	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7228140	7228928	1	-	0	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7228926	7228928	.	-	0	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7228955	7228955	.	-	.	transcript_id "g54.t1"; gene_id "g54";
# protein sequence = [MNKVILRILAVLFLLGIYAVSAQSDGRIVGGADTSSYYTKYVVQLRRRSSSSSSYAQTCGGCILDAVTIATAAHCVYN
# REAENFLVVAGDDSRGGMNGVVVRVSKLIPHELYNSSTMDNDIALVVVDPPLPLDSFSTMEAIEIASEQPAVGVQATISGWGYTKENGLSSDQLQQVK
# VPIVDSEKCQEAYYWRPISEGMLCAGLSEGGKDACQGDSGGPLVVANKLAGIVSWGEGCARPNYPGVYANVAYYKDWIAKQRTSYV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 92
#      E:   8 (gi|41405867,gi|103662210,gi|103661117,gi|103656727,gi|103650724,gi|103658308,gi|103661292,...)
#      W:  84 
# incompatible hint groups: 1
#      W:   1 
# end gene g54
###
# start gene g55
chr2R	AUGUSTUS	gene	7229010	7231535	0.28	-	.	g55
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7229010	7231535	0.28	-	.	g55.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7229010	7229010	.	-	.	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7229010	7230259	.	-	.	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7229459	7229461	.	-	0	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7229459	7230247	1	-	0	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7230245	7230247	.	-	0	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7231458	7231535	.	-	.	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7231535	7231535	.	-	.	transcript_id "g55.t1"; gene_id "g55";
# protein sequence = [MHRLVVLLVCLAVGSACAGTVGVSNGDPFEREGRIVGGEDTTIGAHPYQVSLQTKSGSHFCGGSLINEDTVVTAAHCL
# VGRKVSKVFVRLGSTLYNEGGIVVAVRELAYNEDYNSKTMEYDVGILKLDEKVKETENIRYIELATETPPTGTTAVVTGWGSKCYFWCMTLPKTLQEV
# YVNIVDWKTCASDEYKYGEIIYDSMVCAYEKKKDACQGDSGGPLAVGNTLVGIVSWGYACASNLLPGVYSDVPALRKWILNASETL]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 60
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/3
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 114
#      E:  10 (gi|103655226,gi|103665056,gi|103665980,gi|38626518,gi|164492321,gi|3946200,gi|15325437,...)
#      W: 104 
# incompatible hint groups: 1
#      E:   1 (gi|4245203)
# end gene g55
###
# start gene g56
chr2R	AUGUSTUS	gene	7231636	7232675	0.09	-	.	g56
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7231636	7232675	0.09	-	.	g56.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7231636	7231636	.	-	.	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7231636	7232675	.	-	.	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7231827	7231829	.	-	0	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7231827	7232597	1	-	0	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7232595	7232597	.	-	0	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7232675	7232675	.	-	.	transcript_id "g56.t1"; gene_id "g56";
# protein sequence = [MLKIVILLSAVVCALGGTVPEGLLPQLDGRIVGGSATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSANIIVTAAHCLQSVSA
# SVLQVRAGSTYWSSGGVVAKVSSFKNHEGYNANTMVNDIAVIRLSSSLSFSSSIKAISLATYNPANGASAAVSGWGTQSSGSSSIPSQLQYVNVNIVS
# QSQCASSTYGYGSQIRNTMICAAASGKDACQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAYSNYPGVYADVAVLRSWVVSTANSI]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 143
#      E:  50 (gi|3946000,gi|4247806,gi|3514603,gi|13757568,gi|13759217,gi|38625709,gi|3946172,...)
#      W:  93 
# incompatible hint groups: 9
#      E:   9 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g56
###
# start gene g57
chr2R	AUGUSTUS	gene	7232744	7233675	0.11	-	.	g57
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7232744	7233675	0.11	-	.	g57.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7232744	7232744	.	-	.	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7232744	7233675	.	-	.	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7232782	7232784	.	-	0	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7232782	7233552	1	-	0	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7233550	7233552	.	-	0	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7233675	7233675	.	-	.	transcript_id "g57.t1"; gene_id "g57";
# protein sequence = [MLKFAVLLSVLACALAGTIPDGLLPQLDGRIVGGYETSIDAHPYQVSLQRYGSHFCGGSIYSHDIVITAAHCLQSIEA
# KDLKIRVGSTYWRSGGSVHSVRSFRNHEGYNSRTMVNDIAIIRIESDLSFRSSIREIRIADSNPREGATAVVSGWGTTESGGSTIPDHLLAVDLEIID
# VSRCRSDEFGYGKKIKDTMLCAYAPHKDACQGDSGGPLVSGDRLVGVVSWGYGCGDVRYPGVYADVAHFHEWIERTAEEV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 123
#      E:  43 (gi|48957556,gi|41404402,gi|3945527,gi|164475238,gi|3864677,gi|48953473,gi|38624718,...)
#      W:  80 
# incompatible hint groups: 9
#      E:   9 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g57
###
# start gene g58
chr2R	AUGUSTUS	gene	7233786	7234639	0.1	+	.	g58
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7233786	7234639	0.1	+	.	g58.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7233786	7233786	.	+	.	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7233786	7234639	.	+	.	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7233847	7233849	.	+	0	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7233847	7234608	1	+	0	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7234606	7234608	.	+	0	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7234639	7234639	.	+	.	transcript_id "g58.t1"; gene_id "g58";
# protein sequence = [MLKFLILLSAVACALGGTIPEGLLPQLDGRIVGGTATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSARVIVTAAHCLQSVSA
# SSLQIRAGSSYWSSGGVVAKVSSFKNHEGYNANTMVNDIAVLHLSSSLSFSSTIKAIGLASSNPANGAAASVSGWGTESSGSSSIPSQLRYVNVNIVS
# QSRCSSSSYGYGNQIKSSMICAFASGKDSCQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAAANYPGVYADVAALRSWVINNA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 89
#      E:  11 (gi|3866020,gi|49006209,gi|133841127,gi|133841254,gi|133838495,gi|3865415,gi|133838620,...)
#      W:  78 
# incompatible hint groups: 13
#      E:  13 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g58
###
# start gene g59
chr2R	AUGUSTUS	gene	7236568	7237395	0.39	-	.	g59
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7236568	7237395	0.39	-	.	g59.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7236568	7236568	.	-	.	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7236568	7237395	.	-	.	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7236599	7236601	.	-	0	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7236599	7237360	1	-	0	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7237358	7237360	.	-	0	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7237395	7237395	.	-	.	transcript_id "g59.t1"; gene_id "g59";
# protein sequence = [MLKFVILLSAVACALGGTVPEGLLPQLDGRIVGGSATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSSNVIVTAAHCLQSVSA
# SVLQIRAGSSYWSSGGVTFSVSSFKNHEGYNANTMVNDIAIIKINGALTFSSTIKAIGLASSNPANGAAASVSGWGTLSYGSSSIPSQLQYVNVNIVS
# QSQCASSTYGYGSQIRSTMICAAASGKDACQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAYSNYPGVYADVAALRSWVISNA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 72
#      W:  72 
# incompatible hint groups: 133
#      E: 133 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g59
###
# start gene g60
chr2R	AUGUSTUS	gene	7238136	7239124	0.7	+	.	g60
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7238136	7239124	0.7	+	.	g60.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7238136	7238136	.	+	.	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7238136	7239124	.	+	.	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7238332	7238334	.	+	0	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7238332	7239093	1	+	0	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7239091	7239093	.	+	0	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7239124	7239124	.	+	.	transcript_id "g60.t1"; gene_id "g60";
# protein sequence = [MLKFVILLSAVACALGGTVPEGLLPQLDGRIVGGSATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSSNVIVTAAHCLQSVSA
# SVLQIRAGSSYWSSGGVTFSVSSFKNHEGYNANTMVNDIAIIKINGALTFSSTIKAIGLASSNPANGAAASVSGWGTLSYGSSSIPSQLQYVNVNIVS
# QSQCASSTYGYGSQIRSTMICAAASGKDACQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAYSNYPGVYADVAALRSWVISNA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 77
#      W:  77 
# incompatible hint groups: 134
#      E: 134 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g60
###
# start gene g61
chr2R	AUGUSTUS	gene	7240774	7241995	0.05	-	.	g61
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7240774	7241995	0.05	-	.	g61.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7240774	7240774	.	-	.	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7240774	7241995	.	-	.	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7241103	7241105	.	-	0	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7241103	7241864	1	-	0	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7241862	7241864	.	-	0	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7241995	7241995	.	-	.	transcript_id "g61.t1"; gene_id "g61";
# protein sequence = [MLKFVILLSAVACALGGTVPEGLLPQLDGRIVGGSATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSSNVIVTAAHCLQSVSA
# SVLQIRAGSSYWSSGGVTFSVSSFKNHEGYNANTMVNDIAIIKINGALTFSSTIKAIGLASSNPANGAAASVSGWGTLSYGSSSIPSQLQYVNVNIVS
# QSQCASSTYGYGSQIRSTMICAAASGKDACQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAYSNYPGVYADVAALRSWVINNA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 71
#      W:  71 
# incompatible hint groups: 119
#      E: 119 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
# end gene g61
###
# start gene g62
chr2R	AUGUSTUS	gene	7242806	7243630	0.38	+	.	g62
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7242806	7243630	0.38	+	.	g62.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7242806	7242806	.	+	.	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7242806	7243630	.	+	.	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7242838	7242840	.	+	0	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7242838	7243599	1	+	0	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7243597	7243599	.	+	0	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7243630	7243630	.	+	.	transcript_id "g62.t1"; gene_id "g62";
# protein sequence = [MLKFVILLSAVACALGGTVPEGLLPQLDGRIVGGSATTISSFPWQISLQRSGSHSCGGSIYSSNVIVTAAHCLQSVSA
# SVLQIRAGSSYWSSGGVTFSVSSFKNHEGYNANTMVNDIAIIKINGALTFSSTIKAIGLASSNPANGAAASVSGWGTLSYGSSSIPSQLQYVNVNIVS
# QSQCASSTYGYGSQIRSTMICAAASGKDACQGDSGGPLVSGGVLVGVVSWGYGCAYSNYPGVYADVAALRSWVISNA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 84
#      E:   7 (gi|38623483,gi|3866571,gi|48952623,gi|49005531,gi|49005619,gi|49002958,gi|49004519)
#      W:  77 
# incompatible hint groups: 118
#      E: 117 (gi|164472830,gi|164495575,gi|164482424,gi|164474716,gi|164476314,gi|164480377,gi|164484508,...)
#      W:   1 
# end gene g62
###
# start gene g63
chr2R	AUGUSTUS	gene	7243637	7244105	0.55	-	.	g63
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7243637	7244105	0.55	-	.	g63.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7243637	7243637	.	-	.	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7243637	7243770	.	-	.	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7243671	7243673	.	-	0	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7243771	7243831	1	-	.	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7243671	7243770	1	-	1	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7243832	7243977	1	-	0	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7243832	7244105	.	-	.	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7243975	7243977	.	-	0	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7244105	7244105	.	-	.	transcript_id "g63.t1"; gene_id "g63";
# protein sequence = [MDNWKITAEELIRLRESCLQCIRDGELYELRNDAKLRAVYSTQNYEEFKNIVDAAHLRPVTKGDKANFKTKNRLWNSA
# ARD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 35
#      E:   1 
#      W:  34 
# incompatible hint groups: 9
#      E:   2 (gi|10606957,gi|38623894)
#      W:   7 
# end gene g63
###
# start gene g64
chr2R	AUGUSTUS	gene	7244206	7245039	0.71	+	.	g64
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7244206	7245039	0.71	+	.	g64.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7244206	7244206	.	+	.	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7244206	7245039	.	+	.	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7244248	7244250	.	+	0	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7244248	7245006	1	+	0	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7245004	7245006	.	+	0	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7245039	7245039	.	+	.	transcript_id "g64.t1"; gene_id "g64";
# protein sequence = [MAVYGIVATVLVLLLLGDASDVEATGRIIGGSDQLIRNAPWQVSIQISARHECGGVIYSKEIIITAGHCLHERSVTLM
# KVRVGAQNHNYGGTLVPVAAYKVHEQFDSRFLHYDIAVLRLSTPLTFGLSTRAINLASTSPSGGTTVTVTGWGHTDNGALSDSLQKAQLQIIDRGECA
# SQKFGYGADFVGEETICAASTDADACTGDSGGPLVASSQLVGIVSWGYRCADDNYPGVYADVAILRPWIVKAANAI]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 83
#      E:   6 (gi|15469809,gi|103654234,gi|103662882,gi|103664125,gi|103656788,gi|49003726)
#      W:  77 
# incompatible hint groups: 1
#      E:   1 (gi|38623894)
# end gene g64
###
# start gene g65
chr2R	AUGUSTUS	gene	7245415	7246695	0.35	-	.	g65
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7245415	7246695	0.35	-	.	g65.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7245415	7245415	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7245415	7245776	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7245621	7245623	.	-	0	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7245777	7245840	1	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7245930	7246462	1	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7245621	7245776	1	-	0	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7245841	7245929	1	-	2	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7245841	7245929	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7246463	7246508	1	-	0	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7246463	7246526	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7246506	7246508	.	-	0	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7246593	7246695	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7246695	7246695	.	-	.	transcript_id "g65.t1"; gene_id "g65";
# protein sequence = [MADEQPNLVAGHPPALKAGGMRIVQHKAPTAERAPKDAEDCTGLTQPIAVNSGSVSGAPVKGNTDFTPASAQVAHSPK
# PPAAVQQKPQIHIQQPRK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 3/3
#      E:   2 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   1 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 72
#      E:  14 (gi|13759382,gi|13759385,gi|114058817,gi|133847404,gi|8116088,gi|41401133,gi|48957951,...)
#      W:  58 
# incompatible hint groups: 5
#      W:   5 
# end gene g65
###
# start gene g66
chr2R	AUGUSTUS	gene	7246949	7247675	0.87	-	.	g66
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7246949	7247675	0.87	-	.	g66.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7246949	7246949	.	-	.	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7246949	7247675	.	-	.	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7247024	7247026	.	-	0	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7247024	7247590	0.97	-	0	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7247588	7247590	.	-	0	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7247675	7247675	.	-	.	transcript_id "g66.t1"; gene_id "g66";
# protein sequence = [MNPNMNMMPMSGPQMMQVMQSSPSGPPGPVQHQQQQPPQPLQQQQQAEKLDNISRVKSLLGPLRESMFLTIRSSAFAL
# QQNNLADNLKRDTGAHHVPRFDKHLEDFYACCDQIEIHLKTAMQCLQQQNSSNHYLPGPVTPMRMETFMPDNAGPISYPTYLNTVRVHIQSAKDIHDT
# LISAAQNISQAD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 75
#      E:  22 (gi|114070331,gi|114070332,gi|107272417,gi|49148081,gi|49372904,gi|107281807,gi|107231576,...)
#      W:  53 
# incompatible hint groups: 0
# end gene g66
###
# start gene g67
chr2R	AUGUSTUS	gene	7248206	7250908	0.45	+	.	g67
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7248206	7250908	0.45	+	.	g67.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7248206	7248206	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7248206	7248337	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7248464	7248787	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7249020	7250346	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7249405	7249407	.	+	0	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7250347	7250409	1	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7250572	7250633	1	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7249405	7250346	0.88	+	0	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7250410	7250571	1	+	0	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7250410	7250571	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7250634	7250774	1	+	0	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7250634	7250908	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7250772	7250774	.	+	0	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7250908	7250908	.	+	.	transcript_id "g67.t1"; gene_id "g67";
# protein sequence = [MQRDDGFVYCYGNLYSLLLYWGLVTIRVRSPDRGGAFSNRWTVCYALFTRSFMVICFMATVMTKLRDPEMSAAMFGHL
# SPLVKAIFTWECLSCSVTYIEYCLSLDLQKDRHLKLVARMQEFDRSVLMVFPHVQWNYRRARLKYWYGTVIVGFCFFSFSISLIFDTTRCTCGIPSTL
# LMAFTYTLLTSSVGLLGFVHIGIMDFIRVRLRLVQQLLHQLYQADDSSEVHERIAYLFEMSKRCSFLLAELNGVFGFAAAAGIFYDFTIMTCFVYVIC
# QKLLEREPWDPEYVYMLLHVAIHTYKVVITSTYGYLLLREKRNCMHLLSQYSRYFSGQDVARRKTEDFQHWRMHNRQAAMVGSTTLLSVSTIYLVYNG
# MANYVIILVQLLFQQQQIKDHQLTSGKDVDIVGPMGPITHMD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 90.9
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
# CDS introns: 1/2
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 5/5
#      E:   5 
#      W:   3 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 177
#      E:  97 (gi|222505509,gi|222490895,gi|13756659,gi|222491040,gi|222506254,gi|2761862,gi|222489974,...)
#      W:  80 
# incompatible hint groups: 1
#      E:   1 (gi|133836491)
# end gene g67
###
# start gene g68
chr2R	AUGUSTUS	gene	7254226	7257786	0.22	+	.	g68
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7254226	7257786	0.22	+	.	g68.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7254226	7254226	.	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7254226	7254606	.	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7254420	7254422	.	+	0	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7254607	7256052	1	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7256204	7256261	1	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7254420	7254606	1	+	0	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7256053	7256203	1	+	2	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7256053	7256203	.	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7256262	7257741	1	+	1	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7256262	7257786	.	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7257739	7257741	.	+	0	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7257786	7257786	.	+	.	transcript_id "g68.t1"; gene_id "g68";
# protein sequence = [MKDVKVARAISESSTTSDNTSDFIEIVKKYDVVYNNHNPDYKNVEVKLKVWTQIADEIGLSVEASKRKWKNLRDSYTK
# YLRSFRVGTKTSKKYQYWAHADHMDFLKPFQGPGRNSANGNGKSNDEDDTECDFGYQVLAKAASNGGEDELKITIATASAGCSSMGTHTVNTYTTALS
# STSASGITSSLGATTPPNMISPGSNLGGTGGGSGSVGPQIHNSNSNGSATGSLNCAAVAPLSSMTPPATSGSNSAVVLPLPISPASSVAAAAAAVSKA
# NANALASLANHLPMGLGVSGLAQQMFPLATLKAAAVAAGLPLPPTITPPGCSTGSATNSNVGCLIIEPHLFAAADNFKKELTAAAAAGAPLGLFQNLA
# NQVQNANRLNGSCPSLPMGNPTPPPPPPAPPASKVRRVQPSPQTTAINLSCSGGNSVQTQQQQSMQMPQIQQQQQPSPAKTRKICDPRFPSDWDVSAV
# LQANRELDANTLFFLSLARQVRAMPMKFQSLAKMRCMRIVSDLELELENFDCNGGAPPPDDSGGGGAGNLKYCSIDTPPPPPQDGSVVIPPPPVGPEG
# STEHFVYVMSPSRVESMIDISSDEEATMNGAPSTGQV]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 218
#      E:  23 (gi|166159953,gi|166161301,gi|15462998,gi|15480230,gi|15478460,gi|15531609,gi|15521116,...)
#      W: 195 
# incompatible hint groups: 7
#      W:   7 
# end gene g68
###
# start gene g69
chr2R	AUGUSTUS	gene	7257805	7258685	0.28	-	.	g69
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7257805	7258685	0.28	-	.	g69.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7257805	7257805	.	-	.	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7257805	7258218	.	-	.	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7257958	7257960	.	-	0	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7258219	7258277	1	-	.	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7257958	7258218	1	-	0	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7258278	7258517	1	-	0	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7258278	7258685	.	-	.	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7258515	7258517	.	-	0	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7258685	7258685	.	-	.	transcript_id "g69.t1"; gene_id "g69";
# protein sequence = [MSRQLFAICLIAAVCASGVYGSCKATVSSFSTQDATILTQLAHVGEFTLQCSGAAPASLFAEFPCGKVVPVAKVGDNK
# YQVSWVEDIKQGSSGNVQVRLFDEDGYANVRKAQRDGDKVSSVKSLLDISVPTKGAYKGPWIKAELLAAFLVGGFAYFAFTTKGKVQS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 153
#      E:  76 (gi|38623493,gi|114071535,gi|38626613,gi|133847042,gi|114069716,gi|114073008,gi|114058630,...)
#      W:  77 
# incompatible hint groups: 6
#      E:   4 (gi|15460232,gi|15472478,gi|114063524,gi|114063525)
#      W:   2 
# end gene g69
###
# start gene g70
chr2R	AUGUSTUS	gene	7261406	7264601	0.22	+	.	g70
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7261406	7264601	0.22	+	.	g70.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7261406	7261406	.	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7261406	7261905	.	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7261484	7261486	.	+	0	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7261906	7262812	1	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7263424	7263733	1	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7261484	7261905	0.99	+	0	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7262813	7263423	1	+	1	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7262813	7263423	.	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7263734	7264326	1	+	2	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7263734	7264601	.	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7264324	7264326	.	+	0	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7264601	7264601	.	+	.	transcript_id "g70.t1"; gene_id "g70";
# protein sequence = [MSLSVASRRRLQTTNASSSVVNPSSSTSGGRYHLPLSVRKQHSFIEPTSRFSTQQRGYLSRGLSVGRSIENIRQKLYP
# VGRQASLAVEETAPRTAPRITASQVQGLRLRDRSLVAWSSTSSLLKDQESERAAQVEQPEAKISAKADKNRINLNIVLSQTIRATNEREQEPEVDADA
# DLEAERASDIEGSHPVENPDIQLSISPALTVQRRPPLVRAMSAPVRGLDESSKGVIAASKRSQQKLRRRKIFTRTPSSSVPLDVIGDNSTSSSSVAGN
# ASKKALNRARSVVAPDVITLVSLLSSEGSDSEREDNSSVAVSSPPTGGSDKQTSGASQRRAPLLRKTGKSVSFQDSYPPTFQLASKEYSHMIRRGSIA
# PLAARIRANRPPTAPPVSIFLTDVQAKMDQQPKKEGGADPPVVTLSPDEAKKENNNNAANCEDQQPQPDHNYPAYVRSLKERECWKLHQKMGAKGVSV
# SYETVLRGMLTPTEFRHFQKQREQEEARVLEEAEAAEAAAAAAILESGEKDGRKPPVTAIERLSEALLQSK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 85.7
# CDS exons: 3/3
#      E:   2 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 78
#      E:   3 (SRR023505.784347/2,gi|160422303)
#      W:  75 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   2 (gi|13683629,gi|38628062)
# end gene g70
###
# start gene g71
chr2R	AUGUSTUS	gene	7264830	7266875	0.06	-	.	g71
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7264830	7266875	0.06	-	.	g71.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7264830	7264830	.	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7264830	7265503	.	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7265036	7265038	.	-	0	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7265504	7265562	1	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7265752	7266469	1	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7265036	7265503	1	-	0	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7265563	7265751	1	-	0	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7265563	7265751	.	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7266470	7266532	1	-	0	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7266470	7266875	.	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7266530	7266532	.	-	0	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7266875	7266875	.	-	.	transcript_id "g71.t1"; gene_id "g71";
# protein sequence = [MRSCGPSLIKYVLFAFNVLFAISGLGILIAGAVVLADVNEFNHFVEGRVLAPPIVLIVTGLIIFLIASLGCFGAIKES
# PTLLITFAVLLAVIFIVELAVGIAASVFKKDLEGMVKNSLQESIKRSNSEDTMAWDNIQQKLMCCGVDSPADWRTLSANKTLPGSCCQPQYIDSTVGH
# CLESPALGKDKYFQVGCVGKLKDRIEKNAIILIGVGIGIAFIQILGIVLACYLANSIRQERAK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 85.7
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 4
#      E:   4 (gi|103722792,gi|195958437)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g71
###
# start gene g72
chr2R	AUGUSTUS	gene	7267953	7271605	0.6	-	.	g72
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7267953	7271605	0.48	-	.	g72.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7267953	7267953	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7267953	7268298	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7268187	7268189	.	-	0	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7268299	7269077	1	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269100	7269167	1	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269397	7269459	1	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269688	7269753	1	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7268187	7268298	1	-	1	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269078	7269099	1	-	2	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269078	7269099	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269168	7269396	1	-	0	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269168	7269396	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269460	7269687	1	-	0	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269460	7269687	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269754	7269816	1	-	0	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269754	7269822	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7269814	7269816	.	-	0	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7271520	7271605	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7271605	7271605	.	-	.	transcript_id "g72.t1"; gene_id "g72";
# protein sequence = [MMQYLVVSLALCATICSAAQTRNMPIQAIAYLIGPVQSDNTQVKGNVTFTQNDCGQNVHVRVQLEGLKEGKHGFHIHE
# KGDLTNGCISMGAHYNPDKVDHGGPDHEVRHVGDLGNLEANSTGIIDVTYTDQVITLTGKLGIIGRGVVVHELEDDLGLGNHTDSKKTGNAGGRIACG
# VIGINSDVDEWPCRDGGAGALRYSFSILTVIVALIMARSLD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 92.3
# CDS exons: 5/5
#      E:   2 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 2/3
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 100
#      E:  10 (gi|164476969,gi|164477407,gi|107283518,gi|49378967,gi|164474845)
#      W:  90 
# incompatible hint groups: 78
#      W:  78 
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7267953	7271605	0.12	-	.	g72.t2
chr2R	AUGUSTUS	tts	7267953	7267953	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7267953	7268533	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7268723	7269099	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7269074	7269076	.	-	0	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269100	7269167	1	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269397	7269459	1	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7269688	7269753	1	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269074	7269099	1	-	2	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269168	7269396	1	-	0	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269168	7269396	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269460	7269687	1	-	0	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269460	7269687	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7269754	7269816	1	-	0	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7269754	7269822	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7269814	7269816	.	-	0	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7271520	7271605	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7271605	7271605	.	-	.	transcript_id "g72.t2"; gene_id "g72";
# protein sequence = [MMQYLVVSLALCATICSAAQTRNMPIQAIAYLIGPVQSDNTQVKGNVTFTQNDCGQNVHVRVQLEGLKEGKHGFHIHE
# KGDLTNGCISMGAHYNPDKVDHGGPDHEVRHVGDLGNLEANSTGIIDVTYTDQVITLTGKLGIIGRGVVVHELEDDLGLGNHTDSKKTGNAGGRIACG
# VIGIK]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 84.6
# CDS exons: 4/4
#      E:   1 
#      W:   4 
# CDS introns: 3/3
#      E:   3 
# 5'UTR exons and introns: 2/3
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 2/3
#      E:   1 
#      W:   2 
# hint groups fully obeyed: 155
#      E:   9 (gi|164476969,gi|164477407,gi|107283518,gi|49378967,gi|164474845)
#      W: 146 
# incompatible hint groups: 23
#      E:   1 
#      W:  22 
# end gene g72
###
# start gene g73
chr2R	AUGUSTUS	gene	7272249	7274685	0.64	-	.	g73
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7272249	7274685	0.64	-	.	g73.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7272249	7272249	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7272249	7272947	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7272566	7272568	.	-	0	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7272948	7273060	1	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7274102	7274167	0.7	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7274572	7274629	0.7	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7272566	7272947	1	-	1	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7273061	7274101	0.7	-	1	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7273061	7274101	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7274168	7274571	0.7	-	0	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7274168	7274571	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7274630	7274659	0.7	-	0	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7274630	7274685	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7274657	7274659	.	-	0	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7274685	7274685	.	-	.	transcript_id "g73.t1"; gene_id "g73";
# protein sequence = [MTASFYSLTSTILNPKGCGSAVKYSLHSTAETNQETASTTTTSTHCSTTGRRRKGGSLGGTLSSRSTRSESKELRSAL
# QDREAVIQNLRIQLCLGKLPRPTGPPLDESEKPAAEQKLNRLKTEAENKRIKIKNLKSALEKLDITDNIDIRIRQAELEYALGREELQMLSIVEEARA
# LQARLEKSKPEAQTLYNIISSGVSLSLHAVHATSGRWAVQQRTDQPGFYVEWALEGDGLYKGDRILEINGRLVTGKSKEELQKQVGNSGKCQMVVLRK
# KSVPIPQKQLDQEKENNMRLQHRISYLEEQVRELQTVKEHHPSQQQQQQQQQQQNPQQNPQQNPQQTSSNQSQHVTSISISSPPSTPPEKPLIFQRGN
# YITTLVGGKPIELMGDDMASTQTPPGHVTKTLIKENTHIDLRDRLSHMYSMPSKSLSASKISINSDSAYMQHHRRDKERHRDRQHRERPRDPLQQQQQ
# LHREHLMSTHARSVEHLNHYNGLDRRRDTPRQSESNTLRARLPSDMRSVKSLDFDSENESKPATETRTTRPTPPKKPLRLSLQRAQSLQTVELHPCAD
# IERKRPMKRVHHNNNNNNKGGESPTGEGQTMLIENCSPMHTASLGRHKLI]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 66.7
# CDS exons: 3/4
#      E:   3 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/3
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 0/1
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 194
#      E:  17 (gi|8116262,gi|107260179,gi|49363687,gi|107277541,gi|103725080,gi|49226306,gi|103758377,...)
#      W: 177 
# incompatible hint groups: 7
#      W:   7 
# end gene g73
###
# start gene g74
chr2R	AUGUSTUS	gene	7274737	7284935	0.13	-	.	g74
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7274737	7284935	0.13	-	.	g74.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7274737	7274737	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7274737	7274820	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7274765	7274767	.	-	0	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7274821	7274876	1	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7274996	7275049	1	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7275414	7275504	1	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7275650	7275712	1	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7274765	7274820	1	-	2	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7274877	7274995	1	-	1	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7274877	7274995	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7275050	7275413	1	-	2	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7275050	7275413	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7275505	7275649	1	-	0	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7275505	7275649	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7275713	7275847	0.5	-	0	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7275713	7276278	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7275845	7275847	.	-	0	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7278576	7278686	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7284399	7284935	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7284935	7284935	.	-	.	transcript_id "g74.t1"; gene_id "g74";
# protein sequence = [MLAALKRLSTNQPPTLVSNIRYLSSFGTMSLPERQPFSPDFFFRQLFDGESSTYSYLLADLKNGQAVIIDPVLEQAKR
# DAQLVKDLGFELKYAINTHMHADHITGSGWLRKLTGCQSVIAAASGAKADRHLNEGDRIDFGTHVIDALATPGHTNGCMTYVIKDQGCVFTGDTLLIR
# GCGRTDFQEGCPRNLYENVHSKIFTLPENFRIYPAHDYKGQMESSVWEEKRYNPRLTKDIEEFVKIMENLNLPYPKKIDASLPANRECGVYDIPKE]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 93.3
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 4/5
#      E:   4 
#      W:   3 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 166
#      E:  20 (gi|49203542,gi|15066072,gi|15324224,gi|15052521,gi|3113725,gi|15072187,gi|15317597,...)
#      W: 146 
# incompatible hint groups: 6
#      E:   1 (gi|107255553)
#      W:   5 
# end gene g74
###
# start gene g75
chr2R	AUGUSTUS	gene	7293096	7295569	0.07	+	.	g75
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7293096	7295569	0.07	+	.	g75.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7293096	7293096	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7293096	7293515	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7293191	7293193	.	+	0	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7293516	7293580	1	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7293645	7293717	1	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7293850	7293905	1	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7294254	7294308	1	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7294552	7294611	1	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7293191	7293515	0.95	+	0	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7293581	7293644	1	+	2	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7293581	7293644	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7293718	7293849	1	+	1	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7293718	7293849	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7293906	7294253	1	+	1	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7293906	7294253	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7294309	7294551	1	+	1	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7294309	7294551	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7294612	7295482	1	+	1	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7294612	7295569	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7295480	7295482	.	+	0	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7295569	7295569	.	+	.	transcript_id "g75.t1"; gene_id "g75";
# protein sequence = [MKTPLSQKTGFFAEYYLKLKDQAGPNCESDIAKLSACKSDEERVAYVEKLPWVQAGDANLVVNQEFAGKNASLAAEIK
# ERATSAFKAKKWLEAMMLYTRSYVALPSENVAEIRVVLANRSATLYHMQKYQECLIDIKRALDLSYSKDLIYKLYERQARCYMALKDYPHTIDSFKKC
# ITAMDDSTLASDKRAKLNLDAMTMIKMLQNDPRTAKQEAKQQKQKIALDQAKPVKLENEFVSPLVRIDSNRQEGRFARASADVKPGEELLVERPFVSV
# LLEKFAKTHCENCFMRTVVPVACPRCADVLYCSEQCREEASKKYHKYECGIVPIIWRSGASINNHIALRIIASKPLDYFLKLKPTIDEELTPEQLISL
# PKDDFRRVAQLERHQGERQPSNFFQHVLMARFLTNCLRAGGYFGSEPKPDEVSIICSLVLRSLQFIQFNTHEVAELHKFSSSGREKSIFIGGAIYPTL
# ALFNHSCDPGVVRYFRGTTIHINSVRPIEAGLPINENYGPMYTQDERSERQARLKDLYWFECSCDACIDNWPKFDDLPRDVIRFRCDAPNNCSAVIEV
# PPSCNDFMVKCVTCGEITNILKGLKVMQDTEMMTRTAKRLYETGEYPKALAKFVDLIRIMYEVLAPPFPDFCESQQHLKDCFLNLGNVYTLD]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 92.3
# CDS exons: 6/6
#      E:   6 
#      W:   6 
# CDS introns: 5/5
#      E:   5 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 200
#      E:  13 (gi|13765535,gi|2700433,SRR023608.10801751/2,gi|49201495,gi|103685390,gi|49399616,...)
#      W: 187 
# incompatible hint groups: 1
#      E:   1 (gi|8116894)
# end gene g75
###
# start gene g76
chr2R	AUGUSTUS	gene	7296060	7299075	0.08	-	.	g76
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7296060	7299075	0.08	-	.	g76.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7296060	7296060	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7296060	7296317	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7296172	7296174	.	-	0	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7296318	7296370	1	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7296172	7296317	1	-	2	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7296371	7296911	1	-	0	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7296371	7297045	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7296909	7296911	.	-	0	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7297176	7297510	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7297595	7298255	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7298863	7299075	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7299075	7299075	.	-	.	transcript_id "g76.t1"; gene_id "g76";
# protein sequence = [MKSAIICVFFIATATWAQDTRPEVPIYLPPPSITTTTTEAPVTTTITEEPTTESLTTTTTETSSTFSTTEPAATTTTE
# ISTTSTTEPSTTTLTTKKIPSTTTAIITTTGVETSTTTTTETTTASTTQGDPIYPTYRPPYMRPSTSGIPPVSSTNPWIWNNGNPAVKCYLRNQQEYR
# SDCYGVGWHPTTICYRCCYYDQNRIAGCSKIHRGRCSWYDYARWISPNFYVY]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 81.8
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 5/7
#      E:   4 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 41
#      E:  14 (gi|26254450,gi|133846396,gi|133846528,gi|133846527,gi|133846658,gi|133846397,gi|133846269,...)
#      W:  27 
# incompatible hint groups: 2
#      W:   2 
# end gene g76
###
# start gene g77
chr2R	AUGUSTUS	gene	7299303	7317175	0.49	-	.	g77
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7299303	7317175	0.49	-	.	g77.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7299303	7299303	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7299303	7300079	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7299891	7299893	.	-	0	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7300080	7300136	1	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7300491	7308762	1	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7299891	7300079	1	-	0	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7300137	7300490	1	-	0	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7300137	7300490	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7308763	7308939	0.98	-	0	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7308763	7308941	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7308937	7308939	.	-	0	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7316558	7317175	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7317175	7317175	.	-	.	transcript_id "g77.t1"; gene_id "g77";
# protein sequence = [MSKFVGVADITENKKIWRMLLGELVGTFFLIFVGVGSTTSGSVPQIAFTFGLTVATIAQGLGHLSGCHINPAVTLGFL
# IVGEISILKAAFYIIVQCVGAIAGAAVIKVALDGVAGGDLGVSSFDPSLNCAQAVLIEALITFILVFVVKAVSDPGRQDIKGSAPLAVGLAIAAGHLC
# AIKLSGASMNPARSFGPAVVQGVWTYHWVYWVGPIAGGLLAGIIYRLIFKVRKGDDETDSYDF]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 200
#      E:  33 (gi|49200370,gi|107276867,gi|49002495,gi|26256452,gi|38623491,gi|133849369,gi|107215794,...)
#      W: 167 
# incompatible hint groups: 75
#      E:   2 
#      W:  73 
# end gene g77
###
# start gene g78
chr2R	AUGUSTUS	gene	7301976	7302969	0.12	+	.	g78
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7301976	7302969	0.12	+	.	g78.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7301976	7301976	.	+	.	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7301976	7302129	.	+	.	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7302061	7302063	.	+	0	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7302130	7302190	0.95	+	.	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7302061	7302129	0.95	+	0	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7302191	7302820	0.95	+	0	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7302191	7302969	.	+	.	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7302818	7302820	.	+	0	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7302969	7302969	.	+	.	transcript_id "g78.t1"; gene_id "g78";
# protein sequence = [MQKSIIFLVLPLCLSSSYSAACEGVESDSQCAAYCYGVLNPCIASMGNLQRRVEACEAAVAIARIALNDRRLDNFGTS
# TNLQLENQNTSQQLLTHGTAMGRKLEENEIFQQLGSKYYYIEKEEKLNWHDALDKCHKMGGHLASLQSQEELDRFNNQLNGLNRYWIDVTNQFNESEF
# VSVTKGSKANFLSWADGEPTKDGECVDIRTFNGKTTMNDNSCFANLYFICEKSIEI]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 80
# CDS exons: 2/2
#      W:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 72
#      E:   1 
#      W:  71 
# incompatible hint groups: 3
#      E:   1 
#      W:   2 
# end gene g78
###
# start gene g79
chr2R	AUGUSTUS	gene	7303106	7306047	0.19	+	.	g79
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7303106	7306047	0.19	+	.	g79.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7303106	7303106	.	+	.	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7303106	7303187	.	+	.	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7304495	7304553	.	+	.	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7305099	7306047	.	+	.	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7305309	7305311	.	+	0	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7305309	7305734	0.98	+	0	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7305732	7305734	.	+	0	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7306047	7306047	.	+	.	transcript_id "g79.t1"; gene_id "g79";
# protein sequence = [MLLLTNFNGTLRTAAENYDLIGSFIIQFDNETIMVNGQNYSSYSVSHLMAMPAVLSHITASNFQLSLEYVHDVSMKNL
# EKMSNMASELLASLLTEAALAICIFLGFYFLWKKLMSTKGMPDVREIAANLEALGQTELNKAH]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 0
# CDS exons: 0/1
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 0/5
# 3'UTR exons and introns: 0/1
# hint groups fully obeyed: 0
# incompatible hint groups: 1
#      E:   1 
# end gene g79
###
# start gene g80
chr2R	AUGUSTUS	gene	7323715	7329718	0.5	+	.	g80
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7323715	7329718	0.5	+	.	g80.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7323715	7323715	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7323715	7323927	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7327303	7327373	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7327338	7327340	.	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7327374	7327474	1	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7327631	7327691	1	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7327836	7328572	1	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7328996	7329439	1	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7327338	7327373	1	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7327475	7327630	1	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7327475	7327630	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7327692	7327835	1	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7327692	7327835	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7328573	7328995	1	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7328573	7328995	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7329440	7329475	1	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7329440	7329718	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7329473	7329475	.	+	0	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7329718	7329718	.	+	.	transcript_id "g80.t1"; gene_id "g80";
# protein sequence = [MGKFEYSLGLNELKSKELRLWQALIGEFLGNLILNFFACGACTQIEDGTFKALAFGLAIFMAITIVGHLSGGHVNPAV
# TAGMLVAGRISLIRAFFYVVFQCLGAIAGTAAVKILIDQDYYNGLGHTSLAPNITELQGLGIEFFLGLLLVLVVFGACDPHKPDSRYTAPLAIGMAVT
# LGHLGTIRYTGASMNPARTVGTAFATDIWASHWVYWVGPVLGGVAAALLYTQVLEAKPVPKVNEASEKYRTHADEREMRKLEGARDYA]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 150
#      E:  35 (gi|222758435,gi|222750632,gi|14691114,gi|14706509,gi|14703991,gi|15321227,gi|14706622,...)
#      W: 115 
# incompatible hint groups: 3
#      W:   3 
# end gene g80
###
# start gene g81
chr2R	AUGUSTUS	gene	7330005	7336228	0.17	+	.	g81
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7330005	7336228	0.17	+	.	g81.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7330005	7330005	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7330005	7330617	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7332045	7332132	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7332189	7332265	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7332217	7332219	.	+	0	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7332266	7333637	0.49	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7333695	7334660	0.59	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7334714	7334774	0.52	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7334869	7335031	0.85	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7332217	7332265	0.49	+	0	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7333638	7333694	0.49	+	2	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7333638	7333694	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7334661	7334713	0.49	+	2	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7334661	7334713	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7334775	7334868	0.49	+	0	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7334775	7334868	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7335032	7335255	0.85	+	2	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7335032	7336228	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7335253	7335255	.	+	0	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7336228	7336228	.	+	.	transcript_id "g81.t1"; gene_id "g81";
# protein sequence = [MWTQRNAVGNWLLVLTAVIGFLTFIWIPQTSAECQTRSIYCYECDSWTDARCKDPFNYTALPRDQPPLMTCNGCCVKM
# VRHQRSPYEVVRRMCTSQLQINLFMVDHVCMMESSGNGHMCFCEEDMCNSSKNLHTNGCQLHLIPIAVAVSWLMGQLLSR]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 5/5
#      E:   5 
#      W:   5 
# CDS introns: 4/4
#      E:   4 
# 5'UTR exons and introns: 5/5
#      E:   5 
#      W:   3 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 204
#      E:  46 (gi|222569856,gi|222607541,gi|222715875,gi|222710993,gi|222611980,gi|222609987,gi|222556302,...)
#      W: 158 
# incompatible hint groups: 25
#      E:  24 (gi|8119871,gi|107275499,gi|49195347,gi|49203668,gi|107232781,gi|49189082,gi|107233880,...)
#      W:   1 
# end gene g81
###
# start gene g82
chr2R	AUGUSTUS	gene	7336236	7339104	0.31	-	.	g82
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7336236	7339104	0.31	-	.	g82.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7336236	7336236	.	-	.	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7336236	7339104	.	-	.	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7338072	7338074	.	-	0	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7338072	7338461	0.96	-	0	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7338459	7338461	.	-	0	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7339104	7339104	.	-	.	transcript_id "g82.t1"; gene_id "g82";
# protein sequence = [MDCDGVHDEKYSQTVVSYVKKHHFRGWLWVVGVAQLRESEGISLCRGCATVLVVEESGVRRERALLLQHITELNENKK
# IFSSPFERILRTPLVEFVARAPLGVVSWGEWVKWRIEVSGGKHYLDVCVVS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# CDS introns: 0/0
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 233
#      E:  79 (gi|107292509,gi|49194961,gi|107214105,gi|49202857,gi|49370488,gi|107224396,gi|107233654,...)
#      W: 154 
# incompatible hint groups: 7
#      E:   6 (gi|49399792,gi|107315118,gi|103771792,gi|107283100,gi|103700655,gi|49375193)
#      W:   1 
# end gene g82
###
# start gene g83
chr2R	AUGUSTUS	gene	7340105	7351226	0.07	+	.	g83
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7340105	7351226	0.07	+	.	g83.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7340105	7340105	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7340105	7340390	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7340898	7341974	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7341822	7341824	.	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7341975	7342038	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7342175	7342329	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7342569	7342637	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7342793	7343092	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7343261	7343324	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7343507	7343871	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7344240	7344309	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7344426	7344492	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7347825	7348095	1	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7341822	7341974	0.96	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7342039	7342174	1	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7342039	7342174	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7342330	7342568	1	+	2	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7342330	7342568	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7342638	7342792	1	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7342638	7342792	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7343093	7343260	1	+	1	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7343093	7343260	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7343325	7343506	1	+	1	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7343325	7343506	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7343872	7344239	1	+	2	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7343872	7344239	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7344310	7344425	1	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7344310	7344425	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7344493	7347824	1	+	1	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7344493	7347824	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7348096	7349318	1	+	2	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7348096	7351226	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7349316	7349318	.	+	0	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7351226	7351226	.	+	.	transcript_id "g83.t1"; gene_id "g83";
# protein sequence = [MSKLSFRARHLDPSKQMPIYLAEELPDLPEYSAINRAVPQMPSGMEKEEESEHHLQRAICTGLIIPTPEVLQTDQPFY
# DAYYPPDYKMPRQMIHMQPLGLDTEVPDYDMDSADEDWLSQQQRLELTELKFEQMMDRLEKSSGQTVVTLNEAKSLLNQDDETSISVYDYWLNKRLKM
# QHPLILTVKTESRPGASSNNPYLAFRRRTEKMQTRKNRKNDEASYEKMLKLRRDLQRATTILEMVRRREETKRDHLKMTVNIFEKRVEMRDFNGAVYS
# ELNSQYKNTRPAYNPLYTNQYSQGAAAVGTAGAILAALPTGLLPGGAGAAGNANVFGSASQYLNSSNLTMDAISGSGNGNSSRKEKRPYKKRKHKLPR
# DKQQHQQQQTQQHQQQQYLPASGGAGVSPAHHLPHHLHHLSRQQSASPAANDSIADSEEEDYFGAGAQNGNKLGSESEEETPFAFRRRSSCVYLPTRQ
# RDGRYPWDSADEDMAPSGACSDAKYRYTLTSLNYPRPRCIGFARRRLGRGGRILLDRATTNFDDFWSQLDYTVMESVTVNKCRDKIKQRDPDQLCKPS
# SPPTVVDLVPAGKPVDGEHPVPELIKEEPSSDTEKPVAATESGRESKERELEEKFENDVDDEFVASDDENVSRLGIYSSAVTLPQSCADLRQKRRRLR
# RKKQQLRELNAAKRLKRSSEAVATAEDVQLEDEDTKPDLRPLPRAYLQRLALILGQKLKVEEDDNTEVSENVAPELLEMNDPEQLQPPRANHQQHHRS
# NHNNNNNTVLNNNNSSSSNVMNKDVSISEKINVIKQEAEELVGGKCEDQPVASTSAAAAAARAAEAAAAAEAASSTTTLAAPNPGPSLEEVAKTIKRE
# MIDADDSNEPLSSIRTAAVMLSTQTSVSELMDDEAEDDVNLAQLSSIIRHTAVKKELEAQQHQQQVQHEQMQAARKMEEDEAAPCLNQLPDVIRLRNI
# RNSQVHARPKDLFVQAPVDEEFNADYMGGLSPTSSQRLDICNELLSEIRRDWLHFRPKTPTDELSDSQDCEVGKTCDSHAVDWTQDTPISVELNRLGK
# REAEESDSSSYFLSSGFKYRDLESDAQLLQTVQAQDYARGSSKSPNCSGSGSGSALEFNLSGGDSLNDINNLLGCDDEDDNHEHMLDNILQECAMDDP
# KALNQATNFWNGILDGEAAVDEVEMADQLLDCIDEKKSKVGAADTSKRAGRNRKARLIQAPVGSSAFTVCPTAETLKERELFFSQAPPVEVPPKEKTP
# AEVELPEVVVKETANLPVKVEAVEKPQSEVLPVAPQPQQLQPQAITLPTTQLINIPAQISTQKQHQQPQVTQLLNQFANAGPQIIARTEYGGGAAVGD
# IVTITPHTGSSPLPTLTAQQQLQHQLAQAQLRNVTVQQRQATPQNPNQNQNPQQQLLFQMQRDPSRSLTPLQAAGAGATGNHLIYTTSCGEIVTAGAA
# ASASQKVTYAIQKAGVSSGGATTASIGPNTVITLSNVKVQNDDISSGGSGNSGSSVNIINTASGQQLAVHSIAGMQQQGQQQVQQVTTSTPLLVATPT
# RNNVQQQQQQLVQQQPIVWRQVSGTNTAVATTAVLSTTVDSSPKAVTNQILWTSRATQKRQLNGPENTDINKLLLNRKLPRKQQIQQQHQQIQLTKQQ
# LQQLVQHEELDDLVATSTGNSGDQMETGDGLQQQQQQQQQQQQLQKLSKVIKMSQFPLLVSDVSLQQQQSVSGQAQQQQLKPNSAAAIAANHNYSLHP
# ASTAIITAQATPQQANKIFLTSSNSGGGGSAGNFTIATASELQAAAAGQKLHYKELPNSNLKLNFVSSAGTGEQTQQVGATTVLLNKSQQQQQQQQHQ
# KLKTLATTGNSQTGQGDKRVLYTSLLNVKPLQKNNSGQMQMQLGPGGLQQVLRGRLNNSAIITRTLPLGTTVNSTGGAVGPTTTTIRQLVTTNANNVS
# SQDGNLLSAKEVGKALTVEQVIASANNGGVVLPTSNNNNNNNGSGAGGNGGPLNSGVNATGAGGGGSTGAGVGGAGVTSTINR]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 10/10
#      E:   3 
#      W:  10 
# CDS introns: 9/9
#      E:   9 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   3 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 836
#      E:  65 (gi|222759611,gi|222739366,gi|49227784,gi|103735402,gi|222771291,gi|222769086,gi|222740901,...)
#      W: 771 
# incompatible hint groups: 7
#      E:   6 (SRR023608.6637816/1,gi|222753087,gi|13766093,gi|49225252,gi|8116006)
#      W:   1 
# end gene g83
###
# start gene g84
chr2R	AUGUSTUS	gene	7361875	7394687	0.03	+	.	g84
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7361875	7394687	0.03	+	.	g84.t1
chr2R	AUGUSTUS	tss	7361875	7361875	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7361875	7362214	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7362315	7362877	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7363216	7364778	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7363481	7363483	.	+	0	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7364779	7393573	0.31	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7393735	7394153	1	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7363481	7364778	0.23	+	0	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7393574	7393734	1	+	1	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7393574	7393734	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7394154	7394395	0.24	+	2	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7394154	7394687	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7394393	7394395	.	+	0	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
chr2R	AUGUSTUS	tts	7394687	7394687	.	+	.	transcript_id "g84.t1"; gene_id "g84";
# protein sequence = [MSTLASTRPPPLKLTIPSLEEAEDHAQERRAGGGGQEVGKMHPDCLPLPLVQPGNSPQVREEEEDEQTECEEQLNIED
# EEVEEEHDLDLEDPASCCSENSVLSVGQEQSEAAQAALSAQAQARQRLLISQIYRPSAFSSTATTVLPPSEGPPFSPEDLLQLPPSTGTFQEEFLRKS
# QLYAEELMKQQMHLMAAARVNALTAAAAGKQLQMAMAAAAVATVPSGQDALAQLTATALGLGPGGAVHPHQQLLLQRDQVHHHHHMQNHLNNNENLHE
# RALKFSIDNILKADFGSRLPKIGALSGNIGGGSVSGSSTGSSKNSGNTNGNRSPLKAPKKSGKPLNLAQSNAAANSSLSFSSSLANICSNSNDSNSTA
# TSSSTTNTSGAPVDLVKSPPPAAGAGATGASGKSGEDSGTPIVWPAWVYCTRYSDRPSSGESTSAKAQEAGDVQFGGRWWGWGRREGGGRRWGRGAGG
# QKAANGLQRNAVGQTEARVQRESLSDGEATPAAERGTGTERGADQDLVPEQTGQAEKVERHQESAGAAADGAGIVQPLDDTADPRGGGAAGAAGGG]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 90.9
# CDS exons: 3/3
#      E:   1 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 4/5
#      E:   4 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 213
#      E:   9 (gi|13754586,gi|15508198,gi|3515064,gi|41400555,gi|3113669,gi|49390276,gi|107265782,...)
#      W: 204 
# incompatible hint groups: 12
#      W:  12 
# end gene g84
###
# start gene g85
chr2R	AUGUSTUS	gene	7407596	7410324	0.04	-	.	g85
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7407596	7410324	0.04	-	.	g85.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7407596	7407596	.	-	.	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7407596	7409063	.	-	.	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7408903	7408905	.	-	0	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7409064	7409441	0.82	-	.	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7408903	7409063	0.82	-	2	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7409442	7409508	0.31	-	0	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7409442	7410324	.	-	.	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7409506	7409508	.	-	0	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7410324	7410324	.	-	.	transcript_id "g85.t1"; gene_id "g85";
# protein sequence = [MRSIERTIKKPQKHICHIHGSINAAQDAGVKSSAPFDLETTDTCLHPHSSTSLIARAAGIANCAFWVVHFAVLSP]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 2/2
#      E:   2 
# CDS introns: 1/1
#      E:   1 
# 5'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
# hint groups fully obeyed: 6
#      E:   6 (gi|133847682,gi|133847903,gi|133847786,gi|133847560,gi|133847787,gi|133847561)
# incompatible hint groups: 0
# end gene g85
###
# start gene g86
chr2R	AUGUSTUS	gene	7411523	7423674	0.02	-	.	g86
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7411523	7423674	0.02	-	.	g86.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7411523	7411523	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7411523	7412352	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7412104	7412106	.	-	0	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7412353	7412632	1	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7412731	7413863	1	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7412104	7412352	1	-	0	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7412633	7412730	1	-	2	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7412633	7412730	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7413864	7415175	0.63	-	0	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7413864	7415445	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7415173	7415175	.	-	0	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7417018	7417726	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7423184	7423216	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7423411	7423674	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7423674	7423674	.	-	.	transcript_id "g86.t1"; gene_id "g86";
# protein sequence = [MALEDRCSPQSAPSPITLQMQHLHHQQQQQQQQQQQMQHLHQLQQLQQLHQQQLAAGVFHHPAMAFDAAAAAAAAAAA
# AAAHAHAAALQQRLSGSGSPASCSTPASSTPLTIKEEESDSVIGDMSFHNQTHTTNEEEEAEEDDDIDVDVDDTSAGGRLPPPAHQQQSTAKPSLAFS
# ISNILSDRFGDVQKPGKSMENQASIFRPFEASRSQTATPSAFTRVDLLEFSRQQQAAAAAATAAMMLERANFLNCFNPAAYPRIHEEIVQSRLRRSAA
# NAVIPPPMSSKMSDANPEKSALGSLCKAVSQIGQPAAPTMTQPPLSSSASSLASPPPASNASTISSTSSVATSSSSSSSGCSSAASSLNSSPSSRLGA
# SGSGVNASSPQPQPIPPPSAVSRDSGMESSDDTRSETGSTTTEGGKNEMWPAWVYCTRYSDRPSSGPRYRRPKQPKDKTNDEKRPRTAFSSEQLARLK
# REFNENRYLTERRRQQLSSELGLNEAQIKIWFQNKRAKIKKSTGSKNPLALQLMAQGLYNHTTVPLTKEEEELEMRMNGQIP]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 61.5
# CDS exons: 3/3
#      E:   3 
#      W:   3 
# CDS introns: 2/2
#      E:   2 
# 5'UTR exons and introns: 2/7
#      E:   2 
#      W:   1 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 251
#      E:  47 (gi|8120098,gi|103760191,gi|49223237,gi|49000381,gi|103745337,gi|49400899,gi|107310147,...)
#      W: 204 
# incompatible hint groups: 2
#      E:   1 (gi|13760842)
#      W:   1 
# end gene g86
###
# start gene g87
chr2R	AUGUSTUS	gene	7465336	7480634	0.11	-	.	g87
chr2R	AUGUSTUS	transcript	7465336	7480634	0.11	-	.	g87.t1
chr2R	AUGUSTUS	tts	7465336	7465336	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7465336	7467488	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	stop_codon	7467332	7467334	.	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7467489	7467553	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7467676	7467739	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7468368	7468453	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7468904	7469132	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7469255	7470519	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7474531	7474601	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7474644	7475042	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7475088	7475150	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7475217	7475275	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7475633	7475867	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7476141	7476202	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7477446	7477507	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7478131	7478191	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7478680	7479189	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	intron	7479436	7479497	1	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7467332	7467488	1	-	1	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7467554	7467675	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7467554	7467675	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7467740	7468367	1	-	1	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7467740	7468367	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7468454	7468903	1	-	1	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7468454	7468903	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7469133	7469254	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7469133	7469254	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7470520	7474530	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7470520	7474530	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7474602	7474643	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7474602	7474643	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7475043	7475087	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7475043	7475087	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7475151	7475216	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7475151	7475216	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7475276	7475632	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7475276	7475632	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7475868	7476140	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7475868	7476140	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7476203	7477445	1	-	1	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7476203	7477445	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7477508	7478130	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7477508	7478130	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7478192	7478679	1	-	2	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7478192	7478679	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7479190	7479435	1	-	2	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7479190	7479435	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	CDS	7479498	7479624	1	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7479498	7479680	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	start_codon	7479622	7479624	.	-	0	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	exon	7480464	7480634	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
chr2R	AUGUSTUS	tss	7480634	7480634	.	-	.	transcript_id "g87.t1"; gene_id "g87";
# protein sequence = [MNKNAGDGSDGKNSNKNSNAGGGGGAGGPHDPTGLLDAASLFAYWGRDPTGAAAAAASNPLFNSQFNAAAAAGLGLLP
# QAGGASANDRYSMAAAAAAAAGAHHHQNTMAVAASQAASLAGLHPASWWSMAQLAAQDYFSRLQASGLSPFPHPDLAAAFGPAGMGMGGGAGGAGAGG
# GGAGVLGQGGGGNGGSGNGGGGSSSGSSGSKSNKSRKEKRAAQQQQQQQQNLANSLNAAAAAAAAAAANNPAAALASMHGFGVGVPGTSIPSVSTGSG
# SISTNSGGHGSYKSTASAYGKPSTMTSSSMANNPGSAYDPVTLHKELLAMQAVAAAASGSGSSGSSGKKSGGGGSSSSSMHSLGMGIGGSGGMMSSGK
# ASTSVSASNSSLGGMHPSLTSSNPLMSPHAGMGSSSSSSSKDRDKNNPSLNALNSLSQFGALGMTPQQSMQAAMNAFAASTGVSPSATVTSSPHHSSQ
# QQQQMGGNSSTSGSGKSSSKDYMMGTGSEHPSLLGVRLPPDTEIIKYTSSIVGPKIPGTTSRGRKKTISETEQQTTQQQQKQQHQAEQHLLQQQQQAQ
# KELDSTKNAISSLLAFPGLSPAKRARLEMEYAAMAAAAQQQHQQAQQQHQAQQQLHGMLGAAGIPGMAGLVGLPGMSGNPLDQLSVSKASSSTAPTTS
# TSSSSAGSNLLNQSNSDRVEVIKLPPTITSNGAYNLSSKGKEVHDLTTDMATNSGGVNLSLKSNAGSSALTPSGAVGSASNPITIDDFDAPLNLSMKP
# SDKSNSSSSNAAAGGSSSSSAALANLASDYQAASSGQSGNSLQSLSSITAALGGTGGMPGGSISGSGGTSPAPAGAGSGATGGGSGSGGSGGGSSSYK
# EGRPRNLGRGVSKPKKNTVASLLAQSRAVGLKPMLATQQLLQQGADIEKIRLALSEANAHMETSTDSESVAAESGLSESESEDANILNVAELRVPLEL
# GWKRETVIRGLTKQGQIRGEVTYYAPGSTTPLKSNGQVFAILEQQPSNLSRENFSFSARAIVGSFLQPAPPPYANDGEYIRMTDEDVAKRLEDLKVFT
# RQTLNVEQRIEIAKQQQAMRDAKKLQKEELARNKEKARQEKNSKLEQQRKDKELKNQQAVEERKKRQEELDRLKQEELLKKQQEKEKRRQEAILAKEQ
# ELQKQKEMLLAAEMERERRRQHMSLIRMLELRRKFEDREKKKHQLVLDRLLLRERRMAERKRDAEILQLIRRPNEDSEMPQELVIPELDRIAGNRLPG
# QAMADLLMVFEFLHNFGETLGFDMESLPSLQNLHDALMSDSNADAEEELLSVMTHLLVCAIEDPGVPNPGRHTTLLGQSLRNADITNSNVSEILRIYL
# YATATGEVRQMHGITVDRERERRVPDHHQLDSDTTTHSHSVKNQEYYKLLHENDTWKLSQSLKDRPFVALNPTRKAQMLAHLCNDLLMNKAVLRQIDG
# SLETCAQMRKEKYMTDMKVRKYKALHMRKARIEAYERAQAEREAAMQALMAQQKLDAERLKAEEEAKAAAAEEAAAAAGTDGEATKGGSPNGEKPEDG
# DQNEEGAAKEPQQQQQQPMEVDGVVDEASLVSPAKTIIQTDNSLTPSKQDMPTPTYQINGSSTPTTSGVTGGDMNVLLQAKKSGARNSINDEHHHDVS
# IIDDDLSDLDSEITNVEEDEDNRLSADELQKKLDKIVRASLNCKEALEKSTNQLRAACFGQDRFWRRYWKLPKAGGIFIEALESAQNDICDYHEALEA
# MDDKKDANDEKENSENEKDVAAESSEQPMEVDESITKLEDGVPASDVGMPESNQQNAHQDEEDDDDDVTEINKVEPEIVDLGDDDDDAAPPLPKIEPP
# RPEIKVKSEMELMGPPPTTMISTKTDFEAEIKIPSMPGILMPPTLNNNNTNNNNNNNGSDNCDKLETGLGLGQQQQNFSQSVIKTEDVKKEDDCIIVS
# TSSVDDTPKWFSIVRREVPLISELPAEEGGVVGQELQISYANQNCSAQLQLQGHPWDLINNMQYYSIPMDECKVDTSKLGNECIFSLSGLDEKQMLAK
# VEEYKAHKVESKNGLGSPHRHHETKDDEEQAKLKLDKEIDTEMETDADDLAGKEKFFRLRSDVPPDTGGGVSEGTDVKPKIELRLDEALSQAYYHNIA
# NMSLSSVQTYIPIDIPLPLSMTPDEHRLLEQVKLAGFPERVHGVYVPRRQRYGWWQLDDEQKLRQLLKTLNPSGLRERELQENLQRFLGLEQPLGVNY
# KLKSDIDFPEEFLMPDKKGDWNPKVAKRVELALIEQLESLEDKVASASMQLKNWQLPNRVESELTLDSQEDVTEEDFVSIIPMIRERIIDLEANIERR
# YLKPPLGSQTGDAHLAVIAQNQHTTTQTQNSASAAAYLLQMQQQQQQQQLAQQQQQQQQGSGAGNSLNPSSFNERTMALAAAAAASGPGNATGVANSA
# VVAGATPCESGSGEPNSGNASPASNCDSDRDEKVEQIPKGLVQWRDAVSRSHTTAQLAMALYVLESCVAWDKSIMKANCQFCTSGENEDKLLLCDGCD
# KGYHTYCFKPKMDNIPDGDWYCYECVNKATNERKCIVCGGHRPSPVGKMIYCDLCPRAYHADCYIPPLLKVPRGKWYCHGCISRAPPPKKRSAGGTSG
# SSSKSRRDRDRESGGSAKRRSDNSKTPAMEHMQQQQMPLAGGDSHHHHHQQPPSLNSSHDESMNSLPAAPLSPAHSVVSATNYDDQHHANNSVDGSSR
# FHAHLIPPSNNGTAALLEDVPGGANVMPGVYPVYTPVAAGNFSAGLINQAPVQPAMPFANVVAMSPRAVTPTRTRTPTPTPAPTPPPPPPTPLLMQAS
# PTATALHVNACQSPPQQQHAQLMTMPSPPAIGVGTATNQMSPPPINIHAIQEAKEKLKQEKKEKHATKKLMKELAVCKTLLGEMELHEDSWPFLLPVN
# TKQFPTYRKIIKTPMDLSTIKKKLQDLSYKTREDFCVDVRQIFDNCEMFNEDDSPVGKAGHGMRKFFESRWGELTDKHS]
# Evidence for and against this transcript:
# % of transcript supported by hints (any source): 100
# CDS exons: 16/16
#      E:  13 
#      W:  16 
# CDS introns: 15/15
#      E:  15 
# 5'UTR exons and introns: 3/3
#      E:   2 
#      W:   2 
# 3'UTR exons and introns: 1/1
#      E:   1 
#      W:   1 
# hint groups fully obeyed: 1086
#      E:  74 (gi|114056080,gi|48950705,gi|49220337,gi|8121793,gi|13766095,gi|13766079,gi|107212947,...)
#      W:1012 
# incompatible hint groups: 36
#      W:  36 
# end gene g87
###
# command line:
# augustus --species=fly --predictionStart=7000001 --predictionEnd=7500000 chr2R.fa --extrinsicCfgFile=extrinsic.bug.cfg --hintsfile=hints.gff