1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
|
ClassName = DirichletReg
Name = recode3.20comp
Alphabet = ExtAA
Order = A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
AlphaChar= 20
NumDistr= 20
Number= 0
Mixture= 0.176513
Alpha= 10.1329 0.668781 0.072626 1.08101 0.930936 0.1235 0.982387 0.366701 0.0586812 0.849019 0.185073 0.0648062 0.979541 0.519704 0.555784 0.636552 1.04987 0.60931 0.129148 0.0676805 0.201772
Comment= N , D S Q H K E G R T P >< A Y , W C F M , L V , I
Number= 1
Mixture= 0.207622
Alpha= 11.6836 0.880009 0.197393 0.303744 0.497357 0.657492 0.391988 0.348159 0.936094 0.527206 1.42844 0.449302 0.368825 0.384576 0.439775 0.581516 0.622624 0.747064 1.08007 0.235012 0.606928
Comment= M Y L F I W V H T Q >< R A C S K N P E , G D
Number= 2
Mixture= 0.0669246
Alpha= 5.22319 0.153384 0.0520756 0.0073824 0.0158439 0.428964 0.025533 0.0185789 0.845361 0.0282996 2.42256 0.424296 0.0190716 0.0313429 0.0274578 0.0252186 0.028514 0.0519217 0.522946 0.0279653 0.0664755
Comment= L , M I , F V >< C , A Y W , T H Q P , R K S N G , E , D
Number= 3
Mixture= 0.0868259
Alpha= 9.82176 0.794007 0.0130659 0.624236 1.85769 0.0290214 0.115707 0.123504 0.22099 1.52605 0.341371 0.111114 0.308302 0.263545 0.953727 0.933444 0.554741 0.604551 0.396451 0.00823516 0.0420054
Comment= E K Q , R T D A >< S N P V H M , L I , G , Y C F , W
Number= 4
Mixture= 0.0593123
Alpha= 5.54386 0.740015 0.187165 0.0213261 0.0456854 0.118944 0.0633687 0.0170331 1.06684 0.0380614 0.733524 0.138456 0.0300644 0.0718692 0.0240143 0.0301022 0.0862989 0.367283 1.70735 0.0113856 0.045079
Comment= V , I , C A L T M >< F , P S , Y G W E H , N K Q R D
Number= 5
Mixture= 0.0358616
Alpha= 4.66847 0.15978 0.0261585 0.0505181 0.125524 0.0350331 0.102549 0.157461 0.0795041 1.26261 0.189383 0.0550608 0.171028 0.0844169 0.290476 1.44604 0.129158 0.138972 0.0851144 0.0159134 0.0637679
Comment= R K ,, Q H >< N T M , S L A E P Y C G I V , W D F
Number= 6
Mixture= 0.03427
Alpha= 5.9237 0.308434 0.0137217 1.69731 1.92422 0.0361113 0.162357 0.07232 0.0487895 0.236135 0.0809074 0.0286236 0.213663 0.181631 0.320245 0.104878 0.218398 0.141668 0.0747719 0.0141705 0.0453433
Comment= E D ,, Q >< N K A P S , H T G R , M Y V W L F I C
Number= 7
Mixture= 0.0428319
Alpha= 0.0441636 0.00260287 9.99856e-06 0.00631292 0.00445502 0.00274753 1.03886e-05 1.02839e-05 0.000913052 0.0029241 0.00353485 0.00105128 0.00338172 1.04172e-05 0.00173574 0.00459583 0.00274255 0.00247625 0.00175366 1.02411e-05 0.00288489
Comment= D R , Y N E F K M Q T S >< L A V , I ,,,,, W C H , P , G
Number= 8
Mixture= 0.047875
Alpha= 3.87573 1.61043 0.15522 0.0378292 0.0498243 0.0406484 0.529136 0.0217524 0.040597 0.0413396 0.100193 0.0509779 0.0357917 0.0931204 0.0367156 0.0330646 0.529587 0.196607 0.230878 0.00909518 0.0329275
Comment= A , S C , G >< T V M P , L Q F , Y H N E K I R D W
Number= 9
Mixture= 0.0466614
Alpha= 4.02936 0.15525 0.0136827 0.0857138 0.0508316 0.0151451 3.10555 0.027169 0.0140491 0.0654038 0.0257501 0.00901049 0.127437 0.0423873 0.0345064 0.0477247 0.12452 0.0341196 0.0230637 0.00930115 0.0187464
Comment= G ,,,>< N S A , D K H , R Q P E C T W Y , M F V L , I
Number= 10
Mixture= 0.0283695
Alpha= 4.37516 0.225739 0.0684326 0.101072 0.0813791 0.0298832 0.0915218 0.0336807 0.0833114 0.0931673 0.0731542 0.0419314 0.230216 0.087446 0.0694702 0.0751969 1.13857 1.63158 0.179083 0.00912576 0.0311963
Comment= T S ,, N >< C A V , M Q P D K R I H E G , Y L F W
Number= 11
Mixture= 0.0301127
Alpha= 5.10487 1.3431e-06 0.0166656 0.00743068 1.34592e-06 0.169076 0.00407061 0.00714122 1.98221 0.017522 0.816669 0.114773 0.00678027 0.0106392 0.0100244 0.0158968 0.00879658 0.0399043 1.81043 0.0150671 0.0517801
Comment= I V ,, L M >< F , Y , W C T ,, R K H Q P , N S D , G ,,,,,,,,,,, E , A
Number= 12
Mixture= 0.0233828
Alpha= 3.08488 0.063525 0.0288391 1.09265 0.0959581 0.00965196 0.216914 0.0730986 0.0207325 0.08719 0.0315107 0.00960293 0.752755 0.059914 0.0445321 0.0312317 0.287327 0.116896 0.0249446 0.00701663 0.0305859
Comment= D N ,, S >< H G T C , K E P Q Y A , R W M , V L I F
Number= 13
Mixture= 0.034662
Alpha= 5.72698 0.294281 0.019271 0.12293 0.162747 0.0373667 0.145029 0.0412349 0.0815261 0.157594 0.151631 0.021412 0.0601581 3.6966 0.0809085 0.101856 0.23533 0.135424 0.140532 0.00900473 0.0321389
Comment= P ,,,>< S A , K E T Q D R V G H L , N I C M Y F , W
Number= 14
Mixture= 0.0270202
Alpha= 3.67648 0.0844832 0.0584945 0.0411628 0.045719 0.847822 0.0590839 0.250253 0.0675757 0.0562614 0.168617 0.0439737 0.0794234 0.028301 0.0305672 0.0598024 0.0798202 0.0585385 0.0858243 0.227395 1.30336
Comment= Y , F W , H ,>< C M L , N S V R I A T K , Q G E D P
Number= 15
Mixture= 0.0226822
Alpha= 3.08684 0.0634034 0.0246167 1.3443e-06 0.00389272 1.12953 0.00796028 1.35032e-06 0.233395 1.34466e-06 0.541933 0.101309 1.36412e-06 0.027467 0.00704479 0.00802297 0.0248977 0.0276933 0.185467 0.183309 0.516892
Comment= F , Y , W , L M I >< V , C A , P T S ,, Q R G , E ,,,,,,,,,, H , N K , D
Number= 16
Mixture= 0.00898452
Alpha= 2.51284 0.123696 0.0454619 0.0386434 0.351847 0.0560181 0.0439442 0.223229 0.01302 0.148699 0.19001 0.120964 0.098734 5.90055e-06 0.554971 0.219233 0.0453885 0.0564686 0.0614792 0.0410248 0.0800036
Comment= Q , H E M , R W K >< C N Y L A F , T V S D , G , I ,,,,,,,,,,, P
Number= 17
Mixture= 0.00716226
Alpha= 3.39257 0.0212037 3.18769 0.00745627 0.00382411 0.00691924 0.0126233 1.34375e-06 0.00724293 0.00522979 0.00785563 0.00489521 0.0105326 0.0136265 0.00505819 0.00677712 0.0251744 0.0235516 0.0371462 0.00187667 0.0038893
Comment= C ,,,,,><,, V T , S P A N M , G F Q R D W I Y , K L E ,,,,,,,,,, H
Number= 18
Mixture= 0.00710292
Alpha= 2.51689 0.0229376 0.00427768 0.00959934 0.013608 0.182277 0.0227654 0.0157344 0.0226783 0.011561 0.0803491 0.0154283 0.00899225 0.00980608 0.00600945 0.0342359 0.0216842 0.0189306 0.0223176 1.83914 0.154565
Comment= W ,,,,, F Y ><, L M R H , I S T , V G A C E P N K D Q
Number= 19
Mixture= 0.00582299
Alpha= 1.35874 2.16602e-06 2.16245e-06 0.0198496 2.17942e-06 0.0246741 2.47051e-06 1.02563 0.0131152 2.16539e-06 0.00637704 2.1414e-06 0.0839371 0.0168135 0.0438887 0.0252951 0.0235533 0.0130626 0.00797507 2.16433e-06 0.0545531
Comment= H ,,,, N Y >< Q , F R S P D , T I , V , L ,,,,,,,,, W C M ,, K E G A
EndClassName = DirichletReg
|
