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# This code is part of the Biopython distribution and governed by its
# license.  Please see the LICENSE file that should have been included
# as part of this package.
#

"""Substitution matrices for use in alignments, etc.

The information on this page was originally obtained from Dr. Gerhard Vogt's
page http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/mlist1.html (dead link),
and was extracted using a script.

You can view an archive copy of this webpage from 1999 here;
https://web.archive.org/web/19991014010917/http://www.embl-heidelberg.de/%7Evogt/matrices/mlist1.html
"""


# a list of all available substitution matrices
available_matrices = ['benner6', 'benner22', 'benner74', 'blosum100',
                      'blosum30', 'blosum35', 'blosum40', 'blosum45',
                      'blosum50', 'blosum55', 'blosum60', 'blosum62',
                      'blosum65', 'blosum70', 'blosum75', 'blosum80',
                      'blosum85', 'blosum90', 'blosum95', 'feng',
                      'fitch', 'genetic', 'gonnet', 'grant',
                      'ident', 'johnson', 'levin', 'mclach',
                      'miyata', 'nwsgappep', 'pam120', 'pam180',
                      'pam250', 'pam30', 'pam300', 'pam60',
                      'pam90', 'rao', 'risler', 'structure',
                      ]

# NOTE - The only reason we define temp functions rather than assigning
# the dictionaries directly to variables is to work around a JVM
# limitation on code size if running under Jython. The temp functions
# have an underscore to indicate they are private, and are in any case
# deleted after use (partly to ensure we don't use any of them twice).


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/benner6.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): -1.6, ('L', 'R'): -3.2, ('I', 'I'): 4.4, ('Q', 'Q'): 5.3,
        ('W', 'N'): -4.4, ('V', 'I'): 3.9, ('H', 'T'): -1.7, ('H', 'P'): -0.4,
        ('W', 'V'): -4.8, ('Q', 'E'): 2.1, ('W', 'R'): 2.0, ('Q', 'A'): -1.7,
        ('H', 'H'): 6.1, ('H', 'D'): 0.1, ('L', 'N'): -3.4, ('Y', 'M'): -3.6,
        ('Y', 'I'): -3.3, ('Y', 'E'): -4.1, ('E', 'S'): -1.2, ('Y', 'A'): -4.0,
        ('Y', 'Y'): 9.5, ('T', 'C'): -1.5, ('E', 'C'): -4.7, ('Y', 'Q'): -1.4,
        ('E', 'G'): 0.5, ('V', 'A'): 0.7, ('C', 'C'): 12.1, ('M', 'R'): -3.0,
        ('P', 'T'): 0.6, ('V', 'E'): -3.0, ('P', 'P'): 6.5, ('I', 'T'): 0.7,
        ('K', 'S'): -1.2, ('R', 'G'): -0.1, ('I', 'P'): -2.0, ('R', 'C'): -0.4,
        ('A', 'T'): 1.7, ('K', 'K'): 5.6, ('A', 'P'): 1.1, ('V', 'M'): 3.3,
        ('I', 'D'): -4.2, ('K', 'C'): -2.8, ('K', 'G'): -1.4, ('R', 'S'): -0.9,
        ('F', 'Q'): -4.4, ('F', 'A'): -3.2, ('V', 'V'): 4.0, ('M', 'N'): -2.5,
        ('F', 'E'): -6.7, ('D', 'N'): 2.5, ('F', 'I'): 0.0, ('F', 'M'): -0.1,
        ('M', 'S'): -1.3, ('S', 'S'): 2.1, ('L', 'Q'): -2.4, ('W', 'E'): -5.6,
        ('W', 'A'): -4.3, ('W', 'M'): -4.4, ('H', 'S'): -0.9, ('W', 'I'): -5.0,
        ('S', 'C'): 0.9, ('L', 'A'): -1.3, ('L', 'E'): -5.0, ('W', 'Q'): -2.6,
        ('H', 'G'): -2.1, ('Q', 'N'): 0.1, ('H', 'C'): -1.2, ('L', 'M'): -2.9,
        ('W', 'Y'): -0.3, ('Y', 'N'): -0.9, ('E', 'P'): -2.6, ('Y', 'F'): 5.6,
        ('E', 'T'): -1.6, ('A', 'A'): 2.5, ('I', 'N'): -2.5, ('G', 'A'): 0.8,
        ('Y', 'V'): -3.8, ('E', 'D'): 4.4, ('W', 'H'): -2.8, ('Y', 'R'): -2.6,
        ('M', 'Q'): -3.1, ('P', 'S'): 1.4, ('R', 'H'): 1.8, ('A', 'C'): -1.7,
        ('R', 'D'): -1.5, ('K', 'P'): -2.3, ('L', 'D'): -5.3, ('K', 'T'): -1.1,
        ('V', 'N'): -2.4, ('M', 'A'): -0.2, ('K', 'H'): 0.9, ('V', 'R'): -3.7,
        ('P', 'C'): -2.7, ('M', 'E'): -4.1, ('A', 'S'): 1.4, ('T', 'T'): 2.4,
        ('R', 'T'): -1.3, ('I', 'G'): -3.4, ('R', 'P'): -1.3, ('K', 'D'): -0.2,
        ('I', 'C'): -3.6, ('F', 'R'): -4.9, ('F', 'V'): -0.5, ('L', 'C'): -3.8,
        ('F', 'F'): 8.3, ('D', 'A'): -0.6, ('F', 'N'): -3.5, ('W', 'D'): -6.3,
        ('L', 'P'): -0.2, ('Q', 'S'): -1.4, ('N', 'C'): -1.6, ('N', 'G'): -0.1,
        ('H', 'N'): 1.4, ('W', 'T'): -2.6, ('Q', 'G'): -1.6, ('W', 'P'): -4.8,
        ('Q', 'C'): -3.2, ('N', 'S'): 1.2, ('L', 'H'): -2.2, ('L', 'L'): 4.8,
        ('G', 'T'): -0.5, ('M', 'M'): 4.8, ('G', 'P'): -1.7, ('Y', 'K'): -4.0,
        ('Y', 'G'): -4.9, ('Y', 'C'): 2.6, ('E', 'A'): -0.7, ('E', 'E'): 5.2,
        ('Y', 'S'): -1.8, ('M', 'P'): -1.8, ('V', 'C'): -3.1, ('M', 'T'): 0.6,
        ('V', 'G'): -2.3, ('R', 'E'): -0.4, ('V', 'K'): -3.8, ('K', 'Q'): 2.5,
        ('R', 'A'): -1.7, ('I', 'R'): -3.8, ('N', 'A'): 0.0, ('V', 'S'): -0.9,
        ('M', 'D'): -4.3, ('M', 'H'): -3.4, ('K', 'A'): -1.9, ('R', 'Q'): 2.5,
        ('K', 'E'): 0.9, ('F', 'S'): -1.8, ('I', 'K'): -3.8, ('D', 'P'): -2.8,
        ('D', 'T'): -1.2, ('I', 'M'): 4.0, ('F', 'C'): -0.1, ('W', 'L'): -3.0,
        ('F', 'G'): -5.7, ('F', 'K'): -6.3, ('F', 'T'): -2.4, ('D', 'D'): 5.2,
        ('Q', 'T'): -1.7, ('W', 'G'): -1.7, ('Q', 'P'): 0.1, ('W', 'C'): 1.6,
        ('W', 'K'): -1.4, ('H', 'Q'): 3.2, ('Q', 'D'): 0.6, ('W', 'W'): 14.7,
        ('V', 'L'): 1.9, ('L', 'G'): -4.6, ('W', 'S'): -2.9, ('L', 'K'): -4.1,
        ('N', 'P'): -1.1, ('H', 'E'): -0.2, ('N', 'T'): 0.5, ('H', 'A'): -2.1,
        ('Y', 'L'): -1.6, ('Y', 'H'): 4.4, ('G', 'S'): 0.8, ('Y', 'D'): -2.3,
        ('V', 'Q'): -3.5, ('L', 'T'): -0.4, ('G', 'G'): 5.8, ('G', 'C'): -1.3,
        ('E', 'N'): 1.1, ('Y', 'T'): -3.4, ('Y', 'P'): -3.8, ('R', 'N'): -0.1,
        ('V', 'D'): -3.3, ('K', 'R'): 4.3, ('V', 'H'): -3.8, ('I', 'Q'): -3.8,
        ('V', 'P'): -1.6, ('M', 'C'): -3.7, ('K', 'N'): 1.0, ('V', 'T'): 0.6,
        ('M', 'G'): -3.7, ('T', 'S'): 1.5, ('I', 'E'): -4.1, ('M', 'K'): -2.9,
        ('I', 'A'): 0.1, ('N', 'N'): 3.6, ('R', 'R'): 5.1, ('F', 'P'): -3.2,
        ('L', 'I'): 2.4, ('I', 'S'): -1.2, ('D', 'S'): -0.4, ('L', 'S'): -1.5,
        ('I', 'H'): -3.7, ('F', 'D'): -5.7, ('D', 'C'): -3.7, ('F', 'H'): 0.1,
        ('D', 'G'): 0.8, ('F', 'L'): 2.4
        }
benner6 = _temp()


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/benner22.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0.5, ('L', 'R'): -2.9, ('I', 'I'): 4.2, ('Q', 'Q'): 4.2,
        ('W', 'N'): -5.2, ('V', 'I'): 3.6, ('H', 'T'): -1.1, ('H', 'P'): -0.4,
        ('W', 'V'): -4.5, ('Q', 'E'): 1.7, ('W', 'R'): -1.1, ('Q', 'A'): -0.9,
        ('H', 'H'): 6.1, ('H', 'D'): 0.3, ('L', 'N'): -3.5, ('Y', 'M'): -1.8,
        ('Y', 'I'): -2.2, ('Y', 'E'): -4.0, ('E', 'S'): -0.5, ('Y', 'A'): -3.5,
        ('Y', 'Y'): 9.0, ('T', 'C'): -1.1, ('E', 'C'): -4.3, ('Y', 'Q'): -1.9,
        ('E', 'G'): 0.5, ('V', 'A'): 0.4, ('C', 'C'): 12.6, ('M', 'R'): -2.1,
        ('P', 'T'): 0.4, ('V', 'E'): -2.7, ('P', 'P'): 7.0, ('I', 'T'): 0.3,
        ('K', 'S'): -0.4, ('R', 'G'): -0.7, ('I', 'P'): -2.3, ('R', 'C'): -1.6,
        ('A', 'T'): 1.4, ('K', 'K'): 4.4, ('A', 'P'): 0.8, ('V', 'M'): 2.5,
        ('I', 'D'): -4.0, ('K', 'C'): -3.3, ('K', 'G'): -1.0, ('R', 'S'): -0.5,
        ('F', 'Q'): -3.6, ('F', 'A'): -3.1, ('V', 'V'): 3.7, ('M', 'N'): -2.6,
        ('F', 'E'): -5.7, ('D', 'N'): 2.4, ('F', 'I'): 0.5, ('F', 'M'): 0.7,
        ('M', 'S'): -1.5, ('S', 'S'): 2.0, ('L', 'Q'): -2.0, ('W', 'E'): -6.3,
        ('W', 'A'): -5.5, ('W', 'M'): -2.8, ('H', 'S'): -0.5, ('W', 'I'): -4.4,
        ('S', 'C'): 0.3, ('L', 'A'): -1.7, ('L', 'E'): -4.4, ('W', 'Q'): -3.3,
        ('H', 'G'): -2.0, ('Q', 'N'): 0.5, ('H', 'C'): -1.5, ('L', 'M'): 3.2,
        ('W', 'Y'): 1.5, ('Y', 'N'): -1.2, ('E', 'P'): -1.7, ('Y', 'F'): 5.9,
        ('E', 'T'): -0.9, ('A', 'A'): 2.5, ('I', 'N'): -2.7, ('G', 'A'): 0.8,
        ('Y', 'V'): -2.6, ('E', 'D'): 3.9, ('W', 'H'): -2.7, ('Y', 'R'): -2.7,
        ('M', 'Q'): -1.7, ('P', 'S'): 1.1, ('R', 'H'): 1.5, ('A', 'C'): -1.2,
        ('R', 'D'): -1.0, ('K', 'P'): -1.6, ('L', 'D'): -4.9, ('K', 'T'): -0.4,
        ('V', 'N'): -2.3, ('M', 'A'): -0.8, ('K', 'H'): 0.8, ('V', 'R'): -2.9,
        ('P', 'C'): -3.1, ('M', 'E'): -3.4, ('A', 'S'): 1.3, ('T', 'T'): 2.5,
        ('R', 'T'): -0.7, ('I', 'G'): -3.8, ('R', 'P'): -1.2, ('K', 'D'): 0.2,
        ('I', 'C'): -2.4, ('F', 'R'): -4.3, ('F', 'V'): -0.1, ('L', 'C'): -2.6,
        ('F', 'F'): 7.7, ('D', 'A'): -0.2, ('F', 'N'): -3.5, ('W', 'D'): -6.4,
        ('L', 'P'): -1.3, ('Q', 'S'): -0.6, ('N', 'C'): -1.9, ('N', 'G'): 0.4,
        ('H', 'N'): 1.4, ('W', 'T'): -4.5, ('Q', 'G'): -1.4, ('W', 'P'): -5.8,
        ('Q', 'C'): -3.3, ('N', 'S'): 1.1, ('L', 'H'): -2.1, ('L', 'L'): 4.6,
        ('G', 'T'): -0.7, ('M', 'M'): 4.9, ('G', 'P'): -1.8, ('Y', 'K'): -3.6,
        ('Y', 'G'): -4.8, ('Y', 'C'): 0.6, ('E', 'A'): -0.3, ('E', 'E'): 4.6,
        ('Y', 'S'): -1.9, ('M', 'P'): -2.0, ('V', 'C'): -1.7, ('M', 'T'): 0.1,
        ('V', 'G'): -2.5, ('R', 'E'): -0.1, ('V', 'K'): -2.7, ('K', 'Q'): 2.2,
        ('R', 'A'): -1.2, ('I', 'R'): -3.2, ('N', 'A'): 0.0, ('V', 'S'): -0.9,
        ('M', 'D'): -3.9, ('M', 'H'): -2.4, ('K', 'A'): -1.0, ('R', 'Q'): 2.2,
        ('K', 'E'): 1.0, ('F', 'S'): -2.2, ('I', 'K'): -3.0, ('D', 'P'): -1.8,
        ('D', 'T'): -0.7, ('I', 'M'): 3.1, ('F', 'C'): -0.1, ('W', 'L'): -1.8,
        ('F', 'G'): -5.8, ('F', 'K'): -5.1, ('F', 'T'): -2.6, ('D', 'D'): 4.8,
        ('Q', 'T'): -0.7, ('W', 'G'): -4.5, ('Q', 'P'): -0.1, ('W', 'C'): 0.5,
        ('W', 'K'): -3.7, ('H', 'Q'): 2.4, ('Q', 'D'): 0.6, ('W', 'W'): 15.7,
        ('V', 'L'): 2.0, ('L', 'G'): -4.9, ('W', 'S'): -3.9, ('L', 'K'): -3.3,
        ('N', 'P'): -1.1, ('H', 'E'): -0.2, ('N', 'T'): 0.5, ('H', 'A'): -1.6,
        ('Y', 'L'): -0.7, ('Y', 'H'): 3.7, ('G', 'S'): 0.6, ('Y', 'D'): -3.0,
        ('V', 'Q'): -2.4, ('L', 'T'): -1.0, ('G', 'G'): 6.2, ('G', 'C'): -1.7,
        ('E', 'N'): 1.2, ('Y', 'T'): -3.0, ('Y', 'P'): -3.5, ('R', 'N'): 0.4,
        ('V', 'D'): -3.0, ('K', 'R'): 3.9, ('V', 'H'): -3.0, ('I', 'Q'): -2.7,
        ('V', 'P'): -1.7, ('M', 'C'): -2.5, ('K', 'N'): 1.0, ('V', 'T'): 0.4,
        ('M', 'G'): -3.8, ('T', 'S'): 1.5, ('I', 'E'): -3.6, ('M', 'K'): -2.0,
        ('I', 'A'): -0.4, ('N', 'N'): 3.3, ('R', 'R'): 5.0, ('F', 'P'): -3.4,
        ('L', 'I'): 2.7, ('I', 'S'): -1.4, ('D', 'S'): 0.1, ('L', 'S'): -2.1,
        ('I', 'H'): -3.2, ('F', 'D'): -5.4, ('D', 'C'): -3.7, ('F', 'H'): 0.3,
        ('D', 'G'): 0.7, ('F', 'L'): 2.2
        }
benner22 = _temp()
del _temp
assert benner6 != benner22


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/benner74.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 3.0, ('L', 'R'): -2.4, ('I', 'I'): 4.0, ('Q', 'Q'): 3.0,
        ('W', 'N'): -4.0, ('V', 'I'): 3.2, ('H', 'T'): -0.5, ('H', 'P'): -1.0,
        ('W', 'V'): -2.9, ('Q', 'E'): 1.7, ('W', 'R'): -1.6, ('Q', 'A'): -0.3,
        ('H', 'H'): 6.1, ('H', 'D'): 0.4, ('L', 'N'): -3.1, ('Y', 'M'): -0.5,
        ('Y', 'I'): -1.0, ('Y', 'E'): -3.0, ('E', 'S'): 0.1, ('Y', 'A'): -2.6,
        ('Y', 'Y'): 8.1, ('T', 'C'): -0.6, ('E', 'C'): -3.2, ('Y', 'Q'): -1.8,
        ('E', 'G'): -0.5, ('V', 'A'): 0.1, ('C', 'C'): 11.8, ('M', 'R'): -1.8,
        ('P', 'T'): 0.1, ('V', 'E'): -2.1, ('P', 'P'): 7.5, ('I', 'T'): -0.3,
        ('K', 'S'): 0.0, ('R', 'G'): -1.0, ('I', 'P'): -2.6, ('R', 'C'): -2.2,
        ('A', 'T'): 0.7, ('K', 'K'): 3.4, ('A', 'P'): 0.4, ('V', 'M'): 1.8,
        ('I', 'D'): -3.9, ('K', 'C'): -2.9, ('K', 'G'): -1.1, ('R', 'S'): -0.2,
        ('F', 'Q'): -2.8, ('F', 'A'): -2.6, ('V', 'V'): 3.4, ('M', 'N'): -2.2,
        ('F', 'E'): -4.3, ('D', 'N'): 2.2, ('F', 'I'): 0.9, ('F', 'M'): 1.3,
        ('M', 'S'): -1.4, ('S', 'S'): 2.1, ('L', 'Q'): -1.7, ('W', 'E'): -4.7,
        ('W', 'A'): -4.1, ('W', 'M'): -1.3, ('H', 'S'): -0.3, ('W', 'I'): -2.3,
        ('S', 'C'): 0.1, ('L', 'A'): -1.4, ('L', 'E'): -3.1, ('W', 'Q'): -2.8,
        ('H', 'G'): -1.6, ('Q', 'N'): 0.7, ('H', 'C'): -1.3, ('L', 'M'): 2.9,
        ('W', 'Y'): 3.6, ('Y', 'N'): -1.4, ('E', 'P'): -0.7, ('Y', 'F'): 5.3,
        ('E', 'T'): -0.2, ('A', 'A'): 2.4, ('I', 'N'): -2.8, ('G', 'A'): 0.6,
        ('Y', 'V'): -1.4, ('E', 'D'): 2.9, ('W', 'H'): -1.0, ('Y', 'R'): -2.0,
        ('M', 'Q'): -1.0, ('P', 'S'): 0.5, ('R', 'H'): 1.0, ('A', 'C'): 0.3,
        ('R', 'D'): -0.5, ('K', 'P'): -0.8, ('L', 'D'): -4.2, ('K', 'T'): 0.1,
        ('V', 'N'): -2.2, ('M', 'A'): -0.8, ('K', 'H'): 0.6, ('V', 'R'): -2.2,
        ('P', 'C'): -3.1, ('M', 'E'): -2.2, ('A', 'S'): 1.1, ('T', 'T'): 2.5,
        ('R', 'T'): -0.3, ('I', 'G'): -4.3, ('R', 'P'): -0.1, ('K', 'D'): 0.4,
        ('I', 'C'): -1.2, ('F', 'R'): -3.5, ('F', 'V'): 0.1, ('L', 'C'): -1.6,
        ('F', 'F'): 7.2, ('D', 'A'): -0.3, ('F', 'N'): -3.2, ('W', 'D'): -5.5,
        ('L', 'P'): -2.2, ('Q', 'S'): 0.1, ('N', 'C'): -1.8, ('N', 'G'): 0.4,
        ('H', 'N'): 1.2, ('W', 'T'): -3.7, ('Q', 'G'): -1.1, ('W', 'P'): -5.2,
        ('Q', 'C'): -2.6, ('N', 'S'): 0.9, ('L', 'H'): -1.9, ('L', 'L'): 4.2,
        ('G', 'T'): -1.0, ('M', 'M'): 4.5, ('G', 'P'): -1.7, ('Y', 'K'): -2.4,
        ('Y', 'G'): -4.3, ('Y', 'C'): -0.4, ('E', 'A'): -0.1, ('E', 'E'): 3.7,
        ('Y', 'S'): -1.9, ('M', 'P'): -2.4, ('V', 'C'): -0.2, ('M', 'T'): -0.4,
        ('V', 'G'): -3.1, ('R', 'E'): 0.3, ('V', 'K'): -1.9, ('K', 'Q'): 1.7,
        ('R', 'A'): -0.8, ('I', 'R'): -2.6, ('N', 'A'): -0.2, ('V', 'S'): -1.0,
        ('M', 'D'): -3.2, ('M', 'H'): -1.5, ('K', 'A'): -0.4, ('R', 'Q'): 1.6,
        ('K', 'E'): 1.2, ('F', 'S'): -2.6, ('I', 'K'): -2.3, ('D', 'P'): -1.0,
        ('D', 'T'): -0.2, ('I', 'M'): 2.6, ('F', 'C'): -0.7, ('W', 'L'): -0.9,
        ('F', 'G'): -5.4, ('F', 'K'): -3.6, ('F', 'T'): -2.2, ('D', 'D'): 4.8,
        ('Q', 'T'): -0.1, ('W', 'G'): -4.1, ('Q', 'P'): -0.2, ('W', 'C'): -0.9,
        ('W', 'K'): -3.6, ('H', 'Q'): 1.4, ('Q', 'D'): 0.8, ('W', 'W'): 14.7,
        ('V', 'L'): 1.9, ('L', 'G'): -4.6, ('W', 'S'): -3.4, ('L', 'K'): -2.4,
        ('N', 'P'): -1.0, ('H', 'E'): 0.2, ('N', 'T'): 0.4, ('H', 'A'): -1.0,
        ('Y', 'L'): -0.1, ('Y', 'H'): 2.5, ('G', 'S'): 0.4, ('Y', 'D'): -2.8,
        ('V', 'Q'): -1.7, ('L', 'T'): -1.1, ('G', 'G'): 6.6, ('G', 'C'): -2.0,
        ('E', 'N'): 1.0, ('Y', 'T'): -2.1, ('Y', 'P'): -3.4, ('R', 'N'): 0.3,
        ('V', 'D'): -2.9, ('K', 'R'): 2.9, ('V', 'H'): -2.1, ('I', 'Q'): -2.0,
        ('V', 'P'): -1.9, ('M', 'C'): -1.2, ('K', 'N'): 0.9, ('V', 'T'): 0.2,
        ('M', 'G'): -3.5, ('T', 'S'): 1.4, ('I', 'E'): -2.9, ('M', 'K'): -1.5,
        ('I', 'A'): -0.8, ('N', 'N'): 3.6, ('R', 'R'): 4.8, ('F', 'P'): -3.8,
        ('L', 'I'): 2.8, ('I', 'S'): -1.8, ('D', 'S'): 0.4, ('L', 'S'): -2.2,
        ('I', 'H'): -2.3, ('F', 'D'): -4.7, ('D', 'C'): -3.2, ('F', 'H'): 0.0,
        ('D', 'G'): 0.2, ('F', 'L'): 2.1
        }
benner74 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum100.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -4, ('S', 'P'): -2, ('V', 'T'): -1,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -2, ('Z', 'Y'): -4, ('W', 'R'): -4,
        ('Q', 'A'): -1, ('S', 'D'): -1, ('H', 'H'): 9, ('S', 'H'): -2,
        ('H', 'D'): -2, ('L', 'N'): -5, ('W', 'A'): -4, ('Y', 'M'): -3,
        ('G', 'R'): -4, ('Y', 'I'): -3, ('Y', 'E'): -4, ('B', 'Y'): -4,
        ('Y', 'A'): -4, ('V', 'D'): -5, ('B', 'S'): -1, ('Y', 'Y'): 8,
        ('G', 'N'): -2, ('E', 'C'): -6, ('Y', 'Q'): -3, ('Z', 'Z'): 4,
        ('V', 'A'): -1, ('C', 'C'): 9, ('M', 'R'): -2, ('V', 'E'): -3,
        ('T', 'N'): -1, ('P', 'P'): 8, ('V', 'I'): 2, ('V', 'S'): -3,
        ('Z', 'P'): -3, ('V', 'M'): 0, ('T', 'F'): -3, ('V', 'Q'): -3,
        ('K', 'K'): 6, ('P', 'D'): -3, ('I', 'H'): -5, ('I', 'D'): -6,
        ('T', 'R'): -2, ('P', 'L'): -4, ('K', 'G'): -3, ('M', 'N'): -4,
        ('P', 'H'): -3, ('F', 'Q'): -4, ('Z', 'G'): -4, ('X', 'L'): -2,
        ('T', 'M'): -2, ('Z', 'C'): -6, ('X', 'H'): -2, ('D', 'R'): -3,
        ('B', 'W'): -6, ('X', 'D'): -3, ('Z', 'K'): 0, ('F', 'A'): -4,
        ('Z', 'W'): -4, ('F', 'E'): -5, ('D', 'N'): 1, ('B', 'K'): -1,
        ('X', 'X'): -2, ('F', 'I'): -1, ('B', 'G'): -2, ('X', 'T'): -1,
        ('F', 'M'): -1, ('B', 'C'): -5, ('Z', 'I'): -4, ('Z', 'V'): -3,
        ('S', 'S'): 6, ('L', 'Q'): -3, ('W', 'E'): -5, ('Q', 'R'): 0,
        ('N', 'N'): 7, ('W', 'M'): -3, ('Q', 'C'): -5, ('W', 'I'): -4,
        ('S', 'C'): -2, ('L', 'A'): -3, ('S', 'G'): -1, ('L', 'E'): -5,
        ('W', 'Q'): -3, ('H', 'G'): -4, ('S', 'K'): -1, ('Q', 'N'): -1,
        ('N', 'R'): -1, ('H', 'C'): -5, ('Y', 'N'): -3, ('G', 'Q'): -3,
        ('Y', 'F'): 3, ('C', 'A'): -1, ('V', 'L'): 0, ('G', 'E'): -4,
        ('G', 'A'): -1, ('K', 'R'): 2, ('E', 'D'): 1, ('Y', 'R'): -3,
        ('M', 'Q'): -1, ('T', 'I'): -2, ('C', 'D'): -5, ('V', 'F'): -2,
        ('T', 'A'): -1, ('T', 'P'): -3, ('B', 'P'): -3, ('T', 'E'): -2,
        ('V', 'N'): -4, ('P', 'G'): -4, ('M', 'A'): -2, ('K', 'H'): -2,
        ('V', 'R'): -4, ('P', 'C'): -5, ('M', 'E'): -4, ('K', 'L'): -4,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 1, ('T', 'Q'): -2, ('I', 'G'): -6,
        ('P', 'K'): -2, ('M', 'M'): 8, ('K', 'D'): -2, ('I', 'C'): -2,
        ('Z', 'D'): 0, ('F', 'R'): -4, ('X', 'K'): -2, ('Q', 'D'): -2,
        ('X', 'G'): -3, ('Z', 'L'): -4, ('X', 'C'): -3, ('Z', 'H'): -1,
        ('B', 'L'): -5, ('B', 'H'): -1, ('F', 'F'): 7, ('X', 'W'): -4,
        ('B', 'D'): 4, ('D', 'A'): -3, ('S', 'L'): -4, ('X', 'S'): -1,
        ('F', 'N'): -5, ('S', 'R'): -2, ('W', 'D'): -7, ('V', 'Y'): -3,
        ('W', 'L'): -4, ('H', 'R'): -1, ('W', 'H'): -3, ('H', 'N'): 0,
        ('W', 'T'): -5, ('T', 'T'): 6, ('S', 'F'): -3, ('W', 'P'): -6,
        ('L', 'D'): -6, ('B', 'I'): -5, ('L', 'H'): -4, ('S', 'N'): 0,
        ('B', 'T'): -2, ('L', 'L'): 5, ('Y', 'K'): -4, ('E', 'Q'): 1,
        ('Y', 'G'): -6, ('Z', 'S'): -1, ('Y', 'C'): -4, ('G', 'D'): -3,
        ('B', 'V'): -5, ('E', 'A'): -2, ('Y', 'W'): 1, ('E', 'E'): 6,
        ('Y', 'S'): -3, ('C', 'N'): -4, ('V', 'C'): -2, ('T', 'H'): -3,
        ('P', 'R'): -3, ('V', 'G'): -5, ('T', 'L'): -3, ('V', 'K'): -4,
        ('K', 'Q'): 1, ('R', 'A'): -2, ('I', 'R'): -4, ('T', 'D'): -2,
        ('P', 'F'): -5, ('I', 'N'): -5, ('K', 'I'): -4, ('M', 'D'): -5,
        ('V', 'W'): -4, ('W', 'W'): 11, ('M', 'H'): -3, ('P', 'N'): -4,
        ('K', 'A'): -2, ('M', 'L'): 2, ('K', 'E'): 0, ('Z', 'E'): 5,
        ('X', 'N'): -2, ('Z', 'A'): -2, ('Z', 'M'): -3, ('X', 'F'): -3,
        ('K', 'C'): -5, ('B', 'Q'): -1, ('X', 'B'): -2, ('B', 'M'): -4,
        ('F', 'C'): -3, ('Z', 'Q'): 3, ('X', 'Z'): -2, ('F', 'G'): -5,
        ('B', 'E'): 0, ('X', 'V'): -2, ('F', 'K'): -4, ('B', 'A'): -3,
        ('X', 'R'): -2, ('D', 'D'): 7, ('W', 'G'): -5, ('Z', 'F'): -5,
        ('S', 'Q'): -1, ('W', 'C'): -5, ('W', 'K'): -5, ('H', 'Q'): 0,
        ('L', 'C'): -3, ('W', 'N'): -6, ('S', 'A'): 1, ('L', 'G'): -5,
        ('W', 'S'): -4, ('S', 'E'): -1, ('H', 'E'): -1, ('S', 'I'): -4,
        ('H', 'A'): -3, ('S', 'M'): -3, ('Y', 'L'): -3, ('Y', 'H'): 1,
        ('Y', 'D'): -5, ('E', 'R'): -2, ('X', 'P'): -3, ('G', 'G'): 6,
        ('G', 'C'): -5, ('E', 'N'): -1, ('Y', 'T'): -3, ('Y', 'P'): -5,
        ('T', 'K'): -2, ('A', 'A'): 5, ('P', 'Q'): -2, ('T', 'C'): -2,
        ('V', 'H'): -5, ('T', 'G'): -3, ('I', 'Q'): -4, ('Z', 'T'): -2,
        ('C', 'R'): -5, ('V', 'P'): -4, ('P', 'E'): -3, ('M', 'C'): -3,
        ('K', 'N'): -1, ('I', 'I'): 5, ('P', 'A'): -1, ('M', 'G'): -5,
        ('T', 'S'): 1, ('I', 'E'): -5, ('P', 'M'): -4, ('M', 'K'): -2,
        ('I', 'A'): -3, ('P', 'I'): -4, ('R', 'R'): 7, ('X', 'M'): -2,
        ('L', 'I'): 1, ('X', 'I'): -2, ('Z', 'B'): 1, ('X', 'E'): -2,
        ('Z', 'N'): -1, ('X', 'A'): -1, ('B', 'R'): -2, ('B', 'N'): 4,
        ('F', 'D'): -5, ('X', 'Y'): -3, ('Z', 'R'): -1, ('F', 'H'): -2,
        ('B', 'F'): -5, ('F', 'L'): 0, ('X', 'Q'): -2, ('B', 'B'): 4
        }
blosum100 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum30.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -2, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 1,
        ('Q', 'Q'): 8, ('N', 'A'): 0, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): 0,
        ('Q', 'A'): 1, ('S', 'D'): 0, ('H', 'H'): 14, ('S', 'H'): -1,
        ('H', 'D'): -2, ('L', 'N'): -2, ('W', 'A'): -5, ('Y', 'M'): -1,
        ('G', 'R'): -2, ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -2, ('B', 'Y'): -3,
        ('Y', 'A'): -4, ('V', 'D'): -2, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 9,
        ('G', 'N'): 0, ('E', 'C'): 1, ('Y', 'Q'): -1, ('Z', 'Z'): 4,
        ('V', 'A'): 1, ('C', 'C'): 17, ('M', 'R'): 0, ('V', 'E'): -3,
        ('T', 'N'): 1, ('P', 'P'): 11, ('V', 'I'): 4, ('V', 'S'): -1,
        ('Z', 'P'): 0, ('V', 'M'): 0, ('T', 'F'): -2, ('V', 'Q'): -3,
        ('K', 'K'): 4, ('P', 'D'): -1, ('I', 'H'): -2, ('I', 'D'): -4,
        ('T', 'R'): -3, ('P', 'L'): -3, ('K', 'G'): -1, ('M', 'N'): 0,
        ('P', 'H'): 1, ('F', 'Q'): -3, ('Z', 'G'): -2, ('X', 'L'): 0,
        ('T', 'M'): 0, ('Z', 'C'): 0, ('X', 'H'): -1, ('D', 'R'): -1,
        ('B', 'W'): -5, ('X', 'D'): -1, ('Z', 'K'): 1, ('F', 'A'): -2,
        ('Z', 'W'): -1, ('F', 'E'): -4, ('D', 'N'): 1, ('B', 'K'): 0,
        ('X', 'X'): -1, ('F', 'I'): 0, ('B', 'G'): 0, ('X', 'T'): 0,
        ('F', 'M'): -2, ('B', 'C'): -2, ('Z', 'I'): -3, ('Z', 'V'): -3,
        ('S', 'S'): 4, ('L', 'Q'): -2, ('W', 'E'): -1, ('Q', 'R'): 3,
        ('N', 'N'): 8, ('W', 'M'): -3, ('Q', 'C'): -2, ('W', 'I'): -3,
        ('S', 'C'): -2, ('L', 'A'): -1, ('S', 'G'): 0, ('L', 'E'): -1,
        ('W', 'Q'): -1, ('H', 'G'): -3, ('S', 'K'): 0, ('Q', 'N'): -1,
        ('N', 'R'): -2, ('H', 'C'): -5, ('Y', 'N'): -4, ('G', 'Q'): -2,
        ('Y', 'F'): 3, ('C', 'A'): -3, ('V', 'L'): 1, ('G', 'E'): -2,
        ('G', 'A'): 0, ('K', 'R'): 1, ('E', 'D'): 1, ('Y', 'R'): 0,
        ('M', 'Q'): -1, ('T', 'I'): 0, ('C', 'D'): -3, ('V', 'F'): 1,
        ('T', 'A'): 1, ('T', 'P'): 0, ('B', 'P'): -2, ('T', 'E'): -2,
        ('V', 'N'): -2, ('P', 'G'): -1, ('M', 'A'): 1, ('K', 'H'): -2,
        ('V', 'R'): -1, ('P', 'C'): -3, ('M', 'E'): -1, ('K', 'L'): -2,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 1, ('T', 'Q'): 0, ('I', 'G'): -1,
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        ('H', 'A'): -2, ('S', 'M'): -2, ('Y', 'L'): 3, ('Y', 'H'): 0,
        ('Y', 'D'): -1, ('E', 'R'): -1, ('X', 'P'): -1, ('G', 'G'): 8,
        ('G', 'C'): -4, ('E', 'N'): -1, ('Y', 'T'): -1, ('Y', 'P'): -2,
        ('T', 'K'): -1, ('A', 'A'): 4, ('P', 'Q'): 0, ('T', 'C'): -2,
        ('V', 'H'): -3, ('T', 'G'): -2, ('I', 'Q'): -2, ('Z', 'T'): -1,
        ('C', 'R'): -2, ('V', 'P'): -4, ('P', 'E'): 1, ('M', 'C'): -2,
        ('K', 'N'): 0, ('I', 'I'): 6, ('P', 'A'): -1, ('M', 'G'): -2,
        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -3, ('P', 'M'): -4, ('M', 'K'): 2,
        ('I', 'A'): 0, ('P', 'I'): -3, ('R', 'R'): 8, ('X', 'M'): 0,
        ('L', 'I'): 2, ('X', 'I'): 0, ('Z', 'B'): 0, ('X', 'E'): -1,
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        ('B', 'F'): -3, ('F', 'L'): 2, ('X', 'Q'): 0, ('B', 'B'): 5
        }
blosum30 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum35.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -2, ('S', 'P'): -2, ('V', 'T'): 1,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -1, ('W', 'R'): 0,
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        ('Y', 'A'): -1, ('V', 'D'): -2, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 8,
        ('G', 'N'): 1, ('E', 'C'): -1, ('Y', 'Q'): 0, ('Z', 'Z'): 4,
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        ('Z', 'P'): 0, ('V', 'M'): 1, ('T', 'F'): -1, ('V', 'Q'): -3,
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        ('S', 'C'): -3, ('L', 'A'): -2, ('S', 'G'): 1, ('L', 'E'): -1,
        ('W', 'Q'): -1, ('H', 'G'): -2, ('S', 'K'): 0, ('Q', 'N'): 1,
        ('N', 'R'): -1, ('H', 'C'): -4, ('Y', 'N'): -2, ('G', 'Q'): -2,
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        ('M', 'Q'): -1, ('T', 'I'): -1, ('C', 'D'): -3, ('V', 'F'): 1,
        ('T', 'A'): 0, ('T', 'P'): 0, ('B', 'P'): -1, ('T', 'E'): -1,
        ('V', 'N'): -2, ('P', 'G'): -2, ('M', 'A'): 0, ('K', 'H'): -2,
        ('V', 'R'): -1, ('P', 'C'): -4, ('M', 'E'): -2, ('K', 'L'): -2,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 1, ('T', 'Q'): 0, ('I', 'G'): -3,
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        ('Z', 'D'): 1, ('F', 'R'): -1, ('X', 'K'): 0, ('Q', 'D'): -1,
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        ('B', 'D'): 5, ('D', 'A'): -1, ('S', 'L'): -2, ('X', 'S'): 0,
        ('F', 'N'): -1, ('S', 'R'): -1, ('W', 'D'): -3, ('V', 'Y'): 0,
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        ('B', 'V'): -2, ('E', 'A'): -1, ('Y', 'W'): 3, ('E', 'E'): 6,
        ('Y', 'S'): -1, ('C', 'N'): -1, ('V', 'C'): -2, ('T', 'H'): -2,
        ('P', 'R'): -2, ('V', 'G'): -3, ('T', 'L'): 0, ('V', 'K'): -2,
        ('K', 'Q'): 0, ('R', 'A'): -1, ('I', 'R'): -3, ('T', 'D'): -1,
        ('P', 'F'): -4, ('I', 'N'): -1, ('K', 'I'): -2, ('M', 'D'): -3,
        ('V', 'W'): -2, ('W', 'W'): 16, ('M', 'H'): 1, ('P', 'N'): -2,
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        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -3, ('P', 'M'): -3, ('M', 'K'): 0,
        ('I', 'A'): -1, ('P', 'I'): -1, ('R', 'R'): 8, ('X', 'M'): 0,
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        ('F', 'D'): -3, ('X', 'Y'): -1, ('Z', 'R'): 0, ('F', 'H'): -3,
        ('B', 'F'): -2, ('F', 'L'): 2, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 5
        }
blosum35 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum40.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -2, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 1,
        ('Q', 'Q'): 8, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): -2,
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        ('K', 'K'): 6, ('P', 'D'): -2, ('I', 'H'): -3, ('I', 'D'): -4,
        ('T', 'R'): -2, ('P', 'L'): -4, ('K', 'G'): -2, ('M', 'N'): -2,
        ('P', 'H'): -2, ('F', 'Q'): -4, ('Z', 'G'): -2, ('X', 'L'): -1,
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        ('Z', 'W'): -2, ('F', 'E'): -3, ('D', 'N'): 2, ('B', 'K'): 0,
        ('X', 'X'): -1, ('F', 'I'): 1, ('B', 'G'): -1, ('X', 'T'): 0,
        ('F', 'M'): 0, ('B', 'C'): -2, ('Z', 'I'): -4, ('Z', 'V'): -3,
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        ('N', 'N'): 8, ('W', 'M'): -2, ('Q', 'C'): -4, ('W', 'I'): -3,
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        ('G', 'A'): 1, ('K', 'R'): 3, ('E', 'D'): 2, ('Y', 'R'): -1,
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        ('V', 'R'): -2, ('P', 'C'): -5, ('M', 'E'): -2, ('K', 'L'): -2,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 1, ('T', 'Q'): -1, ('I', 'G'): -4,
        ('P', 'K'): -1, ('M', 'M'): 7, ('K', 'D'): 0, ('I', 'C'): -4,
        ('Z', 'D'): 1, ('F', 'R'): -2, ('X', 'K'): -1, ('Q', 'D'): -1,
        ('X', 'G'): -1, ('Z', 'L'): -2, ('X', 'C'): -2, ('Z', 'H'): 0,
        ('B', 'L'): -3, ('B', 'H'): 0, ('F', 'F'): 9, ('X', 'W'): -2,
        ('B', 'D'): 6, ('D', 'A'): -1, ('S', 'L'): -3, ('X', 'S'): 0,
        ('F', 'N'): -3, ('S', 'R'): -1, ('W', 'D'): -5, ('V', 'Y'): -1,
        ('W', 'L'): -1, ('H', 'R'): 0, ('W', 'H'): -5, ('H', 'N'): 1,
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        ('L', 'D'): -3, ('B', 'I'): -3, ('L', 'H'): -2, ('S', 'N'): 1,
        ('B', 'T'): 0, ('L', 'L'): 6, ('Y', 'K'): -1, ('E', 'Q'): 2,
        ('Y', 'G'): -3, ('Z', 'S'): 0, ('Y', 'C'): -4, ('G', 'D'): -2,
        ('B', 'V'): -3, ('E', 'A'): -1, ('Y', 'W'): 3, ('E', 'E'): 7,
        ('Y', 'S'): -2, ('C', 'N'): -2, ('V', 'C'): -2, ('T', 'H'): -2,
        ('P', 'R'): -3, ('V', 'G'): -4, ('T', 'L'): -1, ('V', 'K'): -2,
        ('K', 'Q'): 1, ('R', 'A'): -2, ('I', 'R'): -3, ('T', 'D'): -1,
        ('P', 'F'): -4, ('I', 'N'): -2, ('K', 'I'): -3, ('M', 'D'): -3,
        ('V', 'W'): -3, ('W', 'W'): 19, ('M', 'H'): 1, ('P', 'N'): -2,
        ('K', 'A'): -1, ('M', 'L'): 3, ('K', 'E'): 1, ('Z', 'E'): 5,
        ('X', 'N'): -1, ('Z', 'A'): -1, ('Z', 'M'): -2, ('X', 'F'): -1,
        ('K', 'C'): -3, ('B', 'Q'): 0, ('X', 'B'): -1, ('B', 'M'): -3,
        ('F', 'C'): -2, ('Z', 'Q'): 4, ('X', 'Z'): -1, ('F', 'G'): -3,
        ('B', 'E'): 1, ('X', 'V'): -1, ('F', 'K'): -3, ('B', 'A'): -1,
        ('X', 'R'): -1, ('D', 'D'): 9, ('W', 'G'): -2, ('Z', 'F'): -4,
        ('S', 'Q'): 1, ('W', 'C'): -6, ('W', 'K'): -2, ('H', 'Q'): 0,
        ('L', 'C'): -2, ('W', 'N'): -4, ('S', 'A'): 1, ('L', 'G'): -4,
        ('W', 'S'): -5, ('S', 'E'): 0, ('H', 'E'): 0, ('S', 'I'): -2,
        ('H', 'A'): -2, ('S', 'M'): -2, ('Y', 'L'): 0, ('Y', 'H'): 2,
        ('Y', 'D'): -3, ('E', 'R'): -1, ('X', 'P'): -2, ('G', 'G'): 8,
        ('G', 'C'): -3, ('E', 'N'): -1, ('Y', 'T'): -1, ('Y', 'P'): -3,
        ('T', 'K'): 0, ('A', 'A'): 5, ('P', 'Q'): -2, ('T', 'C'): -1,
        ('V', 'H'): -4, ('T', 'G'): -2, ('I', 'Q'): -3, ('Z', 'T'): -1,
        ('C', 'R'): -3, ('V', 'P'): -3, ('P', 'E'): 0, ('M', 'C'): -3,
        ('K', 'N'): 0, ('I', 'I'): 6, ('P', 'A'): -2, ('M', 'G'): -2,
        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -4, ('P', 'M'): -2, ('M', 'K'): -1,
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        ('L', 'I'): 2, ('X', 'I'): -1, ('Z', 'B'): 2, ('X', 'E'): -1,
        ('Z', 'N'): 0, ('X', 'A'): 0, ('B', 'R'): -1, ('B', 'N'): 4,
        ('F', 'D'): -4, ('X', 'Y'): -1, ('Z', 'R'): 0, ('F', 'H'): -2,
        ('B', 'F'): -3, ('F', 'L'): 2, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 5
        }
blosum40 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum45.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -2, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 6, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): -2,
        ('Q', 'A'): -1, ('S', 'D'): 0, ('H', 'H'): 10, ('S', 'H'): -1,
        ('H', 'D'): 0, ('L', 'N'): -3, ('W', 'A'): -2, ('Y', 'M'): 0,
        ('G', 'R'): -2, ('Y', 'I'): 0, ('Y', 'E'): -2, ('B', 'Y'): -2,
        ('Y', 'A'): -2, ('V', 'D'): -3, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 8,
        ('G', 'N'): 0, ('E', 'C'): -3, ('Y', 'Q'): -1, ('Z', 'Z'): 4,
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        ('K', 'K'): 5, ('P', 'D'): -1, ('I', 'H'): -3, ('I', 'D'): -4,
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        ('P', 'H'): -2, ('F', 'Q'): -4, ('Z', 'G'): -2, ('X', 'L'): -1,
        ('T', 'M'): -1, ('Z', 'C'): -3, ('X', 'H'): -1, ('D', 'R'): -1,
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        ('S', 'S'): 4, ('L', 'Q'): -2, ('W', 'E'): -3, ('Q', 'R'): 1,
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        ('S', 'C'): -1, ('L', 'A'): -1, ('S', 'G'): 0, ('L', 'E'): -2,
        ('W', 'Q'): -2, ('H', 'G'): -2, ('S', 'K'): -1, ('Q', 'N'): 0,
        ('N', 'R'): 0, ('H', 'C'): -3, ('Y', 'N'): -2, ('G', 'Q'): -2,
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        ('M', 'Q'): 0, ('T', 'I'): -1, ('C', 'D'): -3, ('V', 'F'): 0,
        ('T', 'A'): 0, ('T', 'P'): -1, ('B', 'P'): -2, ('T', 'E'): -1,
        ('V', 'N'): -3, ('P', 'G'): -2, ('M', 'A'): -1, ('K', 'H'): -1,
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        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 2, ('T', 'Q'): -1, ('I', 'G'): -4,
        ('P', 'K'): -1, ('M', 'M'): 6, ('K', 'D'): 0, ('I', 'C'): -3,
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        ('L', 'D'): -3, ('B', 'I'): -3, ('L', 'H'): -2, ('S', 'N'): 1,
        ('B', 'T'): 0, ('L', 'L'): 5, ('Y', 'K'): -1, ('E', 'Q'): 2,
        ('Y', 'G'): -3, ('Z', 'S'): 0, ('Y', 'C'): -3, ('G', 'D'): -1,
        ('B', 'V'): -3, ('E', 'A'): -1, ('Y', 'W'): 3, ('E', 'E'): 6,
        ('Y', 'S'): -2, ('C', 'N'): -2, ('V', 'C'): -1, ('T', 'H'): -2,
        ('P', 'R'): -2, ('V', 'G'): -3, ('T', 'L'): -1, ('V', 'K'): -2,
        ('K', 'Q'): 1, ('R', 'A'): -2, ('I', 'R'): -3, ('T', 'D'): -1,
        ('P', 'F'): -3, ('I', 'N'): -2, ('K', 'I'): -3, ('M', 'D'): -3,
        ('V', 'W'): -3, ('W', 'W'): 15, ('M', 'H'): 0, ('P', 'N'): -2,
        ('K', 'A'): -1, ('M', 'L'): 2, ('K', 'E'): 1, ('Z', 'E'): 4,
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        ('K', 'C'): -3, ('B', 'Q'): 0, ('X', 'B'): -1, ('B', 'M'): -2,
        ('F', 'C'): -2, ('Z', 'Q'): 4, ('X', 'Z'): -1, ('F', 'G'): -3,
        ('B', 'E'): 1, ('X', 'V'): -1, ('F', 'K'): -3, ('B', 'A'): -1,
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        ('L', 'C'): -2, ('W', 'N'): -4, ('S', 'A'): 1, ('L', 'G'): -3,
        ('W', 'S'): -4, ('S', 'E'): 0, ('H', 'E'): 0, ('S', 'I'): -2,
        ('H', 'A'): -2, ('S', 'M'): -2, ('Y', 'L'): 0, ('Y', 'H'): 2,
        ('Y', 'D'): -2, ('E', 'R'): 0, ('X', 'P'): -1, ('G', 'G'): 7,
        ('G', 'C'): -3, ('E', 'N'): 0, ('Y', 'T'): -1, ('Y', 'P'): -3,
        ('T', 'K'): -1, ('A', 'A'): 5, ('P', 'Q'): -1, ('T', 'C'): -1,
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        ('K', 'N'): 0, ('I', 'I'): 5, ('P', 'A'): -1, ('M', 'G'): -2,
        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -3, ('P', 'M'): -2, ('M', 'K'): -1,
        ('I', 'A'): -1, ('P', 'I'): -2, ('R', 'R'): 7, ('X', 'M'): -1,
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        ('Z', 'N'): 0, ('X', 'A'): 0, ('B', 'R'): -1, ('B', 'N'): 4,
        ('F', 'D'): -4, ('X', 'Y'): -1, ('Z', 'R'): 0, ('F', 'H'): -2,
        ('B', 'F'): -3, ('F', 'L'): 1, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 4
        }
blosum45 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum50.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): -3,
        ('Q', 'A'): -1, ('S', 'D'): 0, ('H', 'H'): 10, ('S', 'H'): -1,
        ('H', 'D'): -1, ('L', 'N'): -4, ('W', 'A'): -3, ('Y', 'M'): 0,
        ('G', 'R'): -3, ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -2, ('B', 'Y'): -3,
        ('Y', 'A'): -2, ('V', 'D'): -4, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 8,
        ('G', 'N'): 0, ('E', 'C'): -3, ('Y', 'Q'): -1, ('Z', 'Z'): 5,
        ('V', 'A'): 0, ('C', 'C'): 13, ('M', 'R'): -2, ('V', 'E'): -3,
        ('T', 'N'): 0, ('P', 'P'): 10, ('V', 'I'): 4, ('V', 'S'): -2,
        ('Z', 'P'): -1, ('V', 'M'): 1, ('T', 'F'): -2, ('V', 'Q'): -3,
        ('K', 'K'): 6, ('P', 'D'): -1, ('I', 'H'): -4, ('I', 'D'): -4,
        ('T', 'R'): -1, ('P', 'L'): -4, ('K', 'G'): -2, ('M', 'N'): -2,
        ('P', 'H'): -2, ('F', 'Q'): -4, ('Z', 'G'): -2, ('X', 'L'): -1,
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        ('S', 'S'): 5, ('L', 'Q'): -2, ('W', 'E'): -3, ('Q', 'R'): 1,
        ('N', 'N'): 7, ('W', 'M'): -1, ('Q', 'C'): -3, ('W', 'I'): -3,
        ('S', 'C'): -1, ('L', 'A'): -2, ('S', 'G'): 0, ('L', 'E'): -3,
        ('W', 'Q'): -1, ('H', 'G'): -2, ('S', 'K'): 0, ('Q', 'N'): 0,
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        ('G', 'A'): 0, ('K', 'R'): 3, ('E', 'D'): 2, ('Y', 'R'): -1,
        ('M', 'Q'): 0, ('T', 'I'): -1, ('C', 'D'): -4, ('V', 'F'): -1,
        ('T', 'A'): 0, ('T', 'P'): -1, ('B', 'P'): -2, ('T', 'E'): -1,
        ('V', 'N'): -3, ('P', 'G'): -2, ('M', 'A'): -1, ('K', 'H'): 0,
        ('V', 'R'): -3, ('P', 'C'): -4, ('M', 'E'): -2, ('K', 'L'): -3,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 2, ('T', 'Q'): -1, ('I', 'G'): -4,
        ('P', 'K'): -1, ('M', 'M'): 7, ('K', 'D'): -1, ('I', 'C'): -2,
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        ('B', 'L'): -4, ('B', 'H'): 0, ('F', 'F'): 8, ('X', 'W'): -3,
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        ('B', 'V'): -4, ('E', 'A'): -1, ('Y', 'W'): 2, ('E', 'E'): 6,
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        ('P', 'R'): -3, ('V', 'G'): -4, ('T', 'L'): -1, ('V', 'K'): -3,
        ('K', 'Q'): 2, ('R', 'A'): -2, ('I', 'R'): -4, ('T', 'D'): -1,
        ('P', 'F'): -4, ('I', 'N'): -3, ('K', 'I'): -3, ('M', 'D'): -4,
        ('V', 'W'): -3, ('W', 'W'): 15, ('M', 'H'): -1, ('P', 'N'): -2,
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        ('S', 'Q'): 0, ('W', 'C'): -5, ('W', 'K'): -3, ('H', 'Q'): 1,
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        ('W', 'S'): -4, ('S', 'E'): -1, ('H', 'E'): 0, ('S', 'I'): -3,
        ('H', 'A'): -2, ('S', 'M'): -2, ('Y', 'L'): -1, ('Y', 'H'): 2,
        ('Y', 'D'): -3, ('E', 'R'): 0, ('X', 'P'): -2, ('G', 'G'): 8,
        ('G', 'C'): -3, ('E', 'N'): 0, ('Y', 'T'): -2, ('Y', 'P'): -3,
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        ('C', 'R'): -4, ('V', 'P'): -3, ('P', 'E'): -1, ('M', 'C'): -2,
        ('K', 'N'): 0, ('I', 'I'): 5, ('P', 'A'): -1, ('M', 'G'): -3,
        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -4, ('P', 'M'): -3, ('M', 'K'): -2,
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        ('B', 'F'): -4, ('F', 'L'): 1, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 5
        }
blosum50 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum55.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): -3,
        ('Q', 'A'): -1, ('S', 'D'): 0, ('H', 'H'): 10, ('S', 'H'): -1,
        ('H', 'D'): -1, ('L', 'N'): -4, ('W', 'A'): -3, ('Y', 'M'): 0,
        ('G', 'R'): -3, ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -2, ('B', 'Y'): -3,
        ('Y', 'A'): -2, ('V', 'D'): -4, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 8,
        ('G', 'N'): 0, ('E', 'C'): -3, ('Y', 'Q'): -1, ('Z', 'Z'): 5,
        ('V', 'A'): 0, ('C', 'C'): 13, ('M', 'R'): -2, ('V', 'E'): -3,
        ('T', 'N'): 0, ('P', 'P'): 10, ('V', 'I'): 4, ('V', 'S'): -2,
        ('Z', 'P'): -1, ('V', 'M'): 1, ('T', 'F'): -2, ('V', 'Q'): -3,
        ('K', 'K'): 6, ('P', 'D'): -1, ('I', 'H'): -4, ('I', 'D'): -4,
        ('T', 'R'): -1, ('P', 'L'): -4, ('K', 'G'): -2, ('M', 'N'): -2,
        ('P', 'H'): -2, ('F', 'Q'): -4, ('Z', 'G'): -2, ('X', 'L'): -1,
        ('T', 'M'): -1, ('Z', 'C'): -3, ('X', 'H'): -1, ('D', 'R'): -2,
        ('B', 'W'): -5, ('X', 'D'): -1, ('Z', 'K'): 1, ('F', 'A'): -3,
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        ('N', 'R'): -1, ('H', 'C'): -3, ('Y', 'N'): -2, ('G', 'Q'): -2,
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        ('G', 'A'): 0, ('K', 'R'): 3, ('E', 'D'): 2, ('Y', 'R'): -1,
        ('M', 'Q'): 0, ('T', 'I'): -1, ('C', 'D'): -4, ('V', 'F'): -1,
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        ('V', 'N'): -3, ('P', 'G'): -2, ('M', 'A'): -1, ('K', 'H'): 0,
        ('V', 'R'): -3, ('P', 'C'): -4, ('M', 'E'): -2, ('K', 'L'): -3,
        ('V', 'V'): 5, ('M', 'I'): 2, ('T', 'Q'): -1, ('I', 'G'): -4,
        ('P', 'K'): -1, ('M', 'M'): 7, ('K', 'D'): -1, ('I', 'C'): -2,
        ('Z', 'D'): 1, ('F', 'R'): -3, ('X', 'K'): -1, ('Q', 'D'): 0,
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blosum55 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum60.cmp
def _temp():
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        ('P', 'R'): -2, ('V', 'G'): -3, ('T', 'L'): -1, ('V', 'K'): -2,
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        }
blosum60 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum62.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -2, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 5, ('N', 'A'): -2, ('Z', 'Y'): -2, ('W', 'R'): -3,
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        ('K', 'N'): 0, ('I', 'I'): 4, ('P', 'A'): -1, ('M', 'G'): -3,
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        }
blosum62 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum65.cmp
def _temp():
    return {
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blosum65 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum70.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
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blosum70 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum75.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
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blosum75 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum80.cmp
def _temp():
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blosum80 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum85.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 6, ('N', 'A'): -2, ('Z', 'Y'): -3, ('W', 'R'): -4,
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        }
blosum85 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum90.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -2, ('V', 'T'): -1,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -2, ('Z', 'Y'): -3, ('W', 'R'): -4,
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        ('H', 'D'): -2, ('L', 'N'): -4, ('W', 'A'): -4, ('Y', 'M'): -2,
        ('G', 'R'): -3, ('Y', 'I'): -2, ('Y', 'E'): -4, ('B', 'Y'): -4,
        ('Y', 'A'): -3, ('V', 'D'): -5, ('B', 'S'): 0, ('Y', 'Y'): 8,
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        ('V', 'A'): -1, ('C', 'C'): 9, ('M', 'R'): -2, ('V', 'E'): -3,
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        ('T', 'S'): 1, ('I', 'E'): -4, ('P', 'M'): -3, ('M', 'K'): -2,
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        }
blosum90 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/blosum95.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): -2, ('V', 'T'): -1,
        ('Q', 'Q'): 7, ('N', 'A'): -2, ('Z', 'Y'): -4, ('W', 'R'): -4,
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        ('G', 'N'): -1, ('E', 'C'): -6, ('Y', 'Q'): -3, ('Z', 'Z'): 4,
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        }
blosum95 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/feng.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 3, ('L', 'R'): 2, ('I', 'I'): 6, ('Q', 'Q'): 6,
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        ('F', 'Q'): 1, ('F', 'A'): 2, ('V', 'V'): 6, ('M', 'N'): 1,
        ('F', 'E'): 0, ('D', 'N'): 5, ('F', 'I'): 4, ('F', 'M'): 2,
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        ('H', 'N'): 4, ('W', 'T'): 1, ('Q', 'G'): 2, ('W', 'P'): 2,
        ('Q', 'C'): 1, ('N', 'S'): 5, ('L', 'H'): 3, ('L', 'L'): 6,
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        ('Y', 'G'): 2, ('Y', 'C'): 3, ('E', 'A'): 4, ('E', 'E'): 6,
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        ('V', 'G'): 4, ('R', 'E'): 2, ('V', 'K'): 3, ('K', 'Q'): 4,
        ('R', 'A'): 2, ('I', 'R'): 2, ('N', 'A'): 3, ('V', 'S'): 2,
        ('M', 'D'): 0, ('M', 'H'): 1, ('K', 'A'): 3, ('R', 'Q'): 3,
        ('K', 'E'): 4, ('F', 'S'): 3, ('I', 'K'): 2, ('D', 'P'): 2,
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        ('F', 'G'): 1, ('F', 'K'): 0, ('F', 'T'): 1, ('D', 'D'): 6,
        ('Q', 'T'): 3, ('W', 'G'): 3, ('Q', 'P'): 3, ('W', 'C'): 3,
        ('W', 'K'): 1, ('H', 'Q'): 4, ('Q', 'D'): 4, ('W', 'W'): 6,
        ('V', 'L'): 5, ('L', 'G'): 2, ('W', 'S'): 2, ('L', 'K'): 2,
        ('N', 'P'): 2, ('H', 'E'): 2, ('N', 'T'): 4, ('H', 'A'): 2,
        ('Y', 'L'): 3, ('Y', 'H'): 3, ('G', 'S'): 5, ('Y', 'D'): 2,
        ('V', 'Q'): 2, ('L', 'T'): 2, ('G', 'G'): 6, ('G', 'C'): 3,
        ('E', 'N'): 3, ('Y', 'T'): 2, ('Y', 'P'): 2, ('R', 'N'): 2,
        ('V', 'D'): 3, ('K', 'R'): 5, ('V', 'H'): 1, ('I', 'Q'): 1,
        ('V', 'P'): 3, ('M', 'C'): 2, ('K', 'N'): 4, ('V', 'T'): 3,
        ('M', 'G'): 1, ('T', 'S'): 5, ('I', 'E'): 1, ('M', 'K'): 2,
        ('I', 'A'): 2, ('N', 'N'): 6, ('R', 'R'): 6, ('F', 'P'): 2,
        ('L', 'I'): 5, ('I', 'S'): 2, ('D', 'S'): 3, ('L', 'S'): 2,
        ('I', 'H'): 1, ('F', 'D'): 1, ('D', 'C'): 1, ('F', 'H'): 2,
        ('D', 'G'): 4, ('F', 'L'): 4
        }
feng = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/fitch.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 2, ('U', 'I'): 1, ('W', 'T'): 0, ('R', 'R'): 3,
        ('N', 'M'): 1, ('U', 'M'): 2, ('U', 'O'): 1, ('N', 'A'): 2,
        ('U', 'A'): 1, ('N', 'C'): 1, ('U', 'C'): 1, ('N', 'E'): 2,
        ('U', 'E'): 1, ('W', 'H'): 1, ('W', 'R'): 1, ('W', 'V'): 2,
        ('Q', 'E'): 1, ('S', 'S'): 3, ('T', 'T'): 3, ('S', 'F'): 2,
        ('Q', 'A'): 1, ('Q', 'C'): 1, ('H', 'F'): 1, ('S', 'H'): 1,
        ('L', 'H'): 1, ('S', 'N'): 2, ('Q', 'I'): 2, ('S', 'L'): 2,
        ('L', 'L'): 3, ('Y', 'M'): 1, ('M', 'M'): 3, ('Y', 'I'): 1,
        ('W', 'N'): 2, ('Y', 'R'): 2, ('Y', 'E'): 1, ('O', 'O'): 3,
        ('Y', 'A'): 2, ('Y', 'C'): 2, ('U', 'S'): 2, ('Y', 'U'): 2,
        ('Q', 'Q'): 3, ('E', 'A'): 1, ('N', 'L'): 1, ('E', 'C'): 1,
        ('W', 'W'): 3, ('E', 'E'): 3, ('Y', 'S'): 2, ('V', 'A'): 2,
        ('C', 'C'): 3, ('V', 'C'): 2, ('T', 'H'): 0, ('V', 'E'): 1,
        ('T', 'N'): 0, ('O', 'I'): 1, ('R', 'E'): 2, ('O', 'E'): 1,
        ('R', 'A'): 1, ('O', 'C'): 2, ('R', 'C'): 2, ('O', 'A'): 2,
        ('V', 'Q'): 1, ('V', 'M'): 2, ('V', 'S'): 1, ('Q', 'O'): 2,
        ('I', 'H'): 1, ('M', 'F'): 1, ('R', 'Q'): 2, ('M', 'H'): 0,
        ('O', 'F'): 2, ('T', 'F'): 1, ('M', 'I'): 2, ('M', 'L'): 1,
        ('V', 'T'): 1, ('Q', 'H'): 2, ('Q', 'N'): 1, ('T', 'M'): 1,
        ('W', 'M'): 2, ('Y', 'Y'): 3, ('T', 'S'): 2, ('R', 'O'): 1,
        ('T', 'R'): 2, ('H', 'H'): 3, ('F', 'A'): 1, ('F', 'C'): 2,
        ('F', 'E'): 1, ('W', 'L'): 1, ('T', 'L'): 1, ('U', 'R'): 2,
        ('U', 'H'): 2, ('N', 'H'): 2, ('U', 'Q'): 2, ('W', 'E'): 2,
        ('U', 'L'): 1, ('W', 'C'): 1, ('U', 'N'): 1, ('W', 'A'): 1,
        ('W', 'O'): 1, ('I', 'F'): 0, ('U', 'F'): 2, ('N', 'F'): 1,
        ('L', 'C'): 1, ('S', 'C'): 2, ('L', 'A'): 2, ('S', 'A'): 1,
        ('W', 'S'): 2, ('L', 'E'): 2, ('S', 'E'): 2, ('Q', 'L'): 1,
        ('H', 'E'): 1, ('S', 'I'): 1, ('H', 'C'): 1, ('S', 'O'): 2,
        ('H', 'A'): 2, ('S', 'M'): 1, ('Y', 'L'): 2, ('Y', 'N'): 1,
        ('Y', 'H'): 1, ('O', 'M'): 0, ('Y', 'Q'): 1, ('Y', 'F'): 1,
        ('W', 'I'): 1, ('C', 'A'): 1, ('R', 'I'): 2, ('Y', 'O'): 1,
        ('Q', 'M'): 1, ('S', 'Q'): 2, ('U', 'T'): 2, ('Y', 'T'): 2,
        ('Y', 'V'): 2, ('O', 'L'): 1, ('R', 'N'): 1, ('A', 'A'): 3,
        ('N', 'I'): 2, ('R', 'L'): 1, ('T', 'I'): 1, ('L', 'F'): 1,
        ('T', 'O'): 1, ('R', 'H'): 2, ('O', 'H'): 2, ('V', 'F'): 2,
        ('T', 'C'): 2, ('V', 'H'): 1, ('T', 'A'): 0, ('R', 'F'): 1,
        ('V', 'L'): 2, ('T', 'E'): 1, ('V', 'N'): 1, ('M', 'A'): 0,
        ('Q', 'F'): 1, ('M', 'C'): 0, ('W', 'U'): 2, ('I', 'I'): 3,
        ('V', 'V'): 3, ('O', 'N'): 2, ('I', 'E'): 2, ('T', 'Q'): 2,
        ('I', 'A'): 1, ('N', 'N'): 3, ('I', 'C'): 0, ('S', 'R'): 2,
        ('V', 'R'): 1, ('L', 'I'): 1, ('V', 'I'): 1, ('R', 'M'): 2,
        ('Y', 'W'): 1, ('M', 'E'): 2, ('V', 'U'): 2, ('W', 'Q'): 0,
        ('U', 'U'): 3, ('V', 'O'): 1, ('F', 'F'): 3
        }
fitch = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/genetic.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0.0, ('L', 'R'): -0.4, ('I', 'I'): 4.1, ('Q', 'Q'): 5.5,
        ('W', 'N'): -3.0, ('V', 'I'): 1.0, ('H', 'T'): -1.8, ('H', 'P'): 0.7,
        ('W', 'V'): -2.1, ('Q', 'E'): 2.0, ('W', 'R'): 1.8, ('Q', 'A'): -2.1,
        ('H', 'H'): 4.7, ('H', 'D'): 1.7, ('L', 'N'): -2.2, ('Y', 'M'): -2.9,
        ('Y', 'I'): -1.6, ('Y', 'E'): -0.9, ('E', 'S'): -2.8, ('Y', 'A'): -2.4,
        ('Y', 'Y'): 6.5, ('T', 'C'): -1.9, ('E', 'C'): -3.0, ('Y', 'Q'): -0.8,
        ('E', 'G'): 1.4, ('V', 'A'): 1.0, ('C', 'C'): 5.5, ('M', 'R'): -0.4,
        ('P', 'T'): 1.1, ('V', 'E'): 1.3, ('P', 'P'): 3.8, ('I', 'T'): 0.8,
        ('K', 'S'): -1.5, ('R', 'G'): 0.8, ('I', 'P'): -1.6, ('R', 'C'): 0.7,
        ('A', 'T'): 0.9, ('K', 'K'): 5.6, ('A', 'P'): 0.8, ('V', 'M'): 1.0,
        ('I', 'D'): -2.1, ('K', 'C'): -3.2, ('K', 'G'): -2.2, ('R', 'S'): 0.3,
        ('F', 'Q'): -2.1, ('F', 'A'): -2.4, ('V', 'V'): 4.1, ('M', 'N'): 0.1,
        ('F', 'E'): -2.9, ('D', 'N'): 1.7, ('F', 'I'): 1.3, ('F', 'M'): 0.5,
        ('M', 'S'): -1.3, ('S', 'S'): 2.6, ('L', 'Q'): 0.1, ('W', 'E'): -3.2,
        ('W', 'A'): -2.2, ('W', 'M'): -2.0, ('H', 'S'): -1.6, ('W', 'I'): -2.2,
        ('S', 'C'): 1.5, ('L', 'A'): -2.3, ('L', 'E'): -2.5, ('W', 'Q'): -2.3,
        ('H', 'G'): -2.2, ('Q', 'N'): 0.4, ('H', 'C'): -1.6, ('L', 'M'): 1.5,
        ('W', 'Y'): -0.5, ('Y', 'N'): 2.5, ('E', 'P'): -2.1, ('Y', 'F'): 2.0,
        ('E', 'T'): -2.1, ('A', 'A'): 4.0, ('I', 'N'): 0.9, ('G', 'A'): 1.2,
        ('Y', 'V'): -2.2, ('E', 'D'): 3.8, ('W', 'H'): -2.1, ('Y', 'R'): -1.9,
        ('M', 'Q'): -1.2, ('P', 'S'): 0.4, ('R', 'H'): 3.6, ('A', 'C'): -1.9,
        ('R', 'D'): -2.3, ('K', 'P'): -1.5, ('L', 'D'): -2.4, ('K', 'T'): 1.0,
        ('V', 'N'): -2.2, ('M', 'A'): -2.0, ('K', 'H'): 0.6, ('V', 'R'): -2.1,
        ('P', 'C'): -1.9, ('M', 'E'): -1.8, ('A', 'S'): 0.1, ('T', 'T'): 4.0,
        ('R', 'T'): -0.6, ('I', 'G'): -2.5, ('R', 'P'): 0.3, ('K', 'D'): 0.3,
        ('I', 'C'): -1.9, ('F', 'R'): -1.5, ('F', 'V'): 1.0, ('L', 'C'): -1.3,
        ('F', 'F'): 4.5, ('D', 'A'): 1.0, ('F', 'N'): -1.3, ('W', 'D'): -2.9,
        ('L', 'P'): 0.0, ('Q', 'S'): -2.3, ('N', 'C'): -1.5, ('N', 'G'): -2.6,
        ('H', 'N'): 1.8, ('W', 'T'): -2.2, ('Q', 'G'): -2.1, ('W', 'P'): -1.6,
        ('Q', 'C'): -3.1, ('N', 'S'): -0.3, ('L', 'H'): -0.1, ('L', 'L'): 3.4,
        ('G', 'T'): -2.1, ('M', 'M'): 5.4, ('G', 'P'): -1.8, ('Y', 'K'): -0.8,
        ('Y', 'G'): -1.8, ('Y', 'C'): 2.6, ('E', 'A'): 1.3, ('E', 'E'): 5.7,
        ('Y', 'S'): 0.3, ('M', 'P'): -1.4, ('V', 'C'): -2.2, ('M', 'T'): 0.7,
        ('V', 'G'): 1.1, ('R', 'E'): -2.0, ('V', 'K'): -2.1, ('K', 'Q'): 2.2,
        ('R', 'A'): -1.6, ('I', 'R'): -1.2, ('N', 'A'): -1.7, ('V', 'S'): -2.2,
        ('M', 'D'): -2.5, ('M', 'H'): -1.8, ('K', 'A'): -1.9, ('R', 'Q'): 0.3,
        ('K', 'E'): 2.0, ('F', 'S'): 0.0, ('I', 'K'): 0.7, ('D', 'P'): -2.2,
        ('D', 'T'): -2.1, ('I', 'M'): 3.3, ('F', 'C'): 1.8, ('W', 'L'): -0.3,
        ('F', 'G'): -1.9, ('F', 'K'): -2.8, ('F', 'T'): -2.1, ('D', 'D'): 4.8,
        ('Q', 'T'): -1.7, ('W', 'G'): 1.4, ('Q', 'P'): 1.0, ('W', 'C'): 4.1,
        ('W', 'K'): -3.0, ('H', 'Q'): 3.6, ('Q', 'D'): 0.3, ('W', 'W'): 7.5,
        ('V', 'L'): 1.1, ('L', 'G'): -2.2, ('W', 'S'): 0.8, ('L', 'K'): -2.0,
        ('N', 'P'): -1.6, ('H', 'E'): 0.3, ('N', 'T'): 0.9, ('H', 'A'): -2.1,
        ('Y', 'L'): -1.6, ('Y', 'H'): 2.3, ('G', 'S'): -0.6, ('Y', 'D'): 2.3,
        ('V', 'Q'): -2.0, ('L', 'T'): -1.9, ('G', 'G'): 4.2, ('G', 'C'): 1.0,
        ('E', 'N'): 0.3, ('Y', 'T'): -2.1, ('Y', 'P'): -2.3, ('R', 'N'): -1.5,
        ('V', 'D'): 1.0, ('K', 'R'): -0.2, ('V', 'H'): -2.1, ('I', 'Q'): -1.9,
        ('V', 'P'): -2.1, ('M', 'C'): -2.7, ('K', 'N'): 3.5, ('V', 'T'): -2.2,
        ('M', 'G'): -2.3, ('T', 'S'): 1.0, ('I', 'E'): -2.3, ('M', 'K'): 1.6,
        ('I', 'A'): -1.8, ('N', 'N'): 4.7, ('R', 'R'): 2.9, ('F', 'P'): -1.8,
        ('L', 'I'): 1.2, ('I', 'S'): -0.5, ('D', 'S'): -2.1, ('L', 'S'): -1.2,
        ('I', 'H'): -1.8, ('F', 'D'): -1.7, ('D', 'C'): -1.6, ('F', 'H'): -1.1,
        ('D', 'G'): 1.1, ('F', 'L'): 2.2
        }
genetic = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/gonnet.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 3.6, ('L', 'R'): -2.2, ('I', 'I'): 4.0, ('Q', 'Q'): 2.7,
        ('W', 'N'): -3.6, ('V', 'I'): 3.1, ('H', 'T'): -0.3, ('H', 'P'): -1.1,
        ('W', 'V'): -2.6, ('Q', 'E'): 1.7, ('W', 'R'): -1.6, ('Q', 'A'): -0.2,
        ('H', 'H'): 6.0, ('H', 'D'): 0.4, ('L', 'N'): -3.0, ('Y', 'M'): -0.2,
        ('Y', 'I'): -0.7, ('Y', 'E'): -2.7, ('E', 'S'): 0.2, ('Y', 'A'): -2.2,
        ('Y', 'Y'): 7.8, ('T', 'C'): -0.5, ('E', 'C'): -3.0, ('Y', 'Q'): -1.7,
        ('E', 'G'): -0.8, ('V', 'A'): 0.1, ('C', 'C'): 11.5, ('M', 'R'): -1.7,
        ('P', 'T'): 0.1, ('V', 'E'): -1.9, ('P', 'P'): 7.6, ('I', 'T'): -0.6,
        ('K', 'S'): 0.1, ('R', 'G'): -1.0, ('I', 'P'): -2.6, ('R', 'C'): -2.2,
        ('A', 'T'): 0.6, ('K', 'K'): 3.2, ('A', 'P'): 0.3, ('V', 'M'): 1.6,
        ('I', 'D'): -3.8, ('K', 'C'): -2.8, ('K', 'G'): -1.1, ('R', 'S'): -0.2,
        ('F', 'Q'): -2.6, ('F', 'A'): -2.3, ('V', 'V'): 3.4, ('M', 'N'): -2.2,
        ('F', 'E'): -3.9, ('D', 'N'): 2.2, ('F', 'I'): 1.0, ('F', 'M'): 1.6,
        ('M', 'S'): -1.4, ('S', 'S'): 2.2, ('L', 'Q'): -1.6, ('W', 'E'): -4.3,
        ('W', 'A'): -3.6, ('W', 'M'): -1.0, ('H', 'S'): -0.2, ('W', 'I'): -1.8,
        ('S', 'C'): 0.1, ('L', 'A'): -1.2, ('L', 'E'): -2.8, ('W', 'Q'): -2.7,
        ('H', 'G'): -1.4, ('Q', 'N'): 0.7, ('H', 'C'): -1.3, ('L', 'M'): 2.8,
        ('W', 'Y'): 4.1, ('Y', 'N'): -1.4, ('E', 'P'): -0.5, ('Y', 'F'): 5.1,
        ('E', 'T'): -0.1, ('A', 'A'): 2.4, ('I', 'N'): -2.8, ('G', 'A'): 0.5,
        ('Y', 'V'): -1.1, ('E', 'D'): 2.7, ('W', 'H'): -0.8, ('Y', 'R'): -1.8,
        ('M', 'Q'): -1.0, ('P', 'S'): 0.4, ('R', 'H'): 0.6, ('A', 'C'): 0.5,
        ('R', 'D'): -0.3, ('K', 'P'): -0.6, ('L', 'D'): -4.0, ('K', 'T'): 0.1,
        ('V', 'N'): -2.2, ('M', 'A'): -0.7, ('K', 'H'): 0.6, ('V', 'R'): -2.0,
        ('P', 'C'): -3.1, ('M', 'E'): -2.0, ('A', 'S'): 1.1, ('T', 'T'): 2.5,
        ('R', 'T'): -0.2, ('I', 'G'): -4.5, ('R', 'P'): -0.9, ('K', 'D'): 0.5,
        ('I', 'C'): -1.1, ('F', 'R'): -3.2, ('F', 'V'): 0.1, ('L', 'C'): -1.5,
        ('F', 'F'): 7.0, ('D', 'A'): -0.3, ('F', 'N'): -3.1, ('W', 'D'): -5.2,
        ('L', 'P'): -2.3, ('Q', 'S'): 0.2, ('N', 'C'): -1.8, ('N', 'G'): 0.4,
        ('H', 'N'): 1.2, ('W', 'T'): -3.5, ('Q', 'G'): -1.0, ('W', 'P'): -5.0,
        ('Q', 'C'): -2.4, ('N', 'S'): 0.9, ('L', 'H'): -1.9, ('L', 'L'): 4.0,
        ('G', 'T'): -1.1, ('M', 'M'): 4.3, ('G', 'P'): -1.6, ('Y', 'K'): -2.1,
        ('Y', 'G'): -4.0, ('Y', 'C'): -0.5, ('E', 'A'): 0.0, ('E', 'E'): 3.6,
        ('Y', 'S'): -1.9, ('M', 'P'): -2.4, ('V', 'C'): 0.0, ('M', 'T'): -0.6,
        ('V', 'G'): -3.3, ('R', 'E'): 0.4, ('V', 'K'): -1.7, ('K', 'Q'): 1.5,
        ('R', 'A'): -0.6, ('I', 'R'): -2.4, ('N', 'A'): -0.3, ('V', 'S'): -1.0,
        ('M', 'D'): -3.0, ('M', 'H'): -1.3, ('K', 'A'): -0.4, ('R', 'Q'): 1.5,
        ('K', 'E'): 1.2, ('F', 'S'): -2.8, ('I', 'K'): -2.1, ('D', 'P'): -0.7,
        ('D', 'T'): 0.0, ('I', 'M'): 2.5, ('F', 'C'): -0.8, ('W', 'L'): -0.7,
        ('F', 'G'): -5.2, ('F', 'K'): -3.3, ('F', 'T'): -2.2, ('D', 'D'): 4.7,
        ('Q', 'T'): 0.0, ('W', 'G'): -4.0, ('Q', 'P'): -0.2, ('W', 'C'): -1.0,
        ('W', 'K'): -3.5, ('H', 'Q'): 1.2, ('Q', 'D'): 0.9, ('W', 'W'): 14.2,
        ('V', 'L'): 1.8, ('L', 'G'): -4.4, ('W', 'S'): -3.3, ('L', 'K'): -2.1,
        ('N', 'P'): -0.9, ('H', 'E'): 0.4, ('N', 'T'): 0.5, ('H', 'A'): -0.8,
        ('Y', 'L'): 0.0, ('Y', 'H'): 2.2, ('G', 'S'): 0.4, ('Y', 'D'): -2.8,
        ('V', 'Q'): -1.5, ('L', 'T'): -1.3, ('G', 'G'): 6.6, ('G', 'C'): -2.0,
        ('E', 'N'): 0.9, ('Y', 'T'): -1.9, ('Y', 'P'): -3.1, ('R', 'N'): 0.3,
        ('V', 'D'): -2.9, ('K', 'R'): 2.7, ('V', 'H'): -2.0, ('I', 'Q'): -1.9,
        ('V', 'P'): -1.8, ('M', 'C'): -0.9, ('K', 'N'): 0.8, ('V', 'T'): 0.0,
        ('M', 'G'): -3.5, ('T', 'S'): 1.5, ('I', 'E'): -2.7, ('M', 'K'): -1.4,
        ('I', 'A'): -0.8, ('N', 'N'): 3.8, ('R', 'R'): 4.7, ('F', 'P'): -3.8,
        ('L', 'I'): 2.8, ('I', 'S'): -1.8, ('D', 'S'): 0.5, ('L', 'S'): -2.1,
        ('I', 'H'): -2.2, ('F', 'D'): -4.5, ('D', 'C'): -3.2, ('F', 'H'): -0.1,
        ('D', 'G'): 0.1, ('F', 'L'): 2.0
        }
gonnet = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/grant.cmp
def _temp():
    return {
        ('L', 'R'): 103, ('I', 'I'): 215, ('Q', 'Q'): 215, ('N', 'E'): 150,
        ('Q', 'Y'): 128, ('H', 'P'): 138, ('W', 'V'): 186, ('Q', 'E'): 173,
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        ('U', 'S'): 70, ('N', 'U'): 62, ('G', 'V'): 94, ('G', 'R'): 161,
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        ('M', 'R'): 124, ('V', 'E'): 146, ('T', 'N'): 41, ('M', 'V'): 194,
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        ('F', 'E'): 112, ('G', 'N'): 173, ('P', 'U'): 117, ('S', 'S'): 215,
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        ('C', 'P'): 46, ('N', 'R'): 129, ('H', 'C'): 41, ('N', 'V'): 82,
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        ('P', 'S'): 141, ('M', 'U'): 200, ('T', 'M'): 148, ('A', 'C'): 61,
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        }
grant = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/ident.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): -1, ('L', 'R'): -1, ('I', 'I'): 6, ('Q', 'Q'): 6,
        ('W', 'N'): -1, ('V', 'I'): -1, ('H', 'T'): -1, ('H', 'P'): -1,
        ('W', 'V'): -1, ('Q', 'E'): -1, ('W', 'R'): -1, ('Q', 'A'): -1,
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        ('E', 'T'): -1, ('A', 'A'): 6, ('I', 'N'): -1, ('G', 'A'): -1,
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        ('M', 'Q'): -1, ('P', 'S'): -1, ('R', 'H'): -1, ('A', 'C'): -1,
        ('R', 'D'): -1, ('K', 'P'): -1, ('L', 'D'): -1, ('K', 'T'): -1,
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        ('P', 'C'): -1, ('M', 'E'): -1, ('A', 'S'): -1, ('T', 'T'): 6,
        ('R', 'T'): -1, ('I', 'G'): -1, ('R', 'P'): -1, ('K', 'D'): -1,
        ('I', 'C'): -1, ('F', 'R'): -1, ('F', 'V'): -1, ('L', 'C'): -1,
        ('F', 'F'): 6, ('D', 'A'): -1, ('F', 'N'): -1, ('W', 'D'): -1,
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        ('Q', 'C'): -1, ('N', 'S'): -1, ('L', 'H'): -1, ('L', 'L'): 6,
        ('G', 'T'): -1, ('M', 'M'): 6, ('G', 'P'): -1, ('Y', 'K'): -1,
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        ('Y', 'S'): -1, ('M', 'P'): -1, ('V', 'C'): -1, ('M', 'T'): -1,
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        ('D', 'T'): -1, ('I', 'M'): -1, ('F', 'C'): -1, ('W', 'L'): -1,
        ('F', 'G'): -1, ('F', 'K'): -1, ('F', 'T'): -1, ('D', 'D'): 6,
        ('Q', 'T'): -1, ('W', 'G'): -1, ('Q', 'P'): -1, ('W', 'C'): -1,
        ('W', 'K'): -1, ('H', 'Q'): -1, ('Q', 'D'): -1, ('W', 'W'): 6,
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ident = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/johnson.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 3.4, ('S', 'P'): -1.0, ('N', 'M'): -3.7, ('Q', 'Q'): 9.0,
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        ('F', 'D'): -7.0, ('D', 'C'): -9.7
        }
johnson = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/levin.cmp
def _temp():
    return {
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        ('Q', 'Q'): 2, ('N', 'A'): 0, ('H', 'T'): 0, ('N', 'E'): 0,
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        ('W', 'L'): 0, ('F', 'G'): -1, ('F', 'K'): -1, ('D', 'D'): 2,
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        }
levin = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/mclach.cmp
def _temp():
    return {
        ('N', 'I'): 1, ('K', 'V'): 2, ('S', 'P'): 3, ('N', 'M'): 2,
        ('L', 'V'): 5, ('N', 'A'): 3, ('H', 'T'): 4, ('N', 'E'): 4,
        ('Q', 'Y'): 1, ('H', 'P'): 3, ('W', 'V'): 2, ('H', 'L'): 2,
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        ('P', 'L'): 1, ('K', 'G'): 3, ('R', 'S'): 4, ('D', 'R'): 1,
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        ('Y', 'V'): 3, ('G', 'M'): 1, ('G', 'I'): 1, ('P', 'W'): 0,
        ('R', 'L'): 2, ('T', 'I'): 3, ('A', 'G'): 3, ('R', 'H'): 5,
        ('T', 'M'): 3, ('T', 'A'): 3, ('K', 'T'): 3, ('P', 'G'): 3,
        ('T', 'Y'): 1, ('A', 'W'): 1, ('C', 'T'): 2, ('V', 'V'): 8,
        ('R', 'T'): 3, ('R', 'P'): 3, ('D', 'Y'): 1, ('F', 'V'): 3,
        ('D', 'Q'): 4, ('K', 'P'): 3, ('D', 'I'): 1, ('D', 'M'): 2,
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        ('Q', 'W'): 2, ('S', 'V'): 2, ('Q', 'S'): 4, ('H', 'V'): 2,
        ('W', 'L'): 3, ('N', 'G'): 3, ('Q', 'G'): 2, ('S', 'F'): 2,
        ('Q', 'C'): 0, ('H', 'F'): 4, ('N', 'S'): 5, ('Q', 'K'): 4,
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        ('E', 'Q'): 5, ('E', 'I'): 1, ('E', 'M'): 1, ('E', 'A'): 4,
        ('G', 'L'): 1, ('Y', 'W'): 6, ('E', 'E'): 8, ('R', 'M'): 1,
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        ('T', 'L'): 3, ('I', 'V'): 5, ('C', 'I'): 1, ('R', 'A'): 2,
        ('C', 'Y'): 1, ('C', 'M'): 3, ('P', 'F'): 1, ('A', 'V'): 3,
        ('K', 'I'): 1, ('R', 'Y'): 2, ('K', 'M'): 1, ('K', 'H'): 4,
        ('T', 'P'): 3, ('M', 'L'): 6, ('T', 'T'): 8, ('C', 'L'): 0,
        ('D', 'P'): 3, ('N', 'F'): 0, ('K', 'Y'): 1, ('D', 'T'): 3,
        ('D', 'H'): 4, ('D', 'L'): 1, ('K', 'K'): 8, ('D', 'D'): 8,
        ('Q', 'T'): 3, ('N', 'H'): 4, ('Q', 'P'): 3, ('N', 'L'): 1,
        ('H', 'Y'): 4, ('S', 'Y'): 3, ('W', 'W'): 9, ('H', 'M'): 3,
        ('S', 'A'): 4, ('H', 'I'): 2, ('Q', 'L'): 3, ('N', 'P'): 1,
        ('S', 'I'): 2, ('Q', 'H'): 4, ('N', 'T'): 3, ('H', 'A'): 3,
        ('S', 'M'): 2, ('Y', 'L'): 3, ('G', 'W'): 1, ('E', 'R'): 3,
        ('E', 'V'): 2, ('G', 'G'): 8, ('T', 'V'): 3, ('E', 'F'): 0,
        ('C', 'F'): 0, ('A', 'A'): 8, ('K', 'R'): 5, ('A', 'M'): 3,
        ('Q', 'Q'): 8, ('R', 'F'): 1, ('T', 'G'): 2, ('A', 'I'): 2,
        ('P', 'Y'): 0, ('C', 'V'): 1, ('I', 'I'): 8, ('P', 'A'): 4,
        ('T', 'S'): 5, ('P', 'M'): 1, ('R', 'V'): 2, ('T', 'W'): 2,
        ('A', 'Y'): 1, ('P', 'I'): 1, ('R', 'R'): 8, ('N', 'Y'): 2,
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        ('F', 'L'): 5, ('W', 'F'): 6
        }
mclach = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/miyata.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0.14, ('L', 'R'): -1.37, ('S', 'P'): 0.69, ('I', 'I'): 1.25,
        ('Q', 'Q'): 1.25, ('N', 'A'): -0.53, ('H', 'T'): -0.07, ('N', 'E'): 0.4,
        ('H', 'P'): -0.9, ('W', 'V'): -1.26, ('W', 'R'): -1.47, ('Q', 'A'): -0.67,
        ('H', 'H'): 1.25, ('N', 'Q'): 0.26, ('H', 'D'): -0.47, ('L', 'N'): -2.24,
        ('Y', 'M'): 0.32, ('Y', 'I'): 0.39, ('Y', 'E'): -1.97, ('E', 'S'): -0.81,
        ('Y', 'A'): -1.93, ('Y', 'Y'): 1.25, ('E', 'C'): -2.01, ('Y', 'Q'): -1.23,
        ('E', 'G'): -1.53, ('V', 'A'): -0.6, ('C', 'C'): 1.25, ('M', 'R'): -1.04,
        ('V', 'E'): -1.72, ('R', 'K'): 0.85, ('P', 'P'): 1.25, ('I', 'T'): -0.89,
        ('K', 'S'): -1.46, ('R', 'G'): -2.33, ('I', 'P'): -1.37, ('R', 'C'): -1.81,
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        ('K', 'C'): -2.02, ('M', 'I'): 0.96, ('K', 'G'): -2.29, ('R', 'S'): -1.49,
        ('F', 'Q'): -1.56, ('I', 'V'): 0.4, ('M', 'V'): 0.63, ('F', 'A'): -1.98,
        ('V', 'V'): 1.25, ('M', 'N'): -1.83, ('F', 'E'): -2.34, ('D', 'N'): 0.6,
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        ('L', 'Q'): -1.45, ('W', 'E'): -2.83, ('W', 'A'): -2.98, ('W', 'M'): -0.64,
        ('H', 'S'): -0.69, ('L', 'V'): 0.34, ('S', 'C'): -0.59, ('L', 'A'): -1.51,
        ('S', 'G'): 0.4, ('L', 'E'): -2.28, ('W', 'Q'): -2.17, ('H', 'G'): -1.53,
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        ('Y', 'R'): -0.77, ('M', 'Q'): -1.05, ('R', 'H'): 0.43, ('A', 'C'): -0.14,
        ('R', 'D'): -1.09, ('T', 'A'): 0.35, ('T', 'P'): 0.38, ('L', 'D'): -2.85,
        ('K', 'T'): -0.85, ('V', 'N'): -1.51, ('M', 'A'): -1.17, ('K', 'H'): 0.46,
        ('V', 'R'): -1.18, ('P', 'C'): -0.08, ('M', 'E'): -1.88, ('I', 'K'): -1.59,
        ('T', 'T'): 1.25, ('R', 'T'): -0.78, ('I', 'G'): -2.35, ('R', 'P'): -1.65,
        ('K', 'D'): -0.8, ('I', 'C'): -0.38, ('F', 'R'): -1.22, ('F', 'V'): -0.18,
        ('D', 'Q'): -0.22, ('K', 'P'): -1.69, ('F', 'F'): 1.25, ('D', 'A'): -1.12,
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        ('W', 'T'): -2.25, ('Q', 'G'): -1.23, ('W', 'P'): -2.92, ('Q', 'C'): -1.23,
        ('N', 'S'): -0.06, ('L', 'H'): -1.34, ('L', 'L'): 1.25, ('M', 'M'): 1.25,
        ('G', 'P'): 0.28, ('Y', 'K'): -1.17, ('E', 'Q'): 0.41, ('Y', 'G'): -2.83,
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        ('M', 'P'): -1.11, ('V', 'C'): 0.39, ('M', 'T'): -0.61, ('V', 'G'): -1.51,
        ('R', 'E'): -0.2, ('V', 'K'): -1.45, ('K', 'Q'): 0.19, ('R', 'A'): -1.67,
        ('I', 'R'): -1.24, ('V', 'S'): -0.9, ('M', 'L'): 0.84, ('M', 'D'): -2.44,
        ('W', 'W'): 1.25, ('M', 'H'): -0.94, ('K', 'A'): -1.71, ('R', 'Q'): 0.12,
        ('K', 'E'): 0.11, ('F', 'S'): -2.2, ('D', 'P'): -1.15, ('D', 'T'): -0.8,
        ('F', 'C'): -0.99, ('W', 'L'): -0.48, ('F', 'G'): -2.89, ('F', 'K'): -1.6,
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        ('L', 'C'): -0.4, ('W', 'N'): -3.14, ('S', 'A'): 0.74, ('L', 'G'): -2.42,
        ('W', 'S'): -3.13, ('L', 'K'): -1.73, ('N', 'P'): -0.55, ('H', 'E'): 0.29,
        ('N', 'T'): -0.15, ('H', 'A'): -0.92, ('Y', 'L'): 0.31, ('Y', 'H'): -1.02,
        ('Y', 'D'): -2.7, ('L', 'T'): -1.0, ('G', 'G'): 1.25, ('G', 'C'): -0.97,
        ('Y', 'T'): -1.2, ('Y', 'P'): -1.87, ('R', 'N'): -0.79, ('V', 'D'): -2.15,
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        ('V', 'P'): -0.54, ('M', 'C'): -0.21, ('K', 'N'): -0.59, ('V', 'T'): -0.17,
        ('M', 'G'): -2.09, ('T', 'S'): 0.36, ('I', 'E'): -2.14, ('M', 'K'): -1.38,
        ('I', 'A'): -1.44, ('N', 'N'): 1.25, ('R', 'R'): 1.25, ('F', 'P'): -1.92,
        ('I', 'S'): -1.7, ('D', 'S'): -0.62, ('Y', 'F'): 0.77, ('L', 'S'): -1.79,
        ('I', 'H'): -1.2, ('F', 'D'): -3.02, ('D', 'C'): -2.23, ('F', 'H'): -1.38,
        ('D', 'G'): -1.12, ('F', 'L'): 0.62
        }
miyata = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/nwsgappep.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1.3, ('S', 'P'): 0.4, ('W', 'B'): -0.7, ('N', 'N'): 1.5,
        ('N', 'A'): 0.2, ('N', 'E'): 0.5, ('Z', 'Y'): -0.6, ('W', 'V'): -0.8,
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        ('Q', 'I'): -0.3, ('S', 'L'): -0.4, ('Y', 'M'): -0.1, ('Q', 'E'): 0.7,
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        }
nwsgappep = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam120.cmp
def _temp():
    return {
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        ('Q', 'Q'): 6, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -5, ('W', 'R'): 1,
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        ('S', 'S'): 3, ('L', 'Q'): -2, ('W', 'E'): -8, ('Q', 'R'): 1,
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        }
pam120 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam180.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -4, ('S', 'P'): 1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 6, ('N', 'A'): 0, ('Z', 'Y'): -6, ('W', 'R'): 2,
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        ('H', 'D'): 0, ('L', 'N'): -4, ('W', 'A'): -8, ('Y', 'M'): -4,
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        ('L', 'D'): -6, ('B', 'I'): -3, ('L', 'H'): -3, ('S', 'N'): 1,
        ('B', 'T'): 0, ('L', 'L'): 7, ('Y', 'K'): -6, ('E', 'Q'): 3,
        ('Y', 'G'): -7, ('Z', 'S'): -1, ('Y', 'C'): 0, ('G', 'D'): 0,
        ('B', 'V'): -3, ('E', 'A'): 0, ('Y', 'W'): -1, ('E', 'E'): 5,
        ('Y', 'S'): -4, ('C', 'N'): -5, ('V', 'C'): -3, ('T', 'H'): -2,
        ('P', 'R'): -1, ('V', 'G'): -2, ('T', 'L'): -3, ('V', 'K'): -4,
        ('K', 'Q'): 0, ('R', 'A'): -3, ('I', 'R'): -3, ('T', 'D'): -1,
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        ('C', 'R'): -5, ('V', 'P'): -2, ('P', 'E'): -1, ('M', 'C'): -7,
        ('K', 'N'): 1, ('I', 'I'): 6, ('P', 'A'): 1, ('M', 'G'): -4,
        ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -3, ('P', 'M'): -3, ('M', 'K'): 1,
        ('I', 'A'): -1, ('P', 'I'): -3, ('R', 'R'): 8, ('X', 'M'): -1,
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        ('Z', 'N'): 1, ('X', 'A'): -1, ('B', 'R'): -2, ('B', 'N'): 3,
        ('F', 'D'): -8, ('X', 'Y'): -3, ('Z', 'R'): 0, ('F', 'H'): -3,
        ('B', 'F'): -6, ('F', 'L'): 1, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 4
        }
pam180 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam250.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 0, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): 1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 4, ('N', 'A'): 0, ('Z', 'Y'): -4, ('W', 'R'): 2,
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        ('G', 'R'): -3, ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -4, ('B', 'Y'): -3,
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        ('G', 'N'): 0, ('E', 'C'): -5, ('Y', 'Q'): -4, ('Z', 'Z'): 3,
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        ('B', 'V'): -2, ('E', 'A'): 0, ('Y', 'W'): 0, ('E', 'E'): 4,
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        ('W', 'S'): -2, ('S', 'E'): 0, ('H', 'E'): 1, ('S', 'I'): -1,
        ('H', 'A'): -1, ('S', 'M'): -2, ('Y', 'L'): -1, ('Y', 'H'): 0,
        ('Y', 'D'): -4, ('E', 'R'): -1, ('X', 'P'): -1, ('G', 'G'): 5,
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        ('K', 'N'): 1, ('I', 'I'): 5, ('P', 'A'): 1, ('M', 'G'): -3,
        ('T', 'S'): 1, ('I', 'E'): -2, ('P', 'M'): -2, ('M', 'K'): 0,
        ('I', 'A'): -1, ('P', 'I'): -2, ('R', 'R'): 6, ('X', 'M'): -1,
        ('L', 'I'): 2, ('X', 'I'): -1, ('Z', 'B'): 2, ('X', 'E'): -1,
        ('Z', 'N'): 1, ('X', 'A'): 0, ('B', 'R'): -1, ('B', 'N'): 2,
        ('F', 'D'): -6, ('X', 'Y'): -2, ('Z', 'R'): 0, ('F', 'H'): -2,
        ('B', 'F'): -4, ('F', 'L'): 2, ('X', 'Q'): -1, ('B', 'B'): 3
        }
pam250 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam30.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): -4, ('L', 'R'): -8, ('S', 'P'): -2, ('V', 'T'): -3,
        ('Q', 'Q'): 8, ('N', 'A'): -4, ('Z', 'Y'): -9, ('W', 'R'): -2,
        ('Q', 'A'): -4, ('S', 'D'): -4, ('H', 'H'): 9, ('S', 'H'): -6,
        ('H', 'D'): -4, ('L', 'N'): -7, ('W', 'A'): -13, ('Y', 'M'): -11,
        ('G', 'R'): -9, ('Y', 'I'): -6, ('Y', 'E'): -8, ('B', 'Y'): -6,
        ('Y', 'A'): -8, ('V', 'D'): -8, ('B', 'S'): -1, ('Y', 'Y'): 10,
        ('G', 'N'): -3, ('E', 'C'): -14, ('Y', 'Q'): -12, ('Z', 'Z'): 6,
        ('V', 'A'): -2, ('C', 'C'): 10, ('M', 'R'): -4, ('V', 'E'): -6,
        ('T', 'N'): -2, ('P', 'P'): 8, ('V', 'I'): 2, ('V', 'S'): -6,
        ('Z', 'P'): -4, ('V', 'M'): -1, ('T', 'F'): -9, ('V', 'Q'): -7,
        ('K', 'K'): 7, ('P', 'D'): -8, ('I', 'H'): -9, ('I', 'D'): -7,
        ('T', 'R'): -6, ('P', 'L'): -7, ('K', 'G'): -7, ('M', 'N'): -9,
        ('P', 'H'): -4, ('F', 'Q'): -13, ('Z', 'G'): -5, ('X', 'L'): -6,
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        ('B', 'W'): -10, ('X', 'D'): -5, ('Z', 'K'): -4, ('F', 'A'): -8,
        ('Z', 'W'): -14, ('F', 'E'): -14, ('D', 'N'): 2, ('B', 'K'): -2,
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        ('F', 'M'): -4, ('B', 'C'): -12, ('Z', 'I'): -6, ('Z', 'V'): -6,
        ('S', 'S'): 6, ('L', 'Q'): -5, ('W', 'E'): -17, ('Q', 'R'): -2,
        ('N', 'N'): 8, ('W', 'M'): -13, ('Q', 'C'): -14, ('W', 'I'): -14,
        ('S', 'C'): -3, ('L', 'A'): -6, ('S', 'G'): -2, ('L', 'E'): -9,
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        ('N', 'R'): -6, ('H', 'C'): -7, ('Y', 'N'): -4, ('G', 'Q'): -7,
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        ('V', 'N'): -8, ('P', 'G'): -6, ('M', 'A'): -5, ('K', 'H'): -6,
        ('V', 'R'): -8, ('P', 'C'): -8, ('M', 'E'): -7, ('K', 'L'): -8,
        ('V', 'V'): 7, ('M', 'I'): -1, ('T', 'Q'): -5, ('I', 'G'): -11,
        ('P', 'K'): -6, ('M', 'M'): 11, ('K', 'D'): -4, ('I', 'C'): -6,
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        ('X', 'G'): -5, ('Z', 'L'): -7, ('X', 'C'): -9, ('Z', 'H'): -1,
        ('B', 'L'): -9, ('B', 'H'): -1, ('F', 'F'): 9, ('X', 'W'): -11,
        ('B', 'D'): 6, ('D', 'A'): -3, ('S', 'L'): -8, ('X', 'S'): -3,
        ('F', 'N'): -9, ('S', 'R'): -3, ('W', 'D'): -15, ('V', 'Y'): -7,
        ('W', 'L'): -6, ('H', 'R'): -2, ('W', 'H'): -7, ('H', 'N'): 0,
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        ('Y', 'G'): -14, ('Z', 'S'): -5, ('Y', 'C'): -4, ('G', 'D'): -3,
        ('B', 'V'): -8, ('E', 'A'): -2, ('Y', 'W'): -5, ('E', 'E'): 8,
        ('Y', 'S'): -7, ('C', 'N'): -11, ('V', 'C'): -6, ('T', 'H'): -7,
        ('P', 'R'): -4, ('V', 'G'): -5, ('T', 'L'): -7, ('V', 'K'): -9,
        ('K', 'Q'): -3, ('R', 'A'): -7, ('I', 'R'): -5, ('T', 'D'): -5,
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        ('V', 'W'): -15, ('W', 'W'): 13, ('M', 'H'): -10, ('P', 'N'): -6,
        ('K', 'A'): -7, ('M', 'L'): 1, ('K', 'E'): -4, ('Z', 'E'): 6,
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        ('K', 'C'): -14, ('B', 'Q'): -3, ('X', 'B'): -5, ('B', 'M'): -10,
        ('F', 'C'): -13, ('Z', 'Q'): 6, ('X', 'Z'): -5, ('F', 'G'): -9,
        ('B', 'E'): 1, ('X', 'V'): -5, ('F', 'K'): -14, ('B', 'A'): -3,
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        ('L', 'C'): -15, ('W', 'N'): -8, ('S', 'A'): 0, ('L', 'G'): -10,
        ('W', 'S'): -5, ('S', 'E'): -4, ('H', 'E'): -5, ('S', 'I'): -7,
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        ('K', 'N'): -1, ('I', 'I'): 8, ('P', 'A'): -2, ('M', 'G'): -8,
        ('T', 'S'): 0, ('I', 'E'): -5, ('P', 'M'): -8, ('M', 'K'): -2,
        ('I', 'A'): -5, ('P', 'I'): -8, ('R', 'R'): 8, ('X', 'M'): -5,
        ('L', 'I'): -1, ('X', 'I'): -5, ('Z', 'B'): 0, ('X', 'E'): -5,
        ('Z', 'N'): -3, ('X', 'A'): -3, ('B', 'R'): -7, ('B', 'N'): 6,
        ('F', 'D'): -15, ('X', 'Y'): -7, ('Z', 'R'): -4, ('F', 'H'): -6,
        ('B', 'F'): -10, ('F', 'L'): -3, ('X', 'Q'): -5, ('B', 'B'): 6
        }
pam30 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam300.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 1, ('L', 'R'): -3, ('S', 'P'): 1, ('V', 'T'): 0,
        ('Q', 'Q'): 4, ('N', 'A'): 0, ('Z', 'Y'): -5, ('W', 'R'): 3,
        ('Q', 'A'): 0, ('S', 'D'): 0, ('H', 'H'): 7, ('S', 'H'): -1,
        ('H', 'D'): 1, ('L', 'N'): -3, ('W', 'A'): -6, ('Y', 'M'): -2,
        ('G', 'R'): -2, ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -5, ('B', 'Y'): -4,
        ('Y', 'A'): -4, ('V', 'D'): -2, ('B', 'S'): 1, ('Y', 'Y'): 12,
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pam300 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam60.cmp
def _temp():
    return {
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        }
pam60 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/pam90.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): -2, ('L', 'R'): -5, ('S', 'P'): 0, ('V', 'T'): -1,
        ('Q', 'Q'): 6, ('N', 'A'): -1, ('Z', 'Y'): -6, ('W', 'R'): 0,
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        ('W', 'P'): -8, ('L', 'D'): -7, ('B', 'I'): -3, ('L', 'H'): -3,
        ('S', 'N'): 1, ('B', 'T'): -1, ('L', 'L'): 6, ('Y', 'K'): -6,
        ('E', 'Q'): 2, ('Y', 'G'): -8, ('Z', 'S'): -2, ('Y', 'C'): -1,
        ('G', 'D'): -1, ('B', 'V'): -4, ('E', 'A'): 0, ('Y', 'W'): -2,
        ('E', 'E'): 6, ('Y', 'S'): -4, ('C', 'N'): -6, ('V', 'C'): -3,
        ('T', 'H'): -3, ('P', 'R'): -1, ('V', 'G'): -3, ('T', 'L'): -3,
        ('V', 'K'): -5, ('K', 'Q'): -1, ('R', 'A'): -4, ('I', 'R'): -3,
        ('T', 'D'): -2, ('P', 'F'): -6, ('I', 'N'): -3, ('K', 'I'): -3,
        ('M', 'D'): -5, ('V', 'W'): -9, ('W', 'W'): 13, ('M', 'H'): -5,
        ('P', 'N'): -2, ('K', 'A'): -3, ('M', 'L'): 2, ('K', 'E'): -2,
        ('Z', 'E'): 5, ('Q', 'N'): -1, ('Z', 'A'): -1, ('Z', 'M'): -3,
        ('K', 'C'): -8, ('B', 'Q'): 0, ('B', 'M'): -5, ('F', 'C'): -7,
        ('Z', 'Q'): 5, ('F', 'G'): -6, ('B', 'E'): 2, ('F', 'K'): -8,
        ('B', 'A'): -1, ('D', 'D'): 6, ('W', 'G'): -9, ('S', 'Q'): -2,
        ('W', 'C'): -10, ('W', 'K'): -6, ('H', 'Q'): 2, ('L', 'C'): -9,
        ('W', 'N'): -5, ('S', 'A'): 1, ('L', 'G'): -6, ('W', 'S'): -3,
        ('S', 'E'): -2, ('H', 'E'): -1, ('S', 'I'): -3, ('H', 'A'): -4,
        ('S', 'M'): -3, ('Y', 'L'): -3, ('Y', 'H'): -1, ('Y', 'D'): -6,
        ('E', 'R'): -4, ('G', 'G'): 5, ('G', 'C'): -5, ('E', 'N'): 0,
        ('Y', 'T'): -4, ('Y', 'P'): -8, ('T', 'K'): -1, ('A', 'A'): 4,
        ('P', 'Q'): -1, ('T', 'C'): -4, ('V', 'H'): -4, ('T', 'G'): -2,
        ('I', 'Q'): -4, ('Z', 'T'): -2, ('C', 'R'): -5, ('V', 'P'): -3,
        ('P', 'E'): -2, ('M', 'C'): -8, ('K', 'N'): 1, ('I', 'I'): 6,
        ('P', 'A'): 0, ('M', 'G'): -5, ('T', 'S'): 2, ('I', 'E'): -3,
        ('P', 'M'): -4, ('M', 'K'): 0, ('I', 'A'): -2, ('P', 'I'): -4,
        ('R', 'R'): 7, ('Z', 'F'): -8, ('Z', 'B'): 2, ('Z', 'N'): 0,
        ('B', 'R'): -3, ('B', 'N'): 4, ('F', 'D'): -8, ('Z', 'R'): -1,
        ('F', 'H'): -3, ('B', 'F'): -6, ('F', 'L'): 0, ('V', 'Y'): -4,
        ('B', 'B'): 4
        }
pam90 = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/rao.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 11, ('S', 'P'): 10, ('N', 'M'): 6, ('Q', 'Q'): 16,
        ('N', 'A'): 9, ('N', 'E'): 10, ('W', 'V'): 11, ('Q', 'E'): 11,
        ('L', 'H'): 10, ('W', 'R'): 7, ('Q', 'A'): 11, ('S', 'D'): 10,
        ('H', 'H'): 16, ('Q', 'M'): 9, ('S', 'H'): 10, ('H', 'D'): 9,
        ('Q', 'I'): 6, ('S', 'L'): 8, ('Y', 'M'): 8, ('Y', 'I'): 10,
        ('Y', 'E'): 6, ('Y', 'A'): 9, ('G', 'F'): 7, ('V', 'T'): 10,
        ('Y', 'Y'): 16, ('V', 'H'): 9, ('E', 'C'): 9, ('Y', 'Q'): 8,
        ('V', 'A'): 9, ('C', 'C'): 16, ('V', 'E'): 4, ('T', 'N'): 10,
        ('R', 'K'): 11, ('P', 'P'): 16, ('V', 'I'): 12, ('R', 'G'): 7,
        ('V', 'M'): 9, ('T', 'F'): 10, ('R', 'C'): 8, ('V', 'Q'): 6,
        ('K', 'K'): 16, ('P', 'D'): 8, ('I', 'H'): 8, ('M', 'F'): 10,
        ('I', 'D'): 3, ('K', 'C'): 9, ('P', 'L'): 4, ('K', 'G'): 7,
        ('P', 'H'): 5, ('T', 'R'): 9, ('F', 'A'): 10, ('F', 'E'): 6,
        ('S', 'S'): 16, ('W', 'E'): 7, ('N', 'N'): 16, ('W', 'M'): 10,
        ('Q', 'C'): 10, ('N', 'F'): 6, ('S', 'C'): 10, ('L', 'A'): 11,
        ('S', 'G'): 11, ('L', 'E'): 7, ('W', 'Q'): 9, ('H', 'G'): 7,
        ('S', 'K'): 10, ('Q', 'N'): 11, ('V', 'D'): 3, ('H', 'C'): 10,
        ('Y', 'N'): 8, ('Y', 'F'): 10, ('W', 'I'): 11, ('C', 'A'): 11,
        ('G', 'E'): 6, ('G', 'A'): 8, ('Y', 'V'): 10, ('E', 'D'): 11,
        ('W', 'H'): 10, ('Y', 'R'): 7, ('N', 'I'): 5, ('R', 'L'): 6,
        ('T', 'I'): 10, ('Q', 'L'): 9, ('R', 'H'): 10, ('T', 'M'): 8,
        ('V', 'F'): 11, ('R', 'D'): 10, ('T', 'A'): 10, ('T', 'P'): 8,
        ('T', 'E'): 8, ('V', 'N'): 5, ('P', 'G'): 11, ('M', 'A'): 11,
        ('K', 'H'): 11, ('V', 'R'): 5, ('P', 'C'): 7, ('M', 'E'): 8,
        ('V', 'V'): 16, ('T', 'T'): 16, ('M', 'I'): 9, ('T', 'Q'): 10,
        ('I', 'G'): 6, ('P', 'K'): 6, ('M', 'M'): 16, ('K', 'D'): 11,
        ('I', 'C'): 8, ('L', 'C'): 11, ('F', 'F'): 16, ('D', 'A'): 9,
        ('S', 'R'): 9, ('W', 'D'): 6, ('N', 'C'): 9, ('N', 'G'): 10,
        ('W', 'T'): 11, ('Q', 'G'): 8, ('S', 'F'): 8, ('W', 'P'): 6,
        ('L', 'D'): 6, ('H', 'F'): 9, ('Q', 'K'): 12, ('S', 'N'): 11,
        ('L', 'L'): 16, ('Q', 'F'): 7, ('Y', 'K'): 7, ('Y', 'G'): 10,
        ('Y', 'C'): 10, ('G', 'D'): 9, ('E', 'A'): 10, ('Y', 'W'): 11,
        ('E', 'E'): 16, ('Y', 'S'): 11, ('R', 'M'): 6, ('V', 'C'): 8,
        ('T', 'H'): 10, ('R', 'I'): 4, ('V', 'G'): 6, ('T', 'L'): 9,
        ('R', 'E'): 9, ('V', 'K'): 5, ('R', 'Q'): 10, ('R', 'A'): 8,
        ('T', 'D'): 9, ('P', 'F'): 4, ('V', 'S'): 8, ('K', 'I'): 4,
        ('M', 'D'): 5, ('W', 'W'): 16, ('M', 'H'): 10, ('P', 'N'): 9,
        ('I', 'F'): 12, ('K', 'A'): 10, ('M', 'L'): 11, ('K', 'E'): 11,
        ('N', 'K'): 11, ('R', 'P'): 6, ('L', 'F'): 11, ('F', 'C'): 10,
        ('W', 'G'): 8, ('W', 'L'): 11, ('D', 'D'): 16, ('N', 'H'): 10,
        ('S', 'Q'): 10, ('Q', 'P'): 7, ('N', 'L'): 7, ('W', 'K'): 7,
        ('Q', 'D'): 11, ('W', 'N'): 8, ('S', 'A'): 10, ('L', 'G'): 6,
        ('W', 'S'): 10, ('S', 'E'): 9, ('L', 'K'): 7, ('H', 'E'): 11,
        ('S', 'I'): 8, ('Q', 'H'): 11, ('H', 'A'): 11, ('S', 'M'): 7,
        ('Y', 'L'): 9, ('Y', 'H'): 9, ('Y', 'D'): 7, ('G', 'G'): 16,
        ('G', 'C'): 8, ('Y', 'T'): 11, ('W', 'C'): 11, ('Y', 'P'): 8,
        ('T', 'K'): 9, ('R', 'N'): 10, ('A', 'A'): 16, ('W', 'A'): 11,
        ('T', 'C'): 10, ('N', 'D'): 11, ('R', 'F'): 5, ('T', 'G'): 10,
        ('V', 'L'): 10, ('V', 'P'): 3, ('P', 'E'): 5, ('M', 'C'): 10,
        ('I', 'I'): 16, ('P', 'A'): 6, ('M', 'G'): 4, ('T', 'S'): 11,
        ('I', 'E'): 4, ('P', 'M'): 2, ('M', 'K'): 8, ('K', 'F'): 6,
        ('I', 'A'): 9, ('P', 'I'): 3, ('R', 'R'): 16, ('L', 'I'): 10,
        ('F', 'D'): 4, ('D', 'C'): 8
        }
rao = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/risler.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): -0.9, ('S', 'P'): -0.3, ('N', 'M'): 0.0, ('Q', 'Q'): 2.2,
        ('N', 'A'): 1.3, ('N', 'E'): 1.4, ('W', 'V'): -0.7, ('Q', 'E'): 2.1,
        ('L', 'H'): -0.9, ('W', 'R'): -0.8, ('Q', 'A'): 1.8, ('S', 'D'): 0.7,
        ('H', 'H'): 2.2, ('Q', 'M'): 1.2, ('S', 'H'): -0.4, ('H', 'D'): -1.3,
        ('Q', 'I'): 1.4, ('S', 'L'): 1.3, ('Y', 'M'): -0.2, ('Y', 'I'): 0.4,
        ('Y', 'E'): 0.2, ('Y', 'A'): 0.2, ('G', 'F'): -0.4, ('V', 'T'): 1.6,
        ('Y', 'Y'): 2.2, ('V', 'H'): -0.7, ('E', 'C'): -1.5, ('Y', 'Q'): 0.5,
        ('V', 'A'): 2.0, ('C', 'C'): 2.2, ('V', 'E'): 1.6, ('T', 'N'): 1.1,
        ('R', 'K'): 2.1, ('P', 'P'): 2.2, ('V', 'I'): 2.2, ('R', 'G'): 0.1,
        ('V', 'M'): 0.8, ('T', 'F'): 0.3, ('R', 'C'): -1.5, ('V', 'Q'): 1.5,
        ('K', 'K'): 2.2, ('P', 'D'): -1.2, ('I', 'H'): -0.8, ('M', 'F'): -0.2,
        ('I', 'D'): 0.0, ('K', 'C'): -1.6, ('P', 'L'): -0.8, ('K', 'G'): -0.1,
        ('P', 'H'): -1.6, ('T', 'R'): 1.9, ('F', 'A'): 0.6, ('F', 'E'): 0.6,
        ('S', 'S'): 2.2, ('W', 'E'): -1.0, ('N', 'N'): 2.2, ('W', 'M'): -1.3,
        ('Q', 'C'): -1.4, ('N', 'F'): 0.4, ('S', 'C'): -1.3, ('L', 'A'): 1.3,
        ('S', 'G'): 0.7, ('L', 'E'): 0.9, ('W', 'Q'): -1.0, ('H', 'G'): -1.2,
        ('S', 'K'): 1.4, ('Q', 'N'): 1.6, ('V', 'D'): 0.0, ('H', 'C'): -1.8,
        ('Y', 'N'): -0.1, ('Y', 'F'): 2.0, ('W', 'I'): -0.7, ('C', 'A'): -1.5,
        ('G', 'E'): 0.3, ('G', 'A'): 0.6, ('Y', 'V'): 0.3, ('E', 'D'): 1.0,
        ('W', 'H'): -1.7, ('Y', 'R'): 0.8, ('N', 'I'): 0.9, ('R', 'L'): 1.2,
        ('T', 'I'): 1.6, ('Q', 'L'): 1.1, ('R', 'H'): -0.4, ('T', 'M'): 0.8,
        ('V', 'F'): 0.8, ('R', 'D'): -0.1, ('T', 'A'): 1.9, ('T', 'P'): -0.5,
        ('T', 'E'): 1.6, ('V', 'N'): 1.1, ('P', 'G'): -1.2, ('M', 'A'): 1.0,
        ('K', 'H'): -1.0, ('V', 'R'): 1.5, ('P', 'C'): -1.8, ('M', 'E'): 0.6,
        ('V', 'V'): 2.2, ('T', 'T'): 2.2, ('M', 'I'): 0.9, ('T', 'Q'): 1.7,
        ('I', 'G'): 0.0, ('P', 'K'): -0.7, ('M', 'M'): 2.2, ('K', 'D'): 0.1,
        ('I', 'C'): -1.6, ('L', 'C'): -1.5, ('F', 'F'): 2.2, ('D', 'A'): 0.2,
        ('S', 'R'): 2.0, ('W', 'D'): -1.4, ('N', 'C'): -1.6, ('N', 'G'): 0.2,
        ('W', 'T'): -1.0, ('Q', 'G'): 0.2, ('S', 'F'): 0.5, ('W', 'P'): -1.6,
        ('L', 'D'): -0.2, ('H', 'F'): -1.1, ('Q', 'K'): 1.7, ('S', 'N'): 1.9,
        ('L', 'L'): 2.2, ('Q', 'F'): 0.7, ('Y', 'K'): 0.5, ('Y', 'G'): -0.2,
        ('Y', 'C'): -1.1, ('G', 'D'): -0.4, ('E', 'A'): 1.7, ('Y', 'W'): -0.6,
        ('E', 'E'): 2.2, ('Y', 'S'): 0.4, ('R', 'M'): 1.1, ('V', 'C'): -1.4,
        ('T', 'H'): -0.9, ('R', 'I'): 1.4, ('V', 'G'): 0.1, ('T', 'L'): 1.2,
        ('R', 'E'): 1.9, ('V', 'K'): 1.2, ('R', 'Q'): 2.0, ('R', 'A'): 1.5,
        ('T', 'D'): 0.0, ('P', 'F'): -1.1, ('V', 'S'): 1.8, ('K', 'I'): 1.0,
        ('M', 'D'): -0.5, ('W', 'W'): 2.2, ('M', 'H'): -1.2, ('P', 'N'): -1.0,
        ('I', 'F'): 1.0, ('K', 'A'): 1.4, ('M', 'L'): 1.8, ('K', 'E'): 1.4,
        ('N', 'K'): 1.0, ('R', 'P'): -0.3, ('L', 'F'): 1.0, ('F', 'C'): -1.6,
        ('W', 'G'): -1.3, ('W', 'L'): -0.8, ('D', 'D'): 2.2, ('N', 'H'): -0.3,
        ('S', 'Q'): 1.8, ('Q', 'P'): -0.6, ('N', 'L'): 0.8, ('W', 'K'): -1.1,
        ('Q', 'D'): 0.6, ('W', 'N'): -1.1, ('S', 'A'): 2.0, ('L', 'G'): -0.2,
        ('W', 'S'): -0.8, ('S', 'E'): 1.8, ('L', 'K'): 0.7, ('H', 'E'): -0.6,
        ('S', 'I'): 1.6, ('Q', 'H'): -0.5, ('H', 'A'): -0.6, ('S', 'M'): 0.6,
        ('Y', 'L'): 0.5, ('Y', 'H'): -0.8, ('Y', 'D'): -0.4, ('G', 'G'): 2.2,
        ('G', 'C'): -1.7, ('Y', 'T'): 0.3, ('W', 'C'): -1.8, ('Y', 'P'): -1.2,
        ('T', 'K'): 1.2, ('R', 'N'): 1.2, ('A', 'A'): 2.2, ('W', 'A'): -0.9,
        ('T', 'C'): -1.4, ('N', 'D'): 0.8, ('R', 'F'): 0.4, ('T', 'G'): 0.2,
        ('V', 'L'): 2.0, ('V', 'P'): -0.6, ('P', 'E'): -0.1, ('M', 'C'): -1.6,
        ('I', 'I'): 2.2, ('P', 'A'): -0.2, ('M', 'G'): -0.4, ('T', 'S'): 2.1,
        ('I', 'E'): 1.5, ('P', 'M'): -1.2, ('M', 'K'): 0.4, ('K', 'F'): 0.1,
        ('I', 'A'): 1.7, ('P', 'I'): -0.6, ('R', 'R'): 2.2, ('L', 'I'): 2.1,
        ('F', 'D'): -0.3, ('D', 'C'): -1.7
        }
risler = _temp()
del _temp


# http://www.embl-heidelberg.de/~vogt/matrices/str.cmp
def _temp():
    return {
        ('W', 'F'): 2, ('L', 'R'): -3, ('I', 'I'): 6, ('Q', 'Q'): 6,
        ('W', 'N'): -5, ('V', 'I'): 2, ('H', 'T'): -2, ('H', 'P'): -3,
        ('W', 'V'): -4, ('Q', 'E'): 2, ('W', 'R'): -2, ('Q', 'A'): 0,
        ('H', 'H'): 8, ('H', 'D'): 0, ('L', 'N'): -3, ('Y', 'M'): -1,
        ('Y', 'I'): -1, ('Y', 'E'): -2, ('E', 'S'): -1, ('Y', 'A'): -3,
        ('Y', 'Y'): 7, ('T', 'C'): -5, ('E', 'C'): -3, ('Y', 'Q'): -3,
        ('E', 'G'): -2, ('V', 'A'): 0, ('C', 'C'): 11, ('M', 'R'): -4,
        ('P', 'T'): -1, ('V', 'E'): -2, ('P', 'P'): 7, ('I', 'T'): -2,
        ('K', 'S'): -1, ('R', 'G'): -2, ('I', 'P'): -4, ('R', 'C'): -2,
        ('A', 'T'): -1, ('K', 'K'): 5, ('A', 'P'): -1, ('V', 'M'): 0,
        ('I', 'D'): -3, ('K', 'C'): -4, ('K', 'G'): -3, ('R', 'S'): 0,
        ('F', 'Q'): -4, ('F', 'A'): -3, ('V', 'V'): 5, ('M', 'N'): -2,
        ('F', 'E'): -4, ('D', 'N'): 2, ('F', 'I'): 1, ('F', 'M'): 0,
        ('M', 'S'): -4, ('S', 'S'): 4, ('L', 'Q'): -3, ('W', 'E'): -6,
        ('W', 'A'): -3, ('W', 'M'): -2, ('H', 'S'): -2, ('W', 'I'): -2,
        ('S', 'C'): -4, ('L', 'A'): -2, ('L', 'E'): -4, ('W', 'Q'): -5,
        ('H', 'G'): -3, ('Q', 'N'): 0, ('H', 'C'): -6, ('L', 'M'): 3,
        ('W', 'Y'): 2, ('Y', 'N'): -1, ('E', 'P'): -1, ('Y', 'F'): 3,
        ('E', 'T'): 0, ('A', 'A'): 4, ('I', 'N'): -3, ('G', 'A'): 0,
        ('Y', 'V'): -1, ('E', 'D'): 2, ('W', 'H'): -3, ('Y', 'R'): -1,
        ('M', 'Q'): 1, ('P', 'S'): -1, ('R', 'H'): 0, ('A', 'C'): -2,
        ('R', 'D'): -2, ('K', 'P'): -1, ('L', 'D'): -6, ('K', 'T'): 0,
        ('V', 'N'): -4, ('M', 'A'): 0, ('K', 'H'): 0, ('V', 'R'): -3,
        ('P', 'C'): -8, ('M', 'E'): -2, ('A', 'S'): 0, ('T', 'T'): 5,
        ('R', 'T'): -1, ('I', 'G'): -5, ('R', 'P'): -2, ('K', 'D'): -1,
        ('I', 'C'): -4, ('F', 'R'): -4, ('F', 'V'): -1, ('L', 'C'): -6,
        ('F', 'F'): 7, ('D', 'A'): -1, ('F', 'N'): -3, ('W', 'D'): -6,
        ('L', 'P'): -3, ('Q', 'S'): -1, ('N', 'C'): -6, ('N', 'G'): -1,
        ('H', 'N'): 2, ('W', 'T'): -5, ('Q', 'G'): -2, ('W', 'P'): -4,
        ('Q', 'C'): -3, ('N', 'S'): 0, ('L', 'H'): -3, ('L', 'L'): 5,
        ('G', 'T'): -3, ('M', 'M'): 8, ('G', 'P'): -2, ('Y', 'K'): -2,
        ('Y', 'G'): -3, ('Y', 'C'): -6, ('E', 'A'): 0, ('E', 'E'): 5,
        ('Y', 'S'): -2, ('M', 'P'): -6, ('V', 'C'): -4, ('M', 'T'): -2,
        ('V', 'G'): -4, ('R', 'E'): 0, ('V', 'K'): -3, ('K', 'Q'): 1,
        ('R', 'A'): -1, ('I', 'R'): -3, ('N', 'A'): -1, ('V', 'S'): -3,
        ('M', 'D'): -4, ('M', 'H'): -2, ('K', 'A'): -1, ('R', 'Q'): 1,
        ('K', 'E'): 1, ('F', 'S'): -3, ('I', 'K'): -3, ('D', 'P'): -1,
        ('D', 'T'): -1, ('I', 'M'): 1, ('F', 'C'): -2, ('W', 'L'): -1,
        ('F', 'G'): -6, ('F', 'K'): -3, ('F', 'T'): -3, ('D', 'D'): 6,
        ('Q', 'T'): 0, ('W', 'G'): -4, ('Q', 'P'): -2, ('W', 'C'): -6,
        ('W', 'K'): -3, ('H', 'Q'): 0, ('Q', 'D'): 0, ('W', 'W'): 10,
        ('V', 'L'): 1, ('L', 'G'): -5, ('W', 'S'): -5, ('L', 'K'): -2,
        ('N', 'P'): -2, ('H', 'E'): -2, ('N', 'T'): 0, ('H', 'A'): -2,
        ('Y', 'L'): -2, ('Y', 'H'): 0, ('G', 'S'): -1, ('Y', 'D'): -3,
        ('V', 'Q'): -2, ('L', 'T'): -3, ('G', 'G'): 5, ('G', 'C'): -6,
        ('E', 'N'): 0, ('Y', 'T'): -2, ('Y', 'P'): -6, ('R', 'N'): -1,
        ('V', 'D'): -4, ('K', 'R'): 2, ('V', 'H'): -2, ('I', 'Q'): -5,
        ('V', 'P'): -4, ('M', 'C'): -5, ('K', 'N'): 0, ('V', 'T'): -1,
        ('M', 'G'): -4, ('T', 'S'): 1, ('I', 'E'): -3, ('M', 'K'): -1,
        ('I', 'A'): -2, ('N', 'N'): 5, ('R', 'R'): 7, ('F', 'P'): -5,
        ('L', 'I'): 2, ('I', 'S'): -3, ('D', 'S'): 0, ('L', 'S'): -4,
        ('I', 'H'): -5, ('F', 'D'): -5, ('D', 'C'): -7, ('F', 'H'): -2,
        ('D', 'G'): -1, ('F', 'L'): 2
        }
structure = _temp()
del _temp