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kmc 3.2.4%2Bdfsg-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid, trixie
  • size: 3,716 kB
  • sloc: cpp: 38,308; python: 664; makefile: 216; perl: 179; sh: 34

Folder: kmc_core

d .. (parent)
d d rwxr-xr-x 77 libs
- - rw-r--r-- 831 bam_utils.h
- - rw-r--r-- 13,662 binary_reader.h
- - rw-r--r-- 8,527 bkb_merger.h
- - rw-r--r-- 3,001 bkb_reader.cpp
- - rw-r--r-- 1,470 bkb_reader.h
- - rw-r--r-- 13,936 bkb_sorter.h
- - rw-r--r-- 4,461 bkb_subbin.h
- - rw-r--r-- 15,858 bkb_uncompactor.h
- - rw-r--r-- 4,174 bkb_writer.cpp
- - rw-r--r-- 1,445 bkb_writer.h
- - rw-r--r-- 4,259 cpu_info.cpp
- - rw-r--r-- 685 cpu_info.h
- - rw-r--r-- 1,939 critical_error_handler.h
- - rw-r--r-- 3,636 defs.h
- - rw-r--r-- 4,367 develop.cpp
- - rw-r--r-- 433 develop.h
- - rw-r--r-- 2,462 exception_aware_thread.h
- - rw-r--r-- 36,513 fastq_reader.cpp
- - rw-r--r-- 5,722 fastq_reader.h
- - rw-r--r-- 13,401 first_dispatch.h
- - rw-r--r-- 2,626 intr_copy.h
- - rw-r--r-- 2,712 kb_collector.cpp
- - rw-r--r-- 2,738 kb_collector.h
- - rw-r--r-- 10,838 kb_completer.cpp
- - rw-r--r-- 11,169 kb_completer.h
- - rw-r--r-- 7,526 kb_reader.h
- - rw-r--r-- 34,353 kb_sorter.h
- - rw-r--r-- 6,035 kb_storer.cpp
- - rw-r--r-- 2,174 kb_storer.h
- - rw-r--r-- 5,361 kff_writer.cpp
- - rw-r--r-- 1,179 kff_writer.h
- - rw-r--r-- 60,444 kmc.h
- - rw-r--r-- 14,188 kmc_core.vcxproj
- - rw-r--r-- 6,798 kmc_core.vcxproj.filters
- - rw-r--r-- 617 kmc_core.vcxproj.user
- - rw-r--r-- 11,561 kmc_runner.cpp
- - rw-r--r-- 9,161 kmc_runner.h
- - rw-r--r-- 346 kmer.cpp
- - rw-r--r-- 15,863 kmer.h
- - rw-r--r-- 17,799 kxmer_set.h
- - rw-r--r-- 2,608 mem_disk_file.cpp
- - rw-r--r-- 1,146 mem_disk_file.h
- - rw-r--r-- 884 meta_oper.h
- - rw-r--r-- 5,947 params.h
- - rw-r--r-- 1,259 percent_progress.h
- - rw-r--r-- 55,710 queues.h
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- - rw-r--r-- 1,400 raduls.h
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- - rw-r--r-- 334 raduls_neon.cpp
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- - rw-r--r-- 359 rev_byte.cpp
- - rw-r--r-- 591 rev_byte.h
- - rw-r--r-- 6,465 s_mapper.h
- - rw-r--r-- 601 small_k_buf.h
- - rw-r--r-- 14,094 small_sort.h
- - rw-r--r-- 26,982 splitter.cpp
- - rw-r--r-- 5,747 splitter.h
- - rw-r--r-- 402 thread_cancellation_exception.h
- - rw-r--r-- 4,332 timer.cpp
- - rw-r--r-- 1,558 timer.h
- - rw-r--r-- 813 tmp_files_owner.h