package info
(click to toggle)
Folder: src
| .. (parent) | ||||
| - | rw-r--r-- | 43,746 | FMI_search.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 7,265 | FMI_search.h | |
| - | rw-r--r-- | 191,640 | bandedSWA.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 12,081 | bandedSWA.h | |
| - | rw-r--r-- | 15,161 | bntseq.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,780 | bntseq.h | |
| - | rw-r--r-- | 21,628 | bwa.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 3,989 | bwa.h | |
| - | rwxr-xr-x | 116,075 | bwamem.cpp | |
| - | rwxr-xr-x | 15,155 | bwamem.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,445 | bwamem_extra.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 52,998 | bwamem_pair.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 5,296 | bwt.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,469 | bwtindex.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 39,704 | fastmap.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,497 | fastmap.h | |
| - | rw-r--r-- | 16,524 | kbtree.h | |
| - | rw-r--r-- | 20,888 | khash.h | |
| - | rw-r--r-- | 11,807 | kopen.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 9,726 | kseq.h | |
| - | rw-r--r-- | 10,089 | ksort.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,867 | kstring.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 3,754 | kstring.h | |
| - | rw-r--r-- | 27,773 | ksw.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 6,476 | ksw.h | |
| - | rw-r--r-- | 70,702 | kswv.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 6,278 | kswv.h | |
| - | rw-r--r-- | 3,933 | kthread.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,673 | kthread.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,991 | kvec.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,588 | macro.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,802 | main.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,865 | main.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,387 | memcpy_bwamem.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,785 | memcpy_bwamem.h | |
| - | rw-r--r-- | 10,322 | profiling.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 1,666 | profiling.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,435 | read_index_ele.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 2,283 | read_index_ele.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,680 | runsimd.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 19,815 | sais.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,125 | utils.cpp | |
| - | rw-r--r-- | 5,937 | utils.h |
