package info (click to toggle)
bioperl 1.6.924-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: jessie, jessie-kfreebsd
  • size: 50,776 kB
  • ctags: 11,412
  • sloc: perl: 175,865; xml: 27,565; lisp: 2,034; sh: 1,958; makefile: 19

Folder: Tools

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 48 Alignment
d d rwxr-xr-x 74 Analysis
d d rwxr-xr-x 34 EMBOSS
d d rwxr-xr-x 68 HMMER
d d rwxr-xr-x 134 Phylo
d d rwxr-xr-x 46 Prediction
d d rwxr-xr-x 91 Primer
d d rwxr-xr-x 4,096 Run
d d rwxr-xr-x 37 SeqPattern
d d rwxr-xr-x 28 SiRNA
d d rwxr-xr-x 39 Signalp
d d rwxr-xr-x 49 Sim4
d d rwxr-xr-x 49 Spidey
- - rw-r--r-- 2,689 AlignFactory.pm
- - rw-r--r-- 16,119 AmpliconSearch.pm
- - rw-r--r-- 9,582 AnalysisResult.pm
- - rwxr-xr-x 6,946 Blat.pm
- - rw-r--r-- 26,667 CodonTable.pm
- - rwxr-xr-x 6,375 Coil.pm
- - rw-r--r-- 14,319 ECnumber.pm
- - rw-r--r-- 6,395 EPCR.pm
- - rw-r--r-- 12,363 ERPIN.pm
- - rw-r--r-- 11,158 ESTScan.pm
- - rw-r--r-- 7,771 Eponine.pm
- - rw-r--r-- 12,027 Est2Genome.pm
- - rwxr-xr-x 15,549 Fgenesh.pm
- - rw-r--r-- 6,602 FootPrinter.pm
- - rw-r--r-- 38,054 GFF.pm
- - rw-r--r-- 5,860 Gel.pm
- - rw-r--r-- 9,369 Geneid.pm
- - rw-r--r-- 15,004 Genemark.pm
- - rw-r--r-- 8,950 Genewise.pm
- - rw-r--r-- 5,347 Genomewise.pm
- - rw-r--r-- 13,548 Genscan.pm
- - rw-r--r-- 18,978 Glimmer.pm
- - rw-r--r-- 6,342 Grail.pm
- - rw-r--r-- 22,590 GuessSeqFormat.pm
- - rwxr-xr-x 5,735 Hmmpfam.pm
- - rw-r--r-- 14,261 IUPAC.pm
- - rw-r--r-- 17,401 Infernal.pm
- - rw-r--r-- 21,646 Lucy.pm
- - rw-r--r-- 9,764 MZEF.pm
- - rwxr-xr-x 5,558 Match.pm
- - rw-r--r-- 11,686 OddCodes.pm
- - rwxr-xr-x 12,623 Primer3.pm
- - rwxr-xr-x 6,056 Prints.pm
- - rw-r--r-- 4,567 Profile.pm
- - rw-r--r-- 7,235 Promoterwise.pm
- - rw-r--r-- 3,921 PrositeScan.pm
- - rw-r--r-- 10,988 Protparam.pm
- - rw-r--r-- 6,472 Pseudowise.pm
- - rw-r--r-- 12,013 QRNA.pm
- - rw-r--r-- 15,194 RNAMotif.pm
- - rw-r--r-- 5,809 RandomDistFunctions.pm
- - rw-r--r-- 4,177 RepeatMasker.pm
- - rwxr-xr-x 3,504 Seg.pm
- - rw-r--r-- 26,111 SeqPattern.pm
- - rw-r--r-- 28,254 SeqStats.pm
- - rw-r--r-- 9,473 SeqWords.pm
- - rw-r--r-- 16,373 SiRNA.pm
- - rw-r--r-- 18,361 Sigcleave.pm
- - rwxr-xr-x 7,714 Signalp.pm
- - rw-r--r-- 9,213 TandemRepeatsFinder.pm
- - rw-r--r-- 12,184 TargetP.pm
- - rwxr-xr-x 3,469 Tmhmm.pm
- - rw-r--r-- 23,968 dpAlign.pm
- - rw-r--r-- 7,556 ipcress.pm
- - rwxr-xr-x 6,772 isPcr.pm
- - rwxr-xr-x 10,416 pICalculator.pm
- - rw-r--r-- 11,042 pSW.pm
- - rw-r--r-- 8,361 tRNAscanSE.pm