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Folder: 0.7.5+dfsg-6
| .. (parent) | ||||
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | .pc | |
| d | rwxr-xr-x | 53 | asa103 | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | debian | |
| - | rw-r--r-- | 10,351 | ArgumentParser.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 4,119 | ArgumentParser.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,708 | CollapsedSampler.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 215 | CollapsedSampler.h | |
| - | rw-r--r-- | 3,546 | FileHeader.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,311 | FileHeader.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,067 | GibbsParameters.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,574 | GibbsParameters.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,586 | GibbsSampler.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 235 | GibbsSampler.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,778 | Makefile | |
| - | rw-r--r-- | 1,259 | MyTimer.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 594 | MyTimer.h | |
| - | rw-r--r-- | 8,433 | PosteriorSamples.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,025 | PosteriorSamples.h | |
| - | rw-r--r-- | 811 | README.md | |
| - | rw-r--r-- | 39,947 | ReadDistribution.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 4,529 | ReadDistribution.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,305 | Sampler.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 3,056 | Sampler.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,550 | SimpleSparse.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 653 | SimpleSparse.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,486 | TagAlignments.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,594 | TagAlignments.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,965 | TranscriptExpression.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 985 | TranscriptExpression.h | |
| - | rw-r--r-- | 8,428 | TranscriptInfo.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,566 | TranscriptInfo.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,181 | TranscriptSequence.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 3,005 | TranscriptSequence.h | |
| - | rw-r--r-- | 12,526 | VariationalBayes.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,542 | VariationalBayes.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,666 | _release_Makefile | |
| - | rwxr-xr-x | 521 | biocUpdate.sh | |
| - | rw-r--r-- | 3,624 | changeList | |
| - | rwxr-xr-x | 2,106 | checkTR.py | |
| - | rw-r--r-- | 606 | common.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 899 | common.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,048 | convertSamples.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 12,128 | estimateDE.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 23,193 | estimateExpression.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 15,566 | estimateHyperPar.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 8,526 | estimateVBExpression.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 3,885 | extractSamples.cpp | |
| - | rwxr-xr-x | 2,660 | extractTranscriptInfo.py | |
| - | rwxr-xr-x | 2,759 | getCounts.py | |
| - | rw-r--r-- | 3,675 | getFoldChange.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 4,601 | getGeneExpression.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 5,667 | getPPLR.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 5,264 | getVariance.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 9,825 | getWithinGeneExpression.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 19,619 | lowess.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 940 | lowess.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,316 | misc.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,652 | misc.h | |
| - | rw-r--r-- | 987 | parameters1.txt | |
| - | rw-r--r-- | 27,582 | parseAlignment.cpp | |
| - | rwxr-xr-x | 17,285 | parseAlignment.py | |
| - | rwxr-xr-x | 1,039 | releaseDo.sh | |
| - | rw-r--r-- | 945 | releaseList | |
| - | rw-r--r-- | 819 | tagAlignment.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,471 | transposeFiles.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 135 | transposeFiles.h | |
| - | rw-r--r-- | 666 | transposeLargeFile.cpp |
