File: deca-ala.psf

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lammps 20210122~gita77bb%2Bds1-2
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PSF

       6 !NTITLE
 REMARKS original generated structure x-plor psf file
 REMARKS 2 patches were applied to the molecule.
 REMARKS topology top_all22_prot.rtf 
 REMARKS segment DAL { first NTER; last CTER; auto angles dihedrals }
 REMARKS defaultpatch NTER DAL:1  
 REMARKS defaultpatch CTER DAL:10  

     103 !NATOM
       1 DAL  1    ALA  N    NH3   -0.300000       14.0070           0
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       3 DAL  1    ALA  HT2  HC     0.330000        1.0080           0
       4 DAL  1    ALA  HT3  HC     0.330000        1.0080           0
       5 DAL  1    ALA  CA   CT1    0.210000       12.0110           0
       6 DAL  1    ALA  HA   HB     0.100000        1.0080           0
       7 DAL  1    ALA  CB   CT3   -0.270000       12.0110           0
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      13 DAL  2    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
      14 DAL  2    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      15 DAL  2    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
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      17 DAL  2    ALA  CB   CT3   -0.270000       12.0110           0
      18 DAL  2    ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
      19 DAL  2    ALA  HB2  HA     0.090000        1.0080           0
      20 DAL  2    ALA  HB3  HA     0.090000        1.0080           0
      21 DAL  2    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
      22 DAL  2    ALA  O    O     -0.510000       15.9990           0
      23 DAL  3    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
      24 DAL  3    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      25 DAL  3    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
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      31 DAL  3    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
      32 DAL  3    ALA  O    O     -0.510000       15.9990           0
      33 DAL  4    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
      34 DAL  4    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      35 DAL  4    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
      36 DAL  4    ALA  HA   HB     0.090000        1.0080           0
      37 DAL  4    ALA  CB   CT3   -0.270000       12.0110           0
      38 DAL  4    ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
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      41 DAL  4    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
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      43 DAL  5    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
      44 DAL  5    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      45 DAL  5    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
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      47 DAL  5    ALA  CB   CT3   -0.270000       12.0110           0
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      50 DAL  5    ALA  HB3  HA     0.090000        1.0080           0
      51 DAL  5    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
      52 DAL  5    ALA  O    O     -0.510000       15.9990           0
      53 DAL  6    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
      54 DAL  6    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      55 DAL  6    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
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      58 DAL  6    ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
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      63 DAL  7    ALA  N    NH1   -0.470000       14.0070           0
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      74 DAL  8    ALA  HN   H      0.310000        1.0080           0
      75 DAL  8    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
      76 DAL  8    ALA  HA   HB     0.090000        1.0080           0
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      78 DAL  8    ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
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      80 DAL  8    ALA  HB3  HA     0.090000        1.0080           0
      81 DAL  8    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
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      85 DAL  9    ALA  CA   CT1    0.070000       12.0110           0
      86 DAL  9    ALA  HA   HB     0.090000        1.0080           0
      87 DAL  9    ALA  CB   CT3   -0.270000       12.0110           0
      88 DAL  9    ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
      89 DAL  9    ALA  HB2  HA     0.090000        1.0080           0
      90 DAL  9    ALA  HB3  HA     0.090000        1.0080           0
      91 DAL  9    ALA  C    C      0.510000       12.0110           0
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     101 DAL  10   ALA  HB1  HA     0.090000        1.0080           0
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     103 DAL  10   ALA  HB3  HA     0.090000        1.0080           0

     102 !NBOND: bonds
       1       5       2       1       3       1       4       1
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       7      10      11       5      11      13      12      11
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     100     102     100     103

     183 !NTHETA: angles
       1       5       6       1       5      11       2       1       5
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     249 !NPHI: dihedrals
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      19 !NIMPHI: impropers
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