File: diffs.txt

package info (click to toggle)
bedtools 2.30.0%2Bdfsg-3
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm
  • size: 56,604 kB
  • sloc: ansic: 38,500; cpp: 29,738; sh: 7,954; makefile: 661; python: 235; javascript: 16
file content (489 lines) | stat: -rw-r--r-- 12,206 bytes parent folder | download | duplicates (6)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
54d53
< chr1	10346493	10346588	419771	100	+
63d61
< chr1	12637536	12637591	487117	100	-
115d112
< chr1	27003383	27003453	401078	100	+
308d304
< chr1	67919095	67919174	458371	100	-
317d312
< chr1	70182988	70182994	240451	100	+
336d330
< chr1	74612375	74612395	359478	100	-
397d390
< chr1	89611230	89611319	24037	100	-
487d479
< chr1	113433734	113433760	492565	100	+
673d664
< chr1	152364876	152364952	62193	100	-
771d761
< chr1	173149673	173149732	337683	100	-
873d862
< chr1	192327148	192327221	486005	100	-
935d923
< chr1	204842892	204842895	252090	100	-
979d966
< chr1	213387147	213387216	139699	100	-
1021d1007
< chr1	219909272	219909353	381028	100	+
1074d1059
< chr1	229916904	229916936	132877	100	-
1077d1061
< chr1	230205808	230205850	341202	100	-
1116d1099
< chr1	238587424	238587441	119251	100	+
1223d1205
< chr2	9180164	9180241	410939	100	+
1227d1208
< chr2	10286862	10286900	102747	100	-
1251d1231
< chr2	14080614	14080632	319225	100	-
1256d1235
< chr2	15444413	15444497	477964	100	+
1563d1541
< chr2	72312696	72312743	30145	100	+
1586d1563
< chr2	75881143	75881218	394852	100	+
1626d1602
< chr2	83013139	83013202	96558	100	+
1648d1623
< chr2	86697801	86697847	61775	100	-
1687d1661
< chr2	92842913	92842944	378270	100	+
1700d1673
< chr2	95462143	95462216	414391	100	+
1864d1836
< chr2	124252688	124252698	279572	100	+
2028d1999
< chr2	161902060	161902088	131109	100	-
2097d2067
< chr2	173934563	173934570	179607	100	-
2231d2200
< chr2	200696770	200696780	115900	100	-
2501d2469
< chr3	6784676	6784709	401830	100	+
2770d2737
< chr3	60020217	60020255	488795	100	+
2805d2771
< chr3	68385106	68385199	410078	100	+
2838d2803
< chr3	76438675	76438730	1197	100	-
2859d2823
< chr3	81799446	81799461	451210	100	+
2876d2839
< chr3	84553552	84553580	54085	100	-
2944d2906
< chr3	96600622	96600700	375083	100	+
2970d2931
< chr3	102117662	102117684	78634	100	-
3001d2961
< chr3	106511612	106511704	153660	100	+
3024d2983
< chr3	109963398	109963426	158565	100	-
3045d3003
< chr3	113425425	113425486	46792	100	-
3077d3034
< chr3	119396237	119396303	433520	100	+
3152d3108
< chr3	136383081	136383158	14666	100	-
3158d3113
< chr3	137594532	137594586	367279	100	+
3239d3193
< chr3	152061330	152061419	311016	100	+
3253d3206
< chr3	154138748	154138796	148286	100	+
3320d3272
< chr3	167119499	167119545	402496	100	-
3322,3323d3273
< chr3	167161157	167161221	395655	100	-
< chr3	167161157	167161249	477843	100	-
3530d3479
< chr4	11334133	11334189	103020	100	+
3562d3510
< chr4	16356889	16356909	96779	100	-
3602d3549
< chr4	24529005	24529029	140900	100	+
3642d3588
< chr4	32635235	32635289	348221	100	+
3796d3741
< chr4	61235328	61235385	399642	100	+
3844d3788
< chr4	72828229	72828246	465837	100	-
3854d3797
< chr4	75314546	75314570	57326	100	+
3890d3832
< chr4	83025590	83025614	214487	100	-
3998d3939
< chr4	103036010	103036081	444012	100	-
4015d3955
< chr4	107012376	107012438	170844	100	+
4080d4019
< chr4	119337105	119337135	324132	100	-
4095d4033
< chr4	122032552	122032631	162962	100	+
4111d4048
< chr4	124910895	124910993	464638	100	-
4130d4066
< chr4	128901133	128901192	485184	100	-
4166d4101
< chr4	135717544	135717568	478396	100	+
4272d4206
< chr4	158543503	158543536	54883	100	+
4373d4306
< chr4	177582825	177582856	35056	100	+
4457d4389
< chr4_ctg9_hap1	360117	360208	41967	100	-
4469d4400
< chr5	2068749	2068778	336896	100	+
4699d4629
< chr5	41539258	41539302	27998	100	+
4744d4673
< chr5	50213593	50213662	319937	100	-
4752d4680
< chr5	50913055	50913154	128909	100	-
4770d4697
< chr5	53608312	53608388	201691	100	-
4845d4771
< chr5	71463588	71463680	489009	100	-
4878d4803
< chr5	76750883	76750967	290945	100	+
5133d5057
< chr5	126963455	126963538	153603	100	+
5214d5137
< chr5	142667040	142667090	150025	100	+
5378d5300
< chr5	173739401	173739404	406533	100	-
5406d5327
< chr5	178447766	178447791	418296	100	+
5499d5419
< chr6	17347638	17347726	77266	100	-
5537d5456
< chr6	24368960	24369007	469640	100	+
5554d5472
< chr6	30320056	30320084	24637	100	-
5660d5577
< chr6	51220350	51220367	338253	100	+
5846d5762
< chr6	93748288	93748364	55386	100	+
5874d5789
< chr6	98172189	98172223	107359	100	+
5889d5803
< chr6	101934220	101934269	300896	100	+
5897d5810
< chr6	102924353	102924425	28620	100	-
6020d5932
< chr6	129788739	129788820	379975	100	-
6058d5969
< chr6	136666210	136666257	414961	100	-
6173d6083
< chr6	157162278	157162303	267632	100	+
6234d6143
< chr6	169381961	169382017	499583	100	-
6515d6423
< chr7	19452220	19452225	273627	100	+
6620d6527
< chr7	40817997	40818088	274394	100	+
6752d6658
< chr7	69036530	69036613	422608	100	+
6822d6727
< chr7	82311341	82311378	308857	100	+
6840d6744
< chr7	85146127	85146211	443468	100	+
6845d6748
< chr7	85756501	85756583	331590	100	-
6866d6768
< chr7	89039245	89039266	2976	100	-
7019d6920
< chr7	122027268	122027296	237448	100	+
7031d6931
< chr7	124481229	124481237	138189	100	-
7039d6938
< chr7	125891977	125892009	359066	100	+
7047d6945
< chr7	127399588	127399636	376616	100	-
7053d6950
< chr7	129424094	129424133	210999	100	-
7081d6977
< chr7	135997401	135997496	173295	100	-
7114d7009
< chr7	142109073	142109093	463495	100	+
7148d7042
< chr7	150239925	150239970	455360	100	+
7214d7107
< chr8	6145176	6145178	130935	100	-
7227d7119
< chr8	7429724	7429763	357625	100	+
7232d7123
< chr8	8285447	8285504	418753	100	-
7269d7159
< chr8	15301646	15301676	160821	100	-
7307d7196
< chr8	24290075	24290126	78725	100	+
7404d7292
< chr8	46830639	46830657	392135	100	-
7431d7318
< chr8	54757317	54757319	267958	100	+
7439d7325
< chr8	56513412	56513437	354092	100	-
7442,7443d7327
< chr8	56655920	56655964	261220	100	+
< chr8	56655970	56656020	75116	100	-
7456d7339
< chr8	58900355	58900408	316346	100	-
7514,7515d7396
< chr8	69817925	69817992	305378	100	-
< chr8	69818002	69818025	280123	100	-
7610d7490
< chr8	88451670	88451713	473326	100	-
7640d7519
< chr8	95073299	95073333	72657	100	-
7843d7721
< chr8	132282856	132282859	244119	100	+
7934d7811
< chr9	6207469	6207567	412652	100	+
8032d7908
< chr9	23314005	23314089	285910	100	-
8076d7951
< chr9	34194442	34194524	251028	100	-
8377d8251
< chr9	85577448	85577489	261241	100	+
8420,8421d8293
< chr9	95332118	95332190	218482	100	-
< chr9	95332118	95332207	218482	100	-
8494d8365
< chr9	112025531	112025547	409486	100	+
8576d8446
< chr9	130258746	130258763	420999	100	+
8589d8458
< chr9	132923879	132923905	77046	100	+
8753d8621
< chr10	30550810	30550887	173260	100	-
8764d8631
< chr10	33331967	33331991	347048	100	+
8768d8634
< chr10	34599233	34599300	158080	100	-
8777d8642
< chr10	36448007	36448061	72216	100	-
8807d8671
< chr10	42218909	42218984	5760	100	+
8835d8698
< chr10	47992664	47992726	175617	100	+
8858d8720
< chr10	52643853	52643951	447920	100	+
8988d8849
< chr10	77946209	77946253	187827	100	-
9051d8911
< chr10	91999424	91999449	81583	100	-
9190d9049
< chr10	119669330	119669420	154994	100	-
9193d9051
< chr10	120622678	120622693	406159	100	-
9234d9091
< chr10	128976070	128976091	99473	100	+
9253d9109
< chr10	133580966	133580982	131318	100	-
9335d9190
< chr11	16163834	16163859	109856	100	+
9400,9401d9254
< chr11	28087410	28087480	468911	100	+
< chr11	28087419	28087510	468911	100	+
9404d9256
< chr11	28246081	28246134	180120	100	+
9467d9318
< chr11	39324616	39324711	87999	100	-
9550d9400
< chr11	56685911	56685917	157985	100	+
9557d9406
< chr11	58502651	58502695	277188	100	-
9612d9460
< chr11	70293750	70293771	277399	100	+
9617d9464
< chr11	70880727	70880777	314587	100	-
9634d9480
< chr11	73925915	73925995	151643	100	-
9756,9757d9601
< chr11	95879596	95879634	150224	100	-
< chr11	95879599	95879634	150224	100	-
9779d9622
< chr11	99607528	99607620	326167	100	-
9795d9637
< chr11	101989636	101989682	453307	100	+
10039d9880
< chr12	10890856	10890911	19268	100	-
10110d9950
< chr12	22680625	22680693	188754	100	+
10116d9955
< chr12	23725917	23725980	53482	100	+
10222d10060
< chr12	44840987	44841007	406940	100	+
10347d10184
< chr12	67986321	67986325	273240	100	+
10361d10197
< chr12	70639563	70639644	301232	100	-
10397d10232
< chr12	76371230	76371266	153647	100	-
10400d10234
< chr12	76550818	76550871	458863	100	-
10411d10244
< chr12	79770832	79770930	200834	100	+
10466d10298
< chr12	89897697	89897787	103460	100	-
10562d10393
< chr12	107295435	107295459	186771	100	-
10649d10479
< chr12	124219637	124219680	41622	100	-
10661d10490
< chr12	126650945	126651040	216736	100	+
10728d10556
< chr13	7148290	7148317	254533	100	+
10754d10581
< chr13	15564317	15564345	334139	100	-
10765d10591
< chr13	17918504	17918520	222568	100	+
10817d10642
< chr13	28194228	28194236	39828	100	+
10930d10754
< chr13	50737355	50737442	385282	100	-
11025d10848
< chr13	71520518	71520533	249454	100	+
11138d10960
< chr13	93335694	93335771	204671	100	+
11218d11039
< chr13	106935202	106935204	420561	100	-
11256d11076
< chr13	111941988	111941997	410809	100	-
11295d11114
< chr14	3975892	3975984	187214	100	-
11309d11127
< chr14	6723759	6723778	202397	100	+
11403d11220
< chr14	25734164	25734229	182723	100	+
11408d11224
< chr14	26741118	26741212	427498	100	-
11593d11408
< chr14	62178630	62178644	489314	100	+
11688d11502
< chr14	79862847	79862913	377150	100	-
11816d11629
< chr14	105327399	105327413	415159	100	-
12113d11925
< chr15	56332022	56332119	218670	100	+
12161d11972
< chr15	64575689	64575779	138290	100	-
12288d12098
< chr15	93396799	93396804	118142	100	+
12315d12124
< chr15	99645970	99646029	425873	100	+
12321d12129
< chr15	102042469	102042485	441644	100	+
12323d12130
< chr15	102074359	102074434	172723	100	+
12342d12148
< chr16	3031560	3031603	362624	100	-
12406d12211
< chr16	17255129	17255147	265540	100	-
12503d12307
< chr16	36430212	36430219	101793	100	+
12570d12373
< chr16	49067744	49067783	330640	100	-
12610d12412
< chr16	57540371	57540456	194493	100	-
12780d12581
< chr16	88568678	88568737	150289	100	-
12879d12679
< chr17	20285309	20285331	271015	100	+
13084d12883
< chr17	63945099	63945116	295250	100	+
13249d13047
< chr18	11185676	11185751	253385	100	-
13362d13159
< chr18	36615811	36615890	263972	100	-
13391d13187
< chr18	41336890	41336983	23596	100	+
13456d13251
< chr18	55105303	55105344	170077	100	-
13468d13262
< chr18	57258422	57258481	305487	100	-
13501d13294
< chr18	62837873	62837907	350866	100	-
13792d13584
< chr19	39779932	39779946	368977	100	+
13805d13596
< chr19	42556845	42556880	199008	100	+
13954d13744
< chr20	14855905	14855939	296707	100	+
14001d13790
< chr20	25218402	25218477	190427	100	+
14054d13842
< chr20	34299632	34299655	223170	100	-
14077d13864
< chr20	38297508	38297588	103546	100	+
14139d13925
< chr20	50092492	50092502	64930	100	+
14142d13927
< chr20	50786075	50786108	80270	100	+
14146d13930
< chr20	51415794	51415847	462735	100	-
14176d13959
< chr20	55249968	55250020	371564	100	-
14196d13978
< chr20	58538739	58538833	332879	100	+
14215d13996
< chr20	62164503	62164520	161753	100	+
14227d14007
< chr21	2609226	2609303	492422	100	-
14347d14126
< chr21	27854023	27854080	451269	100	+
14355,14356d14133
< chr21	28754174	28754221	30364	100	-
< chr21	28754174	28754233	30364	100	-
14598d14374
< chr22	29975574	29975605	318174	100	+
14626d14401
< chr22	36351004	36351031	459740	100	+
14669d14443
< chr22	43332474	43332509	185002	100	+
14721d14494
< chrUn_gl000220	38833	38913	356441	100	-
14730a14504
> chrUn_gl000230	41060	41071	104139	100	+
14786d14559
< chrX	9671470	9671520	136934	100	+
14796d14568
< chrX	12047866	12047908	301444	100	+
14814d14585
< chrX	16229774	16229848	152275	100	+
14873d14643
< chrX	25922160	25922206	425361	100	-
14898d14667
< chrX	32504688	32504779	424337	100	-
14900d14668
< chrX	32541182	32541242	107133	100	+
15071d14838
< chrX	62081980	62082020	64256	100	-
15074d14840
< chrX	62373549	62373592	485865	100	-
15154d14919
< chrX	78460634	78460706	153950	100	+
15206d14970
< chrX	90572923	90573021	338394	100	-
15308d15071
< chrX	108837622	108837644	287787	100	-
15366d15128
< chrX	122515404	122515411	308622	100	-
15444d15205
< chrX	139834063	139834157	53935	100	-
15485d15245
< chrX	147063435	147063499	442281	100	-
15515d15274
< chrX	152383936	152384007	261288	100	+
15528d15286
< chrX	154142139	154142186	465939	100	-
15612d15369
< chrY	20597089	20597160	104172	100	-
15691d15447
< chrY	35189314	35189340	160423	100	+
15705d15460
< chrY	37335865	37335932	346919	100	-
15779d15533
< chrY	51768018	51768079	110067	100	+