package info (click to toggle)
infernal 1.1.4-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: bookworm, bullseye
  • size: 69,944 kB
  • sloc: ansic: 219,655; perl: 14,057; sh: 6,136; makefile: 2,909; python: 1,144

Folder: src

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 4,096 impl_sse
- - rw-r--r-- 6,869 Makefile.in
- - rw-r--r-- 3,577 Rfam.12.1.claninfo
- - rw-r--r-- 16,295 alphabet.c
- - rw-r--r-- 5,659 bandcyk-montecarlo-test.c
- - rw-r--r-- 7,287 bandcyk-truncation-test.c
- - rw-r--r-- 177,138 cm.c
- - rw-r--r-- 63,883 cm_alidisplay.c
- - rw-r--r-- 23,706 cm_alndata.c
- - rw-r--r-- 2,287 cm_dispatch.h
- - rw-r--r-- 263,577 cm_dpalign.c
- - rw-r--r-- 496,730 cm_dpalign_trunc.c
- - rw-r--r-- 194,470 cm_dpsearch.c
- - rw-r--r-- 178,816 cm_dpsearch_trunc.c
- - rw-r--r-- 261,193 cm_dpsmall.c
- - rw-r--r-- 199,516 cm_file.c
- - rw-r--r-- 35,184 cm_modelconfig.c
- - rw-r--r-- 83,313 cm_modelmaker.c
- - rw-r--r-- 295,141 cm_mx.c
- - rw-r--r-- 102,841 cm_p7_band.c
- - rw-r--r-- 24,451 cm_p7_domaindef.c
- - rw-r--r-- 5,347 cm_p7_modelconfig_trunc.c
- - rw-r--r-- 21,541 cm_p7_modelmaker.c
- - rw-r--r-- 192,714 cm_parsetree.c
- - rw-r--r-- 231,143 cm_pipeline.c
- - rw-r--r-- 40,085 cm_qdband.c
- - rw-r--r-- 178,148 cm_submodel.c
- - rw-r--r-- 159,516 cm_tophits.c
- - rw-r--r-- 35,688 cm_trunc.c
- - rw-r--r-- 123,422 cmalign.c
- - rw-r--r-- 159,826 cmbuild.c
- - rw-r--r-- 101,141 cmcalibrate.c
- - rw-r--r-- 7,897 cmconvert.c
- - rw-r--r-- 33,465 cmemit.c
- - rw-r--r-- 12,397 cmfetch.c
- - rw-r--r-- 11,130 cmpress.c
- - rw-r--r-- 177,330 cmscan.c
- - rw-r--r-- 171,887 cmsearch.c
- - rw-r--r-- 33,017 cmsim.c
- - rw-r--r-- 20,691 cmstat.c
- - rw-r--r-- 2,372 config.h.in
- - rw-r--r-- 5,069 cp9-test.c
- - rw-r--r-- 18,962 cp9.c
- - rw-r--r-- 81,270 cp9_dp.c
- - rw-r--r-- 107,784 cp9_modelmaker.c
- - rw-r--r-- 8,806 cp9_mx.c
- - rw-r--r-- 50,348 cp9_trace.c
- - rw-r--r-- 7,776 default.prior
- - rw-r--r-- 48,073 display.c
- - rw-r--r-- 1,617 errors.c
- - rw-r--r-- 23,689 eweight.c
- - rw-r--r-- 250,461 hmmband.c
- - rw-r--r-- 5,404 hmmband.h
- - rw-r--r-- 206,368 infernal.h
- - rw-r--r-- 69,195 itest_brute.c
- - rw-r--r-- 8,188 logsum.c
- - rw-r--r-- 115,954 mpisupport.c
- - rw-r--r-- 4,477 nearzero.prior
- - rw-r--r-- 2,761 plus1.prior
- - rw-r--r-- 79,596 prior.c
- - rw-r--r-- 1,266 prior.h
- - rw-r--r-- 604 rna.null
- - rw-r--r-- 36,254 rnamat.c
- - rw-r--r-- 3,553 rnamat.h
- - rw-r--r-- 2,553 sa-Makefile.in
- - rw-r--r-- 22,076 stats.c
- - rw-r--r-- 1,929 stats.h
- - rw-r--r-- 15,496 sub_cm-test.c
- - rw-r--r-- 3,434 trcyk.c
- - rw-r--r-- 152,204 truncyk.c
- - rw-r--r-- 8,690 truncyk_check.c
- - rw-r--r-- 8,858 v056-to-v102-default.prior