 |
|
|
|
.. (parent) |
 |
- |
rw-r--r-- |
30 |
.gitignore
|
 |
- |
rw-r--r-- |
251 |
README.md
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,094 |
_valid_examples.toml
|
 |
- |
rw-r--r-- |
15,300 |
affine_registration_3d.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,097 |
affine_registration_masks.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,646 |
afq_tract_profiles.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,278 |
brain_extraction_dwi.py
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
2,957 |
bundle_assignment_maps.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
21,201 |
bundle_extraction.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,407 |
bundle_group_registration.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,298 |
bundle_registration.py
|
 |
- |
rwxr-xr-x |
3,500 |
bundle_shape_similarity.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,806 |
bundlewarp_registration.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,890 |
cluster_confidence.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,465 |
combined_workflow_creation.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,038 |
contextual_enhancement.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,279 |
denoise_ascm.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,522 |
denoise_gibbs.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,935 |
denoise_localpca.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,281 |
denoise_mppca.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,808 |
denoise_nlmeans.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,424 |
denoise_patch2self.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,328 |
fast_streamline_search.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,878 |
fiber_to_bundle_coherence.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,129 |
gradients_spheres.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,645 |
histology_resdnn.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,157 |
kfold_xval.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,898 |
linear_fascicle_evaluation.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,482 |
motion_correction.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,514 |
path_length_map.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,138 |
piesno.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,448 |
quick_start.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,859 |
reconst_bingham.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,177 |
reconst_csa.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,614 |
reconst_csa_parallel.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
10,816 |
reconst_csd.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,332 |
reconst_csd_parallel.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,342 |
reconst_cti.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,288 |
reconst_dki.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,759 |
reconst_dki_micro.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,029 |
reconst_dsi.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,423 |
reconst_dsi_metrics.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,021 |
reconst_dsid.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,760 |
reconst_dti.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,215 |
reconst_forecast.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,382 |
reconst_fwdti.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,126 |
reconst_gqi.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,741 |
reconst_ivim.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,254 |
reconst_mapmri.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
12,814 |
reconst_mcsd.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
16,103 |
reconst_msdki.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
19,105 |
reconst_qtdmri.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,833 |
reconst_qti.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,775 |
reconst_qtiplus.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
17,523 |
reconst_rumba.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,473 |
reconst_sfm.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
7,153 |
reconst_sh.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,520 |
reconst_shore.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,830 |
reconst_shore_metrics.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,203 |
register_binary_fuzzy.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,297 |
reslice_datasets.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,713 |
restore_dti.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,441 |
segment_clustering_features.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,692 |
segment_clustering_metrics.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,471 |
segment_extending_clustering_framework.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,506 |
segment_quickbundles.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,675 |
simulate_dki.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,588 |
simulate_multi_tensor.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,617 |
snr_in_cc.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,436 |
streamline_formats.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,992 |
streamline_length.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,707 |
streamline_registration.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
11,021 |
streamline_tools.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,097 |
surface_seed.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,663 |
syn_registration_2d.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,760 |
syn_registration_3d.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,700 |
tissue_classification.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,430 |
tissue_classification_dam.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,093 |
tracking_bootstrap_peaks.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,871 |
tracking_deterministic.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,157 |
tracking_disco_phantom.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,446 |
tracking_introduction_eudx.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,832 |
tracking_pft.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,809 |
tracking_probabilistic.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
2,738 |
tracking_ptt.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
5,464 |
tracking_rumba.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,269 |
tracking_sfm.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
13,064 |
tracking_stopping_criterion.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
9,674 |
viz_advanced.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
6,888 |
viz_bundles.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
3,752 |
viz_roi_contour.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
8,741 |
viz_slice.py
|
 |
- |
rw-r--r-- |
4,143 |
workflow_creation.py
|