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CC= gcc
CFLAGS+= -g -Wall -O2 -Wc++-compat
INCLUDES= -I.
OBJS= sys.o sdict.o paf.o asg.o common.o hit.o asm.o
PROG= miniasm minidot
LIBS= -lm -lz -lpthread
.SUFFIXES:.c .o
.c.o:
$(CC) -c $(CFLAGS) $(CXXFLAGS) $(CPPFLAGS) $(INCLUDES) $< -o $@
all:$(PROG)
miniasm:$(OBJS) main.o
$(CC) $(CXXFLAGS) $(CFLAGS) $^ -o $@ $(LIBS) $(LDFLAGS)
minidot:paf.o sdict.o dotter.o
$(CC) $(CXXFLAGS) $(CFLAGS) $^ -o $@ $(LIBS) $(LDFLAGS)
clean:
rm -fr gmon.out *.o a.out $(PROG) *~ *.a *.dSYM session*
depend:
(LC_ALL=C; export LC_ALL; makedepend -Y -- $(CFLAGS) $(DFLAGS) -- *.c)
# DO NOT DELETE
asg.o: asg.h kvec.h ksort.h
asm.o: miniasm.h sdict.h asg.h kvec.h kdq.h kseq.h
common.o: miniasm.h sdict.h asg.h
dotter.o: paf.h sdict.h kvec.h eps.h ksort.h
hit.o: sdict.h paf.h kvec.h sys.h miniasm.h asg.h ksort.h
main.o: kvec.h sys.h paf.h sdict.h miniasm.h asg.h
paf.o: paf.h kseq.h
sdict.o: sdict.h khash.h
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