File: blosum80.qij

package info (click to toggle)
conservation-code 20110309.0-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye, forky, sid, trixie
  • size: 608 kB
  • sloc: python: 512; sh: 24; makefile: 21
file content (24 lines) | stat: -rw-r--r-- 1,752 bytes parent folder | download | duplicates (4)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
#  BLOSUM Clustered Target Frequencies=qij
#  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
#  Cluster Percentage: >= 80
   A      R      N      D      C      Q      E      G      H      I      L      K      M      F      P      S      T      W      Y      V   
0.0252 
0.0020 0.0210 
0.0016 0.0017 0.0166 
0.0018 0.0013 0.0037 0.0262 
0.0015 0.0003 0.0004 0.0003 0.0172 
0.0017 0.0024 0.0014 0.0014 0.0003 0.0094 
0.0028 0.0023 0.0019 0.0048 0.0003 0.0035 0.0208 
0.0053 0.0015 0.0025 0.0022 0.0006 0.0011 0.0017 0.0463 
0.0009 0.0012 0.0012 0.0008 0.0002 0.0011 0.0012 0.0008 0.0104 
0.0027 0.0010 0.0007 0.0008 0.0011 0.0007 0.0010 0.0009 0.0004 0.0220 
0.0036 0.0018 0.0011 0.0011 0.0014 0.0014 0.0015 0.0016 0.0008 0.0111 0.0442 
0.0029 0.0061 0.0022 0.0020 0.0004 0.0028 0.0036 0.0020 0.0010 0.0012 0.0019 0.0190 
0.0011 0.0006 0.0004 0.0003 0.0004 0.0007 0.0006 0.0005 0.0003 0.0025 0.0052 0.0007 0.0053 
0.0014 0.0007 0.0006 0.0006 0.0005 0.0005 0.0006 0.0009 0.0007 0.0027 0.0052 0.0007 0.0010 0.0211 
0.0021 0.0009 0.0007 0.0009 0.0003 0.0007 0.0012 0.0010 0.0004 0.0007 0.0012 0.0012 0.0003 0.0004 0.0221 
0.0064 0.0020 0.0029 0.0024 0.0010 0.0017 0.0026 0.0034 0.0010 0.0015 0.0021 0.0026 0.0007 0.0010 0.0014 0.0167 
0.0036 0.0015 0.0020 0.0016 0.0009 0.0012 0.0019 0.0019 0.0007 0.0024 0.0028 0.0020 0.0009 0.0011 0.0011 0.0048 0.0156 
0.0003 0.0002 0.0001 0.0001 0.0001 0.0002 0.0002 0.0003 0.0001 0.0003 0.0006 0.0002 0.0002 0.0007 0.0001 0.0002 0.0002 0.0087 
0.0011 0.0007 0.0006 0.0005 0.0003 0.0005 0.0006 0.0006 0.0016 0.0013 0.0020 0.0008 0.0005 0.0046 0.0003 0.0009 0.0008 0.0010 0.0148 
0.0046 0.0013 0.0009 0.0010 0.0013 0.0010 0.0015 0.0014 0.0005 0.0123 0.0089 0.0015 0.0022 0.0022 0.0010 0.0021 0.0033 0.0004 0.0012 0.0246