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// Copyright ©2017 The Gonum Authors. All rights reserved.
// Use of this source code is governed by a BSD-style
// license that can be found in the LICENSE file.
package mat_test
import (
"fmt"
"log"
"gonum.org/v1/gonum/mat"
)
func ExampleHOGSVD() {
// Perform an HOGSVD factorization on food production/consumption data for the
// three years 1990, 2000 and 2014.
//
// See Ponnapalli et al. doi:10.1371/journal.pone.0028072 and
// Alter at al. doi:10.1073/pnas.0530258100 for more details.
var gsvd mat.HOGSVD
ok := gsvd.Factorize(FAO.Africa, FAO.Asia, FAO.LatinAmericaCaribbean, FAO.Oceania)
if !ok {
log.Fatalf("HOGSVD factorization failed: %v", gsvd.Err())
}
for i, n := range []string{"Africa", "Asia", "Latin America/Caribbean", "Oceania"} {
var u mat.Dense
gsvd.UTo(&u, i)
s := gsvd.Values(nil, i)
fmt.Printf("%s\n\ts_%d = %.4f\n\n\tU_%[2]d = %.4[4]f\n",
n, i, s, mat.Formatted(&u, mat.Prefix("\t ")))
}
var v mat.Dense
gsvd.VTo(&v)
fmt.Printf("\nCommon basis vectors\n\n\tVᵀ = %.4f",
mat.Formatted(v.T(), mat.Prefix("\t ")))
// Output:
//
// Africa
// s_0 = [45507.3278 18541.9293 21503.0778]
//
// U_0 = ⎡-0.0005 -0.0039 -0.0019⎤
// ⎢-0.0010 -0.0007 -0.0012⎥
// ⎢-1.0000 -0.0507 -0.9964⎥
// ⎢-0.0022 -0.2906 -0.0415⎥
// ⎢ 0.0001 -0.0127 -0.0016⎥
// ⎢ 0.0003 -0.0067 -0.0010⎥
// ⎢ 0.0003 -0.0022 -0.0003⎥
// ⎢-0.0086 -0.9550 0.0734⎥
// ⎢ 0.0017 0.0002 0.0059⎥
// ⎢-0.0002 -0.0088 -0.0014⎥
// ⎢-0.0006 -0.0078 -0.0001⎥
// ⎢-0.0005 -0.0076 0.0003⎥
// ⎢ 0.0001 -0.0090 0.0008⎥
// ⎢-0.0005 -0.0050 0.0029⎥
// ⎢-0.0011 -0.0078 -0.0012⎥
// ⎢-0.0014 -0.0058 -0.0002⎥
// ⎢ 0.0007 -0.0095 0.0020⎥
// ⎢-0.0008 -0.0081 -0.0009⎥
// ⎢ 0.0004 -0.0092 0.0006⎥
// ⎢-0.0007 -0.0079 -0.0006⎥
// ⎣-0.0011 -0.0076 -0.0010⎦
// Asia
// s_1 = [77228.2804 8413.7024 14711.1879]
//
// U_1 = ⎡ 0.0005 -0.0080 0.0011⎤
// ⎢ 0.0008 -0.0108 0.0016⎥
// ⎢-0.9998 0.0612 0.9949⎥
// ⎢ 0.0007 -0.5734 -0.0468⎥
// ⎢ 0.0001 -0.0265 -0.0022⎥
// ⎢ 0.0001 -0.0165 -0.0019⎥
// ⎢ 0.0000 -0.0070 -0.0013⎥
// ⎢ 0.0196 -0.8148 0.0893⎥
// ⎢ 0.0002 -0.0063 0.0012⎥
// ⎢-0.0001 -0.0135 -0.0013⎥
// ⎢-0.0004 -0.0135 0.0019⎥
// ⎢-0.0005 -0.0132 0.0014⎥
// ⎢ 0.0003 -0.0155 0.0045⎥
// ⎢-0.0003 -0.0130 0.0025⎥
// ⎢-0.0007 -0.0105 0.0016⎥
// ⎢-0.0006 -0.0129 0.0007⎥
// ⎢-0.0006 -0.0178 -0.0023⎥
// ⎢-0.0003 -0.0149 0.0016⎥
// ⎢-0.0001 -0.0134 0.0030⎥
// ⎢-0.0004 -0.0154 0.0010⎥
// ⎣-0.0009 -0.0147 -0.0019⎦
// Latin America/Caribbean
// s_2 = [274.1364 20736.3116 729.6947]
//
// U_2 = ⎡ 0.1060 -0.0021 0.0174⎤
// ⎢ 0.1415 -0.0016 0.0289⎥
// ⎢ 0.2350 -0.2669 -0.9212⎥
// ⎢ 0.0290 -0.0118 -0.0429⎥
// ⎢ 0.0226 -0.0043 -0.0213⎥
// ⎢ 0.0117 -0.0016 -0.0197⎥
// ⎢-0.6263 -0.9635 0.2234⎥
// ⎢ 0.2334 -0.0013 0.1275⎥
// ⎢-0.0358 -0.0085 -0.0498⎥
// ⎢-0.1238 -0.0054 0.0313⎥
// ⎢-0.0421 -0.0059 0.0528⎥
// ⎢-0.1471 -0.0056 0.0350⎥
// ⎢-0.2158 -0.0052 -0.0044⎥
// ⎣-0.6154 -0.0078 -0.2717⎦
// Oceania
// s_3 = [8954.1914 6942.6316 17233.0561]
//
// U_3 = ⎡-0.0080 -0.0012 -0.0040⎤
// ⎢ 0.0004 -0.0014 0.0001⎥
// ⎢ 0.9973 -0.0315 0.9991⎥
// ⎢ 0.0473 -0.7426 -0.0359⎥
// ⎢ 0.0018 -0.0342 -0.0020⎥
// ⎢-0.0005 -0.0148 -0.0016⎥
// ⎢-0.0004 -0.0047 -0.0007⎥
// ⎢-0.0246 -0.6642 -0.0138⎥
// ⎢ 0.0003 -0.0287 -0.0023⎥
// ⎢-0.0011 -0.0148 -0.0014⎥
// ⎢-0.0108 -0.0198 -0.0039⎥
// ⎢-0.0149 -0.0183 -0.0048⎥
// ⎢-0.0178 -0.0208 -0.0075⎥
// ⎢-0.0266 -0.0063 -0.0016⎥
// ⎢-0.0012 -0.0234 -0.0006⎥
// ⎢-0.0084 -0.0184 -0.0030⎥
// ⎢-0.0232 -0.0191 -0.0124⎥
// ⎢-0.0072 -0.0226 -0.0035⎥
// ⎢-0.0150 -0.0144 -0.0045⎥
// ⎢-0.0068 -0.0227 -0.0034⎥
// ⎣-0.0127 -0.0136 -0.0049⎦
//
// Common basis vectors
//
// Vᵀ = ⎡-0.0897 -0.4460 -0.8905⎤
// ⎢-0.4911 -0.5432 -0.6810⎥
// ⎣ 0.0644 0.2841 0.9566⎦
}
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