1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174
|
/home/aphillip/web/mummer/examples/data/B_anthracis_Mslice.fasta /home/aphillip/web/mummer/examples/data/B_anthracis_contigs.fasta
NUCMER
>B_anthracis_Mslice 137795 312600 863
1 -1
131191 848 25 - -
131264 777 66 48 46
131331 711 711 1 0
>B_anthracis_Mslice 137797 312600 985
1 1
133048 3 48 - -
133097 52 767 1 1
133866 821 28 2 2
133981 931 20 87 82
134002 951 35 1 0
>B_anthracis_Mslice 137827 312600 851
1 1
29078 1 725 - -
29804 726 54 1 0
>B_anthracis_Mslice 137829 312600 879
1 -1
23410 821 32 - -
23443 789 23 1 0
23471 761 738 5 5
24209 22 22 0 1
>B_anthracis_Mslice 137892 312600 701
1 1
40129 1 572 - -
40707 581 28 6 8
40735 610 23 0 1
40776 651 29 18 18
>B_anthracis_Mslice 137957 312600 822
1 1
294295 1 38 - -
294335 41 639 2 2
294992 698 27 18 18
295021 727 37 2 2
295069 773 30 11 9
>B_anthracis_Mslice 137999 312600 1414
1 1
204363 14 39 - -
204403 53 19 1 0
204423 72 20 1 0
204457 104 1207 14 12
205665 1312 28 1 1
205703 1350 38 10 10
205747 1394 21 6 6
>B_anthracis_Mslice 138021 312600 4574
1 1
230583 1 4574 - -
>B_anthracis_Mslice 138043 312600 973
1 -1
188452 973 196 - -
188657 767 767 9 10
>B_anthracis_Mslice 138045 312600 1120
1 1
270657 1 1120 - -
>B_anthracis_Mslice 138059 312600 1202
1 -1
190507 1202 1202 - -
>B_anthracis_Mslice 138088 312600 1012
1 1
203485 1 1012 - -
>B_anthracis_Mslice 138123 312600 781
1 -1
75553 734 21 - -
75615 674 36 41 39
75657 632 578 6 6
76236 53 53 1 1
>B_anthracis_Mslice 138127 312600 693
1 -1
189674 663 663 - -
>B_anthracis_Mslice 138186 312600 8814
1 -1
100476 8814 168 - -
100645 8645 8642 1 1
>B_anthracis_Mslice 138207 312600 2878
1 1
282953 35 21 - -
282983 63 2816 9 7
>B_anthracis_Mslice 138208 312600 25608
1 1
285887 1 26 - -
285914 27 134 1 0
286053 166 9165 5 5
295218 9332 16273 0 1
>B_anthracis_Mslice 138232 312600 3008
1 -1
200483 3008 3008 - -
>B_anthracis_Mslice 138233 312600 8514
1 -1
191975 8514 8497 - -
>B_anthracis_Mslice 138236 312600 6708
1 -1
223993 6708 6686 - -
230679 21 19 0 1
>B_anthracis_Mslice 138237 312600 43159
1 -1
113964 43147 36 - -
114001 43111 43045 1 0
157047 66 34 1 0
1 -1
130353 26672 21 - -
130374 26650 53 0 1
130434 26589 27 7 8
130466 26556 24 5 6
1 -1
130440 26759 21 - -
130462 26738 53 1 0
130523 26678 27 8 7
130556 26646 24 6 5
>B_anthracis_Mslice 138238 312600 4590
1 -1
109391 4590 786 - -
110178 3804 3784 1 0
>B_anthracis_Mslice 138239 312600 12394
1 -1
80219 12394 9160 - -
89379 3232 3159 0 2
92538 72 59 0 1
>B_anthracis_Mslice 138259 312600 18096
1 -1
205830 18092 1916 - -
207747 16175 16154 1 1
>B_anthracis_Mslice 138261 312600 7422
1 -1
93043 7422 7422 - -
>B_anthracis_Mslice 138262 312600 3659
1 -1
76589 3656 3656 - -
>B_anthracis_Mslice 138291 312600 32872
1 -1
19965 32866 10769 - -
30735 22096 4328 1 1
35064 17767 47 1 1
35111 17719 4007 0 1
39119 13711 13691 1 1
>B_anthracis_Mslice 138310 312600 7647
1 -1
12338 7568 7568 - -
>B_anthracis_Mslice 138330 312600 10819
1 1
272163 1 49 - -
272213 51 10753 1 1
>B_anthracis_Mslice 138378 312600 35186
1 1
235270 1 10413 - -
245683 10415 13458 0 1
259142 23873 32 1 0
259175 23906 11256 1 1
270432 35163 24 1 1
1 1
259059 24136 54 - -
259122 24199 31 9 9
259154 24231 86 1 1
259257 24334 42 17 17
1 1
259405 23791 54 - -
259500 23885 20 41 40
259603 23988 42 83 83
>B_anthracis_Mslice 138387 312600 31149
1 -1
156798 31147 31123 - -
187923 22 22 2 2
>B_anthracis_Mslice 138388 312600 22500
1 -1
52816 22500 14357 - -
67173 8142 8142 0 1
>B_anthracis_Mslice 138389 312600 6944
1 -1
5224 6944 3395 - -
8620 3549 52 1 0
8682 3487 20 10 10
8762 3412 67 60 55
8830 3345 3345 1 0
|