1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
|
// -*- Mode: C++; tab-width: 2; -*-
// vi: set ts=2:
//
// $Id: descriptor.C,v 1.12.20.3 2007/08/07 16:16:16 bertsch Exp $
//
#include <BALL/QSAR/descriptor.h>
using namespace std;
namespace BALL
{
Descriptor::Descriptor()
: UnaryProcessor<AtomContainer>(),
name_("generic descriptor"),
unit_("")
{
}
Descriptor::Descriptor(const String& name)
: UnaryProcessor<AtomContainer>(),
name_(name),
unit_("")
{
}
Descriptor::Descriptor(const String& name, const String& unit)
: UnaryProcessor<AtomContainer>(),
name_(name),
unit_(unit)
{
}
Descriptor::~Descriptor()
{
}
Descriptor::Descriptor(const Descriptor& descriptor)
: UnaryProcessor<AtomContainer>(descriptor),
name_(descriptor.name_),
unit_(descriptor.unit_)
{
}
Descriptor& Descriptor::operator = (const Descriptor& descriptor)
{
this->setUnit(descriptor.getUnit());
this->setName(descriptor.getName());
return *this;
}
const String& Descriptor::getName() const
{
return name_;
}
void Descriptor::setName(const String& name)
{
name_ = name;
}
Processor::Result Descriptor::operator () (AtomContainer& ac)
{
ac.setProperty(getName(), compute(ac));
return Processor::CONTINUE;
}
const String& Descriptor::getUnit() const
{
return unit_;
}
void Descriptor::setUnit(const String& unit)
{
unit_ = unit;
}
bool Descriptor::isValid_(AtomContainer& /* ac */)
{
return false;
}
void Descriptor::calculate_(AtomContainer& /* ac */)
{
}
double Descriptor::compute(AtomContainer& ac)
{
if (!isValid_(ac))
{
calculate_(ac);
}
return ac.getProperty(this->getName()).getDouble();
}
}
|
