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#!/bin/sh
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# #
# Script ksh pour lancer un calcul G03 en batch #
# Auteur: A-R Allouche allouche@lasim.univ-lyon1.fr #
# LASIM, Villeurbanne #
# Ecriture : Janvier 2006 #
# #
###################################################################
queue=$1 ; [ 0 = $# ] || shift
filename=$1 ; [ 0 = $# ] || shift
if [ -z "$filename" ] || [ -z "$queue" ]
then
clear
echo " "
echo "==========================================="
echo " submitG03 "
echo " Pour toutes questions contacter : "
echo " A.R. Allouche allouche@lasim.univ-lyon1.fr"
echo "==========================================="
echo " Queue Duree # proc"
echo " ========= ===== ======"
echo " v12zlin1 96h 2"
echo " v20zlin 96h 2"
echo " v20zlin1 168h 2"
echo " v22zlin 72h 4"
echo " v40zlin 120h 4"
echo " v12zlin1_1 96h 1"
echo " v20zlin1_1 168h 1"
echo "-------------------------------------------"
echo "Vous devez fournir :"
echo " - Le nom de la queue :"
echo " - Le nom du fichier(y compris l'extension .com)"
echo "-------------------------------------------"
echo "Exemple:"
echo " submitG03 v12zlin1 h2.com "
echo " fichier de donnees : h2.com"
echo " Queue : v12zlin1(96)"
echo "==========================================="
echo " "
exit 1
fi
filecom=$filename
filename=${filecom%.com}
[ $queue = "v12zlin1" ] && underqueue="gaussian2" && nproc=2
[ $queue = "v20zlin" ] && underqueue="gaussian2" && nproc=2
[ $queue = "v20zlin1" ] && underqueue="gaussian2" && nproc=2
[ $queue = "v22zlin" ] && underqueue="gaussian4" && nproc=4
[ $queue = "v40zlin" ] && underqueue="gaussian4" && nproc=4
[ $queue = "v12zlin1_1" ] && queue="v12zlin1" && underqueue="MONO" && nproc=1
[ $queue = "v20zlin1_1" ] && queue="v20zlin1" && underqueue="MONO" && nproc=1
DEFAULTDIR=`pwd`
if test ! -s "$filecom"
then
echo " "
echo "============================================"
echo "le fichier $filecom est introuvable(ou vide)"
echo "============================================"
echo " "
exit 2
fi
g03filecom=g03$filecom
endof=EOF
cat > $filename.sh <<EOF
#!/bin/sh
cd $DEFAULTDIR
export LD_ASSUME_KERNEL=2.4.1
export g03root=/softs/gaussianlasim
. \$g03root/g03/bsd/g03.profile
export GAUSS_SCRDIR=/scratch/$LOGNAME/$RANDOM
mkdir /scratch/$LOGNAME
mkdir \$GAUSS_SCRDIR
if test ! -s "$g03filecom"
then
/bin/rm $g03filecom
fi
if [ $nproc != "1" ]
then
cat > $g03filecom <<$endof
%Nproc=$nproc
$endof
fi
cat $filecom >> $g03filecom
echo "Run gaussian 03 : Queue = $queue/$underqueue "
\$g03root/g03/g03 < "$DEFAULTDIR/$g03filecom" > $filename.log
/bin/rm $g03filecom
echo "Remove tmp dir : \$GAUSS_SCRDIR "
/bin/rm -r \$GAUSS_SCRDIR
/bin/rm $filename.sh
EOF
if [ $nproc != "1" ]
then
/usr/local/sge/bin/lx24-amd64/qsub -o $DEFAULTDIR -e $DEFAULTDIR -q $queue -pe $underqueue $nproc $filename.sh
else
/usr/local/sge/bin/lx24-amd64/qsub -o $DEFAULTDIR -e $DEFAULTDIR -q $queue $filename.sh
fi
echo " "
echo "==================================================================="
echo " "
echo "Un fichier $filename.sh a ete cree pour lancer le calcul"
echo "Ne pas effacer ce fichier avant la fin du calcul"
echo " "
echo "-------------------------------------------------------------------"
echo " "
echo "pour avoir des informations sur vos job taper : qstat "
echo " "
echo "pour detruire un job taper : qdel JobID"
echo " JobID est le Job-Id fourni par qstat"
echo " "
echo "==================================================================="
echo " "
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