1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
|
<?xml version="1.0" encoding="ISO-8859-1"?>
<game>
<!-- Curational annotations from Apollo -->
<!-- Analysis of: 3R -->
<!-- Saved on Thu Sep 15 20:18:28 GMT 2005 -->
<!-- Apollo version: Apollo Genome Annotation and Curation Tool, version 1.5.5 dev, last updated 2005-09-15 13:07 2005, /users/sima/apollo/src/java/apollo/editor/AnnotationEditor.java -->
<seq id="3R-frag" length="13374" focus="true">
<name>3R-frag</name>
<organism>Drosophila melanogaster</organism>
<residues>
TCATTGCTAACGTATTTCAACCCATAATGGTATATCAAGGCAGCGAGGAC
TGCGACTTCATAAATTTCTATCGGGAAACCGCAGAAGCCATCAAGTCTCA
GGACGCGATGTATGAAAACGGGGAAATTCAGAGAAGAATTGACACAATAT
TACCAATTCTTGATGCCAAGGGATTTTTGGAGGCCCATTGAAATAACATA
TATTAAATAATCCGTTTATCAGCTATGAATAATAATAATTTTGAGCTTTA
ACCAAAAATGACAAGCCTTTTTCAGAGGACACGTTATGCAAATTGCTAAA
TTCGGATTATATTTAAGCACGGATACACACAATTAAGCCTGAGGATTGTG
TATTTGCAAAACAGTAAAATGTTAGAAACGATAATGACTAGACAGACCTC
AAACAGTTACCTAGGGGAATGACTTGACATGGTAGAATGTGACATTTCAC
GATGACCTCGTATTATAGTGAAATCACTCTGAGATCTGAGATAGCACAAC
AAAAGCCATTGAGACATCTACACAATAATAATAATAATAGTATTATTATT
AATGATCTCACAACCGTGAGCAACCGAGCTAAGTCGCCAAAAGATCGAGG
AACCGCACCACGTATGGAAATCACCTGGATAAGACTTATTATTAATGCAG
GAAAGGCCAGCTATTGAAATCTGGACCAAGCCGTCGATCGGGAAAACTAT
TAATTCGTGAGCTGATACAAATTTTGACTATCAGCGCTGGAACGTTACAG
AAGAGACCTTGAAGCAGGCCCTTCCCGAAGACGTTCCTATGGCGGAGGCT
ATCTTTGGGAATAGCCATACGTGCGGAAAATGGACAGATCGATCTGGTAA
GTAGATCTGTCTTCCGTAGAAGGAACTGCTAGTGGAAGCCGGGCTGGGCG
GAAAGCAAGTTGAATATGCCATGGACCAAGATCCAGAAGCTCCATAATTC
TGGAGGATCTTGTGCCGTATAAGTTCATCAATGCAATGCAGTAGCTGGAC
TTGGTTTACATCAAGCTCACTCCGAAAATGCCAGCAATGTGCCATGCTGC
CTCCATAATCCTGTGAGGCGGATATAAGAGGTTCATTGATGAACAACCGA
ACATAAATAAGCCAATGACAACAAATTGGGGAAGTACCCACATAGTAAAT
GTGGAGTGGGGGGGACCAGTTATGGCCACTTTCAGTTCAGCACCTTCGCG
TTGATAAGAAACTCGAAGTTTGCTCTAAAAGTGAACTCTAACAAGTTACA
AAGGAGCTAAAAAGACCAAAACCTCTGAAGTCTTCACTAAAAGACTCCTG
AAGTTTTCGCAATCAGGTTTCGGTTTATGCCAGTGAACTTGTTAAAGATG
ATTTTTTTAATTTTGCAGTGTTAAATCCAGATACTAATATAAATATTTAT
AACTAGATCAATTCTAAAAAGACATTTTGGATGTTTGGTGCAGTATGTTT
CTATTGCGGTGTTCATTAATTTTCATGTCCGCATTTAGAGTACGATCCCC
GAGATGGCTTGTTTTGCAAATAAGTTTTTGTAGAGCACTGCAAAGATAAG
CTATCAGCAGGCACCACATTATTTTAAAATATCATAATATCTCTTTCGTC
ATTTTGGTATCACTTTTAGCGAGGTATGATAAAATGTCATCATAGGCTAT
ACTGTTAAGATAGAACTTTATTTTGTATGACTCAAATTTCCAGGCACACG
CAATTTTTTAACATCCCCTCGACCAATGTGCGAAGCTTTTCCACCCCTAG
TTTCGGTGATAAGAAAGCTCTGCACAGCTGACGGCCCAAAATCCAAAACA
AACTCGAAGCGCGGGCCCACGGCCTGTTGACCAAGTGCGATGCCTTCAGT
CGCAACTTTTGTGCCACGCGGCGTATACGCAACGCGCCCCGGCAAACAGC
AAATCAGGCGGATATATCGGCGGGACTAGGGTATATAAGCAGGAGATGCG
CACCAAAAGCCAACAGATGGTCGCTGACTGTGCACGCGTGTGGTTATCGG
AGATCAGTAAACAGCCCAACTAAACACCGAAACTTACTGTAATAAAAAAA
AACGGGAAATAAGCGAAATAATCAAAATGCGGCCGCATACTTATTTATAA
TTTTGAGGCGGCCGAGCACCGGGGCCCCAAACTCTTTGGATCTGCACGGA
ATCCAGAATTCCGAGAGGTATGCCATCGACGCAGTGTTTTGTGTTTGTTT
TCCCACAATGTGCCGTCATTAAAAAGCTGAAGTGTGAGGATTTCGCACGG
AGCCTCGACATTTACGACCATTTTTCCCTGATGCGAAGTGGTCCGCGGAA
ATTCGCTAATTGTCCGCCGGACGCTCCGCAGTTGTCGGTATTTATTATGA
TTATTTTTTCCGAACGCGCTCCAATGAATCTGGACTGCAAGTTGTGAATA
TTTCGAAAAAAAAAAATATTATTCCGCGCGAGTCTTTCGGGATAACAAAT
CTTTCGAGTCCGTAATGCCAAGTGAAGTGCGTGGGCAAAAATTATTTTTT
AAGAAAAATGCAGGACAGTTGGTGTCCTCGTTCGATGGAAAATTAATGAA
TGTGTATTTTGCGTAATGAGATGTAAATGCCTGCTACACTTCAACAAAAA
ATACAACCAAAATGTCATTTACTTAATGGGATTATTAATGGACTCTGAAT
TAAGAAGCGGATTTCTCGGCACATGTCGAAAAAAGTTCGAATATTTCAGC
AATAATGATTATAATGACATGAAGAATTAACCATCTAGAGCCAAACAAAT
TGTGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAATTAAGACAGAGCA
CTTATTTCTTTACTTCTTCGAGCTCTGATTAAATAAATATACTTTATTAG
GTCCGATTACAACATATGTTTCTCGGTGTTCAGTAATTTATGCCTATCGA
TTGGAAACGAAATTAATAAATTGGAATAAAAAGCCCATTTCGTCGGACAA
AATTTACATAAAAATTCTTCATTGGGTCTATTGATAACATTTTATTGAGA
GACGTTTAAATTCTATAAATGAAATTTTATGCAGTGAAACTTCACTTAAA
ATAAACATGTATTTAAAAAATGTTATCCTTAATGTGATTTTCAAGCTAGG
GCTATAGAGCTTAGGAAATGTATACAGTATATATTCATCTAGCATGAAGT
GTTTTGTTAATGTTAAATGATGTTTTTATGACATGAAGTCAATTTAAAGT
TTAAGGTTTTACCGCCCAACTGAGCATGACTTGAACGTCCTCAAAGTGCG
CCAGAATCTGGAAAATGTTCCAAAAGTTATGCATACCAATGGATGCGAAG
CTGGAACCCCCATGGTACTTAAAAAGTGCAACTATCTTGTGCAAACTTTT
AGCTTCAGGCCCGTGTGCCTGCTGCCTAAAGGATTAAGCTGTGTCAGAAA
CTCTGCGCAATTTTATGAATTTTTGGTGCACTTTAATTAAGTCGATTATG
CTGGCAACCAGATTGTCCAGATTAAATGCTATGTGCATCGGACCCCTTGA
ACGAAAGCATCCATTAGCTGAATTGTTATCATTTCTTTTAATTTCAAGAG
CAAAAACACAAAGCGAAGTCCCGTGAGTGCATTCCAAGTTGAAAACTAAG
TGAGCAACTGCTGCTTTGGCAGCCGGAAAAACAGAGATTCACTCGTGTCA
CTCGCAGAAGGAAAAACAAGAACCGACGGCCAGGAAAACAATACGGTACC
ACGCACTATAGTAAATATATAGCATACATATCCCCAGGGCGAAGGAGATT
GCCAGGACGATGGTGAGTGTAATTGCAATATAAATACTTAAAGCCAGCTC
AAGAAGCCATTTCGAAGTAGATGTCAAATGGAACGAAATTACTTTGTTCC
CAAAATGAAAAAGTTTGTTTGAGTTGCTTTGGGGGAATGGGTTGTGCTCT
ACGTTGGCCATATGGTTGTGTGAGCTCCCACTTCGTTGGCATTTGCAGAG
TGCCTCGCCAGATGGAGAACCATACAAATTTCAAAATAATGCTCCCTCCT
GGCGGCCAATTTAAAAACTCGGGTAAGGCTTAAAAGTCATGGAGAGCTAT
ATCAATTTACCTGGTTACACATTCGCTTGACATTTTCGTGGTCGGGACTT
TTACTAGGGGCTTTTATTTTTATCCCAACACCCTGTGGCTTTCCTTTGAC
ACCAAAGAAGTGTTAAGCGGCACACAGAACATGATTAAATTGCAAGGGAC
TTAGACAAATGGCTAGAATTTGCGTTCAGCCTTTAGGCAGCTTAGCCTAT
TAGTTCCCTAGAAACCCAGTTTGGCTCTGTGCCAGATGCCTCCGCTTAAG
CATAGCTCTTTCCCTACAAGTGAATGATTTGGAGTTGACCAGCCGCACAG
ATGAGGCCAATTCAAGCTGCATCCCACCTCCATCTTGTTGAAACTAAATC
GACTTCAATTAATAAGGAAAACGTCCATCCGCAAACAAAACACACAAGCA
GCAATAAAATTCATCTTATAGTGGGCGAAACAAGAGACCCACCGCAAATA
AATCACAAAAATAGCTGACTAGAAGTGCCAGCAGCTTGGAATCCGCACGA
GCTTCCCGGAAAACGGATGACATTTAAAATCTTTGTCATGCTTTACTTAT
CCAGTGAAGCAAAAATACTTCAGGCACTCGGAATGCAAAAATTATTCCAA
TTTTGTGACAACTGCCGATTACTTGAGGCTGCTTTACATAATTTTCCCCA
CACAAACTTCCTTTCTGCTTCCAAACTGAGAAGGCAGCTGCGCAGGGATT
TCCCCTTTTGCTTTGGGGAACAGAACATGTAAATTCAATTTTCACCTTGC
AAGTCAATCTATCGAAGGCGTTGTTGTTTTGGGCTGTGATTGGAACTTTT
GCGACCAATTGGTGATCAACTTCGAACAGTGTTTTATGCTCCGTTTTCCT
TGGCTGAAAATTTCCATTAGGTCCTTGCCCGAAGCGGAAGGAGAATCCCA
CTTTGCAGACTGGCCAGTTTGCGGTCGACAGACTTTTTCATTTCGGACTC
CCATGTTTGAGTTGAAGTGCAAATATTAGTCAATTAGGAGCCGGCCAACA
TGAAATTAAATTTCCATGGAAACTTGCTCTTCGCCTCGATACCCAATGCC
CGACACCCGATGCCCCGAAATCCCCACACCCTATCCGGTATCTGGCGAGC
TAATTCCCCGATTGGCGAGATTTATTAGCGCCTCATTTATCGCAGCTGTC
AGGGGCACATAATGCATACCTTTGGGCGCCACTATAAGTCTGTTTCGCCC
ACCTTCGAGTGAGGCATCGGATTTTATCGATACTGACAAGTGCGCAGCTC
AGATGGCGCATAAAATTACACAATTATTTTTAGCAAATGTCGTCATTTAT
AACCTGCCTGTTTCTGTTTCTGTTTGTGTATCTGTATCTGGATATGGGTC
TGACGGCTGTCCCTCGACACCGGAATATCTTGATCTGGCAACAAATACCA
GGCATCAAAATCAAACGCACATTTCCCCGGAGGAAACGGCACTTTTGACT
TTTTCCAATTAAATGCATGTCTCGCCTTGATGTGCTGCATAAATTACGGC
GACGGGTAATGCATGAATATTTACGAGGGAAAACAACCGACTAACTGAAG
CTCGGCACTGGGATATTGCATAAATTGACTACAAATGGGAAGATATTTTT
CGAAAAAAGGGACTTTCGAAACTTGAAAACAAAGCGAATTACTTTTCCTT
GCCAAAGTTATCCTGTAGCAGATAATTTCAGAGTCGAGTTGATTCGAGTC
CCAGGAGTCAAGGCCATTGTCTGTGTTCAGAAGGGTATTAACAGGCGAAT
GCCAAGGGCGTTTGAAGTTTTATCAAGCCTCGAGATCTGAATTCAATTAT
TAAAATGGCTCACTGGGAAATGGATTTAGCAAGAAGATGAGGCGATAAGC
ACTATGATTTTACATTGACATAGATAGTTCTCTAATCGCATTTTAGCTTT
TAGACTTTTGTCAAGTGTCCAACAACAAACTTAACTTAAAATGTATACAA
CCATTGTATCTATCCGTTTGTCTATTTACCAATTTTTATTTAAAGTTTTG
AAAGATTTTCTTGAATCTTTTGAACAGAAAACCACTTTAATCTAATAGCA
ATACATTTGATGCAATTGCATCCTTAACAATGTAATTTAATAGGACTTAA
ATGGTATAATAATTATGATTTAGTTAATACCCCAAAAGCTTTTAAAATAA
TGAACGTATGACGTAAGGTTACACTGGCGTAAGGTTACACTGTTTTTCTC
CCAGTGTCTGCAAATAAGTGAGAGAGTGAGGCGTCAGAACTTTCATGCAT
GTCGTATGCCCATAGAATCCTTTGGTGCTGGGCCACCTACTGGCACCAAA
CAAACTTTTTATACGATTATTGCCCCGTATTTCAAGCCACAAAGCATTAA
GCAAGCCAGTGGAATTTGCCATTCGCAGCTCGCTAGAAAGTGTGGTGTGT
GCAGCAAGCCAATCTCATAAATCATACGTGATGTGGCACGCAAAGTTGCT
GCTTCCTTGCCCCCTGACAATTGAATATTTCGTGCCGCGGATTTGGGAAA
TAATGAGACCCTGTTTGCCTCCTTCGTTCCCTAGATAATCAGCATGAATC
AGACGGAGCCCGCCCAGCTGGCAGATGGGGAGCATCTGAGTGGATACGCC
AGCAGCAGCAACAGCGTGCGCTATCTGGACGACCGGCATCCGCTGGACTA
CCTTGACCTGGGCACGGTGCACGCCCTCAACACCACTGCCATCAACACCT
CGGATCTGAATGAGACTGGGAGCAGGCCGCTGGACCCGGTGCTTATCGAT
AGGTTCCTGAGCAACAGGGCGGTGGACAGCCCCTGGTACCACATGCTCAT
CAGCATGTACGGCGTGCTAATCGTCTTCGGCGCCCTAGGCAACACCCTGG
TTGTTATAGCCGTCATCCGGAAGCCCATCATGCGCACTGCTCGCAATCTG
TTCATCCTCAACCTGGCCATATCGGGTGAGTTGCCATTCCCACTGAGAGC
CAAAGCAAGTGTGAGTCTCATCCGAGCGGACTTTCAGACCTACTTTTATG
CCTAGTCACCATGCCGCTGACCTTGATGGAGATCCTGTCCAAGTACTGGC
CCTACGGCTCCTGCTCCATCCTGTGCAAAACGATTGCCATGCTGCAGGCA
CTTTGTATTTTCGTGTCGACAATATCCATAACGGCCATTGCCTTCGACAG
ATATCAGGTTAGTCGCTACTCGAGCCTTTTTTAATGCCAACGTTAGTATG
TAAATGGGGCCATCAATGGGGCAAATCGTGTTCGGATATTAATGAGGTGA
ATACCTTCAATGTGTAACCATTAAATTTGACGTTGAGGGAAAATCGATGG
GCTCTCAGTAAATATTTGGCGATTACATAAGGGCTTAACCCACGATTAAA
CCTATTTTTATGGTGTCGAAACAAAGACCATTAAAAAGGGTTGATGGATT
ATAAACAGAAGGATTATTAGGTATTGATTATAAATAGCCGGACTGTTCTG
GGGTAAAGTAGAGAAGTAGGACGCATATAAATTAATCCGATTTTTTTAAT
CAATTTAAGGCGAGTGGCCAGTTGACTTAAAGAAAGACTTATAAGTTAGC
TTTAATATAATGTTTTTGGTGATTAAAGAATAGTAATTGCACGGTTAGAG
AAACCAAACCTAATTGTACGTCACACTCTTATAGCAATCGATTAAAAATT
ATATTTGCTTATAAATTCCCAGTTGAAGATGTATTTTCACTAAGTATAAT
TTACAGTGCGAATGGGTAATAAGACTCCAAGCCCTGAGATATAACAACCG
TCTAACCTCACTTCCAGGTGATCGTGTACCCCACGCGGGACAGCCTGCAG
TTCGTGGGCGCGGTGACGATCCTGGCGGGGATCTGGGCACTGGCACTGCT
GCTGGCCTCGCCGCTGTTCGTCTACAAGGAGCTGATCAACACAGACACGC
CGGCACTCCTGCAGCAGATCGGCCTGCAGGACACGATCCCGTACTGCATT
GAGGACTGGCCAAGTCGCAACGGGCGCTTCTACTACTCGATCTTCTCGCT
GTGCGTACAATACCTGGTGCCCATCCTGATCGTCTCGGTGGCATACTTCG
GGATCTACAACAAGCTGAAGAGCCGCATCACCGTGGTGGCTGTGCAGGCG
TCCTCCGCTCAGCGGAAGGTGGAGCGGGGGCGGCGGATGAAGCGCACCAA
CTGCCTACTGATCAGCATCGCCATCATCTTTGGCGTTTCTTGGCTGCCGC
TGAACTTTTTCAACCTGTACGCGGACATGGAGCGCTCGCCGGTCACTCAG
AGCATGCTAGTCCGCTACGCCATCTGCCACATGATCGGCATGAGCTCCGC
CTGCTCCAACCCGTTGCTCTACGGCTGGCTCAACGACAACTTCCGTAAAG
AATTTCAAGAACTGCTCTGCCGTTGCTCAGACACTAATGTTGCTCTTAAC
GGTCACACGACAGGCTGCAACGTCCAGGCGGCGGCGCGCAGGCGTCGCAA
GTTGGGCGCCGAACTCTCCAAAGGCGAACTCAAGCTGCTGGGGCCAGGCG
GCGCCCAGAGCGGTACCGCCGGCGGGGAAGGCGGTCTGGCGGCCACCGAC
TTCATGACCGGCCACCACGAGGGCGGACTGCGCAGCGCCATAACCGAGTC
GGTGGCCCTCACGGACCACAACCCCGTGCCCTCGGAGGTCACCAAGCTGA
TGCCGCGGTAAAGCACAGGGTAGTCCTAAGGTCCTTGAGGTCTGGTCTCG
TGTCTAAGTCCTCATGATACACGCGTGCATGTCCTTTTGTACGCCCTCGG
GCTGATTGGATTTGCATGCTCCAAACGTCGCTGCTGCTCGCTTTACGTTT
CACTTGTTCCAACTGCAACTGCCACCTCTCTAGAACACTGAGCGAAATGC
CGTGTCCTCTAATCGGGAAACACTCTGGCTGTAAAATCTATAAGCAGCCG
AGTCAAACGTTTCTAGCGTTCTAAAAGTTTCTTATGATTATTTTATTTTA
TATATTAATAACAATGACTTCGTTCCCAATTATATGCTTGTTTTCATCGT
TTTTGAATGTAACAATTGATCAATATTCGACCAAAAGCAAGTTTTGAAAT
ATTTGTGTAAATATCGTTTTCAAATTTGTTCGCCTTAATCTTACTTAATA
ATAATAATAATAATAATCTTTACTCCGATAATCATTAACGTAACATTTCT
ACTTGTAAAAATATTTCTGATCTAAGGGGCTTGCTCTTTTCGGCTCCACC
TTGAATTACTTTTCAGTTGACTAACTAGGCGTATATTTTTGTCAGTGTAT
GCATGCGCTCCTCTTATCGTTGCCTTGTCGAGCTGTAACTCTTGTTGTTG
CCATGTTGTGACATTATTTGCTTTTGAGCTGCAATCGATTATGACCCGTC
TTTTGTGACACATTTTCAGTTTGGAACAGTACTAAATTGGCAATCAATCC
TGGAGCAGCAGGCGGCTGGAGCAGCATTCTAGGGAGGCGACTGCCTGTCA
CCCATAGACTTAACACGTATTGTCCAGTGATCCAAAGCCAAGCTGAGTTA
GCCCTAAGTTAAGACACACGCGACTAAGAGCTCGAAGCCTGTAAACTATT
CTTAAACGACCATGTCATGGCATCCATCATCAACTCGGACTAAGTCTATG
GTTAGATCACTTTCGTATCAAATGCCGAAAAGTAATTGAATGAGCCCCCA
ATTAGATTTCGGGTATTTGATAAGTCGAATACGCCTAAGACTCGAATAAG
TTCTCTCAACAGTTCCTAGGAAATATTTTCGTTTTATCTCAGCATTTCTT
GGTATCATCTAAGCTAAGGATTAGCTATAATTGATGTTCTGTTCGCTATT
CAATAATGATAGGATAGGTCGAAGTCCACTAAGCCAAAGTGAATTTAAAG
TATAGTATAGTATAAAGTATAATTGTAAAAGATAACTTTAAAATAAATGT
CAGCTGCTCTTAAACATTTAATGCAACTGTTTTAATGTCTGCAATGGGTG
AAGATTGCAACACACCGAAATAAAAATCGTAATAAATGTTGCTGGAAAGC
CTTCATTATAGAACGTTTTCACTGTAAATGCTCATGTTTGGATAAAGTGC
CAATAAGAGAAGCCTCTTGTATTTCAATAAATGAGCAACTTTAAGAGCTT
CCAAAGTCCGAAGCTTCAGAATGTTTATTTTTCTTACACAAATGAAGTGG
CACTTTGGAATAAATATGTATCAAGAATTAAGCATGGTAAGTTATCTAAG
AGTTCTGTATAGGTATAAAGTATGTAAGGTGTGTAAATTGAAATATATTT
TTACTCTTTAAAGATATTTTAACACAATTGAAATGATTCTCGAGGAAGTG
AGCCAAAAAAAAGATACACCGTATCTGGAAGCCTAACAACCACAGCAATA
AACAGCAGCTGACCCGCCGAACACTTAACTTTTAAGACTTTTGTGGGTTC
GACACTCAAGCAGCTGCAGCATAAAAACCTACGACCCATAAAAATAGCGC
ATGAGTATGTACGACACAGTTTGAGAACCAGACTACTTATACATTTAGGA
TATATACTTGTGAAACACTGCTTTGGAAGAGCTAAGAATCCAACTAGCAT
AACCATTGAAACTTAAATACGCATTACAATTAAGATAGTTTTATGTTCGC
TATGATTAAGTCATTAGCAGATGTGGTAAGGCTCTCTGGATGAGCGACAG
GTATGCTAAATTAGTGTATGATTAAATTTCAATTTGGGTAAAAGCTCCTT
CGTGGTCGGTCACAATCTCCTCAAAGTCGCAGGTGGGTTCATAGTTCGGC
GACGTGTGACACAAATGTGACCGGTGGCGAGTGAATTGTGGATCATAGCT
GAAAAGAGAAATGTTCCCACCAGGCACCGACAGCGTGAAAATAAAGCAAA
AAACAAAATAAACTAATTAAAAATTTCGTTGGGAATGAGTGATGCGACAG
GTGAGGCCTCATCACCTCACCTGTTTCTGGCTGCTGTAAAACTGTCAACG
GTTTGTTTTGACGGCTCGTAACGGCCTTTTGCACTCGAGCTCGTGAAAGT
GTTTACCTTATTTTTTGTCACACTCAGCCGGCTCCACACCATCAACTCCC
ATTCCCAAACCCCCTGGTCAACACCATCATCGCCATCCTCTCTACGGAGC
GCTGATTACGCAGACCCATCTCACTTTCTTCTCATGCAGATTGCGCAATG
CTGACAAAAGCATTCTGGGTGTGTGCGAGTATCGCCAAGCATCTAGAGTT
AACCAAACTTGCCGGCATCGACATTTTTCGAAGCCGGCGTGAGCATATTT
ATGAGTAAAAGTGGAATTAATGATTGGAATAAAATTCAAAGCAAAGGTTT
GCAAATATTTGCGGCAGGCCGAGACCCCCTCCGCATACCAATCGATCGGA
TTCAGACTCATACTTGGATTGAGGGGAGATGTAACGTAATATATGGATGG
GTTCAAGGCACCTAAGACTTTGCATCCCGCTGCCGTTGGACACATGTCAA
TCGAAAATGGTAGAGGATGCCTGGCTTTCTTTGACATCTTTGGCGGCTCT
TTAATAGGTGCTAAATGAATTCGCAACGAACACTTTCACAGGGGATGACC
AAAATGGGTGATACTCGCAGTCAATTGTTCAGCCTTTTCTCGGGCAAAGA
AGTTGGCCCCGATTTGCGTTGGGCTTTTAGAAAACATTGCTCTGACCATT
GTAACATTGAGAGTGCTTATTGATTTTGCGGTCTCATAAACTGGCTTTCA
TTTCGTTTTGGCTTTTGAGCTTCCCAGTGGTTCAGTGGTTCGTCGGCTTT
GTGGTTTGATGGTTTGATGATAGGGAGCGGAGTGTTTCCGCTCGTTAGCC
ACAAGTCAATGGCAAAGTTTGTCACCAGAAATTAATATCAATGTGACGCT
CAGTTGGCCAATTCTAAACGACGACTTTCCCATGCGTAAACCGGCCCACA
AAACCCGTTCACAGATCAAACGGCGACAATTTATAAATAAGTGAAAATCT
GCTTACAATGTACGCAGCAAAACTAGTTCAGCTTAAATATTTATAGAAAT
CGAAAATGCTCGGCAGATGTGCACAACTGCATTTTCCCCCTATGTTCGGA
ATCCCTAAGCCTCTAATCCCCATGACGACAACATGTGCATTTCAAAGATA
ACATATATTTCAGTAGATATCATTGGGTCTGCGAAAAGACCGCAGTATAT
ATATAGCAAATAGAAAGATACAGCCTGGAAGGTTTACTTTTTCAAATCAG
TCAAGCATGGTTTTTTCGATTCCTGAAACCCAAAAGCCCAATACAATATG
ACAGCCATTAGGGGTAACATTTAAGTTTGCCATCGAAACTGTTGCAAAGG
ACTCCTGGAACAAGAAACTCTGTATACAGCCGAAATATATTCGTATATCA
GTATATGTATGTATATATATCCGTATATATTTATTTATCTTATTCAATCA
TTAGTTTGGATTATAATTTCCGTTTTTAAAATCTCTTTCAAAATAATTTA
TATTCAAAAAGAGCTAATGCTTCGCATTGATTTTAAATTTGAATGGATAC
TGTTTATCTTCATTTAAAGTTATTAAATTTCTTAGCCATTTGCAATATTA
ATTATTTTAATCGAGTGCAAATGGCGTGAGGACCTCAGTATATCAAAAGT
TTAACCGCTTCTGGCGTGGAAAAACACAAGAAACAAATTGTAAGAAATTA
AATAAAGTTTGCGGCAACTCTTGGCCAAGTTTTTCAACAGAGGTCAGCTT
GCTTCCCTCGCAGGGCCAACAAAATCGAAAGTTCGACTAAGACGGCGACT
GACTAACTAAGTGACCGCTTTCCGTTAGCATATGGTGACTATTATTCGCG
CCATGACTTGACTTATTTTTATAGCTTTGTATTATTTATTTATATTCACA
TGCAAAATTGACATGCAGTTTCGCTGCGACGTTGTAGTTTGCAGTTTTAA
TTATTTTTTGGCCGCAGAGGAGCCGTTTTCATTAGCGACTAATTTTCCGT
GTAGGAGAGAAAATGGATGATGGTCACTGATGAGGCACTGAGATTTCTTT
TGAAACATAGAAAATTATGTTTTAGCGCACAATTAGGATTATTCTTAAAC
TTACACATCTTTATTTTCACACTCTTACTCTTACTAATTTGAACTTAAAA
TAAACCTTATATGAAATATAGATGACGAGCGGCAGCACTTTCCCATTTTT
TTCCGTGTAGTGATCTACCACAGCAGCTGTTGAGTTCAGCACTTGGCCCG
GCTCAAACCCTGGCCAAGAGACTCTCTTAGGCCGCTCTTCGCTACGTAAG
AAGTGGGTTCGCTCACGTAGCGCTTCGTAAGGTAAAACTGGTTGATGGCA
CCCGCCGTTTGGCTTTCGCCCGGC
</residues>
</seq>
<map_position seq="3R-frag">
<chromosome>3R</chromosome>
<organism>Drosophila melanogaster</organism>
<arm>3R</arm>
<span>
<start>2011161</start>
<end>2024534</end>
</span>
</map_position>
<annotation id="FBgn0037408">
<name>NPFR1</name>
<type>gene</type>
<property>
<type>sp_status</type>
<value>Imperfect match to SwissProt real (computational)</value>
</property>
<property>
<type>gbunit</type>
<value>AE003600</value>
</property>
<property>
<type>cyto_range</type>
<value>83D5-83E1</value>
</property>
<gene id="NPFR1" association="IS">
<name>NPFR1</name>
</gene>
<dbxref>
<xref_db>Gadfly</xref_db>
<db_xref_id>CG1147</db_xref_id>
</dbxref>
<dbxref>
<xref_db>FlyBase</xref_db>
<db_xref_id>FBan0001147</db_xref_id>
</dbxref>
<dbxref>
<xref_db>FlyBase</xref_db>
<db_xref_id>FBgn0037408</db_xref_id>
</dbxref>
<feature_set id="FBtr0078590">
<name>NPFR1-RA</name>
<type>transcript</type>
<author>simonp</author>
<date timestamp="1036483200000">Tue Nov 05 08:00:00 GMT 2002</date>
<property>
<type>protein_id</type>
<value>AAF51909</value>
</property>
<property>
<type>sp_comment</type>
<value>Imperfect match to REAL SP with corresponding FBgn</value>
</property>
<feature_span produces_seq="NPFR1-PA">
<type>start_codon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>3760</start>
<end>3762</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
<feature_span>
<type>exon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>1962</start>
<end>2167</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
<feature_span>
<type>exon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>3549</start>
<end>3762</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
<feature_span>
<type>exon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>6585</start>
<end>6975</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
<feature_span>
<type>exon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>7038</start>
<end>7207</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
<feature_span>
<type>exon</type>
<seq_relationship type="query" seq="3R-frag">
<span>
<start>7818</start>
<end>9976</end>
</span>
</seq_relationship>
</feature_span>
</feature_set>
</annotation>
</game>
|
