1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80
|
HMMER2.0 [2.2g]
NAME sample
LENG 20
ALPH Amino
RF no
CS no
MAP yes
COM hmmbuild sample.hmm sample.aln
COM hmmcalibrate sample.hmm
NSEQ 262
DATE Thu Jul 18 16:46:33 2002
CKSUM 72
XT -8455 -4 -1000 -1000 -8455 -4 -8455 -4
NULT -4 -8455
NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644
EVD -7.935809 0.378357
HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y
m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e
-5 * -8046
1 1089 467 -2673 -6768 -796 -659 -2409 849 193 1182 2 -1869 -1045 -2295 -182 320 96 56 335 -3000 1
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 -5 *
2 2027 447 -7766 -3539 52 -316 -2320 301 -1493 936 40 -2385 -1390 -3041 -3469 23 -283 405 -173 -1457 2
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
3 1617 -167 -7821 -2243 -295 -545 -5897 748 -3587 1486 563 -1761 -2024 -2960 -6582 -241 -863 888 -669 -1883 3
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
4 1591 1196 -7825 -7188 474 107 -2063 237 -6783 1310 898 -2487 -2622 -6406 -3384 -242 32 721 -5763 -2904 4
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
5 1506 513 -3345 -7188 222 302 -5898 503 -6783 1271 610 -3224 -1603 -6406 -2582 181 -413 878 -5763 -2809 5
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
6 1440 223 -3710 -7184 809 -171 -5897 107 -2624 1507 529 -2338 -1100 -6403 -3384 4 310 318 -1628 -5421 6
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
7 1612 180 -2599 -3892 255 -440 -5893 20 -6766 1350 365 -2410 -960 -2071 -3564 606 174 271 -1528 -2809 7
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
8 1585 423 -3710 -7179 704 -657 -2320 225 -6776 1418 1461 -1783 -1277 -2310 -2510 17 -285 -8 -5764 -1227 8
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
9 960 158 -3345 -7188 1536 681 -5898 -1418 -6783 1689 830 -6672 -2024 -3044 -2070 -127 -11 82 -1628 -1835 9
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
10 1026 -112 -2552 -7181 1507 41 -1382 666 -3426 836 1374 -2534 -1707 -6402 -2558 584 319 83 -752 -1290 10
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
11 1914 694 -7823 -7187 -560 -430 -2320 -331 -6782 -1680 532 -1213 549 -3228 -6583 1877 495 -599 -1434 -2856 11
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
12 757 -466 -6127 -3656 718 1151 196 -2590 -3315 328 -478 -1079 321 307 -1081 968 706 -61 -1573 -5206 12
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
13 1000 -6537 -3232 -2391 209 -307 -2293 -628 -1618 -1132 -1582 11 1569 221 -1242 1445 320 -285 -6751 105 13
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
14 2898 -404 -2416 -3298 -3040 -2094 -2237 -2168 -3138 -770 -5205 -2356 -3499 -1579 -1803 391 -481 941 -6384 -2878 14
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
15 100 -590 -2447 -1916 1378 -1669 2443 -1720 -2146 634 1557 375 -6592 1180 -1701 -30 -279 -400 575 99 15
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
16 3497 -6782 -8621 -3773 -9001 -604 -8243 -8742 -8545 -2782 -8108 -1797 -3489 -8192 -3395 -763 -2069 -3775 -9245 -9046 16
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
17 2298 -15 256 354 -2312 -505 -1418 -2280 -540 -1810 -828 -159 -3213 1475 -1854 -547 -1272 -601 -1871 -797 17
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
18 -154 -6626 1590 1257 -3304 -335 -4816 -720 -1834 -1320 -1535 132 788 559 -2515 -232 1053 4 -122 -2912 18
- -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249
- 0 -13207 -14249 -894 -1115 -701 -1378 * *
19 713 -2321 -444 -28 303 -71 -2203 -302 -562 -250 -2516 -422 514 915 -2477 -173 1214 -107 -140 -459 19
- -138 -511 238 32 -408 393 80 -626 186 -467 -739 283 402 60 81 352 165 -355 -278 -251
- -8371 -4 -14249 -1 -10944 -701 -1378 * *
20 223 -2308 424 359 -1127 -115 -224 190 -196 -251 -1078 494 384 51 -1298 -279 459 418 17 -749 21
- * * * * * * * * * * * * * * * * * * * *
- * * * * * * * * 0
//
|