1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39
|
##fileformat=VCFv4.2
##FILTER=<ID=PASS,Description="All filters passed">
##contig=<ID=chr20,length=64444167>
##INFO=<ID=AC,Number=A,Type=Integer,Description="Alternate Allele Counts">
##INFO=<ID=AN,Number=1,Type=Integer,Description="Total Number Allele Counts">
##phasing=phased
##FORMAT=<ID=GT,Number=1,Type=String,Description="Genotype">
#CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT HG01879 HG00551 HG00403 HG00096 HG01583
chr20 10000775 rs13042390 A G 255 PASS AC=4;AN=10 GT 0|0 0|1 1|0 0|1 1|0
chr20 10001327 rs141420999 A C 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 0|0 0|1
chr20 10001999 rs13038545 A T 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 0|1 0|0
chr20 10002000 rs13037970 C T 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 0|1 0|0
chr20 10002077 rs6057071 G A 255 PASS AC=8;AN=10 GT 1|1 0|1 1|1 1|1 0|1
chr20 10002092 rs559251430 A G 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 1|0 0|0 0|0
chr20 10002161 rs11906973 A T 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 1|0 0|0
chr20 10002243 rs60292786 T C 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 1|0 0|0
chr20 10002468 rs6118851 G A 255 PASS AC=2;AN=10 GT 0|0 0|0 1|1 0|0 0|0
chr20 10002652 rs6039649 T C 255 PASS AC=7;AN=10 GT 1|1 0|0 1|1 1|0 1|1
chr20 10002751 rs74623966 A G 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|0 0|0 1|0 0|0
chr20 10004393 rs17507263 A G 255 PASS AC=4;AN=10 GT 0|1 0|0 1|1 0|0 0|1
chr20 10005015 rs6108374 G A 255 PASS AC=5;AN=10 GT 0|1 0|1 1|1 0|0 0|1
chr20 10005281 rs4816196 T C 255 PASS AC=3;AN=10 GT 0|0 0|0 1|1 0|0 0|1
chr20 10005437 rs8115116 A G 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|1 0|0 0|0 0|0
chr20 10005695 rs6087099 A G 255 PASS AC=8;AN=10 GT 1|1 1|1 1|1 0|1 0|1
chr20 10005758 rs6057072 C T 255 PASS AC=4;AN=10 GT 0|1 0|0 1|1 0|0 0|1
chr20 10005834 rs56242456 T C 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|1 0|0 0|0 0|0
chr20 10006207 rs78434004 C A 255 PASS AC=2;AN=10 GT 0|0 0|0 0|1 0|0 0|1
chr20 10006628 rs8123132 C T 255 PASS AC=3;AN=10 GT 1|0 1|0 0|0 0|1 0|0
chr20 10006761 rs6118852 A G 255 PASS AC=4;AN=10 GT 0|0 0|1 1|1 0|0 0|1
chr20 10006826 rs4816197 A G 255 PASS AC=4;AN=10 GT 0|0 0|1 1|1 0|0 0|1
chr20 10007565 rs8124931 C A 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|1 0|0 0|0 0|0 0|0
chr20 10008603 rs4816199 G A 255 PASS AC=8;AN=10 GT 1|1 1|1 1|1 0|1 0|1
chr20 10009048 rs7343217 G A 255 PASS AC=3;AN=10 GT 0|0 0|0 1|1 0|0 0|1
chr20 10009051 rs881767 A G 255 PASS AC=4;AN=10 GT 1|1 1|0 0|0 0|1 0|0
chr20 10009180 rs2327258 C T 255 PASS AC=8;AN=10 GT 1|1 1|1 1|1 0|1 0|1
chr20 10009286 rs4078321 G A 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|1 0|0 0|0 0|0
chr20 10009481 rs724674 G A 255 PASS AC=8;AN=10 GT 1|1 1|1 1|1 0|1 0|1
chr20 10009685 rs35232282 CTA C 255 PASS AC=3;AN=10 GT 0|0 0|0 1|1 0|0 0|1
chr20 10009927 rs12480468 C T 255 PASS AC=1;AN=10 GT 0|0 0|1 0|0 0|0 0|0
|