package info
(click to toggle)
Folder: 1.4.21-1
| .. (parent) | ||||
| d | rwxr-xr-x | 30 | .github | |
| d | rwxr-xr-x | 108 | .idea | |
| d | rwxr-xr-x | 125 | .pc | |
| d | rwxr-xr-x | 85 | conda | |
| d | rwxr-xr-x | 4,096 | debian | |
| d | rwxr-xr-x | 60 | envs | |
| - | rw-r--r-- | 45 | .gitignore | |
| - | rw-r--r-- | 252,900 | KMAspecification.pdf | |
| - | rw-r--r-- | 4,829 | Makefile | |
| - | rw-r--r-- | 7,144 | README.md | |
| - | rw-r--r-- | 32,020 | align.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,680 | align.h | |
| - | rw-r--r-- | 77,851 | alnfrags.c | |
| - | rw-r--r-- | 7,716 | alnfrags.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,823 | ankers.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,991 | ankers.h | |
| - | rw-r--r-- | 56,598 | assembly.c | |
| - | rw-r--r-- | 3,947 | assembly.h | |
| - | rw-r--r-- | 166 | bitbucket-pipelines.yml | |
| - | rw-r--r-- | 13,625 | chain.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,568 | chain.h | |
| - | rw-r--r-- | 8,773 | compdna.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,691 | compdna.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,428 | compkmers.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,054 | compkmers.h | |
| - | rw-r--r-- | 33,764 | compress.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,103 | compress.h | |
| - | rw-r--r-- | 35,214 | conclave.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,816 | conclave.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,615 | db.c | |
| - | rw-r--r-- | 776 | db.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,301 | decon.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,348 | decon.h | |
| - | rw-r--r-- | 25,752 | dist.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,845 | dist.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,569 | ef.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,113 | ef.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,034 | filebuff.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,713 | filebuff.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,355 | frags.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,160 | frags.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,419 | hashmap.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,343 | hashmap.h | |
| - | rw-r--r-- | 14,345 | hashmapcci.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,861 | hashmapcci.h | |
| - | rw-r--r-- | 10,673 | hashmapindex.c | |
| - | rw-r--r-- | 3,424 | hashmapindex.h | |
| - | rw-r--r-- | 22,413 | hashmapkma.c | |
| - | rw-r--r-- | 4,370 | hashmapkma.h | |
| - | rw-r--r-- | 3,712 | hashmapkmers.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,382 | hashmapkmers.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,433 | hashtable.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,651 | hashtable.h | |
| - | rw-r--r-- | 20,121 | index.c | |
| - | rw-r--r-- | 750 | index.h | |
| - | rw-r--r-- | 59,911 | kma.c | |
| - | rw-r--r-- | 789 | kma.h | |
| - | rw-r--r-- | 826 | kma_index.c | |
| - | rw-r--r-- | 821 | kma_shm.c | |
| - | rw-r--r-- | 803 | kma_update.c | |
| - | rw-r--r-- | 5,838 | kmapipe.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,288 | kmapipe.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,121 | kmathread.h | |
| - | rw-r--r-- | 15,218 | kmeranker.c | |
| - | rw-r--r-- | 3,077 | kmeranker.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,612 | kmerlink.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,143 | kmerlink.h | |
| - | rw-r--r-- | 9,051 | kmers.c | |
| - | rw-r--r-- | 967 | kmers.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,249 | kmmap.c | |
| - | rw-r--r-- | 871 | kmmap.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,506 | loadupdate.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,158 | loadupdate.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,734 | main.c | |
| - | rw-r--r-- | 744 | main.h | |
| - | rw-r--r-- | 8,086 | makeindex.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,456 | makeindex.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,081 | matrix.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,160 | matrix.h | |
| - | rw-r--r-- | 14,939 | mt1.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,398 | mt1.h | |
| - | rw-r--r-- | 25,617 | nw.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,025 | nw.h | |
| - | rw-r--r-- | 28,303 | nw2p.c | |
| - | rw-r--r-- | 891 | penalties.h | |
| - | rw-r--r-- | 272,814 | performanceAndComparisonCMDs.tar.gz | |
| - | rw-r--r-- | 1,844 | pherror.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,667 | pherror.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,897 | printconsensus.c | |
| - | rw-r--r-- | 889 | printconsensus.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,463 | qc.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,467 | qc.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,424 | qseqs.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,006 | qseqs.h | |
| - | rw-r--r-- | 10,216 | qualcheck.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,586 | qualcheck.h | |
| - | rw-r--r-- | 23,248 | runinput.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,621 | runinput.h | |
| - | rw-r--r-- | 50,430 | runkma.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,952 | runkma.h | |
| - | rw-r--r-- | 4,729 | sam.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,041 | sam.h | |
| - | rw-r--r-- | 179,888 | savekmers.c | |
| - | rw-r--r-- | 8,171 | savekmers.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,461 | seq2fasta.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,013 | seq2fasta.h | |
| - | rw-r--r-- | 5,734 | seqmenttree.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,655 | seqmenttree.h | |
| - | rw-r--r-- | 10,865 | seqparse.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,261 | seqparse.h | |
| - | rw-r--r-- | 16,667 | shm.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,363 | shm.h | |
| - | rw-r--r-- | 25,212 | sparse.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,598 | sparse.h | |
| - | rw-r--r-- | 38,074 | spltdb.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,779 | spltdb.h | |
| - | rw-r--r-- | 12,435 | stdnuc.c | |
| - | rw-r--r-- | 5,249 | stdnuc.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,436 | stdstat.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,518 | stdstat.h | |
| - | rw-r--r-- | 1,581 | threader.h | |
| - | rw-r--r-- | 2,358 | tmp.c | |
| - | rw-r--r-- | 765 | tmp.h | |
| - | rw-r--r-- | 21,296 | trim.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,044 | trim.h | |
| - | rw-r--r-- | 3,867 | tsv.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,028 | tsv.h | |
| - | rw-r--r-- | 8,245 | update.c | |
| - | rw-r--r-- | 894 | update.h | |
| - | rw-r--r-- | 6,483 | updateindex.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,845 | updateindex.h | |
| - | rw-r--r-- | 15,645 | updatescores.c | |
| - | rw-r--r-- | 2,707 | updatescores.h | |
| - | rw-r--r-- | 3,325 | valueshash.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,674 | valueshash.h | |
| - | rw-r--r-- | 9,211 | vcf.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,040 | vcf.h | |
| - | rw-r--r-- | 739 | version.h | |
| - | rw-r--r-- | 7,720 | xml.c | |
| - | rw-r--r-- | 1,575 | xml.h |
