File: align.test.ok

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>NM_004448   Homo sapiens v-erb-b2 erythroblastic leukemia viral oncogene homolog 2, neuro/glioblastoma derived oncogene homolog (avian) (ERBB2), transcript variant 1, mRNA. 4624 bp, mRNA, linear, PRI 20-DEC-2004
Paths (1):
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    cDNA direction: sense
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Alignments:
  Alignment for path 1:

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aa.c        34 R  A  A  A  R  P  F  P  R  G  P  L  L  R  R  A  P 

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               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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aa.c        51  G  P  H  P  S  Q  H  P  A  P  R  A  L  P  A  G  S

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aa.g        68   S  R  S  H  G  A  G  A  A  V  S  T  M  E  L  A  
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               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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aa.c        68   S  R  S  H  G  A  G  A  A  V  S  T  M  E  L  A  

           250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g        84 A  L  C  R  W  G  L  L  L  A  L  L  P  P  G  A  A 
        110031 GCCTTGTGCCGCTGGGGGCTCCTCCTCGCCCTCTTGCCCCCCGGAGCCGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           251 GCCTTGTGCCGCTGGGGGCTCCTCCTCGCCCTCTTGCCCCCCGGAGCCGC
aa.c        84 A  L  C  R  W  G  L  L  L  A  L  L  P  P  G  A  A 

           300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       101  S  T  Q  V           C  T  G  T  D  M  K  L  R  L
        110081 GAGCACCCAAGGTG...CAGTGTGCACCGGCACAGACATGAAGCTGCGGC
               |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
           301 GAGCACCCAAG  6678   TGTGCACCGGCACAGACATGAAGCTGCGGC
aa.c       101  S  T  Q  V           C  T  G  T  D  M  K  L  R  L

           350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       115   P  A  S  P  E  T  H  L  D  M  L  R  H  L  Y  Q  
        116800 TCCCTGCCAGTCCCGAGACCCACCTGGACATGCTCCGCCACCTCTACCAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           342 TCCCTGCCAGTCCCGAGACCCACCTGGACATGCTCCGCCACCTCTACCAG
aa.c       115   P  A  S  P  E  T  H  L  D  M  L  R  H  L  Y  Q  

           400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       131 G  C  Q  V  V  Q  G  N  L  E  L  T  Y  L  P  T  N 
        116850 GGCTGCCAGGTGGTGCAGGGAAACCTGGAACTCACCTACCTGCCCACCAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           392 GGCTGCCAGGTGGTGCAGGGAAACCTGGAACTCACCTACCTGCCCACCAA
aa.c       131 G  C  Q  V  V  Q  G  N  L  E  L  T  Y  L  P  T  N 

           450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       148  A  S  L  S  F  L  Q           D  I  Q  E  V  Q  G
        116900 TGCCAGCCTGTCCTTCCTGCAGGTG...CAGGATATCCAGGAGGTGCAGG
               ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
           442 TGCCAGCCTGTCCTTCCTGCAG  1179   GATATCCAGGAGGTGCAGG
aa.c       148  A  S  L  S  F  L  Q           D  I  Q  E  V  Q  G

           500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       162   Y  V  L  I  A  H  N  Q  V  R  Q  V  P  L  Q  R  
        118120 GCTACGTGCTCATCGCTCACAACCAAGTGAGGCAGGTCCCACTGCAGAGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           483 GCTACGTGCTCATCGCTCACAACCAAGTGAGGCAGGTCCCACTGCAGAGG
aa.c       162   Y  V  L  I  A  H  N  Q  V  R  Q  V  P  L  Q  R  

           550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       178 L  R  I  V  R  G  T  Q  L  F  E  D  N  Y  A  L  A 
        118170 CTGCGGATTGTGCGAGGCACCCAGCTCTTTGAGGACAACTATGCCCTGGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           533 CTGCGGATTGTGCGAGGCACCCAGCTCTTTGAGGACAACTATGCCCTGGC
aa.c       178 L  R  I  V  R  G  T  Q  L  F  E  D  N  Y  A  L  A 

           600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       195  V  L  D  N  G  D  P  L  N  N  T  T  P  V  T  G  A
        118220 CGTGCTAGACAATGGAGACCCGCTGAACAATACCACCCCTGTCACAGGGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           583 CGTGCTAGACAATGGAGACCCGCTGAACAATACCACCCCTGTCACAGGGG
aa.c       195  V  L  D  N  G  D  P  L  N  N  T  T  P  V  T  G  A

           650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       212   S  P  G  G  L  R  E  L  Q  L  R  S  L  T  E     
        118270 CCTCCCCAGGAGGCCTGCGGGAGCTGCAGCTTCGAAGCCTCACAGGTG..
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
           633 CCTCCCCAGGAGGCCTGCGGGAGCTGCAGCTTCGAAGCCTCACAG   78
aa.c       212   S  P  G  G  L  R  E  L  Q  L  R  S  L  T  E     

           700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       227       I  L  K  G  G  V  L  I  Q  R  N  P  Q  L  C 
        119095 .CAGAGATCTTGAAAGGAGGGGTCTTGATCCAGCGGAACCCCCAGCTCTG
               .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           678 3   AGATCTTGAAAGGAGGGGTCTTGATCCAGCGGAACCCCCAGCTCTG
aa.c       227       I  L  K  G  G  V  L  I  Q  R  N  P  Q  L  C 

           750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       242  Y  Q  D  T  I  L  W  K  D  I  F  H  K  N  N  Q  L
        119144 CTACCAGGACACGATTTTGTGGAAGGACATCTTCCACAAGAACAACCAGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           724 CTACCAGGACACGATTTTGTGGAAGGACATCTTCCACAAGAACAACCAGC
aa.c       242  Y  Q  D  T  I  L  W  K  D  I  F  H  K  N  N  Q  L

           800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       259   A  L  T  L  I  D  T  N  R  S  R  A  C           
        119194 TGGCTCTCACACTGATAGACACCAACCGCTCTCGGGCCTGTA...CAGGC
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
           774 TGGCTCTCACACTGATAGACACCAACCGCTCTCGGGCCT   360   GC
aa.c       259   A  L  T  L  I  D  T  N  R  S  R  A  C           

           850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       272 H  P  C  S  P  M  C  K  G  S  R  C  W  G  E  S  S 
        119595 CACCCCTGTTCTCCGATGTGTAAGGGCTCCCGCTGCTGGGGAGAGAGTTC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           815 CACCCCTGTTCTCCGATGTGTAAGGGCTCCCGCTGCTGGGGAGAGAGTTC
aa.c       272 H  P  C  S  P  M  C  K  G  S  R  C  W  G  E  S  S 

           900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       289  E  D  C  Q  S  L           T  R  T  V  C  A  G  G
        119645 TGAGGATTGTCAGAGCCGTG...CAGTGACGCGCACTGTCTGTGCCGGTG
               |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
           865 TGAGGATTGTCAGAGCC   204   TGACGCGCACTGTCTGTGCCGGTG
aa.c       289  E  D  C  Q  S  L           T  R  T  V  C  A  G  G

           950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       303   C  A  R  C  K  G  P  L  P  T  D  C  C  H  E  Q  
        119890 GCTGTGCCCGCTGCAAGGGGCCACTGCCCACTGACTGCTGCCATGAGCAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           906 GCTGTGCCCGCTGCAAGGGGCCACTGCCCACTGACTGCTGCCATGAGCAG
aa.c       303   C  A  R  C  K  G  P  L  P  T  D  C  C  H  E  Q  

          1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       319 C  A  A  G  C  T  G  P  K  H  S  D  C  L          
        119940 TGTGCTGCCGGCTGCACGGGCCCCAAGCACTCTGACTGCCTGGTA...CA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
           956 TGTGCTGCCGGCTGCACGGGCCCCAAGCACTCTGACTGCCTG   138  
aa.c       319 C  A  A  G  C  T  G  P  K  H  S  D  C  L          

          1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       333  A  C  L  H  F  N  H  S  G  I  C  E  L  H  C  P  A
        120119 GGCCTGCCTCCACTTCAACCACAGTGGCATCTGTGAGCTGCACTGCCCAG
               >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
           998  GCCTGCCTCCACTTCAACCACAGTGGCATCTGTGAGCTGCACTGCCCAG
aa.c       333  A  C  L  H  F  N  H  S  G  I  C  E  L  H  C  P  A

          1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       350   L  V  T  Y  N  T  D  T  F  E  S  M  P  N  P  E  
        120169 CCCTGGTCACCTACAACACAGACACGTTTGAGTCCATGCCCAATCCCGAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1047 CCCTGGTCACCTACAACACAGACACGTTTGAGTCCATGCCCAATCCCGAG
aa.c       350   L  V  T  Y  N  T  D  T  F  E  S  M  P  N  P  E  

          1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       366 G  R  Y  T  F  G  A  S  C  V  T  A  C  P  Y       
        120219 GGCCGGTATACATTCGGCGCCAGCTGTGTGACTGCCTGTCCCTGTG...T
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
          1097 GGCCGGTATACATTCGGCGCCAGCTGTGTGACTGCCTGTCCCT  1446 
aa.c       366 G  R  Y  T  F  G  A  S  C  V  T  A  C  P  Y       

          1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       381     N  Y  L  S  T  D  V  G  S  C  T  L  V  C  P  L
        121706 AGACAACTACCTTTCTACGGACGTGGGATCCTGCACCCTCGTCTGCCCCC
               >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1140   ACAACTACCTTTCTACGGACGTGGGATCCTGCACCCTCGTCTGCCCCC
aa.c       381     N  Y  L  S  T  D  V  G  S  C  T  L  V  C  P  L

          1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       397   H  N  Q  E  V  T  A  E  D  G  T  Q  R  C  E  K  
        121756 TGCACAACCAAGAGGTGACAGCAGAGGATGGAACACAGCGGTGTGAGAAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1188 TGCACAACCAAGAGGTGACAGCAGAGGATGGAACACAGCGGTGTGAGAAG
aa.c       397   H  N  Q  E  V  T  A  E  D  G  T  Q  R  C  E  K  

          1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       413 C  S  K  P  C  A  R  V           C  Y  G  L  G  M 
        121806 TGCAGCAAGCCCTGTGCCCGAGGTA...CAGTGTGCTATGGTCTGGGCAT
               ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
          1238 TGCAGCAAGCCCTGTGCCCGAG   274   TGTGCTATGGTCTGGGCAT
aa.c       413 C  S  K  P  C  A  R  V           C  Y  G  L  G  M 

          1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       427  E  H  L  R  E  V  R  A  V  T  S  A  N  I  Q  E  F
        122121 GGAGCACTTGCGAGAGGTGAGGGCAGTTACCAGTGCCAATATCCAGGAGT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1279 GGAGCACTTGCGAGAGGTGAGGGCAGTTACCAGTGCCAATATCCAGGAGT
aa.c       427  E  H  L  R  E  V  R  A  V  T  S  A  N  I  Q  E  F

          1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       444   A  G  C  K  K  I  F  G  S  L  A  F  L  P  E  S  
        122171 TTGCTGGCTGCAAGAAGATCTTTGGGAGCCTGGCATTTCTGCCGGAGAGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1329 TTGCTGGCTGCAAGAAGATCTTTGGGAGCCTGGCATTTCTGCCGGAGAGC
aa.c       444   A  G  C  K  K  I  F  G  S  L  A  F  L  P  E  S  

          1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       460 F  D  G           D  P  A  S  N  T  A  P  L  Q  P 
        122221 TTTGATGGGTA...CAGGGACCCAGCCTCCAACACTGCCCCGCTCCAGCC
               ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
          1379 TTTGATGG  2837   GGACCCAGCCTCCAACACTGCCCCGCTCCAGCC
aa.c       460 F  D  G           D  P  A  S  N  T  A  P  L  Q  P 

          1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       474  E  Q  L  Q  V  F  E  T  L  E  E  I  T  G         
        125099 AGAGCAGCTCCAAGTGTTTGAGACTCTGGAAGAGATCACAGGTG...CAG
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
          1420 AGAGCAGCTCCAAGTGTTTGAGACTCTGGAAGAGATCACAG   86    
aa.c       474  E  Q  L  Q  V  F  E  T  L  E  E  I  T  G         

          1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       488   Y  L  Y  I  S  A  W  P  D  S  L  P  D  L  S  V  
        125226 GTTACCTATACATCTCAGCATGGCCGGACAGCCTGCCTGACCTCAGCGTC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1461 GTTACCTATACATCTCAGCATGGCCGGACAGCCTGCCTGACCTCAGCGTC
aa.c       488   Y  L  Y  I  S  A  W  P  D  S  L  P  D  L  S  V  

          1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       504 F  Q  N  L  Q  V  I  R  G  R  I  L  H  N          
        125276 TTCCAGAACCTGCAAGTAATCCGGGGACGAATTCTGCACAAGTG...TAG
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
          1511 TTCCAGAACCTGCAAGTAATCCGGGGACGAATTCTGCACAA   203   
aa.c       504 F  Q  N  L  Q  V  I  R  G  R  I  L  H  N          

          1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       518  G  A  Y  S  L  T  L  Q  G  L  G  I  S  W  L  G  L
        125520 TGGCGCCTACTCGCTGACCCTGCAAGGGCTGGGCATCAGCTGGCTGGGGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1552 TGGCGCCTACTCGCTGACCCTGCAAGGGCTGGGCATCAGCTGGCTGGGGC
aa.c       518  G  A  Y  S  L  T  L  Q  G  L  G  I  S  W  L  G  L

          1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       535   R  S  L  R  E  L  G  S  G  L  A  L  I  H  H  N  
        125570 TGCGCTCACTGAGGGAACTGGGCAGTGGACTGGCCCTCATCCACCATAAC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1602 TGCGCTCACTGAGGGAACTGGGCAGTGGACTGGCCCTCATCCACCATAAC
aa.c       535   R  S  L  R  E  L  G  S  G  L  A  L  I  H  H  N  

          1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       551 T  H  L  C  F  V  H  T  V  P  W  D  Q  L  F  R  N 
        125620 ACCCACCTCTGCTTCGTGCACACGGTGCCCTGGGACCAGCTCTTTCGGAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1652 ACCCACCTCTGCTTCGTGCACACGGTGCCCTGGGACCAGCTCTTTCGGAA
aa.c       551 T  H  L  C  F  V  H  T  V  P  W  D  Q  L  F  R  N 

          1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       568  P  H  Q  A  L  L  H  T  A  N  R  P  E  D  E  C  V
        125670 CCCGCACCAAGCTCTGCTCCACACTGCCAACCGGCCAGAGGACGAGTGTG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1702 CCCGCACCAAGCTCTGCTCCACACTGCCAACCGGCCAGAGGACGAGTGTG
aa.c       568  P  H  Q  A  L  L  H  T  A  N  R  P  E  D  E  C  V

          1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       585            G  E  G  L  A  C  H  Q  L  C  A  R  G  
        125720 GTA...CAGTGGGCGAGGGCCTGGCCTGCCACCAGCTGTGCGCCCGAGGG
               >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1752    361   TGGGCGAGGGCCTGGCCTGCCACCAGCTGTGCGCCCGAGGG
aa.c       585            G  E  G  L  A  C  H  Q  L  C  A  R  G  

          1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       598 H  C  W  G  P  G  P  T  Q  C  V  N  C  S  Q  F  L 
        126122 CACTGCTGGGGTCCAGGGCCCACCCAGTGTGTCAACTGCAGCCAGTTCCT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1793 CACTGCTGGGGTCCAGGGCCCACCCAGTGTGTCAACTGCAGCCAGTTCCT
aa.c       598 H  C  W  G  P  G  P  T  Q  C  V  N  C  S  Q  F  L 

          1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       615  R  G  Q  E  C  V  E  E  C  R  V  L  Q  G         
        126172 TCGGGGCCAGGAGTGCGTGGAGGAATGCCGAGTACTGCAGGGGTA...CA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
          1843 TCGGGGCCAGGAGTGCGTGGAGGAATGCCGAGTACTGCAGGG   81   
aa.c       615  R  G  Q  E  C  V  E  E  C  R  V  L  Q  G         

          2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       629   L  P  R  E  Y  V  N  A  R  H  C  L  P  C  H  P  
        126294 GGCTCCCCAGGGAGTATGTGAATGCCAGGCACTGTTTGCCGTGCCACCCT
               >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1885  GCTCCCCAGGGAGTATGTGAATGCCAGGCACTGTTTGCCGTGCCACCCT
aa.c       629   L  P  R  E  Y  V  N  A  R  H  C  L  P  C  H  P  

          2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       645 E  C  Q  P  Q  N  G  S  V  T  C  F  G  P          
        126344 GAGTGTCAGCCCCAGAATGGCTCAGTGACCTGTTTTGGACCGGTG...CA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
          1934 GAGTGTCAGCCCCAGAATGGCTCAGTGACCTGTTTTGGACCG   714  
aa.c       645 E  C  Q  P  Q  N  G  S  V  T  C  F  G  P          

          2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       659  E  A  D  Q  C  V  A  C  A  H  Y  K  D  P  P  F  C
        127099 GGAGGCTGACCAGTGTGTGGCCTGTGCCCACTATAAGGACCCTCCCTTCT
               >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          1976  GAGGCTGACCAGTGTGTGGCCTGTGCCCACTATAAGGACCCTCCCTTCT
aa.c       659  E  A  D  Q  C  V  A  C  A  H  Y  K  D  P  P  F  C

          2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       676   V  A  R  C  P  S  G  V  K  P  D  L  S  Y  M  P  
        127149 GCGTGGCCCGCTGCCCCAGCGGTGTGAAACCTGACCTCTCCTACATGCCC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2025 GCGTGGCCCGCTGCCCCAGCGGTGTGAAACCTGACCTCTCCTACATGCCC
aa.c       676   V  A  R  C  P  S  G  V  K  P  D  L  S  Y  M  P  

          2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       692 I  W  K  F  P  D  E  E  G  A  C  Q  P  C  P  I  N 
        127199 ATCTGGAAGTTTCCAGATGAGGAGGGCGCATGCCAGCCTTGCCCCATCAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2075 ATCTGGAAGTTTCCAGATGAGGAGGGCGCATGCCAGCCTTGCCCCATCAA
aa.c       692 I  W  K  F  P  D  E  E  G  A  C  Q  P  C  P  I  N 

          2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       709  C  T  H  S           C  V  D  L  D  D  K  G  C  P
        127249 CTGCACCCACTCGTG...CAGCTGTGTGGACCTGGATGACAAGGGCTGCC
               ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
          2125 CTGCACCCACTC  2306   CTGTGTGGACCTGGATGACAAGGGCTGCC
aa.c       709  C  T  H  S           C  V  D  L  D  D  K  G  C  P

          2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       723   A  E  Q  R  A  S           P  L  T  S  I  I  S  
        129596 CCGCCGAGCAGAGAGCCAGGTT...CAGCCCTCTGACGTCCATCATCTCT
               |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
          2166 CCGCCGAGCAGAGAGCCAG  3484   CCCTCTGACGTCCATCATCTCT
aa.c       723   A  E  Q  R  A  S           P  L  T  S  I  I  S  

          2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       736 A  V  V  G  I  L  L  V  V  V  L  G  V  V  F  G  I 
        133121 GCGGTGGTTGGCATTCTGCTGGTCGTGGTCTTGGGGGTGGTCTTTGGGAT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2207 GCGGTGGTTGGCATTCTGCTGGTCGTGGTCTTGGGGGTGGTCTTTGGGAT
aa.c       736 A  V  V  G  I  L  L  V  V  V  L  G  V  V  F  G  I 

          2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       753  L  I  K  R  R  Q  Q  K  I  R  K  Y  T  M  R  R  L
        133171 CCTCATCAAGCGACGGCAGCAGAAGATCCGGAAGTACACGATGCGGAGAC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2257 CCTCATCAAGCGACGGCAGCAGAAGATCCGGAAGTACACGATGCGGAGAC
aa.c       753  L  I  K  R  R  Q  Q  K  I  R  K  Y  T  M  R  R  L

          2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       770   L  Q  E  T  E           L  V  E  P  L  T  P  S  
        133221 TGCTGCAGGAAACGGAGGTG...CAGCTGGTGGAGCCGCTGACACCTAGC
               |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
          2307 TGCTGCAGGAAACGGAG   80    CTGGTGGAGCCGCTGACACCTAGC
aa.c       770   L  Q  E  T  E           L  V  E  P  L  T  P  S  

          2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       783 G  A  M  P  N  Q  A  Q  M  R  I  L  K  E  T  E  L 
        133342 GGAGCGATGCCCAACCAGGCGCAGATGCGGATCCTGAAAGAGACGGAGCT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2348 GGAGCGATGCCCAACCAGGCGCAGATGCGGATCCTGAAAGAGACGGAGCT
aa.c       783 G  A  M  P  N  Q  A  Q  M  R  I  L  K  E  T  E  L 

          2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       800  R  K  V  K  V  L  G  S  G  A  F  G  T  V  Y  K   
        133392 GAGGAAGGTGAAGGTGCTTGGATCTGGCGCTTTTGGCACAGTCTACAAGG
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
          2398 GAGGAAGGTGAAGGTGCTTGGATCTGGCGCTTTTGGCACAGTCTACAAG 
aa.c       800  R  K  V  K  V  L  G  S  G  A  F  G  T  V  Y  K   

          2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       816         G  I  W  I  P  D  G  E  N  V  K  I  P  V  
        133442 TC...CAGGGCATCTGGATCCCTGATGGGGAGAATGTGAAAATTCCAGTG
               >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2447   251   GGCATCTGGATCCCTGATGGGGAGAATGTGAAAATTCCAGTG
aa.c       816         G  I  W  I  P  D  G  E  N  V  K  I  P  V  

          2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       830 A  I  K  V  L  R  E  N  T  S  P  K  A  N  K  E  I 
        133734 GCCATCAAAGTGTTGAGGGAAAACACATCCCCCAAAGCCAACAAAGAAAT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2489 GCCATCAAAGTGTTGAGGGAAAACACATCCCCCAAAGCCAACAAAGAAAT
aa.c       830 A  I  K  V  L  R  E  N  T  S  P  K  A  N  K  E  I 

          2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       847  L  D           E  A  Y  V  M  A  G  V  G  S  P  Y
        133784 CTTAGACGTA...CAGGAAGCATACGTGATGGCTGGTGTGGGCTCCCCAT
               |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2539 CTTAGAC   715   GAAGCATACGTGATGGCTGGTGTGGGCTCCCCAT
aa.c       847  L  D           E  A  Y  V  M  A  G  V  G  S  P  Y

          2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       861   V  S  R  L  L  G  I  C  L  T  S  T  V  Q  L  V  
        134540 ATGTCTCCCGCCTTCTGGGCATCTGCCTGACATCCACGGTGCAGCTGGTG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2580 ATGTCTCCCGCCTTCTGGGCATCTGCCTGACATCCACGGTGCAGCTGGTG
aa.c       861   V  S  R  L  L  G  I  C  L  T  S  T  V  Q  L  V  

          2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       877 T  Q  L  M  P  Y  G  C  L  L  D  H  V  R  E  N  R 
        134590 ACACAGCTTATGCCCTATGGCTGCCTCTTAGACCATGTCCGGGAAAACCG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2630 ACACAGCTTATGCCCTATGGCTGCCTCTTAGACCATGTCCGGGAAAACCG
aa.c       877 T  Q  L  M  P  Y  G  C  L  L  D  H  V  R  E  N  R 

          2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       894  G  R  L  G  S  Q  D  L  L  N  W  C  M  Q  I  A  K
        134640 CGGACGCCTGGGCTCCCAGGACCTGCTGAACTGGTGTATGCAGATTGCCA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2680 CGGACGCCTGGGCTCCCAGGACCTGCTGAACTGGTGTATGCAGATTGCCA
aa.c       894  G  R  L  G  S  Q  D  L  L  N  W  C  M  Q  I  A  K

          2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       911            G  M  S  Y  L  E  D  V  R  L  V  H  R  
        134690 AGGTA...CAGGGGATGAGCTACCTGGAGGATGTGCGGCTCGTACACAGG
               ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2730 AG   137   GGGATGAGCTACCTGGAGGATGTGCGGCTCGTACACAGG
aa.c       911            G  M  S  Y  L  E  D  V  R  L  V  H  R  

          2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       924 D  L  A  A  R  N  V  L  V  K  S  P  N  H  V  K  I 
        134868 GACTTGGCCGCTCGGAACGTGCTGGTCAAGAGTCCCAACCATGTCAAAAT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2771 GACTTGGCCGCTCGGAACGTGCTGGTCAAGAGTCCCAACCATGTCAAAAT
aa.c       924 D  L  A  A  R  N  V  L  V  K  S  P  N  H  V  K  I 

          3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       941  T  D  F  G  L  A  R  L  L  D  I  D  E  T  E  Y  H
        134918 TACAGACTTCGGGCTGGCTCGGCTGCTGGACATTGACGAGACAGAGTACC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2821 TACAGACTTCGGGCTGGCTCGGCTGCTGGACATTGACGAGACAGAGTACC
aa.c       941  T  D  F  G  L  A  R  L  L  D  I  D  E  T  E  Y  H

          3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       958   A  D  G  G  K           V  P  I  K  W  M  A  L  
        134968 ATGCAGATGGGGGCAAGGTT...CAGGTGCCCATCAAGTGGATGGCGCTG
               |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
          2871 ATGCAGATGGGGGCAAG   122   GTGCCCATCAAGTGGATGGCGCTG
aa.c       958   A  D  G  G  K           V  P  I  K  W  M  A  L  

          3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       971 E  S  I  L  R  R  R  F  T  H  Q  S  D  V  W  S  Y 
        135131 GAGTCCATTCTCCGCCGGCGGTTCACCCACCAGAGTGATGTGTGGAGTTA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2912 GAGTCCATTCTCCGCCGGCGGTTCACCCACCAGAGTGATGTGTGGAGTTA
aa.c       971 E  S  I  L  R  R  R  F  T  H  Q  S  D  V  W  S  Y 

          3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g       988  G           V  T  V  W  E  L  M  T  F  G  A  K  P
        135181 TGGTG...TAGGTGTGACTGTGTGGGAGCTGATGACTTTTGGGGCCAAAC
               ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          2962 TG   304   GTGTGACTGTGTGGGAGCTGATGACTTTTGGGGCCAAAC
aa.c       988  G           V  T  V  W  E  L  M  T  F  G  A  K  P

          3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1002   Y  D  G  I  P  A  R  E  I  P  D  L  L  E  K  G  
        135526 CTTACGATGGGATCCCAGCCCGGGAGATCCCTGACCTGCTGGAAAAGGGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3003 CTTACGATGGGATCCCAGCCCGGGAGATCCCTGACCTGCTGGAAAAGGGG
aa.c      1002   Y  D  G  I  P  A  R  E  I  P  D  L  L  E  K  G  

          3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1018 E  R  L  P  Q  P  P  I  C  T  I  D  V  Y  M  I  M 
        135576 GAGCGGCTGCCCCAGCCCCCCATCTGCACCATTGATGTCTACATGATCAT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3053 GAGCGGCTGCCCCAGCCCCCCATCTGCACCATTGATGTCTACATGATCAT
aa.c      1018 E  R  L  P  Q  P  P  I  C  T  I  D  V  Y  M  I  M 

          3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1035  V  K  C           W  M  I  D  S  E  C  R  P  R  F
        135626 GGTCAAATGTG...CAGGTTGGATGATTGACTCTGAATGTCGGCCAAGAT
               ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
          3103 GGTCAAAT   708   GTTGGATGATTGACTCTGAATGTCGGCCAAGAT
aa.c      1035  V  K  C           W  M  I  D  S  E  C  R  P  R  F

          3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1049   R  E  L  V  S  E  F  S  R  M  A  R  D  P  Q  R  
        136375 TCCGGGAGTTGGTGTCTGAATTCTCCCGCATGGCCAGGGACCCCCAGCGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3144 TCCGGGAGTTGGTGTCTGAATTCTCCCGCATGGCCAGGGACCCCCAGCGC
aa.c      1049   R  E  L  V  S  E  F  S  R  M  A  R  D  P  Q  R  

          3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1065 F  V  V  I  Q           N  E  D  L  G  P  A  S  P 
        136425 TTTGTGGTCATCCAGGTA...CAGAATGAGGACTTGGGCCCAGCCAGTCC
               |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
          3194 TTTGTGGTCATCCAG   155   AATGAGGACTTGGGCCCAGCCAGTCC
aa.c      1065 F  V  V  I  Q           N  E  D  L  G  P  A  S  P 

          3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1079  L  D  S  T  F  Y  R  S  L  L  E  D  D  D  M  G  D
        136621 CTTGGACAGCACCTTCTACCGCTCACTGCTGGAGGACGATGACATGGGGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3235 CTTGGACAGCACCTTCTACCGCTCACTGCTGGAGGACGATGACATGGGGG
aa.c      1079  L  D  S  T  F  Y  R  S  L  L  E  D  D  D  M  G  D

          3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1096   L  V  D  A  E  E  Y  L  V  P  Q  Q  G  F  F  C  
        136671 ACCTGGTGGATGCTGAGGAGTATCTGGTACCCCAGCAGGGCTTCTTCTGT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3285 ACCTGGTGGATGCTGAGGAGTATCTGGTACCCCAGCAGGGCTTCTTCTGT
aa.c      1096   L  V  D  A  E  E  Y  L  V  P  Q  Q  G  F  F  C  

          3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1112 P  D  P  A  P  G  A  G  G  M  V  H  H  R  H  R  S 
        136721 CCAGACCCTGCCCCGGGCGCTGGGGGCATGGTCCACCACAGGCACCGCAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3335 CCAGACCCTGCCCCGGGCGCTGGGGGCATGGTCCACCACAGGCACCGCAG
aa.c      1112 P  D  P  A  P  G  A  G  G  M  V  H  H  R  H  R  S 

          3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1129  S  S  T  R           S  G  G  G  D  L  T  L  G  L
        136771 CTCATCTACCAGGGTC...CAGAGTGGCGGTGGGGACCTGACACTAGGGC
               |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
          3385 CTCATCTACCAGG   291   AGTGGCGGTGGGGACCTGACACTAGGGC
aa.c      1129  S  S  T  R           S  G  G  G  D  L  T  L  G  L

          3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1143   E  P  S  E  E  E  A  P  R  S  P  L  A  P  S  E  
        137103 TGGAGCCCTCTGAAGAGGAGGCCCCCAGGTCTCCACTGGCACCCTCCGAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3426 TGGAGCCCTCTGAAGAGGAGGCCCCCAGGTCTCCACTGGCACCCTCCGAA
aa.c      1143   E  P  S  E  E  E  A  P  R  S  P  L  A  P  S  E  

          3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1159 G  A  G  S  D  V  F  D  G  D  L  G  M  G  A  A  K 
        137153 GGGGCTGGCTCCGATGTATTTGATGGTGACCTGGGAATGGGGGCAGCCAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3476 GGGGCTGGCTCCGATGTATTTGATGGTGACCTGGGAATGGGGGCAGCCAA
aa.c      1159 G  A  G  S  D  V  F  D  G  D  L  G  M  G  A  A  K 

          3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1176  G  L  Q  S  L  P  T  H  D  P  S  P  L  Q  R  Y  S
        137203 GGGGCTGCAAAGCCTCCCCACACATGACCCCAGCCCTCTACAGCGGTACA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3526 GGGGCTGCAAAGCCTCCCCACACATGACCCCAGCCCTCTACAGCGGTACA
aa.c      1176  G  L  Q  S  L  P  T  H  D  P  S  P  L  Q  R  Y  S

          3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1193   E  D  P  T  V  P  L  P  S  E  T  D  G  Y  V  A  
        137253 GTGAGGACCCCACAGTACCCCTGCCCTCTGAGACTGATGGCTACGTTGCC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3576 GTGAGGACCCCACAGTACCCCTGCCCTCTGAGACTGATGGCTACGTTGCC
aa.c      1193   E  D  P  T  V  P  L  P  S  E  T  D  G  Y  V  A  

          3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1209 P  L  T  C  S  P  Q  P  E           Y  V  N  Q  P 
        137303 CCCCTGACCTGCAGCCCCCAGCCTGGTA...CAGAATATGTGAACCAGCC
               |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
          3626 CCCCTGACCTGCAGCCCCCAGCCTG   141   AATATGTGAACCAGCC
aa.c      1209 P  L  T  C  S  P  Q  P  E           Y  V  N  Q  P 

          3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1223  D  V  R  P  Q  P  P  S  P  R  E  G  P  L  P  A  A
        137485 AGATGTTCGGCCCCAGCCCCCTTCGCCCCGAGAGGGCCCTCTGCCTGCTG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3667 AGATGTTCGGCCCCAGCCCCCTTCGCCCCGAGAGGGCCCTCTGCCTGCTG
aa.c      1223  D  V  R  P  Q  P  P  S  P  R  E  G  P  L  P  A  A

          3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1240   R  P  A  G  A  T  L  E  R  P  K  T  L  S  P  G  
        137535 CCCGACCTGCTGGTGCCACTCTGGAAAGGCCCAAGACTCTCTCCCCAGGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3717 CCCGACCTGCTGGTGCCACTCTGGAAAGGCCCAAGACTCTCTCCCCAGGG
aa.c      1240   R  P  A  G  A  T  L  E  R  P  K  T  L  S  P  G  

          4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1256 K  N  G  V  V  K  D  V  F  A  F  G  G  A  V  E  N 
        137585 AAGAATGGGGTCGTCAAAGACGTTTTTGCCTTTGGGGGTGCCGTGGAGAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3767 AAGAATGGGGTCGTCAAAGACGTTTTTGCCTTTGGGGGTGCCGTGGAGAA
aa.c      1256 K  N  G  V  V  K  D  V  F  A  F  G  G  A  V  E  N 

          4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1273  P  E  Y  L  T  P  Q  G  G  A  A  P  Q  P  H  P  P
        137635 CCCCGAGTACTTGACACCCCAGGGAGGAGCTGCCCCTCAGCCCCACCCTC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3817 CCCCGAGTACTTGACACCCCAGGGAGGAGCTGCCCCTCAGCCCCACCCTC
aa.c      1273  P  E  Y  L  T  P  Q  G  G  A  A  P  Q  P  H  P  P

          4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1290   P  A  F  S  P  A  F  D  N  L  Y  Y  W  D  Q  D  
        137685 CTCCTGCCTTCAGCCCAGCCTTCGACAACCTCTATTACTGGGACCAGGAC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3867 CTCCTGCCTTCAGCCCAGCCTTCGACAACCTCTATTACTGGGACCAGGAC
aa.c      1290   P  A  F  S  P  A  F  D  N  L  Y  Y  W  D  Q  D  

          4150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1306 P  P  E  R  G  A  P  P  S  T  F  K  G  T  P  T  A 
        137735 CCACCAGAGCGGGGGGCTCCACCCAGCACCTTCAAAGGGACACCTACGGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3917 CCACCAGAGCGGGGGGCTCCACCCAGCACCTTCAAAGGGACACCTACGGC
aa.c      1306 P  P  E  R  G  A  P  P  S  T  F  K  G  T  P  T  A 

          4200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
aa.g      1323  E  N  P  E  Y  L  G  L  D  V  P  V  *            
        137785 AGAGAACCCAGAGTACCTGGGTCTGGACGTGCCAGTGTGAACCAGAAGGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          3967 AGAGAACCCAGAGTACCTGGGTCTGGACGTGCCAGTGTGAACCAGAAGGC
aa.c      1323  E  N  P  E  Y  L  G  L  D  V  P  V  *            

          4250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        137835 CAAGTCCGCAGAAGCCCTGATGTGTCCTCAGGGAGCAGGGAAGGCCTGAC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4017 CAAGTCCGCAGAAGCCCTGATGTGTCCTCAGGGAGCAGGGAAGGCCTGAC
                                                                 

          4300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        137885 TTCTGCTGGCATCAAGAGGTGGGAGGGCCCTCCGACCACTTCCAGGGGAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4067 TTCTGCTGGCATCAAGAGGTGGGAGGGCCCTCCGACCACTTCCAGGGGAA
                                                                 

          4350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        137935 CCTGCCATGCCAGGAACCTGTCCTAAGGAACCTTCCTTCCTGCTTGAGTT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4117 CCTGCCATGCCAGGAACCTGTCCTAAGGAACCTTCCTTCCTGCTTGAGTT
                                                                 

          4400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        137985 CCCAGATGGCTGGAAGGGGTCCAGCCTCGTTGGAAGAGGAACAGCACTGG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4167 CCCAGATGGCTGGAAGGGGTCCAGCCTCGTTGGAAGAGGAACAGCACTGG
                                                                 

          4450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138035 GGAGTCTTTGTGGATTCTGAGGCCCTGCCCAATGAGACTCTAGGGTCCAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4217 GGAGTCTTTGTGGATTCTGAGGCCCTGCCCAATGAGACTCTAGGGTCCAG
                                                                 

          4500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138085 TGGATGCCACAGCCCAGCTTGGCCCTTTCCTTCCAGATCCTGGGTACTGA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4267 TGGATGCCACAGCCCAGCTTGGCCCTTTCCTTCCAGATCCTGGGTACTGA
                                                                 

          4550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138135 AAGCCTTAGGGAAGCTGGCCTGAGAGGGGAAGCGGCCCTAAGGGAGTGTC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4317 AAGCCTTAGGGAAGCTGGCCTGAGAGGGGAAGCGGCCCTAAGGGAGTGTC
                                                                 

          4600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138185 TAAGAACAAAAGCGACCCATTCAGAGACTGTCCCTGAAACCTAGTACTGC
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4367 TAAGAACAAAAGCGACCCATTCAGAGACTGTCCCTGAAACCTAGTACTGC
                                                                 

          4650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138235 CCCCCATGAGGAAGGAACAGCAATGGTGTCAGTATCCAGGCTTTGTACAG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4417 CCCCCATGAGGAAGGAACAGCAATGGTGTCAGTATCCAGGCTTTGTACAG
                                                                 

          4700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138285 AGTGCTTTTCTGTTTAGTTTTTACTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTAAAGAT
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4467 AGTGCTTTTCTGTTTAGTTTTTACTTTTTTTGTTTTGTTTTTTTAAAGAT
                                                                 

          4750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138335 GAAATAAAGACCCAGGGGGAGAATGGGTGTTGTATGGGGAGGCAAGTGTG
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4517 GAAATAAAGACCCAGGGGGAGAATGGGTGTTGTATGGGGAGGCAAGTGTG
                                                                 

          4800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
                                                                 
        138385 GGGGGTCCTTCTCCACACCCACTTTGTCCATTTGCAAATATATTTTGGAA
               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
          4567 GGGGGTCCTTCTCCACACCCACTTTGTCCATTTGCAAATATATTTTGGAA
                                                                 

          4850     .   
                       
        138435 AACAGCTA
               ||||||||
          4617 AACAGCTA