1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
|
/*****************************************************************************
/
/ SPACE (SPArse Cholesky Elimination) Library: types.h
/
/ author J"urgen Schulze, University of Paderborn
/ created 99sep14
/
/ This file contains the fundamental data structures
/
******************************************************************************/
/*****************************************************************************
A macro defining the size of integers
(modified for compatibility with MUMPS)
******************************************************************************/
#if defined(INTSIZE64) || defined(PORD_INTSIZE64)
#include <inttypes.h>
#define PORD_INT int64_t
#else
#define PORD_INT int
#endif
typedef double FLOAT;
typedef PORD_INT options_t;
typedef FLOAT timings_t;
/*****************************************************************************
Graph object
******************************************************************************/
typedef struct _graph {
PORD_INT nvtx;
PORD_INT nedges;
PORD_INT type;
PORD_INT totvwght;
PORD_INT *xadj;
PORD_INT *adjncy;
PORD_INT *vwght;
} graph_t;
/*****************************************************************************
Graph bisection object
******************************************************************************/
typedef struct _gbisect {
graph_t *G;
PORD_INT *color;
PORD_INT cwght[3];
} gbisect_t;
/*****************************************************************************
Domain decomposition object
******************************************************************************/
typedef struct _domdec {
graph_t *G;
PORD_INT ndom;
PORD_INT domwght;
PORD_INT *vtype;
PORD_INT *color;
PORD_INT cwght[3];
PORD_INT *map;
struct _domdec *prev, *next;
} domdec_t;
/*****************************************************************************
Bipartite graph object
******************************************************************************/
typedef struct _gbipart {
graph_t *G;
PORD_INT nX;
PORD_INT nY;
} gbipart_t;
/*****************************************************************************
Recursive nested dissection object
******************************************************************************/
typedef struct _nestdiss {
graph_t *G;
PORD_INT *map;
PORD_INT depth;
PORD_INT nvint;
PORD_INT *intvertex;
PORD_INT *intcolor;
PORD_INT cwght[3];
struct _nestdiss *parent, *childB, *childW;
} nestdiss_t;
/*****************************************************************************
Multisector object
******************************************************************************/
typedef struct _multisector {
graph_t *G;
PORD_INT *stage;
PORD_INT nstages;
PORD_INT nnodes;
PORD_INT totmswght;
} multisector_t;
/*****************************************************************************
Elimination graph object
******************************************************************************/
typedef struct _gelim {
graph_t *G;
PORD_INT maxedges;
PORD_INT *len;
PORD_INT *elen;
PORD_INT *parent;
PORD_INT *degree;
PORD_INT *score;
} gelim_t;
/*****************************************************************************
Bucket structure object
******************************************************************************/
typedef struct _bucket {
PORD_INT maxbin, maxitem;
PORD_INT offset;
PORD_INT nobj;
PORD_INT minbin;
PORD_INT *bin;
PORD_INT *next;
PORD_INT *last;
PORD_INT *key;
} bucket_t;
/*****************************************************************************
Minimum priority object
******************************************************************************/
typedef struct _stageinfo stageinfo_t;
typedef struct _minprior {
gelim_t *Gelim;
multisector_t *ms;
bucket_t *bucket;
stageinfo_t *stageinfo;
PORD_INT *reachset;
PORD_INT nreach;
PORD_INT *auxaux;
PORD_INT *auxbin;
PORD_INT *auxtmp;
PORD_INT flag;
} minprior_t;
struct _stageinfo {
PORD_INT nstep;
PORD_INT welim;
PORD_INT nzf;
FLOAT ops;
};
/*****************************************************************************
Elimination tree object
******************************************************************************/
typedef struct _elimtree {
PORD_INT nvtx;
PORD_INT nfronts;
PORD_INT root;
PORD_INT *ncolfactor;
PORD_INT *ncolupdate;
PORD_INT *parent;
PORD_INT *firstchild;
PORD_INT *silbings;
PORD_INT *vtx2front;
} elimtree_t;
/*****************************************************************************
Input matrix object
******************************************************************************/
typedef struct _inputMtx {
PORD_INT neqs;
PORD_INT nelem;
FLOAT *diag;
FLOAT *nza;
PORD_INT *xnza;
PORD_INT *nzasub;
} inputMtx_t;
/*****************************************************************************
Dense matrix object
******************************************************************************/
typedef struct _workspace workspace_t;
typedef struct _denseMtx {
workspace_t *ws;
PORD_INT front;
PORD_INT owned;
PORD_INT ncol;
PORD_INT nrow;
PORD_INT nelem;
PORD_INT nfloats;
PORD_INT *colind;
PORD_INT *rowind;
PORD_INT *collen;
FLOAT *entries;
FLOAT *mem;
struct _denseMtx *prevMtx, *nextMtx;
} denseMtx_t;
struct _workspace {
FLOAT *mem;
PORD_INT size;
PORD_INT maxsize;
PORD_INT incr;
denseMtx_t *lastMtx;
};
/*****************************************************************************
Compressed subscript structure object
******************************************************************************/
typedef struct _css {
PORD_INT neqs;
PORD_INT nind;
PORD_INT owned;
PORD_INT *xnzl;
PORD_INT *nzlsub;
PORD_INT *xnzlsub;
} css_t;
/*****************************************************************************
Front subscript object
******************************************************************************/
typedef struct _frontsub {
elimtree_t *PTP;
PORD_INT nind;
PORD_INT *xnzf;
PORD_INT *nzfsub;
} frontsub_t;
/*****************************************************************************
Factor matrix object
******************************************************************************/
typedef struct _factorMtx {
PORD_INT nelem;
PORD_INT *perm;
FLOAT *nzl;
css_t *css;
frontsub_t *frontsub;
} factorMtx_t;
/*****************************************************************************
Mapping object
******************************************************************************/
typedef struct _groupinfo groupinfo_t;
typedef struct {
elimtree_t *T;
PORD_INT dimQ;
PORD_INT maxgroup;
PORD_INT *front2group;
groupinfo_t *groupinfo;
} mapping_t;
struct _groupinfo {
FLOAT ops;
PORD_INT nprocs;
PORD_INT nfronts;
};
/*****************************************************************************
Topology object
******************************************************************************/
typedef struct {
PORD_INT nprocs;
PORD_INT mygridId;
PORD_INT dimX;
PORD_INT dimY;
PORD_INT myQId;
PORD_INT dimQ;
PORD_INT *cube2grid;
#ifdef PARIX
LinkCB_t **link;
#endif
#ifdef MPI
MPI_Comm comm;
MPI_Status status;
#endif
} topology_t;
/*****************************************************************************
Communication buffer object
******************************************************************************/
typedef struct {
char *data;
size_t len;
size_t maxlen;
} buffer_t;
/*****************************************************************************
Bit mask object
******************************************************************************/
typedef struct {
PORD_INT dimQ;
PORD_INT maxgroup;
PORD_INT mygroupId;
PORD_INT offset;
PORD_INT *group;
PORD_INT *colbits, *colmask;
PORD_INT *rowbits, *rowmask;
} mask_t;
|
