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Folder: Tests
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.. (parent) | |||
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d | rwxr-xr-x | 97 | Abi |
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d | rwxr-xr-x | 82 | Ace |
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d | rwxr-xr-x | 120 | BioSQL |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | Blast |
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d | rwxr-xr-x | 120 | Clustalw |
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d | rwxr-xr-x | 45 | CodonUsage |
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d | rwxr-xr-x | 36 | Compass |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | EMBL |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | Emboss |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | Entrez |
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d | rwxr-xr-x | 81 | Enzymes |
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d | rwxr-xr-x | 34 | ExtendedPhylip |
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d | rwxr-xr-x | 22 | FSSP |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | Fasta |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | GenBank |
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d | rwxr-xr-x | 115 | KEGG |
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d | rwxr-xr-x | 112 | PDB |
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d | rwxr-xr-x | 79 | Phd |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | SubsMat |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | SwissProt |
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d | rwxr-xr-x | 83 | UniGene |
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d | rwxr-xr-x | 72 | Wise |
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d | rwxr-xr-x | 4,096 | output |
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- | rw-r--r-- | 1,215 | requires_internet.py |
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- | rw-r--r-- | 939 | requires_wise.py |
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- | rw-r--r-- | 15,595 | run_tests.py |
|
- | rw-r--r-- | 14,615 | seq_tests_common.py |
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- | rw-r--r-- | 2,185 | setup_BioSQL.py |
|
- | rw-r--r-- | 117,697 | test_Ace.py |
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- | rw-r--r-- | 14,548 | test_AlignIO.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,716 | test_AlignIO_FastaIO.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,856 | test_AlignIO_convert.py |
|
- | rw-r--r-- | 28,843 | test_BioSQL.py |
|
- | rw-r--r-- | 8,495 | test_BioSQL_SeqIO.py |
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- | rw-r--r-- | 3,550 | test_CAPS.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,264 | test_Chi2.py |
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- | rw-r--r-- | 6,942 | test_ClustalOmega_tool.py |
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- | rw-r--r-- | 9,212 | test_Clustalw_tool.py |
|
- | rw-r--r-- | 9,160 | test_Clustalw_tool.py~ |
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- | rw-r--r-- | 36,149 | test_Cluster.py |
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- | rw-r--r-- | 5,846 | test_CodonTable.py |
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- | rw-r--r-- | 931 | test_CodonUsage.py |
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- | rw-r--r-- | 4,651 | test_Dialign_tool.py |
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- | rw-r--r-- | 213 | test_DocSQL.py |
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- | rw-r--r-- | 40,916 | test_Emboss.py |
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- | rw-r--r-- | 12,795 | test_EmbossPhylipNew.py |
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- | rw-r--r-- | 392,614 | test_Entrez.py |
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- | rw-r--r-- | 4,582 | test_Enzyme.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,845 | test_FSSP.py |
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- | rw-r--r-- | 2,751 | test_File.py |
|
- | rw-r--r-- | 18,429 | test_GACrossover.py |
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- | rw-r--r-- | 6,758 | test_GAMutation.py |
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- | rw-r--r-- | 5,670 | test_GAOrganism.py |
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- | rw-r--r-- | 14,405 | test_GAQueens.py |
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- | rw-r--r-- | 2,181 | test_GARepair.py |
|
- | rw-r--r-- | 6,176 | test_GASelection.py |
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- | rw-r--r-- | 8,403 | test_GenBank.py |
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- | rwxr-xr-x | 39,268 | test_GenomeDiagram.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,890 | test_GraphicsBitmaps.py |
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- | rw-r--r-- | 37,478 | test_GraphicsChromosome.py |
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- | rw-r--r-- | 2,711 | test_GraphicsDistribution.py |
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- | rw-r--r-- | 3,072 | test_GraphicsGeneral.py |
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- | rw-r--r-- | 6,485 | test_HMMCasino.py |
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- | rw-r--r-- | 16,879 | test_HMMGeneral.py |
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- | rw-r--r-- | 1,601 | test_HotRand.py |
|
- | rw-r--r-- | 295 | test_IsoelectricPoint.py |
|
- | rw-r--r-- | 792 | test_KDTree.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,026 | test_KEGG.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,150 | test_KeyWList.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,563 | test_Location.py |
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- | rw-r--r-- | 3,300 | test_LogisticRegression.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,796 | test_Mafft_tool.py |
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- | rw-r--r-- | 11,506 | test_MarkovModel.py |
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- | rw-r--r-- | 16,468 | test_Medline.py |
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- | rw-r--r-- | 102,025 | test_Motif.py |
|
- | rw-r--r-- | 16,581 | test_Muscle_tool.py |
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- | rw-r--r-- | 1,946 | test_NCBIStandalone.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,331,826 | test_NCBITextParser.py |
|
- | rw-r--r-- | 97,379 | test_NCBIXML.py |
|
- | rw-r--r-- | 12,769 | test_NCBI_BLAST_tools.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,706 | test_NCBI_qblast.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,764 | test_NNExclusiveOr.py |
|
- | rw-r--r-- | 23,223 | test_NNGene.py |
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- | rw-r--r-- | 3,718 | test_NNGeneral.py |
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- | rwxr-xr-x | 20,235 | test_Nexus.py |
|
- | rw-r--r-- | 12,864 | test_PAML_baseml.py |
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- | rw-r--r-- | 21,946 | test_PAML_codeml.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,173 | test_PAML_tools.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,562 | test_PAML_yn00.py |
|
- | rw-r--r-- | 44,919 | test_PDB.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,084 | test_PDB_KDTree.py |
|
- | rw-r--r-- | 4,414 | test_ParserSupport.py |
|
- | rw-r--r-- | 7,429 | test_Pathway.py |
|
- | rwxr-xr-x | 19,920 | test_Phd.py |
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- | rw-r--r-- | 15,184 | test_Phylo.py |
|
- | rw-r--r-- | 30,309 | test_PhyloXML.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,447 | test_Phylo_depend.py |
|
- | rw-r--r-- | 4,099 | test_PopGen_DFDist.py |
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- | rw-r--r-- | 3,519 | test_PopGen_FDist_nodepend.py |
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- | rw-r--r-- | 3,306 | test_PopGen_GenePop.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,987 | test_PopGen_GenePop_EasyController.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,257 | test_PopGen_GenePop_nodepend.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,075 | test_PopGen_SimCoal.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,006 | test_PopGen_SimCoal_nodepend.py |
|
- | rw-r--r-- | 7,939 | test_Prank_tool.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,809 | test_Probcons_tool.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,643 | test_ProtParam.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,826 | test_Restriction.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,385 | test_SCOP_Astral.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,713 | test_SCOP_Cla.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,979 | test_SCOP_Des.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,869 | test_SCOP_Dom.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,426 | test_SCOP_Hie.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,720 | test_SCOP_Raf.py |
|
- | rwxr-xr-x | 2,405 | test_SCOP_Residues.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,691 | test_SCOP_Scop.py |
|
- | rw-r--r-- | 636 | test_SCOP_online.py |
|
- | rw-r--r-- | 2,106 | test_SVDSuperimposer.py |
|
- | rw-r--r-- | 26,460 | test_SeqIO.py |
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- | rw-r--r-- | 18,206 | test_SeqIO_AbiIO.py |
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- | rw-r--r-- | 6,273 | test_SeqIO_FastaIO.py |
|
- | rw-r--r-- | 33,933 | test_SeqIO_QualityIO.py |
|
- | rw-r--r-- | 6,603 | test_SeqIO_SeqXML.py |
|
- | rw-r--r-- | 10,862 | test_SeqIO_convert.py |
|
- | rw-r--r-- | 55,366 | test_SeqIO_features.py |
|
- | rw-r--r-- | 15,016 | test_SeqIO_index.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,571 | test_SeqIO_online.py |
|
- | rw-r--r-- | 8,226 | test_SeqIO_write.py |
|
- | rw-r--r-- | 11,065 | test_SeqRecord.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,319 | test_SeqUtils.py |
|
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|
- | rw-r--r-- | 3,243 | test_SubsMat.py |
|
- | rw-r--r-- | 102,029 | test_SwissProt.py |
|
- | rw-r--r-- | 4,617 | test_TCoffee_tool.py |
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- | rw-r--r-- | 22,912 | test_TogoWS.py |
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- | rw-r--r-- | 4,557 | test_Tutorial.py |
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- | rw-r--r-- | 68,377 | test_UniGene.py |
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- | rw-r--r-- | 9,688 | test_Uniprot.py |
|
- | rwxr-xr-x | 2,643 | test_Wise.py |
|
- | rw-r--r-- | 6,362 | test_align.py |
|
- | rw-r--r-- | 1,012 | test_geo.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,511 | test_kNN.py |
|
- | rwxr-xr-x | 1,113 | test_lowess.py |
|
- | rw-r--r-- | 10,547 | test_pairwise2.py |
|
- | rw-r--r-- | 54,551 | test_prodoc.py |
|
- | rw-r--r-- | 196,883 | test_prosite1.py |
|
- | rw-r--r-- | 54,377 | test_prosite2.py |
|
- | rwxr-xr-x | 4,762 | test_psw.py |
|
- | rw-r--r-- | 23,868 | test_seq.py |
|
- | rw-r--r-- | 3,618 | test_translate.py |
|
- | rw-r--r-- | 5,603 | test_trie.py |