File: protein_amber99.py

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#C* copyright 1998-2000 by Warren Lyford Delano of DeLano Scientific.
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('TYR'  , 'CD2'  ) : { 'type' : 'CA'   , 'charge' : -0.1906 } ,
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('THR'  , 'HB'   ) : { 'type' : 'H1'   , 'charge' : -0.0323 } ,
('THR'  , 'N'    ) : { 'type' : 'N3'   , 'charge' :  0.1812 } ,
('THR'  , 'O'    ) : { 'type' : 'O'    , 'charge' : -0.5722 } ,
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('VAL'  , '2HG1' ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0735 } ,
('VAL'  , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0735 } ,
('VAL'  , '2HT'  ) : { 'type' : 'H'    , 'charge' :  0.2272 } ,
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('ARG'  , '2HH2' ) : { 'type' : 'H'    , 'charge' :  0.4493 } ,
('ARG'  , '3HB'  ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0371 } ,
('ARG'  , '3HD'  ) : { 'type' : 'H1'   , 'charge' :  0.0468 } ,
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('ARG'  , 'O'    ) : { 'type' : 'O2'   , 'charge' : -0.8266 } ,
('ARG'  , 'OXT'  ) : { 'type' : 'O2'   , 'charge' : -0.8266 } ,
('SER'  , '2HB'  ) : { 'type' : 'H1'   , 'charge' :  0.0813 } ,
('SER'  , '3HB'  ) : { 'type' : 'H1'   , 'charge' :  0.0813 } ,
('SER'  , 'C'    ) : { 'type' : 'C'    , 'charge' :  0.8113 } ,
('SER'  , 'CA'   ) : { 'type' : 'CT'   , 'charge' : -0.2722 } ,
('SER'  , 'CB'   ) : { 'type' : 'CT'   , 'charge' :  0.1123 } ,
('SER'  , 'H'    ) : { 'type' : 'H'    , 'charge' :  0.2681 } ,
('SER'  , 'HA'   ) : { 'type' : 'H1'   , 'charge' :  0.1304 } ,
('SER'  , 'HG'   ) : { 'type' : 'HO'   , 'charge' :  0.4474 } ,
('SER'  , 'N'    ) : { 'type' : 'N'    , 'charge' : -0.3821 } ,
('SER'  , 'O'    ) : { 'type' : 'O2'   , 'charge' : -0.8132 } ,
('SER'  , 'OG'   ) : { 'type' : 'OH'   , 'charge' : -0.6514 } ,
('SER'  , 'OXT'  ) : { 'type' : 'O2'   , 'charge' : -0.8132 } ,
('THR'  , '1HG'  ) : { 'type' : 'HO'   , 'charge' :  0.4119 } ,
('THR'  , '1HG2' ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0586 } ,
('THR'  , '2HG2' ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0586 } ,
('THR'  , '3HG2' ) : { 'type' : 'HC'   , 'charge' :  0.0586 } ,
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('THR'  , 'CA'   ) : { 'type' : 'CT'   , 'charge' : -0.2420 } ,
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