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Folder: modules
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.. (parent) | |||
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- | rw-r--r-- | 1,144 | adapterRemoval.md |
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- | rw-r--r-- | 456 | afterqc.md |
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- | rw-r--r-- | 396 | bamtools.md |
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- | rw-r--r-- | 1,772 | bbmap.md |
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- | rw-r--r-- | 967 | bcftools.md |
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- | rw-r--r-- | 537 | bcl2fastq.md |
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- | rw-r--r-- | 625 | biobambam2.md |
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- | rw-r--r-- | 714 | biobloomtools.md |
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- | rw-r--r-- | 786 | biscuit.md |
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- | rw-r--r-- | 419 | bismark.md |
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- | rw-r--r-- | 290 | bowtie1.md |
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- | rw-r--r-- | 1,627 | bowtie2.md |
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- | rw-r--r-- | 610 | busco.md |
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- | rw-r--r-- | 415 | clipandmerge.md |
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- | rw-r--r-- | 784 | clusterflow.md |
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- | rw-r--r-- | 470 | conpair.md |
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- | rw-r--r-- | 970 | cutadapt.md |
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- | rw-r--r-- | 254 | damageprofiler.md |
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- | rw-r--r-- | 478 | dedup.md |
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- | rw-r--r-- | 1,995 | deeptools.md |
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- | rw-r--r-- | 497 | disambiguate.md |
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- | rw-r--r-- | 1,748 | dragen.md |
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- | rw-r--r-- | 637 | fastp.md |
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- | rw-r--r-- | 1,096 | fastq_screen.md |
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- | rw-r--r-- | 3,984 | fastqc.md |
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- | rw-r--r-- | 616 | featureCounts.md |
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- | rw-r--r-- | 446 | fgbio.md |
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- | rw-r--r-- | 1,226 | flash.md |
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- | rw-r--r-- | 424 | flexbar.md |
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- | rw-r--r-- | 1,457 | gatk.md |
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- | rw-r--r-- | 1,009 | goleft_indexcov.md |
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- | rw-r--r-- | 232 | happy.md |
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- | rw-r--r-- | 323 | hicexplorer.md |
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- | rw-r--r-- | 316 | hicpro.md |
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- | rw-r--r-- | 397 | hicup.md |
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- | rw-r--r-- | 1,288 | hisat2.md |
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- | rw-r--r-- | 1,134 | homer.md |
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- | rw-r--r-- | 670 | htseq.md |
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- | rw-r--r-- | 1,000 | interop.md |
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- | rw-r--r-- | 393 | ivar.md |
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- | rw-r--r-- | 1,194 | jellyfish.md |
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- | rw-r--r-- | 532 | kaiju.md |
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- | rw-r--r-- | 655 | kallisto.md |
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- | rw-r--r-- | 371 | kat.md |
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- | rw-r--r-- | 791 | kraken.md |
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- | rw-r--r-- | 374 | leehom.md |
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- | rw-r--r-- | 799 | longranger.md |
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- | rw-r--r-- | 580 | macs2.md |
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- | rw-r--r-- | 592 | malt.md |
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- | rw-r--r-- | 296 | methylQA.md |
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- | rw-r--r-- | 552 | minionqc.md |
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- | rw-r--r-- | 554 | mirtop.md |
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- | rw-r--r-- | 1,047 | mirtrace.md |
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- | rw-r--r-- | 2,062 | mosdepth.md |
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- | rw-r--r-- | 238 | mtnucratio.md |
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- | rw-r--r-- | 542 | multivcfanalyzer.md |
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- | rw-r--r-- | 663 | peddy.md |
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- | rw-r--r-- | 650 | phantompeakqualtools.md |
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- | rw-r--r-- | 4,111 | picard.md |
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- | rw-r--r-- | 2,830 | preseq.md |
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- | rw-r--r-- | 1,000 | prokka.md |
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- | rw-r--r-- | 503 | pycoqc.md |
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- | rw-r--r-- | 784 | qorts.md |
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- | rw-r--r-- | 1,880 | qualimap.md |
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- | rw-r--r-- | 2,077 | quast.md |
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- | rw-r--r-- | 694 | rna_seqc.md |
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- | rw-r--r-- | 413 | rockhopper.md |
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- | rw-r--r-- | 533 | rsem.md |
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- | rw-r--r-- | 1,057 | rseqc.md |
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- | rw-r--r-- | 332 | salmon.md |
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- | rw-r--r-- | 380 | samblaster.md |
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- | rw-r--r-- | 1,353 | samtools.md |
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- | rw-r--r-- | 368 | sargasso.md |
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- | rw-r--r-- | 506 | seqyclean.md |
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- | rw-r--r-- | 407 | sexdeterrmine.md |
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- | rw-r--r-- | 441 | sickle.md |
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- | rw-r--r-- | 414 | skewer.md |
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- | rw-r--r-- | 310 | slamdunk.md |
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- | rw-r--r-- | 751 | snpeff.md |
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- | rw-r--r-- | 519 | somalier.md |
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- | rw-r--r-- | 827 | sortmerna.md |
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- | rw-r--r-- | 664 | star.md |
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- | rw-r--r-- | 1,535 | supernova.md |
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- | rw-r--r-- | 710 | trimmomatic.md |
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- | rw-r--r-- | 879 | varscan2.md |
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- | rw-r--r-- | 1,470 | vcftools.md |
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- | rw-r--r-- | 1,562 | verifybamid.md |