File: de_ligation.htm

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<title>Ligation</title>
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<h1>Ligation</h1>
Die Ligation ist h&auml;ufig der n&auml;chste Schritt nach dem <a href="de_restriction.htm">Restriktionsverdau</a>. &Uuml;ber des Men&uuml; "Werkzeuge/Ligation" oder &uuml;ber das Tastenk&uuml;rzel "Strg-L" kann der Ligationsdialog aufgerufen werden. In der linken Liste werden alle gegenw&auml;rtig geladenen, <i>linearen</i> DNA-Sequenzen angezeigt. Nur markierte DNA-Sequenzen werden in der Ligation ber&uuml;cksichtigt. Automatisch werden dabei alle Sequenzen mit "sticky ends" markiert. F&uuml;r Blunt-End-Ligationen m&uuml;ssen die entsprechenden Sequenzen manuell markiert werden.
<p>Die rechte Liste zeigt alle Ligationsprodukte an, die aus den aktuell markierten Sequenzen entstehen k&ouml;nnen. Dabei werden Poly-Ligationen (z.B. "A-B-A-B-A-B-...") <i>nicht</i> angezeigt. Bei zirkul&auml;ren Produkten werden beide logische Formen (z.B. "A-B" und "B-A" f&uuml;r die Ligation von A und B) angezeigt. Beide sind der Sequenz nach identisch.
<p>Durch den "Ligieren!"-Button werden alle markierten Produkte aus der rechten Spalte erzeugt. Die Produktnamen werden aus den Ausgangssequenzen zusammengesetzt und bed&uuml;rfen oft der manuellen Nachbearbeitung. Der Ligationsverlauf wird der Beschreibung der Produkte angef&uuml;gt.

<center><img src="de_ligation.png"></center>

<center><a href="de_main.htm">Startseite</a></center>
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