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#!/bin/ksh
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# #
# Script ksh pour lancer un calcul Gaussian en batch #
# Auteur: A-R Allouche allouche@lasim.univ-lyon1.fr #
# LASIM, Villeurbanne #
# Ecriture : September 2004 #
# #
###################################################################
jobtime=$1 ; [ 0 = $# ] || shift
filename=$1 ; [ 0 = $# ] || shift
if [ -z "$filename" ] || [ -z "$jobtime" ]
then
clear
echo " "
echo "==========================================="
echo " submitGaussian "
echo " Pour toutes questions contacter : "
echo " A.R. Allouche allouche@lasim.univ-lyon1.fr"
echo "==========================================="
echo "vous devez fournir :"
echo " - le temps de calcul( hh:mm:ss)"
echo " - le nom du fichier(y compris l'extension .com)"
echo "-------------------------------------------"
echo "Exemple:"
echo " submitGaussian 2:00:00 h2.com "
echo " fichier de donnees : h2.com"
echo " Temps de calcul(maximum) : 2 heurs"
echo "==========================================="
echo " "
exit 1
fi
filecom=$filename
filename=${filecom%.com}
DEFAULTDIR=`pwd`
g98root=/data/logiciels/Gaussian
if test ! -s "$filecom"
then
echo " "
echo "============================================"
echo "le fichier $filecom est introuvable(ou vide)"
echo "============================================"
echo " "
exit 2
fi
endof=EOF
cat > $filename.pbs <<EOF
#!/bin/sh
#PBS -j oe
#PBS -N $filename
#PBS -l walltime=$jobtime
#PBS -o $filename.pbsout
g98root=/data/logiciels/Gaussian
export g98root
PGI=/data/logiciels/PGI
export PGI
mkdir /tmp/$LOGNAME
mkdir /tmp/$LOGNAME/$filename
GAUSS_SCRDIR=/tmp/$LOGNAME/$filename
export GAUSS_SCRDIR
. /data/logiciels/Gaussian/g98/bsd/g98.profile
cd $DEFAULTDIR
/data/logiciels/Gaussian/g98/g98 "$DEFAULTDIR/$filecom"
EOF
qsub $filename.pbs
echo " "
echo "==================================================================="
echo " "
echo "Un fichier $filename.pbs a ete cree pour lancer le calcul"
echo "Ne pas effacer ce fichier avant la fin du calcul"
echo " "
echo "-------------------------------------------------------------------"
echo " "
echo "pour avoir des informations sur vos job taper : qstat "
echo " "
echo "pour detruire un job taper : qdel num.master0.alin"
echo " num.master0.alin est le Job Id fourni par qstat"
echo " "
echo "==================================================================="
echo " "
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