 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
d |
rwxr-xr-x |
50 |
Directory_test
|
 |
d |
rwxr-xr-x |
90 |
NMRSpectrum_test
|
 |
d |
rwxr-xr-x |
4,096 |
PropertyManager_test
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43,868 |
1BNA.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
50,185 |
1BNA.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
74,405 |
1BNA_2.hin
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
3,464 |
1b5i_ligand-dockOut.mol2
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
6,054 |
1b5i_ligand.mol2
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
72,333 |
1b5i_pocket.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
564,496 |
2ovc.ccp4
|
 |
- |
rw-r--r-- |
405,234 |
2ptc_H.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73 |
6_12-test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
116 |
6_12-test.options
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,767 |
6_12-test.rdf-fake.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
14,007 |
6_12-test.rdf.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
453 |
6_12-test.rul
|
 |
- |
rw-r--r-- |
225 |
6_12-test.solvent.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,589 |
AA.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,062 |
AAG.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
114,975 |
ACE_test_A.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32,588 |
ACE_test_B.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,020 |
AG.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
463 |
AMBER_test_1.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,432 |
AlaGlySer.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,200 |
AlaGlySer2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,219 |
AlaGlySer_PARSE_charges.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,827 |
AlaGlySer__CysHisMet.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
294 |
AmberFF_test_1.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
379 |
AmberFF_test_2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
302 |
AmberFF_test_3.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
398 |
AmberFF_test_4.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
61 |
Angle_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3 |
Angle_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
259 |
AnisotropyShiftProcessor_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,007 |
AnisotropyShiftProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
87 |
AnisotropyShiftProcessor_test.ini
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
6,318 |
AntechamberFile_test1.ac
|
 |
- |
rw-r--r-- |
189 |
AntechamberFile_test2.ac
|
 |
- |
rw-r--r-- |
189 |
AntechamberFile_test3.ac
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,983 |
AspGluAsnGlnArg.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,541 |
AspGluAsnGlnArg_PARSE_charges.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,069 |
AssignBondOrderProcessor_test_AAA.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,066 |
AssignBondOrderProcessor_test_AGLYSL01_out.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,497 |
AssignBondOrderProcessor_test_AMHTAR01.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,503 |
AssignBondOrderProcessor_test_AMPTRB10_arom_sol0.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,492 |
AssignBondOrderProcessor_test_AMPTRB10_kek_sol0.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
594 |
AssignBondOrderProcessor_test_AN06.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,320 |
AssignBondOrderProcessor_test_BEWCUB.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
203 |
AssignBondOrderProcessor_test_C2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
505 |
AssignBondOrderProcessor_test_C2_sol0.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
405 |
AssignBondOrderProcessor_test_C2_sol1.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
304 |
AssignBondOrderProcessor_test_C2_sol2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
583 |
AssignBondOrderProcessor_test_C3_input.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
536 |
AssignBondOrderProcessor_test_C4_input.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
591 |
AssignBondOrderProcessor_test_CITSED10_sol_2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
591 |
AssignBondOrderProcessor_test_CITSED10_sol_6.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
942 |
AssignBondOrderProcessor_test_COHKOZ_sol_1.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
942 |
AssignBondOrderProcessor_test_COHKOZ_sol_2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
942 |
AssignBondOrderProcessor_test_COHKOZ_sol_5.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
619 |
AssignBondOrderProcessor_test_CONFAM_sol_1.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
619 |
AssignBondOrderProcessor_test_CONFAM_sol_2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
619 |
AssignBondOrderProcessor_test_CONFAM_sol_3.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
619 |
AssignBondOrderProcessor_test_CONFAM_sol_4.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,367 |
AssignBondOrderProcessor_test_CUDJAM_sol_1.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,367 |
AssignBondOrderProcessor_test_CUDJAM_sol_2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,367 |
AssignBondOrderProcessor_test_CUDJAM_sol_3.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,367 |
AssignBondOrderProcessor_test_CUDJAM_sol_4.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,367 |
AssignBondOrderProcessor_test_CUDJAM_sol_5.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
26,272 |
AssignShiftProcessor_test.bmr
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,990 |
AtomContainer_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
438 |
AtomTypes_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
678 |
Atom_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
242 |
BallAndStickModel.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21,470 |
BinaryFingerprintMethods_ConnectedComponents.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,859 |
BinaryFingerprintMethods_MedoidResults.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23,253 |
BinaryFingerprintMethods_SimSearchResults.csv
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
588,696 |
BinaryFingerprintMethods_test.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7 |
BitVector_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7 |
BitVector_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
84 |
BitVector_test3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
540 |
Bond_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
138 |
Box3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
27 |
Box3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,130 |
Chain_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
627 |
CharmmFF_test_1.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
165 |
CharmmFF_test_2.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
Circle3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19 |
Circle3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,122 |
ClaverieParameter_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,874 |
Composite_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
257,756 |
ConformationSet_test.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
183,937 |
ConformationSet_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,201 |
ConnectedComponentsProcessor_test.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
117,583 |
CreateSpectrumProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,914 |
Cys-Asp-Glu-Tyr-His%2BArg%2B.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,677 |
Cys-Asp-Glu-Tyr-His%2BArg%2B_PARSE_charges.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73,516 |
DCDFile_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
159,625 |
DCDFile_test3.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5 |
DCD_test.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43,028 |
DCD_test2.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86,072 |
DCD_test3.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
421 |
DefaultProcessor_test.1
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,022 |
DisulfidBondProcessor_test_AACCQQQQCCRR.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,506 |
DisulfidBondProcessor_test_ACCQQCEECQEICH.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,007 |
EFShiftProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
991 |
EFShiftProcessor_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
330 |
ExpressionParser_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
208 |
ExpressionTree_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,109 |
Expression_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
100 |
File_test.txt
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
100 |
File_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,989 |
Fragment_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,324 |
G4.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,252 |
GPG.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
0 |
GenericMolFile_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
66,916 |
HINFile_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78,772 |
HINFile_test2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78,775 |
HINFile_test3.hin
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
1,851 |
HINFile_test4.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
48,018 |
HMOFile_test.hmo
|
 |
- |
rw-r--r-- |
47,930 |
HMOFile_test_no_charge.hmo
|
 |
- |
rw-r--r-- |
354,761 |
HSD1.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,129 |
HaighMallionShiftProcessor_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,007 |
HaighMallionShiftProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,269 |
HaighMallionShiftProcessor_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,446 |
HaighMallionShiftProcessor_test2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,883 |
HaighMallionShiftProcessor_test3.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
110 |
HaighMallionShiftProcessor_test_HIS.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
998 |
HaighMallionShiftProcessor_test_HIS.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
106 |
HaighMallionShiftProcessor_test_PHE.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,108 |
HaighMallionShiftProcessor_test_PHE.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
106 |
HaighMallionShiftProcessor_test_TRP.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,328 |
HaighMallionShiftProcessor_test_TRP.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
107 |
HaighMallionShiftProcessor_test_TYR.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,163 |
HaighMallionShiftProcessor_test_TYR.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
175 |
HashMap_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
197 |
HashSet_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
138 |
INIFile_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
138 |
INIFile_test2.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,025 |
INIFile_test3.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,516 |
JCAMPFile_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,107 |
JohnsonBoveyShiftProcessor_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,007 |
JohnsonBoveyShiftProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
643 |
JohnsonBoveyShiftProcessor_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,446 |
JohnsonBoveyShiftProcessor_test2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,883 |
JohnsonBoveyShiftProcessor_test3.hin
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
8,190 |
KCFFile_test1.kcf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
142 |
KCFFile_test2.kcf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,821 |
L-Tryptophan.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,428 |
LacNAc.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
62 |
LineBasedFile_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21 |
LineBasedFile_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
89 |
Line_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
Line_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4 |
LogStream_test_general.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
293 |
LogStream_test_setPrefix.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
247 |
MMFF94-bend-lin.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
231 |
MMFF94-bend.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
231 |
MMFF94-bend2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
222 |
MMFF94-bend3.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
379 |
MMFF94-plane.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
274 |
MMFF94-plane2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
167 |
MMFF94-stretch.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
291 |
MMFF94-torsion.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
172 |
MMFF94-vdw.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
170 |
MMFF94-vdw2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
400 |
MMFF94-vdw2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
182 |
MMFF94_test1.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,065 |
MMFF94_test2.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
151 |
MOL2File_test.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,077 |
MOL2File_test2.mol2
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
4,720 |
MOL2File_test3.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,863 |
MOL2File_test4.mol2
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
146 |
MOL2File_test_gaff-disabled.mol2
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
3,851 |
MOL2File_test_set_linebreak.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,268 |
MOLFile_test1.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
229 |
MOLFile_test2.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,223 |
MOLFile_test3.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,785 |
MOLFile_test4.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,906 |
MOLFile_test5.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
117,583 |
MakeSpectrumProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
87 |
Matrix4x4_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
252 |
Matrix4x4_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,046 |
Molecule_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
84,132 |
NMRSpectrum_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
117,583 |
NMRSpectrum_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,114 |
NMRSpectrum_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
26,272 |
NMRStarFile_test.bmr
|
 |
- |
rw-r--r-- |
39,295 |
NMRStarFile_test_1z0r.bmr
|
 |
- |
rw-r--r-- |
146,785 |
NMRStarFile_test_1z0r.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,139 |
NucleicAcid_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,303 |
Nucleotide_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86 |
Object_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
129,192 |
OoiEnergy_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
652 |
OoiEnergy_test1.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
613 |
OoiEnergy_test2.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,141 |
OoiEnergy_test3.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
444 |
OoiEnergy_test4.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
558 |
OoiEnergy_test5.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
578 |
OoiEnergy_test6.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,204 |
OoiEnergy_test7.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
816 |
OoiEnergy_test8.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
925 |
OoiEnergy_test9.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
226 |
OptionsFile1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
238 |
OptionsFile2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
506 |
OptionsFile3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
233 |
OptionsFile4.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
236 |
Options_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
726 |
PDBAtom_test_dump.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73,516 |
PDBFile_test2.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73,576 |
PDBFile_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
73,336 |
PDBFile_test2_2006.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,041 |
PDBFile_test3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
242 |
PDBFile_test_line_checking.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
710 |
PDBFile_test_models.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
243 |
PDBFile_test_no_model.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
176 |
PDBFile_test_write_empty.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
875 |
PDBFile_test_write_methane.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
665 |
PDBFile_test_write_methane_2006.txt
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
14,823 |
PDBInfo_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
24 |
PTE_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
213 |
ParameterSection_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
0 |
Parameters_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,246 |
PheTyrTrpHisLys%2B.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,126 |
PheTyrTrpHisLys%2B_PARSE_charges.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
81 |
PiecewiseFunction_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86 |
Plane3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
Plane3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,112 |
PointGrid_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
515,396 |
PoseClustering2_test.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25,880 |
PoseClustering3_test.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
257,756 |
PoseClustering_test.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
37,872 |
PoseClustering_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,320 |
PoseClustering_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
43,892 |
PoseClustering_test2.dcd
|
 |
- |
rw-r--r-- |
576 |
PoseClustering_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
882 |
PoseClustering_transformFile.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
321 |
PoseClustering_wardtree.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
38 |
PreciseTime_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
57 |
PreciseTime_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,293 |
Predicate_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,764 |
Protein_test.txt
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
374,601 |
QSAR_test.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
134 |
Quaternion_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
36 |
Quaternion_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
57 |
Quaternion_test3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,007 |
RandomCoilShiftProcessor_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,507 |
RandomCoilShiftProcessor_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,758 |
ReconstructFragmentProcessor_test1.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
140 |
Regression_test.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
835 |
Regression_test2.csv
|
 |
- |
rw-r--r-- |
117 |
RegularData2D_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,121 |
RegularData3D_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
61 |
Regular_Expression.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7 |
Regular_Expression2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
506 |
RepresentationManager.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
139 |
RepresentationManager2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,294 |
Residue_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
438 |
ResourceFile_test1.xml
|
 |
- |
rw-r--r-- |
464 |
RuleEvaluator_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
251 |
RuleEvaluator_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
443,556 |
SCWRLRotamerFile_test1.lib
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,796 |
SCWRLRotamerFile_test2.lib
|
 |
- |
rw-r--r-- |
50,783 |
SDFile_test1.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
283 |
SDFile_test2.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,782 |
SecondaryStructure_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1 |
Selectable_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
23 |
Selectable_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
78 |
Selectable_test3.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
478 |
Selector_test.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,291 |
SerThrLysCysMet.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,717 |
SerThrLysCysMet_PARSE_charges.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,779 |
ShiftModel_test.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,488 |
ShiftModel_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
129,192 |
ShiftModel_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
90 |
ShiftModule_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,917 |
SideChainPlacementProcessor_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,917 |
SideChainPlacementProcessor_test_input_1.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,484 |
SideChainPlacementProcessor_test_output_1.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
0 |
SideChainPlacementProcessor_test_output_pre_1.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
74 |
SimpleBox3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
SimpleBox3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,167 |
SmartsMatcher_test.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,369 |
SmartsMatcher_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,496 |
SmartsParser_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
815 |
SmilesParser_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
225 |
SolventParameter_test.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
195 |
SolventParameter_test1.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
215 |
SolventParameter_test2.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
198 |
SolventParameter_test3.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
225 |
SolventParameter_test4.ini
|
 |
- |
rw-r--r-- |
82 |
Sphere3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11 |
Sphere3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
72 |
String_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
20 |
String_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32,835 |
StructureMapper_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
72 |
Substring_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5 |
Substring_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
107 |
SurfaceProcessor_test_single_atom.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,381 |
Surface_test.face.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,074 |
Surface_test.vert.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
TextPersistenceManager_test.checkHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10 |
TextPersistenceManager_test.checkName.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
56 |
TextPersistenceManager_test.checkObjectPointerArrayHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3 |
TextPersistenceManager_test.checkObjectPointerArrayTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25 |
TextPersistenceManager_test.checkObjectPointerHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25 |
TextPersistenceManager_test.checkObjectReferenceHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
TextPersistenceManager_test.checkPrimitiveHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1 |
TextPersistenceManager_test.checkPrimitiveTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40 |
TextPersistenceManager_test.checkStorableHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
116 |
TextPersistenceManager_test.checkStorableTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6 |
TextPersistenceManager_test.checkStreamHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4 |
TextPersistenceManager_test.checkStreamTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
232 |
TextPersistenceManager_test.checkTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
64 |
TextPersistenceManager_test.getObjectHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
69 |
TextPersistenceManager_test.writeHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10 |
TextPersistenceManager_test.writeName.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
55 |
TextPersistenceManager_test.writeObjectPointerArrayHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3 |
TextPersistenceManager_test.writeObjectPointerArrayTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25 |
TextPersistenceManager_test.writeObjectPointerHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
25 |
TextPersistenceManager_test.writeObjectReferenceHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
TextPersistenceManager_test.writePrimitiveHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1 |
TextPersistenceManager_test.writePrimitiveTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
40 |
TextPersistenceManager_test.writeStorableHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
116 |
TextPersistenceManager_test.writeStorableTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6 |
TextPersistenceManager_test.writeStreamHeader.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4 |
TextPersistenceManager_test.writeStreamTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
232 |
TextPersistenceManager_test.writeTrailer.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
39 |
TimeStamp_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
109 |
TimeStamp_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
430 |
Timer_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
114,975 |
Timer_test1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,317 |
TyrPheTrp.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
86 |
Vector2_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9 |
Vector2_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
79 |
Vector3_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13 |
Vector3_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
82 |
Vector4_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17 |
Vector4_test2.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1 |
XDRPersistenceManager_test1.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
28 |
XYZFile_test1.xyz
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19 |
XYZFile_test2.xyz
|
 |
- |
rw-r--r-- |
22,443 |
all_amino.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
62,593 |
amber91.ini
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
722 |
benzene.hin
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
1,578 |
benzoic_acid.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
32,835 |
bpti.pdb
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
24,002 |
buildBondsProcessor_test.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
233 |
chimera-test.mol2
|
 |
- |
rw-r--r-- |
62 |
class_test_infile.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
35 |
class_test_regexp_template.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
62 |
class_test_template.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
141,248 |
current.ac
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
60,955 |
current.xyz
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
10,827 |
descriptors_test.sdf
|
 |
- |
rw-r--r-- |
0 |
empty_file.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
749 |
ethan.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,312 |
ftp_test.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
48 |
hashgrid3_test_dump0.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,048 |
http_test.txt
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
944 |
indole.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
990 |
input_ChainBuilder_test.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
990 |
input_ChainBuilder_test_2.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,476 |
input_MoleculeAssembler_test.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,536 |
input_MoleculeAssembler_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,126 |
input_MoleculeAssembler_test_2.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,280 |
input_RSConstructor_test.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,849 |
input_RSConstructor_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,285 |
input_RSConstructor_test_2.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
411 |
input_SDGenerator_test.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
820 |
input_SDGenerator_test.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
552 |
input_SDGenerator_test_2.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
990 |
input_SDGenerator_test_2a.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,563 |
input_SDGenerator_test_2a.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
995 |
input_SDGenerator_test_2b.mol
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,535 |
input_SDGenerator_test_2b.pdb
|
 |
- |
rw-r--r-- |
514 |
methane.hin
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
555 |
pyrrole.hin
|
 |
- |
rw-r--r-- |
59 |
string_test_dump0.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
107 |
string_test_dump4.txt
|
 |
- |
rw-r--r-- |
568 |
svd_input_complex.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
455 |
svd_input_real.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
68 |
svd_results_complex_S.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
1,040 |
svd_results_complex_U.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
343 |
svd_results_complex_Vh.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
68 |
svd_results_real_S.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
791 |
svd_results_real_U.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
260 |
svd_results_real_Vt.dat
|
 |
- |
rw-r--r-- |
439 |
test.db
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,046,399 |
test_ascii.am
|