File: 3.seq

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hyphy 2.2.7%2Bdfsg-1
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a          ATGATTCAACCTCAGACCCTTTTAAATGTAGCAGATAACAGTGGAGCTCG
           AAAATTGATGTGTATTCGAGTCATAGGAGCTGCTAGTAATCAGCGATATG
           CTCGTATTGGTGATGTTATTGTTGCTGTAATCAAAGACGCAGTGCCCCAA
           ATGCCTCTAGAAAGATCCGAAGTAATTCGAGCTGTAATTGTACGTACATG
           TAAAGAGTTCAAATGCGAAGACGGTATAATAATACGCTATGACGACAATG
           CAGCGGTTATCATTGATCAAAAAGGA---AATCCAAAAGGAACTCGCGTT
           TTTGGCGCGATCGCCGAGGAATTGAGAGAATTGAATTTTACTAAAATAGT
           TTCATTAGCTCCTGAAGTATTATAA

b          ATGATTCAACCTCAGACCCATTTAAATGTAGCGGATAACAGCGGGGCTCG
           AGAATTGATGTGTATTCGAATCATAGGAGCT---AGCAATCGTCGATATG
           CTCATATTGGTGACGTTATTGTTGCTGTGATCAAAGAAGCCGTACCAAAT
           ATGCCCCTAGAAAGATCAGAAGTAGTCAGAGCTGTAATTGTGCGGACCTG
           TAAAGAACTCAAACGTGACAACGGGATGATAATACGATATGATGACAATG
           CTGCAGTTGTTATTGATCAAGAAGGAAGGAAATCAAAAGGAACTCGAATT
           TTTGGTGCAATCGCCCGGGAATTGAGAGAATTAAATTTTACTAAAATAGT
           TTCATTAGCTCCCGAGGTATTATAA

og         ATGATTCAACCTCAAACTTATTTAAATGTTGCAGATAATAGTGGAGCTCG
           AAAACTAATGTGCATTCGAGTTATAGGAACG---AGTAATCGAAAATATG
           CAAATATTGGTGATATTATTATTGCTGTTGTTAAAGAAGCAGTGCCAAAT
           ATGCCTATTAAAAAATCCGAAATTGTAAGAGCTGTAATTGTACGTACGTG
           TAAAGAATTTAAACGAAATAATGGATCCATAATAAAATTTGATGATAATG
           CAGCAGTTGTTATTAATCAAGAAGGA---AATCCAAAAGGAACTCGAGTT
           TTTGGTCCAATTGCTAGAGAATTAAGAGAATCTAATTTTACTAAAATAGT
           TTCGTTAGCTCCAGAAGTTTTATAA


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((a,b),og);