File: 4.8.md

package info (click to toggle)
insighttoolkit5 5.4.4-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 704,404 kB
  • sloc: cpp: 783,697; ansic: 628,724; xml: 44,704; fortran: 34,250; python: 22,874; sh: 4,078; pascal: 2,636; lisp: 2,158; makefile: 461; yacc: 328; asm: 205; perl: 203; lex: 146; tcl: 132; javascript: 98; csh: 81
file content (768 lines) | stat: -rw-r--r-- 40,568 bytes parent folder | download | duplicates (2)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
ITK Release 4.8
===============

New Features

------------------------------------------------------------------------

-   Wrapping improvements

`- Wrapping now uses CastXML instead of GCCXML`\
`- The latest GCC, Clang, and MSVC are fully supported`\
` - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/888`](https://kitware.com/blog/home/post/888)\
`- Cross-compilation and packaging support`\
` - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/904`](https://kitware.com/blog/home/post/904)\
`- ITK_WRAP_VECTOR_COMPONENTS option to specify number of wrapped vector components`\
`- More classes wrapped`

-   Compiler Support

`- GCC 5.1`\
`- Clang 3.6.0`\
`- Better cross-compilation support (requires CMake 3.3)`\
`- Experimental support for Emscripten (JavaScript)`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/912`](https://kitware.com/blog/home/post/912)\
`- Experimental support for the Raspberry Pi`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/887`](https://kitware.com/blog/home/post/887)\
`- Experimental support for Android`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/893`](https://kitware.com/blog/home/post/893)\
`- Experimental support for MXE/MinGW-w64`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/883`](https://kitware.com/blog/home/post/883)\
`- Experimental support for the POWER8`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/891`](https://kitware.com/blog/home/post/891)

-   New Remote Modules

`- MinimalPathExtraction`\
`  - Insight Journal Article: `[`https://hdl.handle.net/1926/1332`](https://hdl.handle.net/1926/1332)\
`- BridgeNumPy`\
`  - Convert itk.Image to NumPy array’s and back`\
`- LabelErodeDilate`\
`  - Insight Journal Article: `[`https://hdl.handle.net/10380/3399`](https://hdl.handle.net/10380/3399)\
`- ParabolicMorphology`\
`  - Insight Journal Article: `[`https://hdl.handle.net/1926/1370`](https://hdl.handle.net/1926/1370)

-   Infrastructure Improvements

`- An UpdateThirdPartyFromUpstream.sh script for 3rd party updates with Git subtree`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/899`](https://kitware.com/blog/home/post/899)\
`- Minimum required CMake version is now 2.8.9 `\
`- Many more modules can be built as shared libraries`\
`- ITK_USE_SYSTEM_LIBRARIES variable during initial configuration to turn on use of common system third party libraries by default`\
`- Release testing data tarball split from source tarball`\
`- Gold linker used by default on Linux`

-   Filtering Improvements

`- itk::FFTPadImageFilter to automatically pad images for the FFT implementation’s supported greatest prime factor`\
`- itk::AtomicInt class for parallel computation`\
`- Various performance enhancements`

-   Registration Improvements

`- Point set SyN registration`\
`- Point set BSpline SyN registration`

-   Documentation Improvements

`- The ITK Software Guide is now available in HTML`\
`  - Details: `[`https://kitware.com/blog/home/post/890`](https://kitware.com/blog/home/post/890)\
`- Updates to the Software Guide, Doxygen, Wiki and Sphinx Examples`

-   Third Party Library Updates

`- GDCM updated to latest upstream`\
`- KWSys updated to the latest upstream`\
`- MetaIO updated to the latest upstream`\
`- MINC updated to the latest upstream`

-   Style improvements -- ITK gets more stylish with every release!

<!-- -->

-   Improved code coverage -- we are at 85.4%!

<!-- -->

-   -   Lots\* of important bug fixes

Changes from v4.8rc03..v4.8.0

------------------------------------------------------------------------

Davis Vigneault (1):

`     COMP: C++11 Warnings in thirdparty PNG module.`

Matthew McCormick (9):

`     COMP: Fix unused parameter warnings in itkMultiThreaderNoThreads.`\
`     BUG: Do not output CMake log files in itkSystemInformationTest.`\
`     COMP: Work around segfaults with VS12 in RegionOfInterestImageFilter.`\
`     DOC: Update Wiki Examples Remote to June 26, 2015.`\
`     COMP: Update ParabolicMorphology to address doxygen warning.`\
`     COMP: Add missing exports in the ITKFEM module.`\
`     BUG: Use CMAKE_LIBRARY_OUTPUT_DIRECTORY for build tree WrapITK.pth.`\
`     DOC: Document grafting the input image in composite filters.`\
`     DOC: Bump SphinxExample remote module version to 2015-07-02.`

Changes from v4.8rc02..v4.8rc03

------------------------------------------------------------------------

Bradley Lowekamp (3):

`     BUG: Remove reliance on exceptions in StringTools::ToData methods`\
`     BUG: Fix WriteCellsAsBinary and valgrind defects`\
`     COMP: Explicitly export SingleValuedNonLinearVnlOptimizerv4`

Matthew McCormick (4):

`     COMP: Address may be used uninitialized in IdentityTransformTest.`\
`     COMP: Address array subscript above bounds in VTKPolyDataReader.`\
`     COMP: Work around GDCM test segfault with Clang 3.5+.`\
`     BUG: Do not use pthreads with Emscripten.`

Michka Popoff (1):

`     ENH: Update PyInit for Python 3`

Changes from v4.8rc01..v4.8rc02

------------------------------------------------------------------------

Arnaud Gelas (2):

`     BUG: memory leaks when calling itk::Mesh::Graft`\
`     BUG: fix memory leaks in BorderQuadEdgeMeshFilter using itk::AutoPointer`

Bradley Lowekamp (1):

`     Revert selection `“`ENH:`` ``Add`` ``shared`` ``libraries`` ``for`` ``ITK`` ``libraries`”

Davis Vigneault (1):

`     STYLE: Minor typographical changes in ParameterizationQuadEdgeMeshFilter`

Dženan Zukić (1):

`     DOC: Improve docs for ConnectedComponentImageFilter`

Hans Johnson (1):

`     STYLE: Use consistent names in template parameters`

Sean McBride (2):

`     COMP: Update MINC to upstream 85145dca36`\
`     BUG: updated MINC to a77da29`

Changes from v4.7.0..v4.8rc01

------------------------------------------------------------------------

Alexander Hewer (1):

`     COMP: fixed error `“`Dunno`` ``about`` ``this`` ``gcc`”` for gcc 5.1`

Arnaud Gelas (14):

`     ENH: add MinimalPathExtraction as a remote module`\
`     ENH: fix KWStyle errors for SubdivisionQuadEdgeMesh`\
`     COMP: fix warning with non default template parameter for OutputImage`\
`     COMP: missing ';' in itkSetClampMacro`\
`     STYLE: no need to expose internal type`\
`     COMP: fix warning with non default template parameter for OutputImage`\
`     COMP: fix warning with non default template parameter for OutputImage`\
`     BUG: fix BinaryImageToLabelMapFilter with negative OutputBackgroundValue`\
`     DOC: add explanations about input and out filters`\
`     COMP: missing include in IterativeTriangleCellSubdivision`\
`     DOC: Improve documentation for ParameterizationQuadEdgeMeshFilter`\
`     BUG: not all combinations were actually test`\
`     ENH: add an exception in BorderQuadEdgeMeshFilter if no boundaries`\
`     COMP: fix CMake warning in ITKModuleHeaderTest`

Bill Lorensen (7):

`     ENH: Update to KWStyle conformant version`\
`     ENH: Add interpolate capability`\
`     ENH: WikiExamples QuickView Update`\
`     COMP: VTK AUTOINIT redefinition warnings`\
`     COMP: Only require the minimal VTK modules`\
`     COMP: Compiler hidden visibility on Mac compiler`\
`     COMP: EventMacro backward compatibility`

Brad King (25):

`     COMP: Fix variable reference in ITKVtkGlue module files`\
`     ENH: ExternalData: Allow local stores without any URL templates`\
`     ENH: ExternalData: Warn on missing file instead of failing`\
`     ENH: ExternalData: Add support for custom download scripts`\
`     ENH: ExternalData: Add support for custom algorithm-to-URL mapping`\
`     DOC: ExternalData: Update documentation to match CMake copy`\
`     ENH: Teach UpdateThirdPartyFromUpstream to support spaces in path`\
`     ENH: Improve UpdateThirdPartyFromUpstream for initial imports`\
`     ENH: Require CMake 2.8.9 or greater`\
`     ENH: Do not produce ITKGDCM library when using system GDCM`\
`     ENH: Drop gdcm source subtree to prepare for fresh import`\
`     ENH: Add script to update GDCM from upstream`\
`     STYLE: Tell Git not to check whitespace in GDCM`\
`     STYLE: Tell Git about larger files in GDCM`\
`     COMP: Configure GDCM to build inside ITK`\
`     COMP: Fix GDCM to handle older expat library`\
`     COMP: Cleanup CMP0022 warnings in GDCM module`\
`     COMP: Add missing include in GDCM source`\
`     COMP: Teach GDCM to honor ITK_DYNAMIC_LOADING option`\
`     ENH: KWSys: Tell Git not to export .gitattributes`\
`     COMP: Remove cmake_minimum_required calls from GDCM`\
`     COMP: Remove extra CMake policy settings in GDCM`\
`     COMP: Use more standard SSE intrinsics in GDCM copy of OpenJPEG`\
`     COMP: Fix GDCM std::accumulate initial value type`\
`     ENH: Update version of CastXML built for wrapper generation`

Bradley Lowekamp (48):

`     PERF: Use ImageAlgorithm::Copy in ImageSeriesWriter`\
`     BUG: Enable setting all zeroes for fixed parameters for displacement`\
`     ENH: Refactor versor to matrix transform code`\
`     DOC: Clarify that Scale Skew Versor does addition`\
`     COMP: Fix unsafe usage of sprintf`\
`     BUG: Correct Simularity3D Jacobian`\
`     BUG: Ensure OptimizerParameters doesn't leak its helper`\
`     BUG: Fix incorrectly ordering of template parameters`\
`     COMP: check for search.h in libtiff`\
`     BUG: restore the center point fixed parameters for scale transforms`\
`     PERF: Remove frequent dynamic allocations used with std::vector`\
`     COMP: Use _timezone for Visual Studio`\
`     BUG: Restore IO support for BSplineDeformableTransform`\
`     BUG: Enable VectorImage to work with the ImageSeriesWriter`\
`     BUG: Replace std::cout message Warning marco`\
`     BUG: Correct ExtractImageFilters Type macro`\
`     DOC: Separately document IsNull and IsNotNull`\
`     ENH: Modularize KWStyleTests`\
`     BUG: Remove ExhaustiveOptimizer ivar which was unused`\
`     STYLE: Update IOFDF to address KWStyle issues`\
`     BUG: Fix undefined signed integer shift`\
`     BUG: Fix IOFDFInDoxygenGroup test`\
`     BUG: Update MGHImageIO for header guarder style`\
`     BUG: Fix itkFDFImageIOTest link error on windows`\
`     STYLE: Update SCIFIO for KWStyke failures`\
`     BUG: Move LBFGSB callback helper to parent`\
`     BUG: Use base's NumberOfIterations for stopping condition`\
`     BUG: Update AmoebaOptimizer NumberOfIterations`\
`     BUG: Use base's NumberOfIterations for stopping condition`\
`     PERF: Report progress for linear transform only at scanline completion`\
`     BUG: Correct convergence string check`\
`     BUG: Avoid underflow in gradient range calculation`\
`     ENH: Use return by value for ImageAlgorithm::EnlargeRegionOverBox`\
`     BUG: No exception for 0 parameter transforms`\
`     COMP: Address conversion compilation warning`\
`     ENH: Use PrinSelfObjectMacro`\
`     BUG: Use module's libraries for linking header test.`\
`     ENH: Add export specifications to FFT library`\
`     COMP: Address conversion compilation warning`\
`     COMP: This patch address linking errors with WrapITK`\
`     DOC: Improving documentation for the names inputs of the ProcessObject`\
`     BUG: Isolate CannyEdgeDetection's internal filter from external`\
`     PERF: Refactor ExpandImageFilter loop`\
`     ENH: Add AtmoicInt class, use TimeStamp & LightObject`\
`     COMP: Address signed to unsigned comparison warning in AtomicInt Test`\
`     ENH: Move IsPrime and GreatestPrimeFactor to compiled cxx file`\
`     COMP: Add export missing export specifications`\
`     BUG: Fix reading HDF5 images into different dimension.`

Brian Helba (2):

`     ENH: Add scripts for automated updating of ThirdParty libraries`\
`     ENH: Make Vector construction from scalar value explicit`

Christopher Mullins (12):

`     STYLE: Keep codesnippet lines under 80 characters.`\
`     STYLE: Fix Latex blocks in documentation to include newlines.`\
`     COMP: Fix clang warnings`\
`     DOC: Fix Latex underscore for SoftwareGuide`\
`     BUG: Return a correct voronoi partition in Danielsson filter example.`\
`     STYLE: Fix Latex blocks in documentation to include newlines.`\
`     DOC: Use the dilated version of the FivePoints image`\
`     COMP: Use c++11 noexcept declarator.`\
`     COMP: Fix override warnings on clang with GPU module and MINC`\
`     COMP: Fix clang override warnings for Review module.`\
`     COMP: Fix more clang warnings in review module`\
`     COMP: Fix more clang override warnings in Review module.`

Cyril Mory (3):

`     BUG: Fixed itkWarpImageFilter wrong result in some cases`\
`     ENH: Method to compute InputRequestedRegion in itkWarpImageFilter`\
`     ENH: Moved some of itkWarpFilter from private to protected`

David Froger (2):

`     ENH: Check regions in HDF5 streaming test`\
`     BUG: Fix HDF5 write streaming test.`

Davis Vigneault (4):

`     STYLE: Minor style and documentation changes to ITK examples.`\
`     DOC: Minor changes and clarifications to the registration chapter of Book 2.`\
`     STYLE: Minor wording and formatting changes to Software Guide Mesh examples.`\
`     COMP: Build failure using EuclideanDistancePointMetric with mismatched meshes.`

Dženan Zukić (4):

`     COMP: VS 2012+ compile fixes and CMake warnings`\
`     COMP: fixing quote matching in vtkGlue-related .cmake file`\
`     ENH: adding reverse iteration test`\
`     ENH: using scanline iterator instead of linear iterator`

GDCM Upstream (1):

`     GDCM 2015-04-29 (81e551fc)`

Gary JIA (1):

`     BUG: Fix memory leak at GPUCommon`

Gaëtan Lehmann (21):

`     BUG: fix extra carriage return in python callbacks`\
`     ENH: use castxml in wrapping`\
`     COMP: almost fix java build`\
`     ENH: use modern cmake list operations in wrapping`\
`     COMP: hide compiler warnings when building pcre and swig`\
`     COMP: fix the IOFDF module name used in wrapping`\
`     COMP: fix last python runtime warnings about unknown types`\
`     COMP: fix undefined __float128 type with gcc`\
`     BUG: reactivate PythonGetNameOfClass and fix the FDFImageIOFactory name`\
`     COMP: fix warnings due to double MultipleValuedCostFunction wrapper`\
`     BUG: fix ipython custom completion`\
`     BUG: fix runtime information for cross correlation filters`\
`     ENH: let the user choose the tradeoff between size and speed in fft operations`\
`     ENH: update progress in ImageFileReader`\
`     ENH: initialize the progress in ImageFileWriter`\
`     BUG: fix extra line return in terminal progress display`\
`     BUG: fix missing space before `“`done`”` in progress display`\
`     ENH: pass ActualXDimensionIsOdd through the pipeline`\
`     COMP: fixes for SizeGreatestPrimeFactor`\
`     ENH: Add itkFFTPadImageFilter`\
`     ENH: factorize shared code in itk::PadImageFilterBase`

Gert Wollny (1):

`     COMP: defining ITK_USE_FLOAT_SPACE_PRECISION`

Hans Johnson (39):

`     COMP: Add c++11 override designation`\
`     COMP: Identify null pointer assignments`\
`     STYLE: rm explicit void for parameterless function`\
`     STYLE: Use ITK_NULLPTR to utilize c++11 features`\
`     BUG: Incorrect addition of ITK_OVERRIDE`\
`     COMP: Use STREQUAL instead of MATCH`\
`     BUG: return type defaults to zero.`\
`     BUG: ImageType, CofficientImageArray types missing`\
`     DOC: Invalid doxygen return for void function.`\
`     COMP: _Pragma suppress fltpnt equality warnings`\
`     COMP: Allow exact floatpnt equality checks.`\
`     COMP: Avoid floatpnt equality check`\
`     COMP: Floatpnt equality for divisor`\
`     COMP: Avoid unnecessary float pnt equality checks.`\
`     PERF: Improve perf of ANTSNeighborhoodCorrelation`\
`     BUG: Test depending on itkMesh.h in Common`\
`     COMP: Make DCMTK header functions const`\
`     Revert `“`COMP:`` ``VTK`` ``AUTOINIT`` ``redefinition`` ``warnings`”\
`     COMP: VTK and ITK H5 build program collision`\
`     COMP: Create out-of-line virtual method defintions`\
`     COMP: Create out-of-line virtual method macros`\
`     DOC: Clarify strange syntax for itk::MetaEvent`\
`     COMP: Fix ENABLE_SHARED variable name`\
`     STYLE: Remove outdated cmake version support`\
`     STYLE: Move SymmetricEigenAnalysis to Deprecated`\
`     COMP: Prefer modern CMake visibility settings`\
`     STYLE: Use ITK_NOEXCEPTION macro`\
`     ENH: Continue to deprecate ::Zero and ::One`\
`     ENH: Avoid need for const_cast, ensure consistency`\
`     BUG: Incorrect function signature`\
`     COMP: Intel compiler warning suppression`\
`     ENH: Add shared libraries for ITK libraries`\
`     ENH: Remove unnecessary const_cast`\
`     STYLE: Move utility TransformIOHelper to cxx file`\
`     BUG: Missing ITKIOMINC_EXPORT on __Private()`\
`     STYLE: Fixed AnalyzeObjectMap header guard style.`\
`     COMP: Missing exports for templates`\
`     ENH: Update MGHIO for consistency with ITK.`\
`     BUG: Remove shared specifications from TransformIO`

Ivan Setiawan (2):

`     BUG: Fix initial ImageTrueMax to the most negative value.`\
`     BUG: Test case to verify fix of ImageTrueMax in MattesMI.`

Jan Bergmeier (1):

`     DOC: Changed indices for steps in ExhaustiveOptimizer.`

Jon Haitz Legarreta (10):

`     ENH: New test for the BinaryStatisticsKeepNObjectsImageFilter`\
`     ENH: New test for the itkLabelShapeKeepNObjectsImageFilter`\
`     ENH: Add test for itkShapeRelabelImageFilter`\
`     ENH: Add test for the itkLabelStatisticsKeepNObjectsImageFilter`\
`     ENH: Add test for itkBinaryShapeKeepNObjectsImageFilter`\
`     ENH: Add test for itkLabelStatisticsOpeningImageFilter`\
`     DOC: Correct documentation typo.`\
`     ENH: Increase code coverage for itkCustomColormapFunction`\
`     ENH: Increase code coverage for itkCustomColormapFunction`\
`     ENH: New test for the itkMetaGaussianConverter`

Julien Jomier (1):

`     BUG: Output pointer origin is not set causing a memory access error.`

KWSys Robot (3):

`     KWSys 2015-04-19 (4f39791b)`\
`     KWSys 2015-05-12 (b1d560a0)`\
`     KWSys 2015-05-18 (9a6b7c3f)`

Kevin H. Hobbs (1):

`     COMP: new baseline for building against VTK master`

Marius Staring (2):

`     BUG: workaround for 64bit VS2013 Release segfaults`\
`     COMP: workaround for 64bit VS2013 Release ICE`

Matthew McCormick (160):

`     ENH: Add BridgeNumPy Remote Module.`\
`     COMP: Bump AnalyzeObjectMapIO to fix doxygen warning.`\
`     STYLE: Style changes for itkGaussianDerivativeImageFunctionTest.`\
`     ENH: Test GaussianDerivativeImageFunction with unsigned short.`\
`     ENH: Bump CMakeLists.txt version to 4.8.0.`\
`     DOC: Add C++11 macros to doxygen configuration.`\
`     ENH: Remove FindNUMARRAY.cmake.`\
`     STYLE: Too many spaces before semi-colon in PCAShapeSignedDistanceFunction.`\
`     COMP: Bump Wiki Examples revision to fix Doxygen warnings.`\
`     COMP: Fix ITK_OVERRIDE update DebugMacro build errors.`\
`     DOC: Updates to GettingStarted.txt.`\
`     BUG: Remove Testing/Temporary/CTestCostData.txt.`\
`     ENH: Update doxygen.config for Doxygen 1.8.9.1.`\
`     ENH: Bump release branch version to 4.7.1.`\
`     ENH: Bump CMakeLists.txt version to 4.8.0.`\
`     BUG: Clear TransformIO's list of transforms in TransformFileReader.`\
`     DOC: Rename duplicate doxygen section.`\
`     Revert Doxygen version 1.8.9.1 to 1.8.5 config to clean up dashboard`\
`     DOC: Fix Doxygen override, nullptr, noexcept definitions.`\
`     DOC: Note that push access is not required to get patches merged.`\
`     COMP: Fix wrapping runtime warning on unknown itk::Matrix.`\
`     COMP: Add missing types for MeshTraits wrapping.`\
`     COMP: Do not wrap the Container types for CellInterface * types.`\
`     COMP: Add wrapping for CellTraitsInfo.`\
`     COMP: Wrap missing Mesh templates.`\
`     DOC: Clean up some wrapping comments.`\
`     ENH: Add wrapping for ITKImageNoise module.`\
`     STYLE: Clean up inter-definition space for Image,ImageBase,ProcessObject.`\
`     ENH: Fetch source tarball external data from midas3.kitware.com.`\
`     BUG: Fix BridgeNumPy signed / unsigned short correspondance.`\
`     DOC: Improve ImageScanlineIterator documentation.`\
`     ENH: Add missing {Set,Get}Element methods to Array2D.`\
`     BUG: Fix linking SmoothingRecursiveYvvGaussianFilter with install tree.`\
`     BUG: Add CMake export code for ITK_USE_SYSTEM_GDCM.`\
`     ENH: Pass CMAKE_GENERATOR to ExternalProject's.`\
`     ENH: Update LLVM/Clang ExternalProject to 3.6.0.`\
`     ENH: Update MetaIO License from Upstream.`\
`     ENH: Bump MetaIO to latest upstream.`\
`     BUG: Export ITK_FFTW_INCLUDE_PATH as CMake path.`\
`     COMP: Do not include tests/ directory in clang tarball.`\
`     ENH: Add Azure Storage as ExternalData source.`\
`     STYLE: Update SplitComponents module for KWStyle fixes.`\
`     COMP: Fix LevelSetsv4 tests with libc++.`\
`     STYLE: Style fixes for LevelSetsv4 and related classes.`\
`     BUG: Move MagnitudeAndPhaseToComplex filter wrapping to ITKImageIntensity.`\
`     ENH: Document testModules.sh and move to Utilities/Maintenance`\
`     BUG: Fix Python tests on Windows with Ninja generator.`\
`     STYLE: Update IOSTL module for KWStyle test.`\
`     BUG: Set ITK_BUILD_SHARED in ITKConfig.cmake on Windows.`\
`     BUG: Suppress wrapping type conversions warnings with MSVC.`\
`     COMP: Address quoted MSVC variable in GDCM.`\
`     BUG: WrapITK.pth should contain the lib/ directory with VS.`\
`     COMP: Suppress swig build configure warning.`\
`     ENH: Use CMAKE_CROSSCOMPILING_EMULATOR to run HDF5 detection.`\
`     BUG: Do not use EXECUTABLE_OUTPUT_PATH for vcl tests.`\
`     BUG: Do not enable floating point exceptions in tests with MinGW.`\
`     DOC: Update KWStyle location.`\
`     BUG: Add QuickViewTest baseline for Mac.`\
`     ENH: MetaIO use UpdateThirdPartyFromUpstream.sh`\
`     ENH: Arrange MetaIO sources for UpdateThirdPartyFromUpstream.sh.`\
`     ENH: Add root snapshot commit support to UpdateThirdPartyFromUpstream.sh`\
`     COMP: Do not try to generate tiff_fax3sm.c when cross compiling.`\
`     COMP: Android does not currently have posix_memalign.`\
`     COMP: The Android pwd.h passwd struct does not have a pw_gecos entry.`\
`     COMP: Android does not have pthread_setcancelstate.`\
`     COMP: Do not do __errno_location workaround on Android.`\
`     COMP: Removed unused parameters in itkThreadPoolTest.`\
`     BUG: Address detection of TransformReadWriteTest as executable.`\
`     ENH: Set CMP0056 to NEW.`\
`     COMP: Work around test file too big with x64_64-w64-mingw32.`\
`     COMP: Increase itkMattesMutualInformationImageToIMageMetricv4Test tolerance.`\
`     COMP: Address NumericTraits warning related to POWER8 char.`\
`     BUG: Add new ResampleImageFilter9Test baseline for MinGW.`\
`     BUG: Add MinGW baseline for VoronoiPartitioningImageFilterTest1.`\
`     COMP: Fix vnl_sample.cxx for srand48 but no drand48.`\
`     ENH: Add ITK_DYNAMIC_LOADING CMake option.`\
`     COMP: Support S_IRUSR and S_IWUSR.`\
`     COMP: Do not log swig configure output.`\
`     BUG: NumericTraits< char > does not have Self typedef.`\
`     ENH: Do not use TestBigEndian from CMAKE_ROOT.`\
`     COMP: Use sizeof(void *) instead of sizeof(size_t) for address model.`\
`     COMP: Do not use GCC demangling with emscripten.`\
`     ENH: Use try_run to determine if double correction required.`\
`     COMP: Address quoted MSVC variable in GDCM.`\
`     COMP: Suppress Swig configure output.`\
`     COMP: Remove duplicate InternalLabelType typedef.`\
`     COMP: Set CMP0058 to NEW.`\
`     COMP: Add missing InternalLabelType.`\
`     BUG: Specify absolute path to double-conversion-configure.h for install.`\
`     DOC: Clarify the UpdateThirdPartyFromUpstream.sh commit message.`\
`     BUG: Link to VTK 6 rendering backend modules.`\
`     COMP: Pass --quiet to swig's configure script.`\
`     STYLE: Update HigherOrderAccurateGradient module for style fixes.`\
`     ENH: Mark ITK_DYNAMIC_LOADING as an advanced CMake variable.`\
`     COMP: Ignore swig-prefix warnings.`\
`     BUG: GDCM set default ultrasound spacing when not found.`\
`     COMP: Initialize arrays in itkCurvatureFlowFunction.`\
`     BUG: Add VTK modules for annotation rendering.`\
`     BUG: Link vtkRenderingFreeType in the VTK modules.`\
`     COMP: Add itkIntTypes.h header for SizeValueType in itkVnlFFTCommon.h`\
`     STYLE: Style fixes for RayCastHelper::CalcRayIntercepts`\
`     COMP: Run the SWIG configure step in a CMake script.`\
`     ENH: Bump release branch version to 4.7.2.`\
`     STYLE: Bump IOFDF module for style and cleanup.`\
`     BUG: Fix DoxygenInGroup test from .zip release files.`\
`     COMP: Do not wrap exotic QuadEdgeMesh CellInterface types.`\
`     COMP: Remove FFTWGlobalConfiguration param doxygen keyword.`\
`     COMP: Do not reference ::MetaEvent in itkMetaEvent.h docs.`\
`     DOC: itkSymmetricEigenSystem is now in the ITKDeprecated module.`\
`     BUG: Fix TestDriver executable for itkSymmetricEigenSystemTest.`\
`     BUG: Use consistent SizeGreatestPrimeFactor in deconvolution tests.`\
`     COMP: Use signed char in ImageToImageMetricv4 test.`\
`     COMP: Do not include itkDynamicLoader in header tests.`\
`     COMP: Include byteswap.h for Android in GDCM.`\
`     COMP: Use signal.h instead of sys/signal.h in GDCM.`\
`     COMP: Not all versions of Android have posix_memalign.`\
`     COMP: Initialize variable in PointSetToListSampleAdaptorTest.`\
`     COMP: Suppress getpwnam warning with static executables.`\
`     COMP: Tighten LandmarkWarping2 lines for Software Guide.`\
`     ENH: Allow skip of FloatPointExceptions implementation for absent fenv.h.`\
`     COMP: Define feenableexcept for Emscripten.`\
`     BUG: HDF5 do not force CMake CheckTypeSize on include.`\
`     STYLE: Style fixes to itkVideoStream.e`\
`     COMP: Ignore build warnings for libs unfound by emscripten.`\
`     BUG: Run HDF5 H5detect in working directory with the executable.`\
`     BUG: HDF5 use CMAKE_EXECUTABLE_SUFFIX.`\
`     COMP: Work around Emscripten internal compiler crash in VideoStream.`\
`     COMP: Use byteswap.h with GDCM with Emscripten.`\
`     COMP: Recognize Emscripten in socket++.`\
`     BUG: Remove HDF5's own internal CheckTypeSize.cmake.`\
`     ENH: Enable cross-compiling of the wrapping.`\
`     COMP: Missing semi-colon in FFT Hermitian filters.`\
`     ENH: Add ExternalData_NO_SYMLINKS option.`\
`     ENH: Mount local filesystem in the test driver for Emscripten.`\
`     BUG: Do not install wrapping with CMAKE_PREFIX_PATH.`\
`     ENH: Define CPACK_PACKAGE_CONTACT.`\
`     ENH: Add post-commit hook for third party library patches.`\
`     ENH: Pass the CastXML flags directly.`\
`     STYLE: Rename GCC-XML references to CastXML.`\
`     ENH: Send an error when CMAKE_CXX_COMPILER_TARGET is not set.`\
`     ENH: Bump CastXML version for cross-compiling target fix.`\
`     BUG: Use STRING type for PY_SITE_PACKAGES_PATH.`\
`     BUG: Continue when IPython.get_ipython throws an AttributeError.`\
`     ENH: Add ITK_USE_SYSTEM_LIBRARIES`\
`     STYLE: Fix indentation in ITKSetStandardCompilerFlags.cmake.`\
`     COMP: Do not enable ITK_HAVE_SYNC_BUILTINS with Emscripten.`\
`     COMP: Fix MinGW ITK_HAVE_SYNC_BUILTINS detection.`\
`     ENH: Split testing data tarball form source tarball.`\
`     COMP: Do not use ITK_NULLPTR as sentinel.`\
`     ENH: Use gold linker on Linux with GCC.`\
`     COMP: Add try_compile check for gold linker.`\
`     COMP: Do not build dsrc2c.c with -fvisibility-inlines-hidden.`\
`     BUG: Remove shared specifications from IOTransformBase.`\
`     BUG: Required GCC version for gold linker is 4.8.3.`\
`     BUG: Fix ITKIOMINCExport.h capitalization.`\
`     BUG: Add missing include directory required after MINC update.`\
`     BUG: Bring in IOFDF license updates.`\
`     COMP: Add missing HDF5 include for MINC.`\
`     COMP: Add missing HDF5 include directory for ITKIOMINC.`\
`     COMP: Fix itkVTKImageExport.h header name in VtkGlue.i.`

MetaIO Maintainers (2):

`     MetaIO 2015-04-12 (b7969294)`\
`     MetaIO 2015-04-21 (dc4f7d16)`

Michka Popoff (20):

`     COMP: Use c++ style comments in pyBase.i`\
`     ENH: Update to swig 3.0.3`\
`     STYLE: Cleanup up cmake files (if, endif, foreach, endforeach).`\
`     ENH: Update to SWIG 3.0.5`\
`     COMP: Fix PythonReadDicomTagTest on OS X`\
`     ENH: Improve wrapping for Vector image types`\
`     ENH: Cleanup itkComposeImageFilter wrapping`\
`     ENH: Setup correct wrapping of GradientRecursiveGaussianImageFilter`\
`     ENH: Add Get/SetSigmaArray to GradientRecursiveGaussianImageFilter`\
`     ENH: Add checks for base types when wrapping more complex types`\
`     COMP: Fix DiffeomorphicDemonsRegistration Wrapping`\
`     STYLE: Rename ITK_WRAP_DIMS to ITK_WRAP_IMAGE_DIMS`\
`     ENH: Add ITK_WRAP_VECTOR_COMPONENTS option`\
`     STYLE: Replace GCCXML by CASTXML`\
`     BUG: Wrap FixedArray sizes also for vector components`\
`     ENH: Wrap MersenneTwisterRandomVariateGenerator`\
`     ENH: Wrap CustomColormapFunction`\
`     ENH: Update to PCRE 8.37`\
`     ENH: Enable wrapping of 4 dimensional vectors`\
`     ENH: Remove inline namespace fix for Wrapping`

Nick Tustison (10):

`     ENH:  Adding point set reg. capabilities for SyN.`\
`     PERF:  Tolerance for testing needs to be increased.`\
`     BUG:  Coverity divide by zero complaint.`\
`     BUG:  Metric evaluation had an incorrect sign.`\
`     ENH:  Making the point set type visible.`\
`     BUG:  Need to check if maxNorm == 0.`\
`     BUG:  Pixel type shouldn't be initialized with scalar.`\
`     ENH:  Cleaning up point set reg. in BSplineSyN`\
`     ENH:  Adding tangent space calculation for SyN methods.`\
`     BUG:  Added sampling only within the specified mask.`

Niels Dekker (2):

`     BUG: workaround for 64bit VS2013 Release segfault`\
`     COMP: Fixed MSVC warnings, `“`warning`` ``D9025:`` ``overriding`` ``'/W1'`` ``with`` ``'/w'`”

Richard Beare (3):

`     ENH: LabelErodeDilate as a remote module`\
`     ENH: remote.cmake for parabolic morphology`\
`     ENH: Use SHA for LabelErodeDilate module.`

Rolf Eike Beer (2):

`     STYLE: ExternalData: Replace MATCHES with STREQUAL where possible`\
`     STYLE: ExternalData: Clean up duplicate regex matches with CMAKE_MATCH_`<n>

Sean McBride (12):

`     COMP: Changed KWStyle check for header include guard names`\
`     COMP: Remove double underscore in header guards (.h & __itk*_h form)`\
`     COMP: Remove double underscore in header guards (.hxx & __itk*_h form)`\
`     COMP: Remove double underscore in header guards (.in & __itk*_h form)`\
`     COMP: Remove remaining double underscore in header guards (__itk form)`\
`     COMP: Remove unnecessary header guards in .cxx files`\
`     COMP: Manually search for `“`__itk`”` and clean up double underscore usage`\
`     COMP: fixed clang -Wkeyword-macro warning by removing invalid #undef`\
`     COMP: Suppress clang -Wdocumentation-unknown-command false positive`\
`     COMP: properly escape @ char in doxygen comments`\
`     COMP: Escaped @ character in doxygen comments`\
`     BUG: updated libminc SHA to newest`

Ziv Yaniv (1):

`     BUG: Versor initialized with null axis (0,0,0) did not throw exception.`

ITK Sphinx Examples Changelog

------------------------------------------------------------------------

Arnaud Gelas (9):

`     DOC: recommend to use CreateNewExample.py`\
`     ENH: Add one example for BinaryFillholeImageFilter`\
`     add one example to illustrate the usage of LabelSelectionLabelMapFilter`\
`     Apply BinaryMorphologicalClosingFilter on all LabelObjects of given LabelMap`\
`     Add one example to apply morphological closing on specific LabelObject`\
`     fix rst formatting`\
`     Add one example to overlay one label map on top of one image`\
`     Minor fixes in page title`\
`     COMP: Fix sphinx warning (missing '.' for one title)`

Bradley Lowekamp (1):

`     BUG: Fix ITK_WRAP_PYTHON check`

Dženan Zukić (1):

`     Adding DicomSeriesReadImageWrite3`

Matt McCormick (11):

`     ENH: Add option to build Python wrapping in the superbuild.`\
`     COMP: Remove `“`ImageFilter`”` from ApplyGradientRecursiveGaussian.`\
`     COMP: Set CMP0054 to NEW.`\
`     BUG: Fix links to Midas community.`\
`     ENH: Send an error when the source/build path is too long on Windows.`\
`     BUG: Extend the superbuild path limit.`\
`     BUG: Add ITKMetaIO to ComputePeronaMalikAnisotropicDiffusion to create output.`\
`     ENH: Update VTK version to 6.2.0.`\
`     COMP: Do not log ExternalProject steps that generate false positives.`\
`     COMP: Remove unused variables and types.`\
`     ENH: Bump ITK ExternalProject to v4.8.0.`

Michka Popoff (19):

`     ENH: Add GradientRecursiveGaussianImageFilter example`\
`     COMP: Fix failing ApplyGradientRecursiveGaussianImageFilter tests`\
`     DOC: Fix GradientRecursiveGaussianImageFilter documentation`\
`     COMP: Fix missing images in ApplyGradientRecursiveGaussianFilter`\
`     ENH: Add new example with GradientRecursiveGaussianImageFilter`\
`     BUG: Correctly detect and set python_file`\
`     ENH: Add Python code to RemoveHolesNotConnectedToImageBoundaries`\
`     STYLE: Remove example_name and folder variables`\
`     STYLE: Pep8 cleanup for CreateNewExample.py.in`\
`     ENH: Improve CreateNewExample script`\
`     ENH: ADD ComputePeronaMalikAnisotropicDiffusion Python Example`\
`     ENH: Add Anti Alias Python Example`\
`     ENH: Add tests for Python examples in AnisotropicSmoothing`\
`     BUG: Fix PeronaMalik python example`\
`     ENH: Add ApplyColorMap Python example`\
`     ENH: Simplify CMakeLists Python setup`\
`     ENH: Add custom colormap Python example`\
`     ENH: Improve Python SuperBuild`\
`     ENH: Replace double with float in python examples`

ITK Software Guide Changelog

------------------------------------------------------------------------

-   Note that improvements in the Examples/ directory of the ITK
    repository also contribute to the improvements in the Software
    Guide.

Davis Vigneault (1):

`     DOC: Fix typo's in SystemOverview and DataRepresentation.`

Matt McCormick (9):

`     ENH: Update the MetaIO license file location.`\
`     ENH: Add option to build HTML output with tex4ht.`\
`     ENH: Remove the 000- and 001- prefixes to the main .tex files.`\
`     ENH: Add CMake option to turn off the draft watermark.`\
`     ENH: Add some styling to the HTML index.`\
`     DOC: Update Python wrapping information.`\
`     BUG: Fixes to How To Write A Filter.`\
`     ENH: Bump ITK ExternalProject to July 01, 2015.`\
`     COMP: Address missing bracket and backslash escapes.`

ITK Apps Changelog

------------------------------------------------------------------------

Matt McCormick (2):

`     COMP: Fix @only capitalization in External-FLTK.cmake.`\
`     ENH: Bump ITK Superbuild version to 4.8.0.`