File: rgfa_example.1.gfa

package info (click to toggle)
gfapy 1.2.3%2Bdfsg-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm
  • size: 2,036 kB
  • sloc: python: 11,777; sh: 167; makefile: 68
file content (15 lines) | stat: -rw-r--r-- 359 bytes parent folder | download | duplicates (3) 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
 
S	s1	CTGAA	SN:Z:chr1	SO:i:0	SR:i:0
S	s2	ACG	SN:Z:chr1	SO:i:5	SR:i:0
S	s3	TGGC	SN:Z:chr1	SO:i:8	SR:i:0
S	s4	TGTGA	SN:Z:chr1	SO:i:12	SR:i:0
S	s5	TTTC	SN:Z:foo	SO:i:8	SR:i:1
S	s6	CTGA	SN:Z:foo	SO:i:12	SR:i:1
S	s7	GTTAC	SN:Z:bar	SO:i:5	SR:i:2
L	s1	+	s2	+	0M
L	s2	+	s3	+	0M
L	s3	+	s4	+	0M
L	s2	+	s5	+	0M
L	s5	+	s6	+	0M
L	s6	+	s4	+	0M
L	s1	+	s7	-	0M
L	s7	-	s6	+	0M