File: dmel58.ltrd.gff3

package info (click to toggle)
ltrsift 1.0.2-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: buster
  • size: 8,172 kB
  • sloc: ansic: 14,200; makefile: 122; sh: 29
file content (969 lines) | stat: -rw-r--r-- 86,646 bytes parent folder | download | duplicates (4)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
##gff-version   3
##sequence-region   seq0 1 23011544
#2L type=chromosome_arm; loc=2L:1..23011544; ID=2L; dbxref=GB:AE014134; MD5=bfdfb99d39fa5174dae1e2ecd8a231cd; length=23011544; release=r5.8; species=Dmel;
seq0	LTRharvest	repeat_region	5	5205	.	?	.	ID=repeat_region1
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5	8	.	?	.	Parent=repeat_region1
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	9	5201	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon1;Parent=repeat_region1;ltr_similarity=96.94;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	9	627	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon1
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4581	5201	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon1
seq0	LTRdigest	RR_tract	4595	4609	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon1
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5202	5205	.	?	.	Parent=repeat_region1
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	347938	355401	.	?	.	ID=repeat_region2
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	347938	347941	.	?	.	Parent=repeat_region2
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	347942	355397	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon2;Parent=repeat_region2;ltr_similarity=97.90;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	347942	348365	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon2
seq0	LTRdigest	RR_tract	348356	348370	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon2
seq0	LTRdigest	protein_match	349000	349450	9.43e-36	-	1	Parent=LTR_retrotransposon2;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	350788	351310	1.68e-44	-	1	Parent=LTR_retrotransposon2;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	354969	355397	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon2
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	355398	355401	.	?	.	Parent=repeat_region2
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	686969	695960	.	?	.	ID=repeat_region3
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	686969	686973	.	?	.	Parent=repeat_region3
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	686974	695955	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon3;Parent=repeat_region3;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	686974	687401	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon3
seq0	LTRdigest	protein_match	689943	690357	5.81e-16	-	0	Parent=LTR_retrotransposon3;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	691350	691758	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon3;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	695528	695955	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon3
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	695956	695960	.	?	.	Parent=repeat_region3
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	976933	984542	.	?	.	ID=repeat_region4
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	976933	976936	.	?	.	Parent=repeat_region4
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	976937	984538	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon4;Parent=repeat_region4;ltr_similarity=96.26;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	976937	977384	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon4
seq0	LTRdigest	protein_match	981194	981602	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon4;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	982584	982995	9.16e-16	+	1	Parent=LTR_retrotransposon4;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	984085	984538	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon4
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	984539	984542	.	?	.	Parent=repeat_region4
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	996768	1005823	.	?	.	ID=repeat_region5
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	996768	996771	.	?	.	Parent=repeat_region5
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	996772	1005819	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon5;Parent=repeat_region5;ltr_similarity=98.63;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	996772	997207	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon5
seq0	LTRdigest	protein_match	999737	1000151	8.01e-16	-	1	Parent=LTR_retrotransposon5;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	1001144	1001552	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon5;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1005383	1005819	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon5
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1005820	1005823	.	?	.	Parent=repeat_region5
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	1220180	1227596	.	?	.	ID=repeat_region6
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1220180	1220183	.	?	.	Parent=repeat_region6
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	1220184	1227592	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon6;Parent=repeat_region6;ltr_similarity=99.75;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1220184	1220582	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon6
seq0	LTRdigest	protein_match	1224238	1224760	1.68e-44	+	1	Parent=LTR_retrotransposon6;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	1226098	1226548	9.36e-36	+	1	Parent=LTR_retrotransposon6;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	1227179	1227193	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon6
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1227193	1227592	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon6
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1227593	1227596	.	?	.	Parent=repeat_region6
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	1679028	1686443	.	?	.	ID=repeat_region7
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1679028	1679031	.	?	.	Parent=repeat_region7
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	1679032	1686439	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon7;Parent=repeat_region7;ltr_similarity=98.76;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1679032	1679433	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon7
seq0	LTRdigest	protein_match	1683086	1683608	1.68e-44	+	1	Parent=LTR_retrotransposon7;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	1684946	1685396	9.36e-36	+	1	Parent=LTR_retrotransposon7;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	1686026	1686040	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon7
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1686039	1686439	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon7
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1686440	1686443	.	?	.	Parent=repeat_region7
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	1801271	1806798	.	?	.	ID=repeat_region8
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1801271	1801274	.	?	.	Parent=repeat_region8
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	1801275	1806794	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon8;Parent=repeat_region8;ltr_similarity=97.07;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1801275	1801547	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon8
seq0	LTRdigest	protein_match	1802258	1802702	7.37e-41	-	0	Parent=LTR_retrotransposon8;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	1803737	1804244	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon8;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	1805318	1805363	1.87e-08	-	0	Parent=LTR_retrotransposon8;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	1806509	1806522	13.8	-	.	Parent=LTR_retrotransposon8;trna=Leu-CAA;trnaoffset=2;pbsoffset=3;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	1806526	1806794	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon8
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	1806795	1806798	.	?	.	Parent=repeat_region8
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	2100411	2109529	.	?	.	ID=repeat_region9
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2100411	2100414	.	?	.	Parent=repeat_region9
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	2100415	2109525	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon9;Parent=repeat_region9;ltr_similarity=96.48;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2100415	2100858	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon9
seq0	LTRdigest	protein_match	2103388	2103802	5.9e-16	-	2	Parent=LTR_retrotransposon9;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	2104795	2105203	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon9;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2109071	2109525	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon9
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2109526	2109529	.	?	.	Parent=repeat_region9
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	2112164	2119776	.	?	.	ID=repeat_region10
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2112164	2112167	.	?	.	Parent=repeat_region10
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	2112168	2119772	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon10;Parent=repeat_region10;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2112168	2112685	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon10
seq0	LTRdigest	RR_tract	2112684	2112696	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon10
seq0	LTRdigest	protein_match	2113993	2114434	7.66e-28	-	1	Parent=LTR_retrotransposon10;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	2115721	2116243	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon10;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	2119238	2119252	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon10;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2119255	2119772	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon10
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2119773	2119776	.	?	.	Parent=repeat_region10
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	2294092	2299247	.	?	.	ID=repeat_region11
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2294092	2294095	.	?	.	Parent=repeat_region11
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	2294096	2299243	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon11;Parent=repeat_region11;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2294096	2294372	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon11
seq0	LTRdigest	protein_match	2295322	2295496	2.26e-29	-	0	Parent=LTR_retrotransposon11;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	2295494	2296085	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon11;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	2296889	2297384	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon11;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	2298954	2298967	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon11;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2298967	2299243	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon11
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2299244	2299247	.	?	.	Parent=repeat_region11
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	2565589	2571607	.	?	.	ID=repeat_region12
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2565589	2565592	.	?	.	Parent=repeat_region12
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	2565593	2571603	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon12;Parent=repeat_region12;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2565593	2566006	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon12
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	2566009	2566023	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon12;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	2567625	2567910	9.12e-24	+	1	Parent=LTR_retrotransposon12;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	2568309	2568831	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon12;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	2569058	2569493	2.15e-27	+	0	Parent=LTR_retrotransposon12;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	2571179	2571191	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon12
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2571190	2571603	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon12
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2571604	2571607	.	?	.	Parent=repeat_region12
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	2772649	2779179	.	?	.	ID=repeat_region13
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2772649	2772652	.	?	.	Parent=repeat_region13
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	2772653	2779175	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon13;Parent=repeat_region13;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2772653	2773066	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon13
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	2773069	2773083	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon13;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	2774687	2774972	1e-23	+	0	Parent=LTR_retrotransposon13;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	2775371	2775893	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon13;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	2776963	2777236	4.38e-17	+	2	Parent=LTR_retrotransposon13;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	2778751	2778763	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon13
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	2778762	2779175	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon13
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	2779176	2779179	.	?	.	Parent=repeat_region13
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	3073083	3078236	.	?	.	ID=repeat_region14
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3073083	3073086	.	?	.	Parent=repeat_region14
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	3073087	3078232	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon14;Parent=repeat_region14;ltr_similarity=98.23;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3073087	3073368	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon14
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	3073364	3073376	6.86	+	.	Parent=LTR_retrotransposon14;trna=Met-CAT;trnaoffset=34;pbsoffset=5;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	3074943	3075438	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon14;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	3076242	3077004	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon14;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3077956	3078232	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon14
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3078233	3078236	.	?	.	Parent=repeat_region14
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	3202790	3210169	.	?	.	ID=repeat_region15
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3202790	3202793	.	?	.	Parent=repeat_region15
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	3202794	3210165	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon15;Parent=repeat_region15;ltr_similarity=96.72;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3202794	3203236	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon15
seq0	LTRdigest	RR_tract	3203237	3203249	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon15
seq0	LTRdigest	protein_match	3203881	3204331	4.15e-37	-	2	Parent=LTR_retrotransposon15;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	3205663	3206185	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon15;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3209708	3210165	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon15
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3210166	3210169	.	?	.	Parent=repeat_region15
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	3251545	3259060	.	?	.	ID=repeat_region16
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3251545	3251548	.	?	.	Parent=repeat_region16
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	3251549	3259056	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon16;Parent=repeat_region16;ltr_similarity=99.02;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3251549	3251952	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon16
seq0	LTRdigest	protein_match	3254555	3255080	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon16;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	3256325	3256769	9.39e-34	+	0	Parent=LTR_retrotransposon16;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	3257247	3258657	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon16;name=Gypsy;id=PF07253.2
seq0	LTRdigest	RR_tract	3258642	3258651	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon16
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3258649	3259056	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon16
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3259057	3259060	.	?	.	Parent=repeat_region16
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	3649838	3654992	.	?	.	ID=repeat_region17
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3649838	3649842	.	?	.	Parent=repeat_region17
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	3649843	3654987	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon17;Parent=repeat_region17;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3649843	3650118	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	3650119	3650132	7.58	+	.	Parent=LTR_retrotransposon17;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	3651699	3652194	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon17;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	3652998	3653760	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon17;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	3654712	3654987	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon17
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	3654988	3654992	.	?	.	Parent=repeat_region17
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	4181323	4183905	.	?	.	ID=repeat_region18
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4181323	4181326	.	?	.	Parent=repeat_region18
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	4181327	4183901	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon18;Parent=repeat_region18;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4181327	4181602	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon18
seq0	LTRdigest	RR_tract	4181601	4181613	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4183626	4183901	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon18
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4183902	4183905	.	?	.	Parent=repeat_region18
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	4601748	4609165	.	?	.	ID=repeat_region19
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4601748	4601751	.	?	.	Parent=repeat_region19
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	4601752	4609161	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon19;Parent=repeat_region19;ltr_similarity=97.22;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4601752	4602219	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon19
seq0	LTRdigest	RR_tract	4602201	4602213	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon19
seq0	LTRdigest	protein_match	4602846	4603296	4.18e-37	-	0	Parent=LTR_retrotransposon19;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	4604628	4605150	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon19;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	4608687	4608697	11	-	.	Parent=LTR_retrotransposon19;trna=Arg-TCG;trnaoffset=0;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4608699	4609161	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon19
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4609162	4609165	.	?	.	Parent=repeat_region19
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	4661876	4669406	.	?	.	ID=repeat_region20
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4661876	4661879	.	?	.	Parent=repeat_region20
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	4661880	4669402	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon20;Parent=repeat_region20;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4661880	4662397	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon20
seq0	LTRdigest	RR_tract	4662396	4662408	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon20
seq0	LTRdigest	protein_match	4663710	4664151	7.56e-28	-	1	Parent=LTR_retrotransposon20;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	4665438	4665960	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon20;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	4668868	4668882	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon20;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	4668885	4669402	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon20
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	4669403	4669406	.	?	.	Parent=repeat_region20
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	5173338	5179786	.	?	.	ID=repeat_region21
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5173338	5173341	.	?	.	Parent=repeat_region21
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	5173342	5179782	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon21;Parent=repeat_region21;ltr_similarity=95.12;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	5173342	5173956	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon21
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	5179171	5179782	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon21
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5179783	5179786	.	?	.	Parent=repeat_region21
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	5827756	5836728	.	?	.	ID=repeat_region22
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5827756	5827759	.	?	.	Parent=repeat_region22
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	5827760	5836724	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon22;Parent=repeat_region22;ltr_similarity=97.08;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	5827760	5828204	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon22
seq0	LTRdigest	protein_match	5830603	5831017	5.79e-16	-	1	Parent=LTR_retrotransposon22;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	5832010	5832418	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon22;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	5836285	5836724	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon22
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	5836725	5836728	.	?	.	Parent=repeat_region22
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	6363201	6366073	.	?	.	ID=repeat_region23
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6363201	6363204	.	?	.	Parent=repeat_region23
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	6363205	6366069	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon23;Parent=repeat_region23;ltr_similarity=96.84;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6363205	6363480	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon23
seq0	LTRdigest	RR_tract	6365783	6365795	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon23
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6365785	6366069	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon23
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6366070	6366073	.	?	.	Parent=repeat_region23
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	6436000	6445127	.	?	.	ID=repeat_region24
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6436000	6436003	.	?	.	Parent=repeat_region24
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	6436004	6445123	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon24;Parent=repeat_region24;ltr_similarity=95.96;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6436004	6436448	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon24
seq0	LTRdigest	protein_match	6440326	6440734	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon24;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	6441727	6442141	5.91e-16	+	2	Parent=LTR_retrotransposon24;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6444685	6445123	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon24
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6445124	6445127	.	?	.	Parent=repeat_region24
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	6876820	6882977	.	?	.	ID=repeat_region25
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6876820	6876823	.	?	.	Parent=repeat_region25
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	6876824	6882973	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon25;Parent=repeat_region25;ltr_similarity=92.65;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6876824	6877095	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon25
seq0	LTRdigest	protein_match	6880345	6880837	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon25;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	6881839	6882235	3.99e-16	+	2	Parent=LTR_retrotransposon25;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6882707	6882973	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon25
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6882974	6882977	.	?	.	Parent=repeat_region25
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	6991483	6998552	.	?	.	ID=repeat_region26
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6991483	6991486	.	?	.	Parent=repeat_region26
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	6991487	6998548	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon26;Parent=repeat_region26;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6991487	6991752	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon26
seq0	LTRdigest	RR_tract	6991751	6991763	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon26
seq0	LTRdigest	protein_match	6992781	6993225	2.2e-34	-	1	Parent=LTR_retrotransposon26;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	6994470	6994992	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon26;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	6998266	6998280	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon26;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	6998283	6998548	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon26
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	6998549	6998552	.	?	.	Parent=repeat_region26
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	7343377	7350443	.	?	.	ID=repeat_region27
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7343377	7343380	.	?	.	Parent=repeat_region27
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	7343381	7350439	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon27;Parent=repeat_region27;ltr_similarity=97.95;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7343381	7343818	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon27
seq0	LTRdigest	protein_match	7347720	7347927	7.37e-24	+	1	Parent=LTR_retrotransposon27;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	7348515	7348929	4.36e-16	+	1	Parent=LTR_retrotransposon27;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7350011	7350439	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon27
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7350440	7350443	.	?	.	Parent=repeat_region27
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	7734851	7741454	.	?	.	ID=repeat_region28
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7734851	7734854	.	?	.	Parent=repeat_region28
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	7734855	7741450	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon28;Parent=repeat_region28;ltr_similarity=97.77;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7734855	7735299	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon28
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7741003	7741450	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon28
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7741451	7741454	.	?	.	Parent=repeat_region28
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	7977131	7984055	.	?	.	ID=repeat_region29
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7977131	7977134	.	?	.	Parent=repeat_region29
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	7977135	7984051	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon29;Parent=repeat_region29;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7977135	7977547	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon29
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	7977550	7977564	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon29;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	7979166	7979451	3.21e-23	+	0	Parent=LTR_retrotransposon29;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	7979850	7980372	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon29;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	7981584	7982019	2.55e-27	+	0	Parent=LTR_retrotransposon29;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	7983628	7983640	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon29
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	7983639	7984051	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon29
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	7984052	7984055	.	?	.	Parent=repeat_region29
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	8013664	8018819	.	?	.	ID=repeat_region30
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8013664	8013668	.	?	.	Parent=repeat_region30
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	8013669	8018814	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon30;Parent=repeat_region30;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8013669	8013944	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon30
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	8013945	8013958	7.58	+	.	Parent=LTR_retrotransposon30;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	8015526	8016021	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon30;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	8016825	8017587	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon30;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8018539	8018814	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon30
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8018815	8018819	.	?	.	Parent=repeat_region30
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	8452471	8461593	.	?	.	ID=repeat_region31
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8452471	8452475	.	?	.	Parent=repeat_region31
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	8452476	8461588	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon31;Parent=repeat_region31;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8452476	8452904	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon31
seq0	LTRdigest	protein_match	8456801	8457209	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon31;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	8458202	8458616	5.9e-16	+	2	Parent=LTR_retrotransposon31;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8461160	8461588	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon31
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8461589	8461593	.	?	.	Parent=repeat_region31
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	8594516	8601520	.	?	.	ID=repeat_region32
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8594516	8594519	.	?	.	Parent=repeat_region32
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	8594520	8601516	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon32;Parent=repeat_region32;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8594520	8594933	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon32
seq0	LTRdigest	RR_tract	8594932	8594944	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon32
seq0	LTRdigest	protein_match	8596627	8597062	2.59e-27	-	2	Parent=LTR_retrotransposon32;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	8598275	8598797	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon32;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	8599196	8599481	1.09e-23	-	1	Parent=LTR_retrotransposon32;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	8601086	8601100	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon32;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8601103	8601516	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon32
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8601517	8601520	.	?	.	Parent=repeat_region32
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	8723165	8731494	.	?	.	ID=repeat_region33
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8723165	8723168	.	?	.	Parent=repeat_region33
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	8723169	8731490	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon33;Parent=repeat_region33;ltr_similarity=98.82;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8723169	8723587	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon33
seq0	LTRdigest	RR_tract	8723585	8723597	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon33
seq0	LTRdigest	protein_match	8725565	8726018	3.26e-31	-	0	Parent=LTR_retrotransposon33;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	8727227	8727749	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon33;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	8731056	8731070	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon33;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=4;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	8731067	8731490	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon33
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	8731491	8731494	.	?	.	Parent=repeat_region33
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	9000330	9007791	.	?	.	ID=repeat_region34
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	9000330	9000334	.	?	.	Parent=repeat_region34
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	9000335	9007786	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon34;Parent=repeat_region34;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	9000335	9000762	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon34
seq0	LTRdigest	protein_match	9003060	9003468	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon34;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	9007359	9007786	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon34
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	9007787	9007791	.	?	.	Parent=repeat_region34
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	9973777	9980846	.	?	.	ID=repeat_region35
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	9973777	9973780	.	?	.	Parent=repeat_region35
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	9973781	9980842	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon35;Parent=repeat_region35;ltr_similarity=98.88;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	9973781	9974049	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon35
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	9974049	9974063	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon35;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	9977334	9977856	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon35;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	9979101	9979545	2.2e-34	+	1	Parent=LTR_retrotransposon35;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	9980566	9980578	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon35
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	9980577	9980842	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon35
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	9980843	9980846	.	?	.	Parent=repeat_region35
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	10156357	10163793	.	?	.	ID=repeat_region36
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10156357	10156360	.	?	.	Parent=repeat_region36
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	10156361	10163789	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon36;Parent=repeat_region36;ltr_similarity=96.45;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10156361	10156780	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon36
seq0	LTRdigest	RR_tract	10156778	10156792	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon36
seq0	LTRdigest	protein_match	10157420	10157870	9.39e-36	-	0	Parent=LTR_retrotransposon36;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	10159208	10159730	1.68e-44	-	0	Parent=LTR_retrotransposon36;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	10163357	10163367	5.83	-	.	Parent=LTR_retrotransposon36;trna=Leu-CAG;trnaoffset=39;pbsoffset=1;edist=1
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10163367	10163789	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon36
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10163790	10163793	.	?	.	Parent=repeat_region36
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	10592893	10600505	.	?	.	ID=repeat_region37
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10592893	10592896	.	?	.	Parent=repeat_region37
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	10592897	10600501	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon37;Parent=repeat_region37;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10592897	10593414	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon37
seq0	LTRdigest	RR_tract	10593413	10593425	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon37
seq0	LTRdigest	protein_match	10594721	10595162	7.66e-28	-	2	Parent=LTR_retrotransposon37;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	10596449	10596971	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon37;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	10599967	10599981	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon37;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10599984	10600501	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon37
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10600502	10600505	.	?	.	Parent=repeat_region37
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	10876594	10883600	.	?	.	ID=repeat_region38
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10876594	10876597	.	?	.	Parent=repeat_region38
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	10876598	10883596	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon38;Parent=repeat_region38;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10876598	10877011	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon38
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	10877014	10877028	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon38;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	10878633	10878918	3.25e-23	+	1	Parent=LTR_retrotransposon38;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	10879317	10879839	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon38;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	10881051	10881486	2.59e-27	+	1	Parent=LTR_retrotransposon38;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	10883172	10883184	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon38
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10883183	10883596	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon38
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10883597	10883600	.	?	.	Parent=repeat_region38
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	10946994	10956160	.	?	.	ID=repeat_region39
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10946994	10946998	.	?	.	Parent=repeat_region39
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	10946999	10956155	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon39;Parent=repeat_region39;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10946999	10947426	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon39
seq0	LTRdigest	protein_match	10951369	10951777	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon39;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	10952770	10953184	5.94e-16	+	2	Parent=LTR_retrotransposon39;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	10955728	10956155	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon39
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	10956156	10956160	.	?	.	Parent=repeat_region39
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	11197661	11200775	.	?	.	ID=repeat_region40
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11197661	11197664	.	?	.	Parent=repeat_region40
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	11197665	11200771	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon40;Parent=repeat_region40;ltr_similarity=91.23;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11197665	11197972	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon40
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	11197972	11197982	9.64	+	.	Parent=LTR_retrotransposon40;trna=Arg-TCG;trnaoffset=9;pbsoffset=1;edist=1
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11200486	11200771	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon40
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11200772	11200775	.	?	.	Parent=repeat_region40
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	11540635	11547987	.	?	.	ID=repeat_region41
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11540635	11540638	.	?	.	Parent=repeat_region41
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	11540639	11547983	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon41;Parent=repeat_region41;ltr_similarity=99.21;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11540639	11541146	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon41
seq0	LTRdigest	RR_tract	11541144	11541156	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon41
seq0	LTRdigest	protein_match	11541872	11542307	8.83e-36	-	0	Parent=LTR_retrotransposon41;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	11543663	11544185	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon41;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	11544794	11545097	2.21e-18	-	0	Parent=LTR_retrotransposon41;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	11547463	11547473	11	-	.	Parent=LTR_retrotransposon41;trna=Arg-TCG;trnaoffset=0;pbsoffset=3;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11547477	11547983	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon41
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11547984	11547987	.	?	.	Parent=repeat_region41
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	11563687	11568841	.	?	.	ID=repeat_region42
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11563687	11563690	.	?	.	Parent=repeat_region42
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	11563691	11568837	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon42;Parent=repeat_region42;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11563691	11563967	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon42
seq0	LTRdigest	protein_match	11564916	11565678	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon42;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	11566482	11566977	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon42;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	11568548	11568561	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon42;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11568561	11568837	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon42
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11568838	11568841	.	?	.	Parent=repeat_region42
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	11713558	11720976	.	?	.	ID=repeat_region43
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11713558	11713561	.	?	.	Parent=repeat_region43
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	11713562	11720972	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon43;Parent=repeat_region43;ltr_similarity=99.75;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11713562	11713960	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon43
seq0	LTRdigest	protein_match	11717616	11718138	1.68e-44	+	1	Parent=LTR_retrotransposon43;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	11719476	11719926	9.36e-36	+	1	Parent=LTR_retrotransposon43;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	11720559	11720573	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon43
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11720573	11720972	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon43
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11720973	11720976	.	?	.	Parent=repeat_region43
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	11896971	11900290	.	?	.	ID=repeat_region44
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11896971	11896974	.	?	.	Parent=repeat_region44
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	11896975	11900286	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon44;Parent=repeat_region44;ltr_similarity=94.97;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11896975	11897153	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon44
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	11897159	11897170	1.5	+	.	Parent=LTR_retrotransposon44;trna=Leu-CAG;trnaoffset=31;pbsoffset=5;edist=1
seq0	LTRdigest	protein_match	11898589	11899363	9.81e-45	+	0	Parent=LTR_retrotransposon44;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	11900115	11900286	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon44
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	11900287	11900290	.	?	.	Parent=repeat_region44
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	12067381	12074383	.	?	.	ID=repeat_region45
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12067381	12067384	.	?	.	Parent=repeat_region45
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	12067385	12074379	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon45;Parent=repeat_region45;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12067385	12067798	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon45
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	12067801	12067815	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon45;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	12069416	12069701	1.09e-23	+	0	Parent=LTR_retrotransposon45;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	12070100	12070622	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon45;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	12071834	12072269	2.59e-27	+	0	Parent=LTR_retrotransposon45;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	12073955	12073967	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon45
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12073966	12074379	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon45
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12074380	12074383	.	?	.	Parent=repeat_region45
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	12558371	12565450	.	?	.	ID=repeat_region46
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12558371	12558374	.	?	.	Parent=repeat_region46
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	12558375	12565446	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon46;Parent=repeat_region46;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12558375	12558641	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon46
seq0	LTRdigest	RR_tract	12558640	12558652	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon46
seq0	LTRdigest	protein_match	12559670	12560114	2.21e-34	-	1	Parent=LTR_retrotransposon46;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	12561359	12561881	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon46;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	12565163	12565177	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon46;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12565180	12565446	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon46
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12565447	12565450	.	?	.	Parent=repeat_region46
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	12781854	12789248	.	?	.	ID=repeat_region47
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12781854	12781857	.	?	.	Parent=repeat_region47
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	12781858	12789244	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon47;Parent=repeat_region47;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12781858	12782516	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon47
seq0	LTRdigest	RR_tract	12782515	12782528	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon47
seq0	LTRdigest	protein_match	12784272	12784707	1.84e-26	-	1	Parent=LTR_retrotransposon47;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	12785952	12786474	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon47;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	12788569	12788583	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon47;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12788586	12789244	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon47
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12789245	12789248	.	?	.	Parent=repeat_region47
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	12933901	12941318	.	?	.	ID=repeat_region48
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12933901	12933904	.	?	.	Parent=repeat_region48
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	12933905	12941314	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon48;Parent=repeat_region48;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12933905	12934303	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon48
seq0	LTRdigest	RR_tract	12934304	12934318	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon48
seq0	LTRdigest	protein_match	12934947	12935397	9.36e-36	-	1	Parent=LTR_retrotransposon48;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	12936735	12937257	1.68e-44	-	1	Parent=LTR_retrotransposon48;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	12940916	12941314	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon48
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	12941315	12941318	.	?	.	Parent=repeat_region48
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	13449513	13456899	.	?	.	ID=repeat_region49
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13449513	13449516	.	?	.	Parent=repeat_region49
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	13449517	13456895	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon49;Parent=repeat_region49;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13449517	13450176	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon49
seq0	LTRdigest	RR_tract	13450175	13450188	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon49
seq0	LTRdigest	protein_match	13451932	13452367	1.84e-26	-	1	Parent=LTR_retrotransposon49;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	13453612	13454134	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon49;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	13456219	13456233	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon49;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13456236	13456895	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon49
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13456896	13456899	.	?	.	Parent=repeat_region49
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	13522309	13527565	.	?	.	ID=repeat_region50
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13522309	13522312	.	?	.	Parent=repeat_region50
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	13522313	13527561	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon50;Parent=repeat_region50;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13522313	13522642	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon50
seq0	LTRdigest	protein_match	13523004	13523445	3.52e-26	-	0	Parent=LTR_retrotransposon50;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	13524816	13525338	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon50;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13527232	13527561	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon50
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13527562	13527565	.	?	.	Parent=repeat_region50
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	13853138	13862238	.	?	.	ID=repeat_region51
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13853138	13853141	.	?	.	Parent=repeat_region51
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	13853142	13862234	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon51;Parent=repeat_region51;ltr_similarity=98.61;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13853142	13853569	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon51
seq0	LTRdigest	protein_match	13856097	13856511	5.9e-16	-	2	Parent=LTR_retrotransposon51;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	13857504	13857912	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon51;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	13861803	13862234	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon51
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	13862235	13862238	.	?	.	Parent=repeat_region51
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	14642621	14651734	.	?	.	ID=repeat_region52
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14642621	14642624	.	?	.	Parent=repeat_region52
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	14642625	14651730	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon52;Parent=repeat_region52;ltr_similarity=99.30;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14642625	14643053	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon52
seq0	LTRdigest	protein_match	14645594	14646008	5.9e-16	-	1	Parent=LTR_retrotransposon52;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	14647001	14647409	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon52;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14651300	14651730	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon52
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14651731	14651734	.	?	.	Parent=repeat_region52
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	14803930	14809083	.	?	.	ID=repeat_region53
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14803930	14803933	.	?	.	Parent=repeat_region53
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	14803934	14809079	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon53;Parent=repeat_region53;ltr_similarity=98.93;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14803934	14804210	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon53
seq0	LTRdigest	protein_match	14805159	14805921	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon53;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	14806725	14807220	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon53;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	14808790	14808803	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon53;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=4;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14808800	14809079	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon53
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14809080	14809083	.	?	.	Parent=repeat_region53
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	14984449	14991979	.	?	.	ID=repeat_region54
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14984449	14984452	.	?	.	Parent=repeat_region54
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	14984453	14991975	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon54;Parent=repeat_region54;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14984453	14984970	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon54
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	14984973	14984987	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon54;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	14987892	14988414	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon54;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	14989701	14990142	7.56e-28	+	1	Parent=LTR_retrotransposon54;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	14991447	14991459	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon54
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	14991458	14991975	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon54
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	14991976	14991979	.	?	.	Parent=repeat_region54
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	15446102	15453521	.	?	.	ID=repeat_region55
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15446102	15446105	.	?	.	Parent=repeat_region55
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	15446106	15453517	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon55;Parent=repeat_region55;ltr_similarity=98.02;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15446106	15446510	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon55
seq0	LTRdigest	protein_match	15450161	15450683	1.26e-42	+	2	Parent=LTR_retrotransposon55;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	15452021	15452471	9.36e-36	+	2	Parent=LTR_retrotransposon55;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	15453104	15453118	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon55
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15453117	15453517	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon55
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15453518	15453521	.	?	.	Parent=repeat_region55
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	15586461	15593463	.	?	.	ID=repeat_region56
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15586461	15586464	.	?	.	Parent=repeat_region56
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	15586465	15593459	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon56;Parent=repeat_region56;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15586465	15586878	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon56
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	15586881	15586895	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon56;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	15588496	15588781	1.09e-23	+	0	Parent=LTR_retrotransposon56;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	15589180	15589702	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon56;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	15590914	15591349	2.59e-27	+	0	Parent=LTR_retrotransposon56;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	15593035	15593047	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon56
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15593046	15593459	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon56
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15593460	15593463	.	?	.	Parent=repeat_region56
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	15718776	15727574	.	?	.	ID=repeat_region57
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15718776	15718779	.	?	.	Parent=repeat_region57
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	15718780	15727570	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon57;Parent=repeat_region57;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15718780	15719438	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon57
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	15719441	15719455	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon57;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	15723164	15723473	7.64e-35	+	1	Parent=LTR_retrotransposon57;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	15724718	15725153	2.26e-26	+	1	Parent=LTR_retrotransposon57;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	15726900	15726913	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon57
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	15726912	15727570	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon57
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	15727571	15727574	.	?	.	Parent=repeat_region57
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	16141213	16146371	.	?	.	ID=repeat_region58
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16141213	16141217	.	?	.	Parent=repeat_region58
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	16141218	16146366	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon58;Parent=repeat_region58;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16141218	16141493	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon58
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	16141494	16141507	7.58	+	.	Parent=LTR_retrotransposon58;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	16143077	16143572	4.2e-45	+	2	Parent=LTR_retrotransposon58;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	16144376	16145084	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon58;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	16145082	16145139	1.97e-09	+	0	Parent=LTR_retrotransposon58;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16146091	16146366	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon58
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16146367	16146371	.	?	.	Parent=repeat_region58
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	16153787	16160791	.	?	.	ID=repeat_region59
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16153787	16153790	.	?	.	Parent=repeat_region59
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	16153791	16160787	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon59;Parent=repeat_region59;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16153791	16154205	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon59
seq0	LTRdigest	RR_tract	16154204	16154216	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon59
seq0	LTRdigest	protein_match	16155899	16156334	2.59e-27	-	1	Parent=LTR_retrotransposon59;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	16157546	16158068	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon59;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	16158467	16158752	1.09e-23	-	1	Parent=LTR_retrotransposon59;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	16160356	16160370	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon59;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16160373	16160787	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon59
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16160788	16160791	.	?	.	Parent=repeat_region59
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	16512014	16519078	.	?	.	ID=repeat_region60
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16512014	16512017	.	?	.	Parent=repeat_region60
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	16512018	16519074	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon60;Parent=repeat_region60;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16512018	16512283	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon60
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	16512286	16512300	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon60;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	16515566	16516088	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon60;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	16517333	16517777	2.2e-34	+	2	Parent=LTR_retrotransposon60;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	16518798	16518810	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon60
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	16518809	16519074	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon60
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	16519075	16519078	.	?	.	Parent=repeat_region60
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	17144381	17151999	.	?	.	ID=repeat_region61
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	17144381	17144384	.	?	.	Parent=repeat_region61
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	17144385	17151995	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon61;Parent=repeat_region61;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	17144385	17144902	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon61
seq0	LTRdigest	RR_tract	17144901	17144913	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon61
seq0	LTRdigest	protein_match	17146212	17146653	7.67e-28	-	2	Parent=LTR_retrotransposon61;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	17147940	17148462	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon61;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	17151461	17151475	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon61;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	17151478	17151995	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon61
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	17151996	17151999	.	?	.	Parent=repeat_region61
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	17819973	17825127	.	?	.	ID=repeat_region62
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	17819973	17819977	.	?	.	Parent=repeat_region62
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	17819978	17825122	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon62;Parent=repeat_region62;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	17819978	17820252	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon62
seq0	LTRdigest	protein_match	17821202	17821964	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon62;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	17822768	17823263	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon62;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	17824834	17824847	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon62;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	17824848	17825122	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon62
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	17825123	17825127	.	?	.	Parent=repeat_region62
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	18051926	18061024	.	?	.	ID=repeat_region63
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	18051926	18051930	.	?	.	Parent=repeat_region63
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	18051931	18061019	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon63;Parent=repeat_region63;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	18051931	18052344	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon63
seq0	LTRdigest	protein_match	18056247	18056655	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon63;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	18057648	18058062	5.89e-16	+	2	Parent=LTR_retrotransposon63;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	18060606	18061019	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon63
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	18061020	18061024	.	?	.	Parent=repeat_region63
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	19147421	19154406	.	?	.	ID=repeat_region64
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19147421	19147424	.	?	.	Parent=repeat_region64
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	19147425	19154402	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon64;Parent=repeat_region64;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19147425	19147838	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon64
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	19147841	19147855	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon64;trna=Ser-AGA;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	19149457	19149742	1.08e-23	+	1	Parent=LTR_retrotransposon64;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	19150141	19150663	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon64;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	19151875	19152310	2.58e-27	+	1	Parent=LTR_retrotransposon64;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	19153978	19153990	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon64
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19153989	19154402	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon64
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19154403	19154406	.	?	.	Parent=repeat_region64
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	19347537	19354961	.	?	.	ID=repeat_region65
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19347537	19347540	.	?	.	Parent=repeat_region65
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	19347541	19354957	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon65;Parent=repeat_region65;ltr_similarity=99.75;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19347541	19347941	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon65
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	19347945	19347972	28	+	.	Parent=LTR_retrotransposon65;trna=Arg-TCG;trnaoffset=0;pbsoffset=3;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	19351600	19352122	1.68e-44	+	0	Parent=LTR_retrotransposon65;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	19353460	19353910	9.37e-36	+	0	Parent=LTR_retrotransposon65;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	19354542	19354556	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon65
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19354556	19354957	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon65
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19354958	19354961	.	?	.	Parent=repeat_region65
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	19657676	19665292	.	?	.	ID=repeat_region66
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19657676	19657679	.	?	.	Parent=repeat_region66
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	19657680	19665288	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon66;Parent=repeat_region66;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19657680	19658197	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon66
seq0	LTRdigest	RR_tract	19658196	19658208	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon66
seq0	LTRdigest	protein_match	19659508	19659949	7.66e-28	-	2	Parent=LTR_retrotransposon66;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	19661236	19661758	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon66;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	19664754	19664768	15	-	.	Parent=LTR_retrotransposon66;trna=Lys-TTT;trnaoffset=0;pbsoffset=2;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19664771	19665288	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon66
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19665289	19665292	.	?	.	Parent=repeat_region66
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	19703587	19712673	.	?	.	ID=repeat_region67
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19703587	19703590	.	?	.	Parent=repeat_region67
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	19703591	19712669	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon67;Parent=repeat_region67;ltr_similarity=97.06;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19703591	19704019	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon67
seq0	LTRdigest	protein_match	19706549	19706963	5.88e-16	-	0	Parent=LTR_retrotransposon67;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	19707956	19708364	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon67;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	19712228	19712669	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon67
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	19712670	19712673	.	?	.	Parent=repeat_region67
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20005924	20010950	.	?	.	ID=repeat_region68
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20005924	20005927	.	?	.	Parent=repeat_region68
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20005928	20010946	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon68;Parent=repeat_region68;ltr_similarity=99.27;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20005928	20006198	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon68
seq0	LTRdigest	protein_match	20007536	20007584	4.4e-09	+	0	Parent=LTR_retrotransposon68;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	protein_match	20008253	20008754	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon68;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	20009780	20010236	1.9e-41	+	0	Parent=LTR_retrotransposon68;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20010674	20010946	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon68
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20010947	20010950	.	?	.	Parent=repeat_region68
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20272777	20277930	.	?	.	ID=repeat_region69
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20272777	20272781	.	?	.	Parent=repeat_region69
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20272782	20277925	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon69;Parent=repeat_region69;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20272782	20273057	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon69
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	20273058	20273071	7.58	+	.	Parent=LTR_retrotransposon69;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	20274638	20275133	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon69;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	20275937	20276642	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon69;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	20276640	20276697	4.8e-09	+	0	Parent=LTR_retrotransposon69;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20277650	20277925	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon69
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20277926	20277930	.	?	.	Parent=repeat_region69
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20303212	20310630	.	?	.	ID=repeat_region70
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20303212	20303215	.	?	.	Parent=repeat_region70
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20303216	20310626	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon70;Parent=repeat_region70;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20303216	20303614	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon70
seq0	LTRdigest	RR_tract	20303615	20303629	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon70
seq0	LTRdigest	protein_match	20304258	20304708	9.36e-36	-	2	Parent=LTR_retrotransposon70;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	20306046	20306568	1.68e-44	-	2	Parent=LTR_retrotransposon70;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20310228	20310626	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon70
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20310627	20310630	.	?	.	Parent=repeat_region70
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20407859	20412897	.	?	.	ID=repeat_region71
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20407859	20407862	.	?	.	Parent=repeat_region71
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20407863	20412893	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon71;Parent=repeat_region71;ltr_similarity=99.28;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20407863	20408141	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon71
seq0	LTRdigest	protein_match	20409479	20409527	4.41e-09	+	2	Parent=LTR_retrotransposon71;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	protein_match	20410196	20410697	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon71;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	20411723	20412179	1.9e-41	+	2	Parent=LTR_retrotransposon71;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20412617	20412893	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon71
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20412894	20412897	.	?	.	Parent=repeat_region71
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20576270	20583688	.	?	.	ID=repeat_region72
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20576270	20576273	.	?	.	Parent=repeat_region72
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20576274	20583684	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon72;Parent=repeat_region72;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20576274	20576672	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon72
seq0	LTRdigest	protein_match	20580329	20580851	1.68e-44	+	2	Parent=LTR_retrotransposon72;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	20582189	20582639	9.36e-36	+	2	Parent=LTR_retrotransposon72;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	20583271	20583285	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon72
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20583286	20583684	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon72
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20583685	20583688	.	?	.	Parent=repeat_region72
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	20740287	20748127	.	?	.	ID=repeat_region73
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20740287	20740290	.	?	.	Parent=repeat_region73
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	20740291	20748123	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon73;Parent=repeat_region73;ltr_similarity=95.11;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20740291	20740720	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon73
seq0	LTRdigest	RR_tract	20740718	20740730	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon73
seq0	LTRdigest	protein_match	20742698	20743151	3.03e-31	-	1	Parent=LTR_retrotransposon73;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	20744360	20744882	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon73;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	20747674	20748123	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon73
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	20748124	20748127	.	?	.	Parent=repeat_region73
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21041178	21049419	.	?	.	ID=repeat_region74
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21041178	21041181	.	?	.	Parent=repeat_region74
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21041182	21049415	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon74;Parent=repeat_region74;ltr_similarity=96.06;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21041182	21041612	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon74
seq0	LTRdigest	protein_match	21044830	21045352	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon74;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	21046561	21047014	3.22e-31	+	0	Parent=LTR_retrotransposon74;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	21048985	21048997	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon74
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21048995	21049415	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon74
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21049416	21049419	.	?	.	Parent=repeat_region74
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21199386	21202319	.	?	.	ID=repeat_region75
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21199386	21199389	.	?	.	Parent=repeat_region75
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21199390	21202315	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon75;Parent=repeat_region75;ltr_similarity=96.41;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21199390	21199994	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon75
seq0	LTRdigest	RR_tract	21201675	21201690	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon75
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21201704	21202315	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon75
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21202316	21202319	.	?	.	Parent=repeat_region75
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21347601	21355023	.	?	.	ID=repeat_region76
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21347601	21347604	.	?	.	Parent=repeat_region76
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21347605	21355019	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon76;Parent=repeat_region76;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21347605	21348003	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon76
seq0	LTRdigest	protein_match	21351661	21352183	1.68e-44	+	0	Parent=LTR_retrotransposon76;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	21353521	21353971	9.36e-36	+	0	Parent=LTR_retrotransposon76;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	21354606	21354620	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon76
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21354621	21355019	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon76
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21355020	21355023	.	?	.	Parent=repeat_region76
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21441092	21450234	.	?	.	ID=repeat_region77
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21441092	21441095	.	?	.	Parent=repeat_region77
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21441096	21450230	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon77;Parent=repeat_region77;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21441096	21441523	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon77
seq0	LTRdigest	protein_match	21445443	21445851	0	+	0	Parent=LTR_retrotransposon77;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	21446844	21447258	5.92e-16	+	0	Parent=LTR_retrotransposon77;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21449803	21450230	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon77
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21450231	21450234	.	?	.	Parent=repeat_region77
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21460030	21465268	.	?	.	ID=repeat_region78
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21460030	21460033	.	?	.	Parent=repeat_region78
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21460034	21465264	.	?	.	ID=LTR_retrotransposon78;Parent=repeat_region78;ltr_similarity=96.05;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21460034	21460210	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon78
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21465092	21465264	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon78
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21465265	21465268	.	?	.	Parent=repeat_region78
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21597080	21604774	.	?	.	ID=repeat_region79
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21597080	21597083	.	?	.	Parent=repeat_region79
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21597084	21604770	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon79;Parent=repeat_region79;ltr_similarity=98.84;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21597084	21597512	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon79
seq0	LTRdigest	protein_match	21601399	21601525	7.22e-19	+	1	Parent=LTR_retrotransposon79;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	21602659	21603073	4.83e-16	+	1	Parent=LTR_retrotransposon79;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21604339	21604770	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon79
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21604771	21604774	.	?	.	Parent=repeat_region79
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21653243	21656499	.	?	.	ID=repeat_region80
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21653243	21653246	.	?	.	Parent=repeat_region80
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21653247	21656495	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon80;Parent=repeat_region80;ltr_similarity=98.30;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21653247	21653599	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon80
seq0	LTRdigest	protein_match	21654409	21654460	1.74e-08	+	1	Parent=LTR_retrotransposon80;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	protein_match	21655187	21655319	3.9e-10	+	2	Parent=LTR_retrotransposon80;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21656148	21656495	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon80
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21656496	21656499	.	?	.	Parent=repeat_region80
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21691878	21698298	.	?	.	ID=repeat_region81
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21691878	21691881	.	?	.	Parent=repeat_region81
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21691882	21698294	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon81;Parent=repeat_region81;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21691882	21692157	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon81
seq0	LTRdigest	RR_tract	21692156	21692168	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon81
seq0	LTRdigest	protein_match	21693426	21693867	2.54e-30	-	2	Parent=LTR_retrotransposon81;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	21695118	21695637	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon81;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21698019	21698294	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon81
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21698295	21698298	.	?	.	Parent=repeat_region81
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	21981748	21990882	.	?	.	ID=repeat_region82
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21981748	21981751	.	?	.	Parent=repeat_region82
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	21981752	21990878	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon82;Parent=repeat_region82;ltr_similarity=93.74;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21981752	21982203	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon82
seq0	LTRdigest	protein_match	21984706	21985120	5.91e-16	-	1	Parent=LTR_retrotransposon82;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	21986113	21986521	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon82;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	21990416	21990878	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon82
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	21990879	21990882	.	?	.	Parent=repeat_region82
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22066503	22071946	.	?	.	ID=repeat_region83
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22066503	22066506	.	?	.	Parent=repeat_region83
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22066507	22071942	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon83;Parent=repeat_region83;ltr_similarity=96.65;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22066507	22067157	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon83
seq0	LTRdigest	RR_tract	22071256	22071263	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon83
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22071287	22071942	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon83
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22071943	22071946	.	?	.	Parent=repeat_region83
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22201403	22206556	.	?	.	ID=repeat_region84
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22201403	22201407	.	?	.	Parent=repeat_region84
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22201408	22206551	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon84;Parent=repeat_region84;ltr_similarity=100.00;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22201408	22201683	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon84
seq0	LTRdigest	protein_match	22202632	22203394	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon84;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	22204198	22204693	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon84;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22206262	22206275	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon84;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22206276	22206551	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon84
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22206552	22206556	.	?	.	Parent=repeat_region84
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22229463	22234308	.	?	.	ID=repeat_region85
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22229463	22229466	.	?	.	Parent=repeat_region85
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22229467	22234304	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon85;Parent=repeat_region85;ltr_similarity=97.60;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22229467	22229630	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon85
seq0	LTRdigest	RR_tract	22229602	22229626	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon85
seq0	LTRdigest	protein_match	22230165	22230540	2.83e-34	-	2	Parent=LTR_retrotransposon85;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22231564	22231900	3.7e-29	-	1	Parent=LTR_retrotransposon85;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	22232221	22232488	5.89e-12	-	1	Parent=LTR_retrotransposon85;name=RVP;id=PF00077.11
seq0	LTRdigest	protein_match	22232620	22232665	1.48e-08	-	1	Parent=LTR_retrotransposon85;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22234126	22234138	12.8	-	.	Parent=LTR_retrotransposon85;trna=Leu-CAA;trnaoffset=2;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22234138	22234304	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon85
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22234305	22234308	.	?	.	Parent=repeat_region85
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22269689	22272608	.	?	.	ID=repeat_region86
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22269689	22269692	.	?	.	Parent=repeat_region86
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22269693	22272604	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon86;Parent=repeat_region86;ltr_similarity=95.62;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22269693	22269825	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon86
seq0	LTRdigest	protein_match	22270285	22270654	1.45e-18	-	0	Parent=LTR_retrotransposon86;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22271540	22272017	2.38e-44	-	2	Parent=LTR_retrotransposon86;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22272456	22272468	12.8	-	.	Parent=LTR_retrotransposon86;trna=Leu-CAA;trnaoffset=2;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22272468	22272604	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon86
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22272605	22272608	.	?	.	Parent=repeat_region86
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22283447	22290104	.	?	.	ID=repeat_region87
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22283447	22283450	.	?	.	Parent=repeat_region87
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22283451	22290100	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon87;Parent=repeat_region87;ltr_similarity=99.30;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22283451	22283737	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon87
seq0	LTRdigest	protein_match	22283730	22285119	0	-	1	Parent=LTR_retrotransposon87;name=Gypsy;id=PF07253.2
seq0	LTRdigest	RR_tract	22283736	22283744	.	-	.	Parent=LTR_retrotransposon87
seq0	LTRdigest	protein_match	22285534	22285960	4.03e-31	-	0	Parent=LTR_retrotransposon87;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22287211	22287736	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon87;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22289814	22290100	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon87
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22290101	22290104	.	?	.	Parent=repeat_region87
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22315668	22318162	.	?	.	ID=repeat_region88
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22315668	22315672	.	?	.	Parent=repeat_region88
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22315673	22318157	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon88;Parent=repeat_region88;ltr_similarity=97.56;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22315673	22315877	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon88
seq0	LTRdigest	protein_match	22316613	22317315	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon88;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	22317682	22317817	5.27e-12	-	1	Parent=LTR_retrotransposon88;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22317936	22317949	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon88;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=3;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22317953	22318157	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon88
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22318158	22318162	.	?	.	Parent=repeat_region88
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22329285	22334337	.	?	.	ID=repeat_region89
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22329285	22329288	.	?	.	Parent=repeat_region89
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22329289	22334333	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon89;Parent=repeat_region89;ltr_similarity=92.16;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22329289	22329544	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon89
seq0	LTRdigest	protein_match	22330240	22330570	8.1e-23	-	1	Parent=LTR_retrotransposon89;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22331608	22331830	1.17e-20	-	1	Parent=LTR_retrotransposon89;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	22332923	22332971	1.73e-09	-	0	Parent=LTR_retrotransposon89;name=zf-CCHC;id=PF00098.14
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22334056	22334066	10.8	-	.	Parent=LTR_retrotransposon89;trna=Leu-CAA;trnaoffset=2;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22334066	22334333	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon89
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22334334	22334337	.	?	.	Parent=repeat_region89
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22498394	22507487	.	?	.	ID=repeat_region90
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22498394	22498397	.	?	.	Parent=repeat_region90
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22498398	22507483	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon90;Parent=repeat_region90;ltr_similarity=98.61;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22498398	22498830	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon90
seq0	LTRdigest	protein_match	22501351	22501765	5.88e-16	-	0	Parent=LTR_retrotransposon90;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22502758	22503166	0	-	0	Parent=LTR_retrotransposon90;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22507056	22507483	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon90
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22507484	22507487	.	?	.	Parent=repeat_region90
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22657876	22666457	.	?	.	ID=repeat_region91
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22657876	22657879	.	?	.	Parent=repeat_region91
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22657880	22666453	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon91;Parent=repeat_region91;ltr_similarity=99.38;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22657880	22658200	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon91
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22658204	22658218	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon91;trna=Tyr-GTA;trnaoffset=0;pbsoffset=3;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	22662808	22663282	0	+	2	Parent=LTR_retrotransposon91;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	22664185	22664659	3.33e-17	+	2	Parent=LTR_retrotransposon91;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	RR_tract	22666120	22666133	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon91
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22666132	22666453	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon91
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22666454	22666457	.	?	.	Parent=repeat_region91
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22780914	22786615	.	?	.	ID=repeat_region92
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22780914	22780917	.	?	.	Parent=repeat_region92
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22780918	22786611	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon92;Parent=repeat_region92;ltr_similarity=96.12;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22780918	22781433	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon92
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22781433	22781447	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon92;trna=Lys-CTT;trnaoffset=0;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	22784025	22784265	2.04e-25	+	2	Parent=LTR_retrotransposon92;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	22784989	22785106	7.04e-11	+	0	Parent=LTR_retrotransposon92;name=Gypsy;id=PF07253.2
seq0	LTRdigest	protein_match	22785169	22785745	9.45e-13	+	0	Parent=LTR_retrotransposon92;name=Gypsy;id=PF07253.2
seq0	LTRdigest	RR_tract	22786089	22786101	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon92
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22786099	22786611	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon92
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22786612	22786615	.	?	.	Parent=repeat_region92
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22791517	22800505	.	?	.	ID=repeat_region93
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22791517	22791520	.	?	.	Parent=repeat_region93
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22791521	22800501	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon93;Parent=repeat_region93;ltr_similarity=99.37;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22791521	22792319	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon93
seq0	LTRdigest	protein_match	22796855	22796987	2.94e-34	+	0	Parent=LTR_retrotransposon93;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	22796991	22797327	0	+	1	Parent=LTR_retrotransposon93;name=Peptidase_A17;id=PF05380.4
seq0	LTRdigest	protein_match	22798203	22798701	8.68e-14	+	1	Parent=LTR_retrotransposon93;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22799705	22800501	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon93
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22800502	22800505	.	?	.	Parent=repeat_region93
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22835714	22841785	.	?	.	ID=repeat_region94
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22835714	22835717	.	?	.	Parent=repeat_region94
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22835718	22841781	.	+	.	ID=LTR_retrotransposon94;Parent=repeat_region94;ltr_similarity=97.03;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22835718	22836221	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon94
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	22836221	22836235	15	+	.	Parent=LTR_retrotransposon94;trna=Lys-CTT;trnaoffset=0;pbsoffset=1;edist=0
seq0	LTRdigest	protein_match	22839203	22839443	2.19e-25	+	2	Parent=LTR_retrotransposon94;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	22840167	22840284	7.53e-11	+	0	Parent=LTR_retrotransposon94;name=Gypsy;id=PF07253.2
seq0	LTRdigest	RR_tract	22841266	22841278	.	+	.	Parent=LTR_retrotransposon94
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22841277	22841781	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon94
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22841782	22841785	.	?	.	Parent=repeat_region94
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	22950622	22956085	.	?	.	ID=repeat_region95
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22950622	22950625	.	?	.	Parent=repeat_region95
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	22950626	22956081	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon95;Parent=repeat_region95;ltr_similarity=94.41;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22950626	22950925	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon95
seq0	LTRdigest	protein_match	22951481	22951937	3.72e-42	-	1	Parent=LTR_retrotransposon95;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	protein_match	22952969	22953251	4.33e-30	-	1	Parent=LTR_retrotransposon95;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRdigest	protein_match	22953286	22953463	1.23e-17	-	2	Parent=LTR_retrotransposon95;name=RVT_1;id=PF00078.18
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	22955778	22956081	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon95
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	22956082	22956085	.	?	.	Parent=repeat_region95
###
seq0	LTRharvest	repeat_region	23004543	23009700	.	?	.	ID=repeat_region96
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	23004543	23004546	.	?	.	Parent=repeat_region96
seq0	LTRharvest	LTR_retrotransposon	23004547	23009696	.	-	.	ID=LTR_retrotransposon96;Parent=repeat_region96;ltr_similarity=98.92;seq_number=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	23004547	23004824	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon96
seq0	LTRdigest	protein_match	23005770	23006532	0	-	2	Parent=LTR_retrotransposon96;name=RVT_2;id=PF07727.5
seq0	LTRdigest	protein_match	23007336	23007831	1.4e-45	-	2	Parent=LTR_retrotransposon96;name=rve;id=PF00665.17
seq0	LTRdigest	primer_binding_site	23009404	23009417	7.58	-	.	Parent=LTR_retrotransposon96;trna=Met-CAT;trnaoffset=33;pbsoffset=0;edist=0
seq0	LTRharvest	long_terminal_repeat	23009418	23009696	.	?	.	Parent=LTR_retrotransposon96
seq0	LTRharvest	target_site_duplication	23009697	23009700	.	?	.	Parent=repeat_region96