1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
|
test_CodonUsage
The current index used:
AAA 1.000
AAC 1.000
AAG 0.219
AAT 0.293
ACA 0.110
ACC 1.000
ACG 0.204
ACT 0.517
AGA 0.018
AGC 0.762
AGG 0.006
AGT 0.195
ATA 0.015
ATC 1.000
ATG 1.000
ATT 0.490
CAA 0.259
CAC 1.000
CAG 1.000
CAT 0.416
CCA 0.247
CCC 0.040
CCG 1.000
CCT 0.161
CGA 0.023
CGC 0.531
CGG 0.014
CGT 1.000
CTA 0.017
CTC 0.100
CTG 1.000
CTT 0.085
GAA 1.000
GAC 1.000
GAG 0.308
GAT 0.886
GCA 0.794
GCC 0.538
GCG 0.937
GCT 1.000
GGA 0.056
GGC 0.892
GGG 0.103
GGT 1.000
GTA 0.465
GTC 0.297
GTG 0.618
GTT 1.000
TAA 1.000
TAC 1.000
TAG 0.012
TAT 0.606
TCA 0.221
TCC 0.785
TCG 0.240
TCT 1.000
TGA 0.081
TGC 1.000
TGG 1.000
TGT 0.721
TTA 0.059
TTC 1.000
TTG 0.072
TTT 0.457
------------------------------------------------------------
codon adaptation index for test gene: 0.67
|
