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htslib 1.21%2Bds-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: trixie
  • size: 10,940 kB
  • sloc: ansic: 68,108; sh: 3,580; perl: 2,021; makefile: 887; cpp: 40

Folder: samples

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 74,975 DEMO.md
- - rw-r--r-- 3,457 Makefile
- - rw-r--r-- 4,036 add_header.c
- - rw-r--r-- 6,655 cram.c
- - rw-r--r-- 6,742 dump_aux.c
- - rw-r--r-- 3,466 flags_demo.c
- - rw-r--r-- 3,683 flags_htsopt_field.c
- - rw-r--r-- 2,377 index_fasta.c
- - rw-r--r-- 4,496 index_multireg_read.c
- - rw-r--r-- 4,383 index_reg_read.c
- - rw-r--r-- 5,326 index_write.c
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- - rw-r--r-- 4,214 mod_aux_ba.c
- - rw-r--r-- 8,097 mod_bam.c
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- - rw-r--r-- 14,317 qtask_ordered.c
- - rw-r--r-- 10,229 qtask_unordered.c
- - rw-r--r-- 7,311 read_aux.c
- - rw-r--r-- 5,356 read_bam.c
- - rw-r--r-- 3,714 read_fast.c
- - rw-r--r-- 5,804 read_fast_index.c
- - rw-r--r-- 5,129 read_header.c
- - rw-r--r-- 3,844 read_refname.c
- - rw-r--r-- 4,219 rem_header.c
- - rw-r--r-- 34 sample.bed
- - rw-r--r-- 106 sample.ref.fa
- - rw-r--r-- 432 sample.ref.fq
- - rw-r--r-- 1,276 sample.sam
- - rw-r--r-- 4,762 split.c
- - rw-r--r-- 5,134 split2.c
- - rw-r--r-- 5,171 split_thread1.c
- - rw-r--r-- 5,371 split_thread2.c
- - rw-r--r-- 4,011 update_header.c
- - rw-r--r-- 4,003 write_fast.c