1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
|
# This DNA seeding scheme reduces run time and memory use, by only
# seeking seeds at ~1/8 of positions in each sequence.
#lastal -m2
R A G
Y C T
RRRRRRRY
RRYRRRYY
RYRRRRYR
RYRRRRYY
RYRRRYRY
YRRRRRRY
YRRRRRYR
YRRRRRYY
YRRRYRRY
YRRYRRYR
YRRYRRYY
YRYRRRYY
YRYRRYRY
YRYRRYYR
YRYRRYYY
YRYRYRYY
YYRRRRYR
YYRRRRYY
YYRRRYRY
YYRRRYYR
YYRRRYYY
YYRRYRYR
YYRRYRYY
YYRRYYRY
YYRRYYYR
YYRRYYYY
YYRYRYYR
YYRYRYYY
YYRYYRYY
YYYRYYYR
YYYRYYYY
YYYYYYYR
|
