File: blosum50.qij

package info (click to toggle)
conservation-code 20110309.0-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye, forky, sid, trixie
  • size: 608 kB
  • sloc: python: 512; sh: 24; makefile: 21
file content (24 lines) | stat: -rw-r--r-- 1,752 bytes parent folder | download | duplicates (4)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
#  BLOSUM Clustered Target Frequencies=qij
#  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
#  Cluster Percentage: >= 50
   A      R      N      D      C      Q      E      G      H      I      L      K      M      F      P      S      T      W      Y      V   
0.0192 
0.0027 0.0152 
0.0024 0.0020 0.0101 
0.0026 0.0019 0.0035 0.0161 
0.0015 0.0005 0.0006 0.0005 0.0091 
0.0022 0.0025 0.0016 0.0017 0.0004 0.0057 
0.0034 0.0029 0.0023 0.0048 0.0006 0.0033 0.0141 
0.0062 0.0020 0.0031 0.0028 0.0009 0.0017 0.0023 0.0316 
0.0012 0.0013 0.0015 0.0011 0.0003 0.0010 0.0013 0.0011 0.0064 
0.0035 0.0015 0.0013 0.0012 0.0008 0.0011 0.0015 0.0018 0.0007 0.0140 
0.0048 0.0028 0.0017 0.0018 0.0014 0.0019 0.0026 0.0027 0.0013 0.0104 0.0304 
0.0033 0.0064 0.0027 0.0026 0.0006 0.0029 0.0043 0.0028 0.0014 0.0017 0.0027 0.0130 
0.0016 0.0009 0.0007 0.0005 0.0004 0.0008 0.0008 0.0009 0.0005 0.0022 0.0042 0.0010 0.0029 
0.0020 0.0012 0.0009 0.0008 0.0006 0.0007 0.0012 0.0015 0.0009 0.0030 0.0058 0.0012 0.0012 0.0154 
0.0022 0.0011 0.0011 0.0015 0.0004 0.0011 0.0019 0.0019 0.0006 0.0013 0.0017 0.0018 0.0005 0.0007 0.0171 
0.0062 0.0025 0.0032 0.0028 0.0011 0.0022 0.0030 0.0044 0.0012 0.0021 0.0029 0.0031 0.0010 0.0016 0.0018 0.0111 
0.0039 0.0021 0.0026 0.0022 0.0010 0.0015 0.0024 0.0025 0.0009 0.0029 0.0038 0.0026 0.0011 0.0015 0.0016 0.0047 0.0100 
0.0005 0.0004 0.0002 0.0002 0.0001 0.0003 0.0004 0.0005 0.0002 0.0005 0.0008 0.0004 0.0003 0.0009 0.0002 0.0003 0.0004 0.0059 
0.0015 0.0013 0.0009 0.0009 0.0004 0.0009 0.0012 0.0012 0.0013 0.0018 0.0027 0.0013 0.0007 0.0039 0.0006 0.0013 0.0012 0.0008 0.0077 
0.0054 0.0020 0.0015 0.0016 0.0013 0.0014 0.0020 0.0022 0.0007 0.0107 0.0092 0.0022 0.0021 0.0030 0.0016 0.0029 0.0041 0.0005 0.0018 0.0164