File: test_meme.fa

package info (click to toggle)
libtfbs-perl 0.5.svn.20100421-1
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: wheezy
  • size: 920 kB
  • sloc: perl: 6,073; ansic: 604; makefile: 30
file content (25 lines) | stat: -rw-r--r-- 4,857 bytes parent folder | download | duplicates (8) 
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
 
>GAL1
CAGGTTATCAGCAACAACACAGTCATATCCATTCTCAATTAGCTCTACCACAGTGTGTGAACCAATGTATCCAGCACCACCTGTAACCAAAACAATTTTAGAAGTACTTTCACTTTGTAACTGAGCTGTCATTTATATTGAATTTTCAAAAATTCTTACTTTTTTTTTGGATGGACGCAAAGAAGTTTAATAATCATATTACATGGCATTACCACCATATACATATCCATATCTAATCTTACTTATATGTTGTGGAAATGTAAAGAGCCCCATTATCTTAGCCTAAAAAAACCTTCTCTTTGGAACTTTCAGTAATACGCTTAACTGCTCATTGCTATATTGAAGTACGGATTAGAAGCCGCCGAGCGGGCGACAGCCCTCCGACGGAAGACTCTCCTCCGTGCGTCCTCGTCTTCACCGGTCGCGTTCCTGAAACGCAGATGTGCCTCGCGCCGCACTGCTCCGAACAATAAAGATTCTACAATACTAGCTTTTATGGTTATGAAGAGGAAAAATTGGCAGTAACCTGGCCCCACAAACCTTCAAATTAACGAATCAAATTAACAACCATAGGATGATAATGCGATTAGTTTTTTAGCCTTATTTCTGGGGTAATTAATCAGCGAAGCGATGATTTTTGATCTATTAACAGATATATAAATGGAAAAGCTGCATAACCACTTTAACTAATACTTTCAACATTTTCAGTTTGTATTACTTCTTATTCAAATGTCATAAAAGTATCAACAAAAAATTGTTAATATACCTCTATACTTTAACGTCAAGGAGAAAAAACTATA
>GAL10
CGGTTTAGCATCATAAGCGCTTATAAATTTCTTAATTATGCTCGGGCACTTTTCGGCCAATGGTCTTGGTAATTCCTTTGCGCTAGAATTGAACTCAGGTACAATCACTTCTTCTGAATGAGATTTAGTCATTATAGTTTTTTCTCCTTGACGTTAAAGTATAGAGGTATATTAACAATTTTTTGTTGATACTTTTATGACATTTGAATAAGAAGTAATACAAACTGAAAATGTTGAAAGTATTAGTTAAAGTGGTTATGCAGCTTTTCCATTTATATATCTGTTAATAGATCAAAAATCATCGCTTCGCTGATTAATTACCCCAGAAATAAGGCTAAAAAACTAATCGCATTATCATCCTATGGTTGTTAATTTGATTCGTTAATTTGAAGGTTTGTGGGGCCAGGTTACTGCCAATTTTTCCTCTTCATAACCATAAAAGCTAGTATTGTAGAATCTTTATTGTTCGGAGCAGTGCGGCGCGAGGCACATCTGCGTTTCAGGAACGCGACCGGTGAAGACGAGGACGCACGGAGGAGAGTCTTCCGTCGGAGGGCTGTCGCCCGCTCGGCGGCTTCTAATCCGTACTTCAATATAGCAATGAGCAGTTAAGCGTATTACTGAAAGTTCCAAAGAGAAGGTTTTTTTAGGCTAAGATAATGGGGCTCTTTACATTTCCACAACATATAAGTAAGATTAGATATGGATATGTATATGGTGGTAATGCCATGTAATATGATTATTAAACTTCTTTGCGTCCATCCAAAAAAAAAGTAAGAATTTTTGAAAATTCAATATAA
>GAL2
CATTAATTTTGCTTCCAAGACGACAGTAATATGTCTCCTACAATACCAGTTTCGCTGCAGAAGGCACATCTATTACATTTACTGAGCATAACGGGCTGTACTAATCCAAGGAGGTTTACGGACCAGGGGAACTTTCCAGATTCAGATCACAGCAATATAGGACTAGAAAATATCAGGTAGCCGCACTCAACTTGTAACTGGCAACTACTTTGCATCAAACTCCAATTAAATGCGGTAGAATCTTTTCACAAAAGGTACTCAACGTCAATTCGGAAAGCTTCCTTCCGGAATGGCTTAAGTAGGTTGCAATTTCTTTTTCTATTAGTAGCTAAAAATGGGTCACGTGATCTATATTCGAAAGGGGCGGTTGCCTCAGGAAGGCACCGGCGGTCTTTCGTCCGTGCGGAGATATCTGCGCCGTTCAGGGGTCCATGTGCCTTGGACGATATTAAGGCAGAAGGCAGTATCGGGGCGGATCACTCCGAACCGAGATTAGTTAAGCCCTTCCCATCTCAAGATGGGGAGCAAATGGCATTATACTCCTGCTAGAAAGTTAACTGTGCACATATTCTTAAATTATACAACATTCTGGAGAGCTATTGTTCAAAAAACAAACATTTCGCAGGCTAAAATGTGGAGATAGGATAAGTTTTGTAGACATATATAAACAATCAGTAATTGGATTGAAAATTTGGTGTTGTGAATTGCTCTTCATTATGCACCTTATTCAATTATCATCAAGAATAGTAATAGTTAAGTAAACACAAGATTAACATAATAAAAAAAATAATTCTTTCATA
>GAL7
GAGAACTGGAAAGATTGTGTAACCTTGAAAAACGGTGAAACTTACGGGTCCAAGATTGTCTACAGATTTTCCTGATTTGCCAGCTTACTATCCTTCTTGAAAATATGCACTCTATATCTTTTAGTTCTTAATTGCAACACATAGATTTGCTGTATAACGAATTTTATGCTATTTTTTAAATTTGGAGTTCAGTGATAAAAGTGTCACAGCGAATTTCCTCACATGTAGGGACCGAATTGTTTACAAGTTCTCTGTACCACCATGGAGACATCAAAAATTGAAAATCTATGGAAAGATATGGACGGTAGCAACAAGAATATAGCACGAGCCGCGGAGTTCATTTCGTTACTTTTGATATCACTCACAACTATTGCGAAGCGCTTCAGTGAAAAAATCATAAGGAAAAGTTGTAAATATTATTGGTAGTATTCGTTTGGTAAAGTAGAGGGGGTAATTTTTCCCCTTTATTTTGTTCATACATTCTTAAATTGCTTTGCCTCTCCTTTTGGAAAGCTATACTTCGGAGCACTGTTGAGCGAAGGCTCATTAGATATATTTTCTGTCATTTTCCTTAACCCAAAAATAAGGGAAAGGGTCCAAAAAGCGCTCGGACAACTGTTGACCGTGATCCGAAGGACTGGCTATACAGTGTTCACAAAATAGCCAAGCTGAAAATAATGTGTAGCTATGTTCAGTTAGTTTGGCTAGCAAAGATATAAAAGCAGGTCGGAAATATTTATGGGCATTATTATGCAGAGCATCAACATGATAAAAAAAAACAGTTGAATATTCCCTCAAAA
>GAL80
TATCCTTTACGTTTTGACTTGGTGCTCGAAGATGCTTTCAGAGATGGTGCTTATCCTCATGTCTTTTGGGTTTGTCTTCAATACGGCAGCCGTTGTCTTGCAAACGGCCGCCTCTGCCATGGCAAAGAATGCTTTCCATGACGATCATCGTAGTGCCCAATTGGGTGCCTCTATGATGGGTATGGCTTGGGCAAGTGTCTTTTTATGTATCGTGGAATTTATCCTGCTGGTCTTCTGGTCTGTTAGGGCAAGGTTGGCCTCTACTTACTCCATCGACAATTCAAGATACAGAACCTCCTCCAGATGGAATCCCTTCCATAGAGAGAAGGAGCAAGCAACTGACCCAATATTGACTGCCACTGGACCTGAAGACATGCAACAAAGTGCAAGCATAGTGGGGCCTTCTTCCAATGCTAATCCGGTCACTGCCACTGCTGCTACGGAAAACCAACCTAAAGGTATTAACTTCTTCACTATAAGAAAATCACACGAGCGCCCGGACGATGTCTCTGTTTAAATGGCGCAAGTTTTCCGCTTTGTAATATATATTTATACCCCTTTCTTCTCTCCCCTGCAATATAATAGTTTAATTCTAATATTAATAATATCCTATATTTTCTTCATTTACCGGCGCACTCTCGCCCGAACGACCTCAAAATGTCTGCTACATTCATAATAACCAAAAGCTCATAACTTTTTTTTTTGAACCTGAATATATATACATCACATATCACTGCTGGTCCTTGCCGACCAGCGTATACAATCTCGATAGTTGGTTTCCCGTTCTTTCCACTCCCGTC
>GCY1
GTCTTAGTATCTCATCTCATCTCAATTTCTATATTCCACTATAAAATTTTTCACTCTTTC
TGCGCGCGCCAATGTCCCCGCAACTACTCAATAGGTAACATGAGAATATTTCAGTTCGTA
AGAGAGAAGAGATGAAGTTATTTGGGCTCTTTGCTCGAGGTTACAGAAGGGCCGCATTAG
AGTGAATGAGCTGATGATATTTCGCCCAGTTCTACATTTTTTTTTTTTTGGAAGTATGAC
CTCTGTTAAATTTTTTTTTTTTTAAATTTCACTTTCTAAAGTCCCAGAAATCCGCTTGAA
TGTCTTACATATTGCAATGGATATGCTTGGGTGATCATACTTCCTGGCTTTAGATATTTG
AAACTTAACTCTTGTCAACAAACTTCCTATGGAGTGTATAAGAATTGTAAGTTATAACAC
CGGCGAACAATCGGGGCAGACTATTCCGGGGAAGAACAAGGAAGGGCGGTCTTTTCTCCC
TCATTGTCATAGCAAGGTCATTTCGCCTTCTCAGAAAGGGGTAGAATCAATCTAGCACGC
AGATTGCAAACACGGCTTAATAATATGCCTATCAGGCATTCACCCGTGTGACGAATCGCA
CACCGCTGCTCTCCTTAATTCCCTAGAGTAGAAACCGAGCTTTCAGGAAAAGACTACGGC
AGTAAAGAATTGCTTTACTGGGCGTATAAAACCGGGAGAATCAAGACATTCTAATGACTT
GATTCAGGATGAGAGCTTAATAGGTGCATCTTAGCAAGCTAAAATTTGGACAGCTCTCATTACTAAATTAAGATAGAAAA