File: lysozymeLarge.fasta

package info (click to toggle)
bppsuite 2.4.1-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 2,116 kB
  • sloc: cpp: 3,867; sh: 65; makefile: 5
file content (172 lines) | stat: -rw-r--r-- 9,108 bytes parent folder | download | duplicates (7)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172

>1.human
AAGGTCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGAAT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTACAACACA
CGAGCTACAA ACTACAATGC TGGAGACAGA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATGA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATTTATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCGTTGTCA AAACAGAGAT
GTCCGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>2.chimp_bonobo_gorilla
AAGGTCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGAAT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
CGAGCTACAA ACTACAATGC TGGAGACAGA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATGA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATTTATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCGTTGTCA AAACAGAGAT
GTCCGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTA                                 

>3.orangutan_Ppy
AAGGTCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGAAT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
CGAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACAGA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATGA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATTTATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCGTTGTCA AAACAGAGAT
GTCCGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTA                                 

>4.gibbon_Ggo
AAGGTCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGAAT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
CGAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACAGA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATGA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATTTATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCC GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGCGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCGTTGTCA AAACAGAGAT
CTCCGTCAGT ATATTCAAGG TTGTGGAGTA                                 

>5.colobus_Cgu&Can
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA AATTGGGACT GGATGGCTAC
AAGGGAGTCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
GACGCTACAA ACTACAATCC TGGAGATGAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAAA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTCG AGCATGGGTG GCATGGAAAA AGCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTGAAGG TTGTGGAGTA                                 

>6.langur_Sen&Sve
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA AATTGGGACT GGATGGCTAC
AAGGGAGTCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
GAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACGAA AGCACTGATT ATGGCATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTGATGCCTG TCATATATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAAA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTCG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAAAGAT
GTCAGTCAGT ACGTTAAAGG TTGTGGAGTA                                 

>7.langur_Tob&Tfr
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA AATTGGGACT GGATGGCTAC
AAGGGAGTCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
GAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACGAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTGATGCCTG TCATATATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAAA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTCG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAAAGAT
GTCAGTCAGT ACGTTAAAGG TTGTGGAGTA                                 

>8.Douc_langur_Pne
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA AATTGGGACT GGATGGCTAC
AAGGGAGTCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
GAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACGAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTGATGCCTG TCATATATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAAA CAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCGTTCG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAAAGAT
GTCAGTCAGT ACGTTAAAGG TTGTGGAGTG                                 

>9.probiscis_Nla
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA AATTGGGACT GGATGGCTAC
AAGGGAGTCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
GAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACGAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCGCTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTGATGCCTG TCATATATCC
TGCAGTGCTT TGCTGCAAAA TAACATCGCT GATGCTGTAG CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTCG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ACGTTAAAGG TTGTGGAGTG                                 

>10.baboon_Pcy
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTGGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>11.mangabey_Cat
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>12.rhesus_Mmu
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTAA TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>13.Allen_Ani
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCGTATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
AGAGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>14.talapoin_Mta
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATTA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA CAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>15.patas_Epa
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAGGA TAACATTGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>16.vervet_Cae
AAGATCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GATTGGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGGTGTGC TTGGCCAAAT GGGAGAGTGG TTATAACACA
CAAGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTACT GGTGTAATAA TGGCAAAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TAACATCGCT GATGCTGTAA CTTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAGAA ATCACTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTG                                 

>17.squirrel_m
AAGGTCTTCG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GGCTTGGAAT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA CTATAACACA
CGTGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTATT GGTGTAATAA TGGCAGAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TGACATCACT CAAGCTGTGG CCTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAAAG CTCATTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTA                                 

>18.tamarin_Soe
AAGGTCTTCG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GACTTGGATT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CGTGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTATT GGTGTAATAA CGGCAGAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TGACATCACT GAAGCTGTGG CCTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGTGATCCAC AAGGCATTAG AGCATGGGTG GCATGGAAAG CTCATTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATATTCAAGG TTGTGGAGTA                                 

>19.Marmoset_Cja
AAGGTCTTTG AAAGGTGTGA GTTGGCCAGA ACTCTGAAAA GGTTTGGACT GGATGGCTAC
AGGGGAATCA GCCTAGCAAA CTGGATGTGT TTGGCCAAAT GGGAGAGTGA TTATAACACA
CGTGCTACAA ACTACAATCC TGGAGACCAA AGCACTGATT ATGGGATATT TCAGATCAAT
AGCCACTATT GGTGTAACAA TGGCAGAACC CCAGGAGCAG TTAATGCCTG TCATATATCC
TGCAATGCTT TGCTGCAAGA TGACATCACT GAAGCTGTGG CCTGTGCAAA GAGGGTTGTC
CGCGATCCAC AAGGCATTAG GGCATGGGTG GCATGGAAAG CTCATTGTCA AAACAGAGAT
GTCAGTCAGT ATGTTCAAGG TTGTGGAGTA