Subject: wrong interpreter path
Description: use Debian Python
Author: Olivier Sallou <osallou@debian.org>
Last-Updated: 2015-04-30
Forwarded: no
--- a/src/extractreads.py
+++ b/src/extractreads.py
@@ -1,3 +1,4 @@
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 9 juin 2012
 
--- a/src/extractreads2.py
+++ b/src/extractreads2.py
@@ -1,3 +1,4 @@
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 9 juin 2012
 
--- a/src/ali2consensus.py
+++ b/src/ali2consensus.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 
 '''
 Created on 30 sept. 2011
--- a/src/ecodbtaxstat.py
+++ b/src/ecodbtaxstat.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`ecodbtaxstat`: gives taxonomic rank frequency of a given ``ecopcr`` database   
 =====================================================================================
--- a/src/ecotaxspecificity.py
+++ b/src/ecotaxspecificity.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`ecotaxspecificity`: Evaluates barcode resolution
 =========================================================
--- a/src/ecotaxstat.py
+++ b/src/ecotaxstat.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`ecotaxstat` : getting the coverage of an ecoPCR output compared to the original ecoPCR database
 ========================================================================================================
--- a/src/illuminapairedend.py
+++ b/src/illuminapairedend.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`illuminapairedend`: aligns paired-end Illumina reads
 =============================================================
--- a/src/ngsfilter.py
+++ b/src/ngsfilter.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`ngsfilter` : Assigns sequence records to the corresponding experiment/sample based on DNA tags and primers
 ===================================================================================================================
--- a/src/obiaddtaxids.py
+++ b/src/obiaddtaxids.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obiaddtaxids`: adds *taxids* to sequence records using an ecopcr database
 ==================================================================================
--- a/src/obiannotate.py
+++ b/src/obiannotate.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 
 '''
 :py:mod:`obiannotate`: adds/edits sequence record annotations
--- a/src/obiclean.py
+++ b/src/obiclean.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 
 '''
 :py:mod:`obiclean`: tags a set of sequences for PCR/sequencing errors identification 
--- a/src/obicomplement.py
+++ b/src/obicomplement.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 """
 :py:mod:`obicomplement`: reverse-complements sequences
 ======================================================
--- a/src/obiconvert.py
+++ b/src/obiconvert.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obiconvert`: converts sequence files to different output formats
 =========================================================================
--- a/src/obicount.py
+++ b/src/obicount.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obicount`: counts the number of sequence records 
 =========================================================
--- a/src/obicut.py
+++ b/src/obicut.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obicut`: trims sequences
 =================================
--- a/src/obidistribute.py
+++ b/src/obidistribute.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obidistribute`: Distributes sequence records over several sequence records files 
 =========================================================================================
--- a/src/obiextract.py
+++ b/src/obiextract.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obiextract`: extract samples from a dataset 
 ====================================================
--- a/src/obigrep.py
+++ b/src/obigrep.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obigrep`: filters sequence file 
 ========================================
--- a/src/obihead.py
+++ b/src/obihead.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obihead`: extracts the first sequence records
 ======================================================
--- a/src/obijoinpairedend.py
+++ b/src/obijoinpairedend.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obijoinpairedend`: Joins paired-end reads
 ==================================================
--- a/src/obipr2.py
+++ b/src/obipr2.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obipr2`: converts silva database into an ecoPCR database
 =================================================================
--- a/src/obisample.py
+++ b/src/obisample.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obisample`: randomly resamples sequence records
 ========================================================
--- a/src/obiselect.py
+++ b/src/obiselect.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 """
 :py:mod:`obiselect` : selects representative sequence records
 =============================================================
--- a/src/obisilva.py
+++ b/src/obisilva.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obisilva`: converts silva database into an ecoPCR database
 ===================================================================
--- a/src/obisort.py
+++ b/src/obisort.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obisort`: Sorts sequence records according to the value of a given attribute 
 =====================================================================================
--- a/src/obisplit.py
+++ b/src/obisplit.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obisplit`: Splits a sequence file in a set of subfiles
 ===============================================================
--- a/src/obistat.py
+++ b/src/obistat.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obistat`: computes basic statistics for attribute values 
 =================================================================
--- a/src/obitab.py
+++ b/src/obitab.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obitab`: converts a sequence file to a tabular file
 ============================================================
--- a/src/obitail.py
+++ b/src/obitail.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obitail`: extracts the last sequence records
 =====================================================
--- a/src/obitaxonomy.py
+++ b/src/obitaxonomy.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obitaxonomy`: manages taxonomic databases
 ==================================================
--- a/src/obiuniq.py
+++ b/src/obiuniq.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`obiuniq`: groups and dereplicates sequences  
 ====================================================
--- a/src/oligotag.py
+++ b/src/oligotag.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`oligotag`: Designs a set of oligonucleotides with specified properties
 ===============================================================================
--- a/src/obitools/barcodecoverage/calcBc.py
+++ b/src/obitools/barcodecoverage/calcBc.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 24 nov. 2011
 
--- a/src/obitools/barcodecoverage/drawBcTree.py
+++ b/src/obitools/barcodecoverage/drawBcTree.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 25 nov. 2011
 
--- a/src/obitools/barcodecoverage/findErrors.py
+++ b/src/obitools/barcodecoverage/findErrors.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 24 nov. 2011
 
--- a/src/obitools/barcodecoverage/readFiles.py
+++ b/src/obitools/barcodecoverage/readFiles.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 23 nov. 2011
 
--- a/src/obitools/barcodecoverage/writeBcTree.py
+++ b/src/obitools/barcodecoverage/writeBcTree.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 25 nov. 2011
 
--- a/src/obitools/solexaPairEnd.py
+++ b/src/obitools/solexaPairEnd.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 Created on 30 dec. 2009
 
--- a/src/ecotag.py
+++ b/src/ecotag.py
@@ -1,4 +1,4 @@
-#!/usr/local/OBITools-1.1.22/bin/python
+#!/usr/bin/python3
 '''
 :py:mod:`ecotag`: assigns sequences to taxa
 ===========================================