package info (click to toggle)
canu 1.7.1+dfsg-1~bpo9+1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: stretch-backports
  • size: 7,680 kB
  • sloc: cpp: 66,708; perl: 13,682; ansic: 4,020; makefile: 627; sh: 472; python: 39

Folder: meryl

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 libkmer
d d rwxr-xr-x 4,096 libleaff
d d rwxr-xr-x 4,096 test
- - rw-r--r-- 6,488 compare-counts.C
- - rw-r--r-- 8,536 estimate-mer-threshold.C
- - rw-r--r-- 522 estimate-mer-threshold.mk
- - rw-r--r-- 7,784 existDB.C
- - rw-r--r-- 501 existDB.mk
- - rwxr-xr-x 8,092 gkrpt.pl
- - rw-r--r-- 2,383 leaff-blocks.C
- - rw-r--r-- 5,506 leaff-duplicates.C
- - rw-r--r-- 4,793 leaff-gc.C
- - rw-r--r-- 6,453 leaff-partition.C
- - rw-r--r-- 6,569 leaff-simulate.C
- - rw-r--r-- 4,305 leaff-statistics.C
- - rw-r--r-- 29,349 leaff.C
- - rw-r--r-- 672 leaff.mk
- - rw-r--r-- 975 libleaff.mk
- - rw-r--r-- 17,501 libmeryl.C
- - rw-r--r-- 7,552 libmeryl.H
- - rw-r--r-- 6,449 libsequence.C
- - rw-r--r-- 2,921 libsequence.H
- - rw-r--r-- 5,417 mapMers-depth.C
- - rw-r--r-- 7,469 mapMers.C
- - rw-r--r-- 18,096 maskMers.C
- - rw-r--r-- 495 maskMers.mk
- - rw-r--r-- 23,044 meryl-args.C
- - rw-r--r-- 8,641 meryl-binaryOp.C
- - rw-r--r-- 28,294 meryl-build.C
- - rw-r--r-- 5,563 meryl-dump.C
- - rw-r--r-- 7,327 meryl-estimate.C
- - rw-r--r-- 13,143 meryl-merge-listmerge.C
- - rw-r--r-- 14,021 meryl-merge-qsort.C
- - rw-r--r-- 9,278 meryl-merge.C
- - rw-r--r-- 3,305 meryl-unaryOp.C
- - rw-r--r-- 17,079 meryl.C
- - rw-r--r-- 5,330 meryl.H
- - rw-r--r-- 691 meryl.mk
- - rw-r--r-- 10,626 positionDB.C
- - rw-r--r-- 507 positionDB.mk
- - rw-r--r-- 34,843 sequence.C
- - rw-r--r-- 467 sequence.mk
- - rw-r--r-- 3,709 simple-dump.C
- - rw-r--r-- 509 simple-dump.mk
- - rw-r--r-- 6,545 simple.C
- - rw-r--r-- 491 simple.mk