File: coils.prf

package info (click to toggle)
pftools 3.2.12-2
  • links: PTS, VCS
  • area: main
  • in suites: forky, sid
  • size: 92,208 kB
  • sloc: ansic: 17,779; fortran: 12,000; perl: 2,956; sh: 232; makefile: 29; f90: 3
file content (16 lines) | stat: -rw-r--r-- 1,007 bytes parent folder | download | duplicates (5)
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
ID   COILS; MATRIX.
AC   PS60001;
DE   Coiled-coil region.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=7; TOPOLOGY=CIRCULAR; 
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=7; 
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6890; R2=0.03483765; TEXT='NScore'; 
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=153; N_SCORE=6.0; MODE=1; 
MA   /DEFAULT: E0=0; B0=0; D=-50; I=-50; B1=0; E1=0; MI=0; MD=0; IM=0; DM=0; M0=-5; I0=-50;
MA   /M: SY='a'; M=-2,-16,3,-13,-27,0,-4,-2,14,-7,9,10,-7,-3,-18,-7,-6,-7,6,-3,6,-16;
MA   /M: SY='b'; M=-2,8,-6,7,4,-4,-3,-2,-7,3,-12,-6,-2,-2,2,-2,-1,-4,-4,-3,-6,1;
MA   /M: SY='c'; M=-4,4,-2,2,0,-1,-1,-2,-6,-1,-11,-8,3,-3,2,0,0,-3,-5,-3,-6,3;
MA   /M: SY='d'; M=7,-14,-2,-12,-22,1,-4,0,-1,-13,24,2,-17,-3,-13,-16,-5,-2,0,4,8,-14;
MA   /M: SY='e'; M=-10,1,-5,-7,19,-4,-3,-5,-6,2,-10,-6,-2,-3,5,0,-2,0,-6,-4,-5,1;
MA   /M: SY='f'; M=-2,1,-2,2,-3,-4,-1,-2,-6,-2,-10,-7,5,-3,1,3,-1,-3,-5,-3,-6,3;
MA   /M: SY='g'; M=-6,1,-5,0,8,-5,-4,-4,-7,1,-9,-6,2,-3,5,1,-4,-1,-5,-4,-6,3;
//