File: blosumn.qij

package info (click to toggle)
conservation-code 20110309.0-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye, forky, sid, trixie
  • size: 608 kB
  • sloc: python: 512; sh: 24; makefile: 21
file content (24 lines) | stat: -rw-r--r-- 1,752 bytes parent folder | download | duplicates (4)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
#  BLOSUM Clustered Target Frequencies=qij
#  Blocks Database = /data/blocks_5.0/blocks.dat
#  Cluster Percentage: >= -2
   A      R      N      D      C      Q      E      G      H      I      L      K      M      F      P      S      T      W      Y      V   
0.0339 
0.0015 0.0271 
0.0012 0.0013 0.0209 
0.0013 0.0009 0.0030 0.0330 
0.0013 0.0002 0.0003 0.0002 0.0213 
0.0014 0.0016 0.0011 0.0010 0.0002 0.0142 
0.0021 0.0016 0.0014 0.0045 0.0002 0.0029 0.0307 
0.0040 0.0011 0.0019 0.0018 0.0004 0.0008 0.0012 0.0596 
0.0007 0.0010 0.0010 0.0006 0.0001 0.0010 0.0009 0.0005 0.0148 
0.0018 0.0006 0.0005 0.0005 0.0010 0.0005 0.0007 0.0006 0.0003 0.0295 
0.0026 0.0012 0.0007 0.0007 0.0010 0.0011 0.0010 0.0011 0.0005 0.0087 0.0543 
0.0021 0.0051 0.0016 0.0014 0.0002 0.0024 0.0026 0.0014 0.0007 0.0008 0.0013 0.0251 
0.0007 0.0005 0.0003 0.0002 0.0003 0.0005 0.0004 0.0004 0.0002 0.0021 0.0044 0.0006 0.0097 
0.0009 0.0005 0.0004 0.0004 0.0005 0.0004 0.0004 0.0006 0.0005 0.0020 0.0041 0.0006 0.0009 0.0264 
0.0016 0.0006 0.0004 0.0006 0.0002 0.0005 0.0009 0.0008 0.0003 0.0005 0.0008 0.0009 0.0003 0.0003 0.0264 
0.0057 0.0015 0.0021 0.0018 0.0008 0.0012 0.0021 0.0029 0.0007 0.0011 0.0015 0.0018 0.0005 0.0008 0.0011 0.0243 
0.0030 0.0012 0.0017 0.0013 0.0008 0.0009 0.0015 0.0015 0.0005 0.0019 0.0021 0.0015 0.0007 0.0008 0.0008 0.0045 0.0249 
0.0002 0.0002 0.0001 0.0001 0.0001 0.0002 0.0002 0.0002 0.0001 0.0002 0.0004 0.0001 0.0002 0.0007 0.0001 0.0002 0.0002 0.0115 
0.0008 0.0005 0.0004 0.0004 0.0003 0.0004 0.0004 0.0004 0.0012 0.0009 0.0013 0.0005 0.0003 0.0044 0.0002 0.0007 0.0006 0.0009 0.0208 
0.0036 0.0008 0.0006 0.0006 0.0011 0.0007 0.0012 0.0009 0.0004 0.0109 0.0069 0.0010 0.0018 0.0016 0.0007 0.0016 0.0028 0.0004 0.0008 0.0335