File: assembly_with_singlets.ace

package info (click to toggle)
bioperl 1.6.1-2
links: PTS, VCS
area: main
in suites: squeeze
size: 40,768 kB
ctags: 12,005
sloc: perl: 174,299; xml: 13,923; sh: 1,941; lisp: 1,803; asm: 109; makefile: 53
file content (1077 lines) | stat: -rw-r--r-- 28,589 bytes
AS 10375 42451

CO Contig1 131 1 1 U
gctagaaaaaaaaggactcccagtagaaatacgtacaataaagtaggttc
ctctagttaactgttacaaaataagtttcccattggtaatataatagatt
tataactgttatatccagagcaacctagggg

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5765593 U 1
BS 1 131 5765593

RD 5765593 131 0 6
gctagaaaaaaaaggactcccagtagaaatacgtacaataaagtaggttc
ctctagttaactgttacaaaataagtttcccattggtaatataatagatt
tataactgttatatccagagcaacctagggg

QA 1 131 1 131

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 108 131 080215:162048
}

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 98 118 080215:162048
}

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 36 57 080215:162048
}

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 15 34 080215:162048
}

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 8 27 080215:162048
}

RT{
5765593 matchElsewhereHighQual phrap 6 25 080215:162048
}

CO Contig2 139 1 1 U
gtgggggcatggcggcccttggccgcccccagtaagtcaattgtcccgcg
aaggagcgggacgaagggtcccgcagggacccgagaaccgatcgggggct
cttaacacaaaatgtccttccggcgggggggccccgtac

BQ
 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5740343 U 1
BS 1 139 5740343

RD 5740343 139 0 4
gtgggggcatggcggcccttggccgcccccagtaagtcaattgtcccgcg
aaggagcgggacgaagggtcccgcagggacccgagaaccgatcgggggct
cttaacacaaaatgtccttccggcgggggggccccgtac

QA 4 139 1 139

RT{
5740343 matchElsewhereHighQual phrap 102 135 080215:162048
}

RT{
5740343 matchElsewhereHighQual phrap 89 129 080215:162048
}

RT{
5740343 matchElsewhereHighQual phrap 40 90 080215:162048
}

RT{
5740343 matchElsewhereHighQual phrap 4 45 080215:162048
}

CO Contig3 118 1 1 U
cctacgcgaggatacgaatgtttcttcgacaataataagctttttattat
tattattattattattattatttctattattattattattattattatta
ttattattattattatta

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5685889 U 1
BS 1 118 5685889

RD 5685889 118 0 2
cctacgcgaggatacgaatgtttcttcgacaataataagctttttattat
tattattattattattattatttctattattattattattattattatta
ttattattattattatta

QA 44 118 1 118

RT{
5685889 matchElsewhereHighQual phrap 75 118 080215:162048
}

RT{
5685889 matchElsewhereHighQual phrap 44 72 080215:162048
}

CO Contig4 81 1 1 U
gctctggctcactcgctctgagcaggcaatctttcagtcttacacagtct
acattcatactggacagcagtgtagacttaa

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5695780 U 1
BS 1 81 5695780

RD 5695780 81 0 2
gctctggctcactcgctctgagcaggcaatctttcagtcttacacagtct
acattcatactggacagcagtgtagacttaa

QA 1 81 1 81

RT{
5695780 matchElsewhereHighQual phrap 23 81 080215:162048
}

RT{
5695780 matchElsewhereHighQual phrap 1 67 080215:162048
}

CO Contig5 86 1 1 U
gtgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtcgtccgtccgtcgtagtagtagtgtg

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5659765 U 1
BS 1 86 5659765

RD 5659765 86 0 1
gtgtgtgcatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtcgtccgtccgtcgtagtagtagtgtg

QA 1 86 1 86

RT{
5659765 matchElsewhereHighQual phrap 10 60 080215:162048
}

CO Contig6 83 1 1 U
gaggaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

BQ
 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5772270 U 1
BS 1 83 5772270

RD 5772270 83 0 2
gaggaggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

QA 7 83 1 83

RT{
5772270 matchElsewhereHighQual phrap 7 83 080215:162048
}

RT{
5772270 matchElsewhereHighQual phrap 6 81 080215:162048
}

CO Contig7 82 1 1 U
cttccttcagcaactgtgtgtgtgtgtntgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5717803 U 1
BS 1 82 5717803

RD 5717803 82 0 1
cttccttcagcaactgtgtgtgtgtgtntgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

QA 15 82 1 82

RT{
5717803 matchElsewhereHighQual phrap 29 82 080215:162048
}

CO Contig8 139 1 1 U
attattattattattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttattcaatttcgactttaattgttgtttttt
ttattaagtaaatactttaattttttttactttaaatac

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5671215 U 1
BS 1 139 5671215

RD 5671215 139 0 0
attattattattattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttattcaatttcgactttaattgttgtttttt
ttattaagtaaatactttaattttttttactttaaatac

QA 70 139 1 139

CO Contig9 81 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5726177 U 1
BS 1 81 5726177

RD 5726177 81 0 2
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

QA 1 81 1 81

RT{
5726177 matchElsewhereHighQual phrap 3 81 080215:162048
}

RT{
5726177 matchElsewhereHighQual phrap 1 77 080215:162048
}

CO Contig10 83 1 1 U
gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtactac

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5741972 U 1
BS 1 83 5741972

RD 5741972 83 0 1
gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtactac

QA 1 83 1 83

RT{
5741972 matchElsewhereHighQual phrap 11 78 080215:162048
}

CO Contig11 177 1 1 U
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
tatttattttatttatttatttattta

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5695538 U 1
BS 1 177 5695538

RD 5695538 177 0 2
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
tatttattttatttatttatttattta

QA 1 177 1 177

RT{
5695538 matchElsewhereHighQual phrap 161 177 080215:162048
}

RT{
5695538 matchElsewhereHighQual phrap 1 167 080215:162048
}

CO Contig12 121 1 1 U
atctcttgatagttgcacgctacattgaacgaaccaaatcccttttttaa
ggtgagtttggtaagattggggtaatatattcatttgataggtctcccta
aaaatggcctantttttttac

BQ
 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0

AF 5732765 U 1
BS 1 121 5732765

RD 5732765 121 0 4
atctcttgatagttgcacgctacattgaacgaaccaaatcccttttttaa
ggtgagtttggtaagattggggtaatatattcatttgataggtctcccta
aaaatggcctantttttttac

QA 2 121 1 121

RT{
5732765 matchElsewhereHighQual phrap 81 110 080215:162048
}

RT{
5732765 matchElsewhereHighQual phrap 54 103 080215:162048
}

RT{
5732765 matchElsewhereHighQual phrap 53 98 080215:162048
}

RT{
5732765 matchElsewhereHighQual phrap 2 55 080215:162048
}

CO Contig13 119 1 1 U
tattattattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattattattattattattattattattattattattattattatt
attattattattattatta

BQ
 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5685756 U 1
BS 1 119 5685756

RD 5685756 119 0 1
tattattattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattattattattattattattattattattattattattattatt
attattattattattatta

QA 3 119 1 119

RT{
5685756 matchElsewhereHighQual phrap 7 86 080215:162048
}

CO Contig14 178 1 1 U
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
tatttattttatttattttatttattta

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5693041 U 1
BS 1 178 5693041

RD 5693041 178 0 1
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattt
tatttattttatttattttatttattta

QA 1 178 1 178

RT{
5693041 matchElsewhereHighQual phrap 1 168 080215:162048
}

CO Contig15 115 1 1 U
ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
ggaagagcagccgccgttagatagggactcacaacccttcaaaatcgccc
taagacttctcaacc

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5651991 U 1
BS 1 115 5651991

RD 5651991 115 0 2
ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
ggaagagcagccgccgttagatagggactcacaacccttcaaaatcgccc
taagacttctcaacc

QA 1 115 1 115

RT{
5651991 matchElsewhereHighQual phrap 47 115 080215:162048
}

RT{
5651991 matchElsewhereHighQual phrap 1 46 080215:162048
}

CO Contig16 83 1 1 U
cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5756120 U 1
BS 1 83 5756120

RD 5756120 83 0 2
cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

QA 1 83 1 83

RT{
5756120 matchElsewhereHighQual phrap 25 83 080215:162048
}

RT{
5756120 matchElsewhereHighQual phrap 9 23 080215:162048
}

CO Contig17 120 1 1 U
ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattattattattattattattattattactactacta
ctactactactactactgtc

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5766191 U 1
BS 1 120 5766191

RD 5766191 120 0 1
ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattattattattattattattattattactactacta
ctactactactactactgtc

QA 8 120 1 120

RT{
5766191 matchElsewhereHighQual phrap 12 91 080215:162048
}

CO Contig18 81 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtnt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0

AF 5701563 U 1
BS 1 81 5701563

RD 5701563 81 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtnt

QA 1 81 1 81

RT{
5701563 matchElsewhereHighQual phrap 1 76 080215:162048
}

CO Contig19 85 1 1 U
gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtcgtactac

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5710086 U 1
BS 1 85 5710086

RD 5710086 85 0 1
gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtagtcgtactac

QA 1 85 1 85

RT{
5710086 matchElsewhereHighQual phrap 11 74 080215:162048
}

CO Contig20 175 1 1 U
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttattattttatttatttt
atttatttatttatttatttattta

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5692289 U 1
BS 1 175 5692289

RD 5692289 175 0 3
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
ttatttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatt
tattttatttattttatttattttatttattttattattttatttatttt
atttatttatttatttatttattta

QA 1 175 1 175

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 159 175 080215:162048
}

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 137 157 080215:162048
}

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 1 135 080215:162048
}

CO Contig21 122 1 1 U
agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
tattctaaatttttttaatcta

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5731835 U 1
BS 1 122 5731835

RD 5731835 122 0 0
agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
tattctaaatttttttaatcta

QA 77 122 1 122

CO Contig22 79 1 1 U
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5734795 U 1
BS 1 79 5734795

RD 5734795 79 0 1
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

QA 1 79 1 79

RT{
5734795 matchElsewhereHighQual phrap 1 79 080215:162048
}

CO Contig23 72 1 1 U
atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5769497 U 1
BS 1 72 5769497

RD 5769497 72 0 1
atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

QA 10 72 1 72

RT{
5769497 matchElsewhereHighQual phrap 10 72 080215:162048
}

CO Contig24 71 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5685312 U 1
BS 1 71 5685312

RD 5685312 71 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt

QA 1 71 1 71

RT{
5685312 matchElsewhereHighQual phrap 1 68 080215:162048
}

CO Contig25 79 1 1 U
catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5654419 U 1
BS 1 79 5654419

RD 5654419 79 0 1
catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

QA 3 79 1 79

RT{
5654419 matchElsewhereHighQual phrap 31 79 080215:162048
}

CO Contig26 85 1 1 U
cgaagacccggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5722605 U 1
BS 1 85 5722605

RD 5722605 85 0 1
cgaagacccggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

QA 11 85 1 85

RT{
5722605 matchElsewhereHighQual phrap 10 85 080215:162048
}

CO Contig27 83 1 1 U
attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5667144 U 1
BS 1 83 5667144

RD 5667144 83 0 2
attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

QA 12 83 1 83

RT{
5667144 matchElsewhereHighQual phrap 18 83 080215:162048
}

RT{
5667144 matchElsewhereHighQual phrap 17 31 080215:162048
}

CO Contig28 103 1 1 U
atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
agacaaccgttctggaaattgaaatcatgcagatgtaaacaaaaatggga
tca

BQ
 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15

AF 5754151 U 1
BS 1 103 5754151

RD 5754151 103 0 0
atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
agacaaccgttctggaaattgaaatcatgcagatgtaaacaaaaatggga
tca

QA 3 103 1 103

CO Contig29 79 1 1 U
natacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5764329 U 1
BS 1 79 5764329

RD 5764329 79 0 1
natacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

QA 4 79 2 79

RT{
5764329 matchElsewhereHighQual phrap 31 79 080215:162048
}

CO Contig30 112 1 1 U
attttcagattcatttgtattttgatttggattattatcattgttgttat
tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattatta

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5725479 U 1
BS 1 112 5725479

RD 5725479 112 0 1
attttcagattcatttgtattttgatttggattattatcattgttgttat
tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattatta

QA 33 112 1 112

RT{
5725479 matchElsewhereHighQual phrap 56 112 080215:162048
}

CO Contig31 78 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5762369 U 1
BS 1 78 5762369

RD 5762369 78 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

QA 1 78 1 78

RT{
5762369 matchElsewhereHighQual phrap 1 78 080215:162048
}

CO Contig32 82 1 1 U
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacgacgacnc

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0

AF 5679898 U 1
BS 1 82 5679898

RD 5679898 82 0 1
acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac
acacacacacacacacacacacacgacgacnc

QA 1 82 1 82

RT{
5679898 matchElsewhereHighQual phrap 1 74 080215:162048
}

CO Contig33 62 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5697733 U 1
BS 1 62 5697733

RD 5697733 62 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgt

QA 1 62 1 62

RT{
5697733 matchElsewhereHighQual phrap 1 62 080215:162048
}

CO Contig34 98 2 54 U
aagggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGAC
ATCATCGCtaatcAAGCCtaacaGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta

BQ
 0 0 0 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15

AF 5704073 U 2
AF 5762101 U 1
BS 1 3 5762101
BS 4 4 5704073
BS 5 5 5762101
BS 6 6 5704073
BS 7 7 5762101
BS 8 8 5704073
BS 9 9 5762101
BS 10 14 5704073
BS 15 15 5762101
BS 16 18 5704073
BS 19 20 5762101
BS 21 21 5704073
BS 22 24 5762101
BS 25 25 5704073
BS 26 26 5762101
BS 27 27 5704073
BS 28 28 5762101
BS 29 29 5704073
BS 30 30 5762101
BS 31 32 5704073
BS 33 38 5762101
BS 39 39 5704073
BS 40 46 5762101
BS 47 47 5704073
BS 48 50 5762101
BS 51 52 5704073
BS 53 54 5762101
BS 55 55 5704073
BS 56 56 5762101
BS 57 61 5704073
BS 62 63 5762101
BS 64 65 5704073
BS 66 66 5762101
BS 67 68 5704073
BS 69 69 5762101
BS 70 72 5704073
BS 73 74 5762101
BS 75 75 5704073
BS 76 77 5762101
BS 78 78 5704073
BS 79 80 5762101
BS 81 81 5704073
BS 82 82 5762101
BS 83 83 5704073
BS 84 84 5762101
BS 85 85 5704073
BS 86 88 5762101
BS 89 90 5704073
BS 91 92 5762101
BS 93 93 5704073
BS 94 94 5762101
BS 95 96 5704073
BS 97 97 5762101
BS 98 98 5704073

RD 5704073 97 0 0
aaggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGACA
TCATCGCtaatcAAGCCtaacaGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta

QA 3 97 3 97

RD 5762101 98 0 0
aagggaCTCGTCTAAGTGAAAGGCAGTAGATGTATGTAAGTCATGATGAC
ATCATCGCta*tcAAGCCta*caGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta

QA 4 98 1 98

CO Contig35 108 2 62 U
atTTTCAATCctttacaCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
TAAATTta

BQ
 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 15 15

AF 5748846 U 1
AF 5729853 U 1
BS 1 6 5748846
BS 7 8 5729853
BS 9 9 5748846
BS 10 11 5729853
BS 12 12 5748846
BS 13 13 5729853
BS 14 16 5748846
BS 17 19 5729853
BS 20 21 5748846
BS 22 22 5729853
BS 23 23 5748846
BS 24 24 5729853
BS 25 25 5748846
BS 26 26 5729853
BS 27 28 5748846
BS 29 30 5729853
BS 31 33 5748846
BS 34 35 5729853
BS 36 36 5748846
BS 37 37 5729853
BS 38 38 5748846
BS 39 39 5729853
BS 40 40 5748846
BS 41 41 5729853
BS 42 43 5748846
BS 44 44 5729853
BS 45 45 5748846
BS 46 48 5729853
BS 49 49 5748846
BS 50 51 5729853
BS 52 52 5748846
BS 53 55 5729853
BS 56 57 5748846
BS 58 58 5729853
BS 59 60 5748846
BS 61 63 5729853
BS 64 68 5748846
BS 69 72 5729853
BS 73 74 5748846
BS 75 75 5729853
BS 76 76 5748846
BS 77 77 5729853
BS 78 78 5748846
BS 79 79 5729853
BS 80 80 5748846
BS 81 81 5729853
BS 82 84 5748846
BS 85 86 5729853
BS 87 89 5748846
BS 90 90 5729853
BS 91 92 5748846
BS 93 93 5729853
BS 94 94 5748846
BS 95 95 5729853
BS 96 96 5748846
BS 97 97 5729853
BS 98 99 5748846
BS 100 101 5729853
BS 102 104 5748846
BS 105 106 5729853
BS 107 107 5748846
BS 108 108 5729853

RD 5748846 108 0 0
atTTTCAATCctttacaCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
TAAATTta

QA 1 108 1 108

RD 5729853 108 0 0
atTTTCAATCcttt*caCACGTTTCTGTACTCCGATGCATGATTCCGATC
CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
TAAATTta

QA 1 108 1 108

CO Contig36 111 2 63 U
taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgccttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
TGCtccaatcg

BQ
 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5648323 U 1
AF 5703145 U 1
BS 1 1 5648323
BS 2 2 5703145
BS 3 4 5648323
BS 5 5 5703145
BS 6 6 5648323
BS 7 8 5703145
BS 9 12 5648323
BS 13 13 5703145
BS 14 15 5648323
BS 16 16 5703145
BS 17 17 5648323
BS 18 18 5703145
BS 19 19 5648323
BS 20 20 5703145
BS 21 21 5648323
BS 22 22 5703145
BS 23 24 5648323
BS 25 25 5703145
BS 26 27 5648323
BS 28 29 5703145
BS 30 32 5648323
BS 33 34 5703145
BS 35 35 5648323
BS 36 36 5703145
BS 37 37 5648323
BS 38 38 5703145
BS 39 39 5648323
BS 40 40 5703145
BS 41 42 5648323
BS 43 43 5703145
BS 44 44 5648323
BS 45 45 5703145
BS 46 46 5648323
BS 47 50 5703145
BS 51 51 5648323
BS 52 55 5703145
BS 56 57 5648323
BS 58 60 5703145
BS 61 63 5648323
BS 64 65 5703145
BS 66 66 5648323
BS 67 67 5703145
BS 68 68 5648323
BS 69 69 5703145
BS 70 70 5648323
BS 71 72 5703145
BS 73 76 5648323
BS 77 78 5703145
BS 79 79 5648323
BS 80 82 5703145
BS 83 84 5648323
BS 85 86 5703145
BS 87 87 5648323
BS 88 90 5703145
BS 91 92 5648323
BS 93 93 5703145
BS 94 95 5648323
BS 96 96 5703145
BS 97 97 5648323
BS 98 99 5703145
BS 100 102 5648323
BS 103 104 5703145
BS 105 111 5648323

RD 5648323 111 0 0
taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgccttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
TGCtccaatcg

QA 1 111 1 111

RD 5703145 109 0 1
taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgc*ttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
TGCtcatcg

QA 1 109 1 105

RT{
5703145 compression phrap 74 76 080215:162048
}