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progressivemauve 1.2.0%2B4713%2Bdfsg-4
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  • sloc: cpp: 11,045; makefile: 188; sh: 43

Folder: src

d .. (parent)
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- - rw-r--r-- 0 AlignmentTree.h
- - rw-r--r-- 7,522 Makefile.am
- - rw-r--r-- 12,156 MatchRecord.h
- - rw-r--r-- 242 RepeatHashCat.cpp
- - rw-r--r-- 503 RepeatHashCat.h
- - rw-r--r-- 4,207 SeedMatchEnumerator.h
- - rw-r--r-- 1,715 UniqueMatchFinder.cpp
- - rw-r--r-- 1,020 UniqueMatchFinder.h
- - rw-r--r-- 725 addUnalignedIntervals.cpp
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- - rw-r--r-- 1,695 backbone_global_to_local.cpp
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- - rw-r--r-- 9,406 bbFilter.cpp
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- - rw-r--r-- 2,354 calculateCoverage.cpp
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- - rw-r--r-- 16,510 scoreProcrastAlignment.cpp
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- - rw-r--r-- 4,349 toEvoHighwayFormat.cpp
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- - rw-r--r-- 2,355 toGrimmFormat.cpp
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- - rw-r--r-- 1,914 transposeCoordinates.cpp
- - rw-r--r-- 2,576 unalign.cpp
- - rw-r--r-- 1,132 uniqueMerCount.cpp
- - rw-r--r-- 7,229 uniquifyTrees.cpp
- - rw-r--r-- 3,090 xmfa2maf.cpp