package info (click to toggle)
ncbi-tools6 6.1.20120620-8
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: jessie, jessie-kfreebsd
  • size: 241,628 kB
  • ctags: 101,236
  • sloc: ansic: 1,431,713; cpp: 6,248; pascal: 3,949; xml: 3,390; sh: 3,090; perl: 1,077; csh: 488; makefile: 449; ruby: 93; lisp: 81

Folder: tools

d .. (parent)
- - rw-r--r-- 107,467 actutils.c
- - rw-r--r-- 9,154 actutils.h
- - rw-r--r-- 11,834 bandalg0.c
- - rw-r--r-- 7,188 bandalg1.c
- - rw-r--r-- 15,590 bandalg2.c
- - rw-r--r-- 8,317 bandalg3.c
- - rw-r--r-- 23,091 bandalg4.c
- - rw-r--r-- 9,848 bandalg5.c
- - rw-r--r-- 35,927 bandalgn.c
- - rw-r--r-- 15,396 bandalgn.h
- - rw-r--r-- 410,837 blast.c
- - rw-r--r-- 34,862 blast.h
- - rw-r--r-- 15,343 blast_dust.c
- - rw-r--r-- 2,173 blast_dust.h
- - rw-r--r-- 41,312 blastconcat.c
- - rw-r--r-- 2,702 blastconcat.h
- - rw-r--r-- 7,520 blastconcatdef.h
- - rw-r--r-- 78,000 blastdef.h
- - rw-r--r-- 162,466 blastkar.c
- - rw-r--r-- 26,514 blastkar.h
- - rw-r--r-- 214,866 blastool.c
- - rw-r--r-- 42,554 blastpri.h
- - rw-r--r-- 383,875 blastutl.c
- - rw-r--r-- 44,836 blfmtutl.c
- - rw-r--r-- 7,807 blfmtutl.h
- - rw-r--r-- 3,561 blstxml.asn
- - rw-r--r-- 7,930 blstxml.h
- - rw-r--r-- 35,747 bxmlobj.c
- - rw-r--r-- 5,554 bxmlobj.h
- - rw-r--r-- 40,175 csim.c
- - rw-r--r-- 4,118 db_list.h
- - rw-r--r-- 11,499 db_slist.c
- - rw-r--r-- 56,818 dotseq.c
- - rw-r--r-- 7,425 dotseq.h
- - rw-r--r-- 17,449 dust.c
- - rw-r--r-- 4,318 dust.h
- - rw-r--r-- 73,573 falign.c
- - rw-r--r-- 12,025 g_any.c
- - rw-r--r-- 91,161 gapxdrop.c
- - rw-r--r-- 12,562 gapxdrop.h
- - rw-r--r-- 24,292 impatool.c
- - rw-r--r-- 106,204 kappa.c
- - rw-r--r-- 4,045 list.h
- - rw-r--r-- 143,235 lnfac.h
- - rw-r--r-- 45,860 lookup.c
- - rw-r--r-- 19,972 lookup.h
- - rw-r--r-- 34,605 mbalign.c
- - rw-r--r-- 2,277 mbalign.h
- - rw-r--r-- 161,261 mblast.c
- - rw-r--r-- 10,598 mblast.h
- - rw-r--r-- 18,963 motif.c
- - rw-r--r-- 2,781 motif.h
- - rw-r--r-- 83,709 ncbisam.c
- - rw-r--r-- 14,197 ncbisam.h
- - rw-r--r-- 7,581 ncbisami.h
- - rw-r--r-- 34,051 ncbisort.c
- - rw-r--r-- 8,284 ncbisort.h
- - rw-r--r-- 6,343 ncbisrti.h
- - rw-r--r-- 64,576 pattern1.c
- - rw-r--r-- 52,548 pobutil.c
- - rw-r--r-- 6,104 pobutil.h
- - rw-r--r-- 238,545 posit.c
- - rw-r--r-- 15,629 posit.h
- - rw-r--r-- 16,340 posit2.c
- - rw-r--r-- 5,373 profiles.h
- - rw-r--r-- 74,532 pseed3.c
- - rw-r--r-- 430,306 readdb.c
- - rw-r--r-- 76,837 readdb.h
- - rw-r--r-- 95,363 rpsutil.c
- - rw-r--r-- 14,305 rpsutil.h
- - rw-r--r-- 56,931 salign.c
- - rw-r--r-- 1,324 salign.h
- - rw-r--r-- 2,127 salmedia.h
- - rw-r--r-- 48,950 salptool.c
- - rw-r--r-- 874 salptool.h
- - rw-r--r-- 13,650 sec.c
- - rw-r--r-- 608 sec.h
- - rw-r--r-- 13,994 seed.h
- - rw-r--r-- 39,042 seg.c
- - rw-r--r-- 4,022 seg.h
- - rw-r--r-- 4,156 sim2.c
- - rw-r--r-- 25,505 sim3.c
- - rw-r--r-- 87,935 sim4.c
- - rw-r--r-- 34,379 simutil.c
- - rw-r--r-- 19,046 simutil.h
- - rw-r--r-- 9,344 slist.c
- - rw-r--r-- 367,062 spidey.c
- - rw-r--r-- 22,034 spidey.h
- - rw-r--r-- 4,726 splutil.c
- - rw-r--r-- 1,980 splutil.h
- - rw-r--r-- 36,114 stsutil.c
- - rw-r--r-- 9,360 stsutil.h
- - rw-r--r-- 51,221 suggadj.c
- - rw-r--r-- 44,651 suggest.c
- - rw-r--r-- 7,307 suggest.h
- - rw-r--r-- 27,998 suggslp.c
- - rw-r--r-- 2,541 suggslp.h
- - rw-r--r-- 60,832 taxblast.c
- - rw-r--r-- 3,115 taxblast.h
- - rw-r--r-- 904 terr.h
- - rw-r--r-- 32,203 tfuns.c
- - rw-r--r-- 2,316 tfuns.h
- - rw-r--r-- 183,049 toasn3.c
- - rw-r--r-- 9,090 toasn3.h
- - rw-r--r-- 184,600 toporg.c
- - rw-r--r-- 4,065 toporg.h
- - rw-r--r-- 17,622 urkbias.c
- - rw-r--r-- 3,150 urkbias.h
- - rw-r--r-- 41,098 urkcnsrt.c
- - rw-r--r-- 3,640 urkcnsrt.h
- - rw-r--r-- 19,164 urkdust.c
- - rw-r--r-- 3,845 urkdust.h
- - rw-r--r-- 30,068 urkepi.c
- - rw-r--r-- 3,474 urkepi.h
- - rw-r--r-- 12,033 urkfltr.c
- - rw-r--r-- 3,383 urkfltr.h
- - rw-r--r-- 25,680 urkgraph.c
- - rw-r--r-- 5,896 urkgraph.h
- - rw-r--r-- 12,855 urkpcc.c
- - rw-r--r-- 3,424 urkpcc.h
- - rw-r--r-- 63,911 urkptpf.c
- - rw-r--r-- 6,102 urkptpf.h
- - rw-r--r-- 5,534 urksigu.c
- - rw-r--r-- 2,603 urksigu.h
- - rw-r--r-- 34,887 urktree.c
- - rw-r--r-- 6,014 urktree.h
- - rw-r--r-- 3,671 urkutil.c
- - rw-r--r-- 2,210 urkutil.h
- - rw-r--r-- 32,060 vecscrn.c
- - rw-r--r-- 8,016 vecscrn.h
- - rw-r--r-- 55,637 xmlblast.c
- - rw-r--r-- 6,930 xmlblast.h