Folder: src

package info (click to toggle)

lammps 0~20120615.gite442279-1

links: PTS, VCS
area: main
in suites: wheezy
size: 128,448 kB
sloc: cpp: 321,874; fortran: 15,187; ansic: 11,007; python: 7,889; perl: 2,915; sh: 2,088; makefile: 924; f90: 374; objc: 238; lisp: 169; csh: 16; tcl: 6

			.. (parent)
d	rwxr-xr-x	4,096	ASPHERE
d	rwxr-xr-x	4,096	CLASS2
d	rwxr-xr-x	4,096	COLLOID
d	rwxr-xr-x	147	DIPOLE
d	rwxr-xr-x	4,096	FLD
d	rwxr-xr-x	4,096	GPU
d	rwxr-xr-x	4,096	GRANULAR
d	rwxr-xr-x	75	KIM
d	rwxr-xr-x	4,096	KSPACE
d	rwxr-xr-x	4,096	MAKE
d	rwxr-xr-x	4,096	MANYBODY
d	rwxr-xr-x	4,096	MC
d	rwxr-xr-x	77	MEAM
d	rwxr-xr-x	4,096	MOLECULE
d	rwxr-xr-x	4,096	OPT
d	rwxr-xr-x	4,096	PERI
d	rwxr-xr-x	77	POEMS
d	rwxr-xr-x	4,096	REAX
d	rwxr-xr-x	4,096	REPLICA
d	rwxr-xr-x	4,096	SHOCK
d	rwxr-xr-x	125	SRD
d	rwxr-xr-x	61	STUBS
d	rwxr-xr-x	90	USER-ATC
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-AWPMD
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-CG-CMM
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-COLVARS
d	rwxr-xr-x	8,192	USER-CUDA
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-EFF
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-EWALDN
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-MISC
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-MOLFILE
d	rwxr-xr-x	12,288	USER-OMP
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-REAXC
d	rwxr-xr-x	4,096	USER-SPH
d	rwxr-xr-x	4,096	WINDOWS
d	rwxr-xr-x	123	XTC
-	rw-r--r--	1,210	Depend.sh
-	rwxr-xr-x	27,623	Make.py
-	rw-r--r--	2,693	Make.sh
-	rwxr-xr-x	6,751	Makefile
-	rw-r--r--	13,794	Makefile.lib
-	rw-r--r--	9,820	Makefile.list
-	rw-r--r--	213	Makefile.package.empty
-	rw-r--r--	147	Makefile.package.settings.empty
-	rw-r--r--	2,901	Package.sh
-	rw-r--r--	1,962	accelerator_cuda.h
-	rw-r--r--	3,473	accelerator_omp.h
-	rw-r--r--	6,485	angle.cpp
-	rw-r--r--	2,146	angle.h
-	rw-r--r--	51,036	atom.cpp
-	rw-r--r--	10,812	atom.h
-	rw-r--r--	1,892	atom_vec.cpp
-	rw-r--r--	4,082	atom_vec.h
-	rw-r--r--	16,914	atom_vec_atomic.cpp
-	rw-r--r--	2,242	atom_vec_atomic.h
-	rw-r--r--	18,287	atom_vec_charge.cpp
-	rw-r--r--	2,389	atom_vec_charge.h
-	rwxr-xr-x	34,766	atom_vec_ellipsoid.cpp
-	rwxr-xr-x	3,256	atom_vec_ellipsoid.h
-	rw-r--r--	23,782	atom_vec_hybrid.cpp
-	rw-r--r--	2,726	atom_vec_hybrid.h
-	rw-r--r--	31,975	atom_vec_line.cpp
-	rw-r--r--	3,400	atom_vec_line.h
-	rw-r--r--	28,288	atom_vec_sphere.cpp
-	rw-r--r--	2,791	atom_vec_sphere.h
-	rw-r--r--	43,065	atom_vec_tri.cpp
-	rw-r--r--	3,659	atom_vec_tri.h
-	rw-r--r--	29,499	balance.cpp
-	rw-r--r--	3,212	balance.h
-	rw-r--r--	5,686	bond.cpp
-	rw-r--r--	2,083	bond.h
-	rw-r--r--	10,354	bond_hybrid.cpp
-	rw-r--r--	2,517	bond_hybrid.h
-	rw-r--r--	16,270	change_box.cpp
-	rw-r--r--	3,289	change_box.h
-	rw-r--r--	56,146	comm.cpp
-	rw-r--r--	8,682	comm.h
-	rw-r--r--	8,575	compute.cpp
-	rw-r--r--	6,222	compute.h
-	rw-r--r--	6,289	compute_angle_local.cpp
-	rw-r--r--	1,676	compute_angle_local.h
-	rw-r--r--	10,348	compute_atom_molecule.cpp
-	rw-r--r--	2,881	compute_atom_molecule.h
-	rw-r--r--	5,456	compute_bond_local.cpp
-	rw-r--r--	1,662	compute_bond_local.h
-	rw-r--r--	8,741	compute_centro_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,764	compute_centro_atom.h
-	rw-r--r--	6,021	compute_cluster_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,965	compute_cluster_atom.h
-	rw-r--r--	10,747	compute_cna_atom.cpp
-	rw-r--r--	2,111	compute_cna_atom.h
-	rw-r--r--	1,523	compute_com.cpp
-	rw-r--r--	1,237	compute_com.h
-	rw-r--r--	4,487	compute_com_molecule.cpp
-	rw-r--r--	1,570	compute_com_molecule.h
-	rw-r--r--	4,312	compute_coord_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,761	compute_coord_atom.h
-	rw-r--r--	6,838	compute_dihedral_local.cpp
-	rw-r--r--	1,712	compute_dihedral_local.h
-	rw-r--r--	4,792	compute_displace_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,443	compute_displace_atom.h
-	rw-r--r--	2,258	compute_erotate_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,385	compute_erotate_sphere.h
-	rw-r--r--	11,159	compute_group_group.cpp
-	rw-r--r--	1,984	compute_group_group.h
-	rw-r--r--	3,330	compute_gyration.cpp
-	rw-r--r--	1,299	compute_gyration.h
-	rw-r--r--	8,408	compute_gyration_molecule.cpp
-	rw-r--r--	1,702	compute_gyration_molecule.h
-	rw-r--r--	5,143	compute_heat_flux.cpp
-	rw-r--r--	1,629	compute_heat_flux.h
-	rw-r--r--	6,665	compute_improper_local.cpp
-	rw-r--r--	1,712	compute_improper_local.h
-	rw-r--r--	1,997	compute_ke.cpp
-	rw-r--r--	1,214	compute_ke.h
-	rw-r--r--	2,951	compute_ke_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,387	compute_ke_atom.h
-	rw-r--r--	5,256	compute_msd.cpp
-	rw-r--r--	1,348	compute_msd.h
-	rw-r--r--	5,418	compute_msd_molecule.cpp
-	rw-r--r--	1,613	compute_msd_molecule.h
-	rw-r--r--	3,422	compute_pair.cpp
-	rw-r--r--	1,697	compute_pair.h
-	rw-r--r--	7,522	compute_pair_local.cpp
-	rw-r--r--	2,106	compute_pair_local.h
-	rw-r--r--	3,164	compute_pe.cpp
-	rw-r--r--	1,624	compute_pe.h
-	rwxr-xr-x	5,345	compute_pe_atom.cpp
-	rwxr-xr-x	1,699	compute_pe_atom.h
-	rw-r--r--	8,993	compute_pressure.cpp
-	rw-r--r--	2,236	compute_pressure.h
-	rw-r--r--	47,084	compute_property_atom.cpp
-	rw-r--r--	3,464	compute_property_atom.h
-	rw-r--r--	25,183	compute_property_local.cpp
-	rw-r--r--	2,819	compute_property_local.h
-	rw-r--r--	4,806	compute_property_molecule.cpp
-	rw-r--r--	1,855	compute_property_molecule.h
-	rw-r--r--	9,064	compute_rdf.cpp
-	rw-r--r--	1,942	compute_rdf.h
-	rw-r--r--	20,598	compute_reduce.cpp
-	rw-r--r--	3,417	compute_reduce.h
-	rw-r--r--	7,849	compute_reduce_region.cpp
-	rw-r--r--	1,269	compute_reduce_region.h
-	rw-r--r--	10,266	compute_slice.cpp
-	rw-r--r--	2,581	compute_slice.h
-	rw-r--r--	8,435	compute_stress_atom.cpp
-	rw-r--r--	1,754	compute_stress_atom.h
-	rw-r--r--	3,597	compute_temp.cpp
-	rw-r--r--	1,325	compute_temp.h
-	rw-r--r--	5,995	compute_temp_com.cpp
-	rw-r--r--	1,526	compute_temp_com.h
-	rw-r--r--	8,687	compute_temp_deform.cpp
-	rw-r--r--	2,054	compute_temp_deform.h
-	rw-r--r--	7,285	compute_temp_partial.cpp
-	rw-r--r--	1,640	compute_temp_partial.h
-	rw-r--r--	13,471	compute_temp_profile.cpp
-	rw-r--r--	1,953	compute_temp_profile.h
-	rw-r--r--	8,766	compute_temp_ramp.cpp
-	rw-r--r--	1,741	compute_temp_ramp.h
-	rw-r--r--	7,048	compute_temp_region.cpp
-	rw-r--r--	1,600	compute_temp_region.h
-	rw-r--r--	9,528	compute_temp_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,999	compute_temp_sphere.h
-	rw-r--r--	5,169	compute_ti.cpp
-	rw-r--r--	1,879	compute_ti.h
-	rw-r--r--	16,273	create_atoms.cpp
-	rw-r--r--	2,314	create_atoms.h
-	rw-r--r--	3,599	create_box.cpp
-	rw-r--r--	1,728	create_box.h
-	rw-r--r--	11,344	delete_atoms.cpp
-	rw-r--r--	2,184	delete_atoms.h
-	rw-r--r--	19,347	delete_bonds.cpp
-	rw-r--r--	2,600	delete_bonds.h
-	rw-r--r--	7,627	dihedral.cpp
-	rw-r--r--	2,146	dihedral.h
-	rw-r--r--	7,186	displace_atoms.cpp
-	rw-r--r--	2,035	displace_atoms.h
-	rw-r--r--	46,310	domain.cpp
-	rw-r--r--	6,584	domain.h
-	rw-r--r--	21,562	dump.cpp
-	rw-r--r--	5,386	dump.h
-	rw-r--r--	12,406	dump_atom.cpp
-	rw-r--r--	2,289	dump_atom.h
-	rwxr-xr-x	7,810	dump_cfg.cpp
-	rwxr-xr-x	1,755	dump_cfg.h
-	rw-r--r--	72,690	dump_custom.cpp
-	rw-r--r--	8,551	dump_custom.h
-	rw-r--r--	10,081	dump_dcd.cpp
-	rw-r--r--	2,466	dump_dcd.h
-	rw-r--r--	33,629	dump_image.cpp
-	rw-r--r--	4,823	dump_image.h
-	rw-r--r--	13,172	dump_local.cpp
-	rw-r--r--	3,851	dump_local.h
-	rw-r--r--	4,125	dump_xyz.cpp
-	rw-r--r--	1,566	dump_xyz.h
-	rw-r--r--	5,401	error.cpp
-	rw-r--r--	1,161	error.h
-	rw-r--r--	22,312	finish.cpp
-	rw-r--r--	932	finish.h
-	rw-r--r--	5,019	fix.cpp
-	rw-r--r--	8,474	fix.h
-	rw-r--r--	11,405	fix_adapt.cpp
-	rw-r--r--	2,257	fix_adapt.h
-	rw-r--r--	10,860	fix_addforce.cpp
-	rw-r--r--	2,179	fix_addforce.h
-	rw-r--r--	14,150	fix_ave_atom.cpp
-	rw-r--r--	2,861	fix_ave_atom.h
-	rw-r--r--	18,710	fix_ave_correlate.cpp
-	rw-r--r--	3,119	fix_ave_correlate.h
-	rw-r--r--	33,912	fix_ave_histo.cpp
-	rw-r--r--	4,673	fix_ave_histo.h
-	rw-r--r--	41,182	fix_ave_spatial.cpp
-	rw-r--r--	4,332	fix_ave_spatial.h
-	rw-r--r--	30,166	fix_ave_time.cpp
-	rw-r--r--	3,819	fix_ave_time.h
-	rw-r--r--	8,788	fix_aveforce.cpp
-	rw-r--r--	1,786	fix_aveforce.h
-	rw-r--r--	29,966	fix_box_relax.cpp
-	rw-r--r--	5,183	fix_box_relax.h
-	rw-r--r--	36,518	fix_deform.cpp
-	rw-r--r--	3,871	fix_deform.h
-	rw-r--r--	14,901	fix_deposit.cpp
-	rw-r--r--	2,459	fix_deposit.h
-	rw-r--r--	3,956	fix_drag.cpp
-	rw-r--r--	1,424	fix_drag.h
-	rw-r--r--	6,126	fix_dt_reset.cpp
-	rw-r--r--	1,740	fix_dt_reset.h
-	rw-r--r--	6,740	fix_efield.cpp
-	rw-r--r--	1,685	fix_efield.h
-	rw-r--r--	3,513	fix_enforce2d.cpp
-	rw-r--r--	1,382	fix_enforce2d.h
-	rw-r--r--	11,424	fix_evaporate.cpp
-	rw-r--r--	1,913	fix_evaporate.h
-	rw-r--r--	3,193	fix_external.cpp
-	rw-r--r--	1,590	fix_external.h
-	rw-r--r--	10,048	fix_gravity.cpp
-	rw-r--r--	1,768	fix_gravity.h
-	rw-r--r--	4,541	fix_heat.cpp
-	rw-r--r--	1,558	fix_heat.h
-	rw-r--r--	15,836	fix_indent.cpp
-	rw-r--r--	2,083	fix_indent.h
-	rw-r--r--	26,286	fix_langevin.cpp
-	rw-r--r--	3,275	fix_langevin.h
-	rw-r--r--	2,929	fix_lineforce.cpp
-	rw-r--r--	1,336	fix_lineforce.h
-	rw-r--r--	6,717	fix_minimize.cpp
-	rw-r--r--	1,367	fix_minimize.h
-	rw-r--r--	4,209	fix_momentum.cpp
-	rw-r--r--	1,330	fix_momentum.h
-	rw-r--r--	31,249	fix_move.cpp
-	rw-r--r--	3,337	fix_move.h
-	rw-r--r--	68,060	fix_nh.cpp
-	rw-r--r--	7,972	fix_nh.h
-	rw-r--r--	3,469	fix_nh_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,135	fix_nh_sphere.h
-	rw-r--r--	2,029	fix_nph.cpp
-	rw-r--r--	1,049	fix_nph.h
-	rw-r--r--	2,075	fix_nph_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,121	fix_nph_sphere.h
-	rw-r--r--	2,027	fix_npt.cpp
-	rw-r--r--	1,046	fix_npt.h
-	rw-r--r--	2,073	fix_npt_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,118	fix_npt_sphere.h
-	rw-r--r--	4,519	fix_nve.cpp
-	rw-r--r--	1,452	fix_nve.h
-	rw-r--r--	6,000	fix_nve_limit.cpp
-	rw-r--r--	1,472	fix_nve_limit.h
-	rw-r--r--	2,420	fix_nve_noforce.cpp
-	rw-r--r--	1,352	fix_nve_noforce.h
-	rw-r--r--	5,231	fix_nve_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,565	fix_nve_sphere.h
-	rw-r--r--	1,472	fix_nvt.cpp
-	rw-r--r--	1,049	fix_nvt.h
-	rw-r--r--	4,075	fix_nvt_sllod.cpp
-	rw-r--r--	1,548	fix_nvt_sllod.h
-	rw-r--r--	1,518	fix_nvt_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,121	fix_nvt_sphere.h
-	rw-r--r--	16,810	fix_orient_fcc.cpp
-	rw-r--r--	3,801	fix_orient_fcc.h
-	rw-r--r--	2,943	fix_planeforce.cpp
-	rw-r--r--	1,342	fix_planeforce.h
-	rw-r--r--	16,323	fix_press_berendsen.cpp
-	rw-r--r--	3,467	fix_press_berendsen.h
-	rw-r--r--	4,091	fix_print.cpp
-	rw-r--r--	1,373	fix_print.h
-	rw-r--r--	3,745	fix_read_restart.cpp
-	rw-r--r--	1,244	fix_read_restart.h
-	rw-r--r--	5,440	fix_recenter.cpp
-	rw-r--r--	1,807	fix_recenter.h
-	rw-r--r--	3,449	fix_respa.cpp
-	rw-r--r--	1,242	fix_respa.h
-	rw-r--r--	17,014	fix_restrain.cpp
-	rw-r--r--	2,068	fix_restrain.h
-	rw-r--r--	67,088	fix_rigid.cpp
-	rw-r--r--	6,080	fix_rigid.h
-	rw-r--r--	8,773	fix_rigid_nve.cpp
-	rw-r--r--	1,100	fix_rigid_nve.h
-	rw-r--r--	20,558	fix_rigid_nvt.cpp
-	rw-r--r--	2,770	fix_rigid_nvt.h
-	rw-r--r--	9,682	fix_setforce.cpp
-	rw-r--r--	2,008	fix_setforce.h
-	rw-r--r--	76,898	fix_shake.cpp
-	rw-r--r--	7,418	fix_shake.h
-	rw-r--r--	9,745	fix_shear_history.cpp
-	rw-r--r--	2,058	fix_shear_history.h
-	rw-r--r--	8,911	fix_spring.cpp
-	rw-r--r--	1,864	fix_spring.h
-	rw-r--r--	3,956	fix_spring_rg.cpp
-	rw-r--r--	1,328	fix_spring_rg.h
-	rw-r--r--	9,048	fix_spring_self.cpp
-	rw-r--r--	1,781	fix_spring_self.h
-	rw-r--r--	3,901	fix_store_force.cpp
-	rw-r--r--	1,468	fix_store_force.h
-	rw-r--r--	35,812	fix_store_state.cpp
-	rw-r--r--	4,407	fix_store_state.h
-	rw-r--r--	6,636	fix_temp_berendsen.cpp
-	rw-r--r--	2,252	fix_temp_berendsen.h
-	rw-r--r--	6,718	fix_temp_rescale.cpp
-	rw-r--r--	2,269	fix_temp_rescale.h
-	rw-r--r--	10,723	fix_thermal_conductivity.cpp
-	rw-r--r--	2,037	fix_thermal_conductivity.h
-	rw-r--r--	16,318	fix_tmd.cpp
-	rw-r--r--	2,814	fix_tmd.h
-	rw-r--r--	22,836	fix_ttm.cpp
-	rw-r--r--	3,628	fix_ttm.h
-	rw-r--r--	9,706	fix_viscosity.cpp
-	rw-r--r--	2,041	fix_viscosity.h
-	rw-r--r--	3,702	fix_viscous.cpp
-	rw-r--r--	1,379	fix_viscous.h
-	rw-r--r--	9,306	fix_wall.cpp
-	rw-r--r--	2,253	fix_wall.h
-	rw-r--r--	2,058	fix_wall_harmonic.cpp
-	rw-r--r--	1,183	fix_wall_harmonic.h
-	rw-r--r--	2,634	fix_wall_lj126.cpp
-	rw-r--r--	1,203	fix_wall_lj126.h
-	rw-r--r--	2,702	fix_wall_lj93.cpp
-	rw-r--r--	1,197	fix_wall_lj93.h
-	rw-r--r--	7,215	fix_wall_reflect.cpp
-	rw-r--r--	2,058	fix_wall_reflect.h
-	rw-r--r--	10,589	fix_wall_region.cpp
-	rw-r--r--	2,181	fix_wall_region.h
-	rw-r--r--	21,241	force.cpp
-	rw-r--r--	5,201	force.h
-	rw-r--r--	43,709	group.cpp
-	rw-r--r--	3,869	group.h
-	rw-r--r--	56,696	image.cpp
-	rw-r--r--	4,430	image.h
-	rw-r--r--	7,447	improper.cpp
-	rw-r--r--	2,108	improper.h
-	rw-r--r--	40,788	input.cpp
-	rw-r--r--	9,154	input.h
-	rw-r--r--	4,958	integrate.cpp
-	rw-r--r--	1,793	integrate.h
-	rw-r--r--	20,896	irregular.cpp
-	rw-r--r--	3,607	irregular.h
-	rw-r--r--	5,905	kspace.cpp
-	rw-r--r--	3,123	kspace.h
-	rw-r--r--	20,496	lammps.cpp
-	rw-r--r--	4,840	lammps.h
-	rw-r--r--	19,447	lattice.cpp
-	rw-r--r--	3,540	lattice.h
-	rw-r--r--	13,937	library.cpp
-	rw-r--r--	1,511	library.h
-	rw-r--r--	3,552	lmptype.h
-	rw-r--r--	1,096	lmpwindows.h
-	rw-r--r--	1,097	main.cpp
-	rw-r--r--	1,218	math_const.h
-	rw-r--r--	18,159	math_extra.cpp
-	rwxr-xr-x	22,790	math_extra.h
-	rw-r--r--	2,622	memory.cpp
-	rw-r--r--	18,334	memory.h
-	rw-r--r--	23,674	min.cpp
-	rw-r--r--	4,841	min.h
-	rw-r--r--	5,369	min_cg.cpp
-	rw-r--r--	890	min_cg.h
-	rw-r--r--	7,755	min_fire.cpp
-	rw-r--r--	982	min_fire.h
-	rw-r--r--	58,927	min_hftn.cpp
-	rw-r--r--	5,120	min_hftn.h
-	rw-r--r--	27,796	min_linesearch.cpp
-	rw-r--r--	1,709	min_linesearch.h
-	rw-r--r--	6,805	min_quickmin.cpp
-	rw-r--r--	1,010	min_quickmin.h
-	rw-r--r--	3,042	min_sd.cpp
-	rw-r--r--	890	min_sd.h
-	rw-r--r--	2,095	minimize.cpp
-	rw-r--r--	1,419	minimize.h
-	rw-r--r--	37,493	modify.cpp
-	rw-r--r--	5,999	modify.h
-	rw-r--r--	12,888	neigh_bond.cpp
-	rw-r--r--	1,757	neigh_bond.h
-	rw-r--r--	14,405	neigh_derive.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_derive.h
-	rw-r--r--	14,943	neigh_full.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_full.h
-	rw-r--r--	17,259	neigh_gran.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_gran.h
-	rw-r--r--	10,237	neigh_half_bin.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_half_bin.h
-	rw-r--r--	11,337	neigh_half_multi.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_half_multi.h
-	rw-r--r--	6,081	neigh_half_nsq.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_half_nsq.h
-	rw-r--r--	8,569	neigh_list.cpp
-	rw-r--r--	4,144	neigh_list.h
-	rw-r--r--	5,408	neigh_request.cpp
-	rw-r--r--	2,992	neigh_request.h
-	rw-r--r--	28,711	neigh_respa.cpp
-	rw-r--r--	892	neigh_respa.h
-	rw-r--r--	14,207	neigh_stencil.cpp
-	rw-r--r--	62,754	neighbor.cpp
-	rw-r--r--	15,323	neighbor.h
-	rw-r--r--	25,814	output.cpp
-	rw-r--r--	5,642	output.h
-	rw-r--r--	23,648	pack.h
-	rw-r--r--	36,130	pair.cpp
-	rw-r--r--	9,186	pair.h
-	rw-r--r--	10,706	pair_beck.cpp
-	rw-r--r--	1,818	pair_beck.h
-	rw-r--r--	12,359	pair_born.cpp
-	rw-r--r--	1,896	pair_born.h
-	rw-r--r--	14,666	pair_born_coul_wolf.cpp
-	rw-r--r--	2,108	pair_born_coul_wolf.h
-	rw-r--r--	10,995	pair_buck.cpp
-	rw-r--r--	1,882	pair_buck.h
-	rw-r--r--	13,737	pair_buck_coul_cut.cpp
-	rw-r--r--	2,136	pair_buck_coul_cut.h
-	rw-r--r--	8,715	pair_coul_cut.cpp
-	rw-r--r--	1,863	pair_coul_cut.h
-	rw-r--r--	5,349	pair_coul_debye.cpp
-	rw-r--r--	1,405	pair_coul_debye.h
-	rw-r--r--	9,675	pair_coul_wolf.cpp
-	rw-r--r--	1,782	pair_coul_wolf.h
-	rw-r--r--	11,108	pair_dpd.cpp
-	rw-r--r--	2,093	pair_dpd.h
-	rw-r--r--	7,014	pair_dpd_tstat.cpp
-	rw-r--r--	1,467	pair_dpd_tstat.h
-	rw-r--r--	9,376	pair_gauss.cpp
-	rw-r--r--	1,849	pair_gauss.h
-	rw-r--r--	24,607	pair_hybrid.cpp
-	rw-r--r--	3,388	pair_hybrid.h
-	rw-r--r--	4,520	pair_hybrid_overlay.cpp
-	rw-r--r--	1,261	pair_hybrid_overlay.h
-	rw-r--r--	20,672	pair_lj96_cut.cpp
-	rw-r--r--	2,022	pair_lj96_cut.h
-	rw-r--r--	10,790	pair_lj_cubic.cpp
-	rw-r--r--	2,203	pair_lj_cubic.h
-	rw-r--r--	20,649	pair_lj_cut.cpp
-	rw-r--r--	2,045	pair_lj_cut.h
-	rw-r--r--	13,515	pair_lj_cut_coul_cut.cpp
-	rw-r--r--	2,001	pair_lj_cut_coul_cut.h
-	rw-r--r--	6,992	pair_lj_cut_coul_debye.cpp
-	rw-r--r--	1,488	pair_lj_cut_coul_debye.h
-	rw-r--r--	11,918	pair_lj_expand.cpp
-	rw-r--r--	1,745	pair_lj_expand.h
-	rw-r--r--	13,166	pair_lj_gromacs.cpp
-	rw-r--r--	1,860	pair_lj_gromacs.h
-	rw-r--r--	15,477	pair_lj_gromacs_coul_gromacs.cpp
-	rw-r--r--	2,171	pair_lj_gromacs_coul_gromacs.h
-	rw-r--r--	13,755	pair_lj_smooth.cpp
-	rw-r--r--	1,840	pair_lj_smooth.h
-	rw-r--r--	10,490	pair_lj_smooth_linear.cpp
-	rw-r--r--	1,791	pair_lj_smooth_linear.h
-	rw-r--r--	9,357	pair_morse.cpp
-	rw-r--r--	1,850	pair_morse.h
-	rw-r--r--	8,584	pair_soft.cpp
-	rw-r--r--	1,717	pair_soft.h
-	rw-r--r--	31,100	pair_table.cpp
-	rw-r--r--	3,895	pair_table.h
-	rw-r--r--	8,885	pair_yukawa.cpp
-	rw-r--r--	1,708	pair_yukawa.h
-	rw-r--r--	2,192	pointers.h
-	rw-r--r--	30,461	procmap.cpp
-	rw-r--r--	3,162	procmap.h
-	rw-r--r--	2,755	random_mars.cpp
-	rw-r--r--	1,152	random_mars.h
-	rw-r--r--	3,329	random_park.cpp
-	rw-r--r--	1,136	random_park.h
-	rw-r--r--	50,565	read_data.cpp
-	rw-r--r--	9,925	read_data.h
-	rw-r--r--	26,735	read_dump.cpp
-	rw-r--r--	2,903	read_dump.h
-	rw-r--r--	27,837	read_restart.cpp
-	rw-r--r--	4,322	read_restart.h
-	rw-r--r--	1,079	reader.cpp
-	rw-r--r--	1,237	reader.h
-	rw-r--r--	10,266	reader_native.cpp
-	rw-r--r--	1,449	reader_native.h
-	rw-r--r--	12,195	region.cpp
-	rw-r--r--	3,200	region.h
-	rw-r--r--	7,013	region_block.cpp
-	rw-r--r--	1,512	region_block.h
-	rw-r--r--	17,851	region_cone.cpp
-	rw-r--r--	1,755	region_cone.h
-	rw-r--r--	11,225	region_cylinder.cpp
-	rw-r--r--	1,561	region_cylinder.h
-	rw-r--r--	7,012	region_intersect.cpp
-	rw-r--r--	1,435	region_intersect.h
-	rw-r--r--	3,508	region_plane.cpp
-	rw-r--r--	1,330	region_plane.h
-	rw-r--r--	15,938	region_prism.cpp
-	rw-r--r--	2,309	region_prism.h
-	rw-r--r--	3,739	region_sphere.cpp
-	rw-r--r--	1,334	region_sphere.h
-	rw-r--r--	6,614	region_union.cpp
-	rw-r--r--	1,469	region_union.h
-	rw-r--r--	13,477	replicate.cpp
-	rw-r--r--	2,402	replicate.h
-	rw-r--r--	5,786	rerun.cpp
-	rw-r--r--	891	rerun.h
-	rw-r--r--	22,825	respa.cpp
-	rw-r--r--	3,721	respa.h
-	rw-r--r--	7,583	run.cpp
-	rw-r--r--	1,765	run.h
-	rw-r--r--	27,458	set.cpp
-	rw-r--r--	3,803	set.h
-	rw-r--r--	30,615	special.cpp
-	rw-r--r--	1,428	special.h
-	rw-r--r--	883	suffix.h
-	rw-r--r--	62,069	thermo.cpp
-	rw-r--r--	11,028	thermo.h
-	rw-r--r--	2,243	timer.cpp
-	rw-r--r--	1,088	timer.h
-	rw-r--r--	5,914	universe.cpp
-	rw-r--r--	2,141	universe.h
-	rw-r--r--	11,521	update.cpp
-	rw-r--r--	3,613	update.h
-	rw-r--r--	116,181	variable.cpp
-	rw-r--r--	9,142	variable.h
-	rw-r--r--	24,483	velocity.cpp
-	rw-r--r--	3,530	velocity.h
-	rw-r--r--	11,072	verlet.cpp
-	rw-r--r--	1,394	verlet.h
-	rw-r--r--	37	version.h
-	rw-r--r--	15,887	write_restart.cpp
-	rw-r--r--	1,919	write_restart.h