1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27
|
##fileformat=VCFv4.0
##INFO=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Total Depth">
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
##FORMAT=<ID=GQ,Number=1,Type=Integer,Description="Genotype Quality">
##FORMAT=<ID=DP,Number=1,Type=Integer,Description="Read Depth">
##FILTER=<ID=q10,Description="Quality below 10">
##contig=<ID=9,length=62435964>
##contig=<ID=1,length=62435964>
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT A B
9 202 . GTTT G 1806 q10 DP=35 GT:GQ:DP 0|1:409:35 0|1
9 212 . C T,G 1792 PASS DP=32 GT:GQ:DP 0|1:245:32 0|1
9 212 . CAAA C 1792 PASS DP=32 GT:GQ:DP 0|1:245:32 0|1
9 222 . GA G 628 q10 DP=21 GT:GQ:DP 0|1:21:21 0|1
9 232 . G T 1016 PASS DP=22 GT:GQ:DP 0|1:212:22 0|1
9 232 . GAA GG 1016 PASS DP=22 GT:GQ:DP 0|1:212:22 0|1
9 242 . GT G 727 PASS DP=30 GT:GQ:DP 0|1:150:30 0|1
9 252 . TAAAA TA,T 246 PASS DP=10 GT:GQ:DP 0|1:12:10 0|1
9 262 . TAAAA TA,T 246 PASS DP=10 GT:GQ:DP 0|1:12:10 0|1
1 100 . GTTT G 1806 q10 DP=35 GT:GQ:DP 0|1:409:35 0|1
1 110 . C T,G 1792 PASS DP=32 GT:GQ:DP 0|1:245:32 0|1
1 110 . CAAA C 1792 PASS DP=32 GT:GQ:DP 0|1:245:32 0|1
1 120 . GA G 628 q10 DP=21 GT:GQ:DP 0|1:21:21 0|1
1 130 . G T 1016 PASS DP=22 GT:GQ:DP 0|1:212:22 0|1
1 130 . GAA GG 1016 PASS DP=22 GT:GQ:DP 0|1:212:22 0|1
1 140 . GT G 727 PASS DP=30 GT:GQ:DP 0|1:150:30 0|1
1 150 . TAAAA TA,T 246 PASS DP=10 GT:GQ:DP 0|1:12:10 0|1
1 160 . TAAAA TA,T 246 PASS DP=10 GT:GQ:DP 0|1:12:10 0|1
|